Andreas Gnirke Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology Biography Publications Institution JoVE Articles Andreas Gnirke has not added a biography. If you are Andreas Gnirke and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Distribuzione Genomiche E Inter-sample Variazione Di Metilazione CpG Non Tutti I Tipi Di Cellule Umane PLoS Genetics. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22174693 Selezione Di Ibridi Per Il Sequenziamento Dei Genomi Di Patogeni Da Campioni Clinici Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21835008 Full-length Transcriptome Assieme Da RNA-Seq Dati Senza Un Genoma Di Riferimento Nature Biotechnology. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21572440 Etichettatura Metabolica Di RNA Scopre I Principi Delle Dinamiche Di Produzione E Degradazione Di RNA Nelle Cellule Dei Mammiferi Nature Biotechnology. May, 2011 | Pubmed ID: 21516085 Preparazione Di Librerie Di Sequenziamento Del Bisolfuro Rappresentazione Ridotta Per La Profilatura a Metilazione Del DNA Del Genoma-scala Nature Protocols. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21412275 Analizzando E Riducendo Al Minimo La Distorsione Amplificazione PCR Nelle Librerie Di Sequenziamento Illumina Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21338519 Mappe Di Riferimento ES Umana E Variazione Delle Cellule IPS Abilitare La Caratterizzazione Di Alto-rendimento Delle Linee Di Cellule Pluripotenti Cell. Feb, 2011 | Pubmed ID: 21295703 Riprogrammazione Espressione Del Fattore Avvia Il Rimodellamento Della Cromatina Mirata Diffusa Cell Stem Cell. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21211784 Assemblee Di Alta Qualità Bozza Dei Genomi Dei Mammiferi Dai Dati Di Sequenza Massivamente Paralleli Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21187386 Confronto Dei Metodi Basati Sulla Sequenza Di Metilazione Del DNA Di Profilo E L'identificazione Delle Modifiche Epigenetiche Monoallelic Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852635 Quantitative Comparison of Genome-wide DNA Methylation Mapping Technologies Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852634 Sequenziamento Di RNA Specifico Strand Rivela Ampie Regolamentate Lunghe Trascrizioni Che Sono Conservate in Tutta La Specie Di Lievito Genome Biology. 2010 | Pubmed ID: 20796282 Completa Analisi Comparativa Dei Metodi Di Sequenziamento Di RNA Strand-specifici Nature Methods. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20711195 Mirate Esone Sequenziamento Di Selezione in Soluzione Ibrida Current Protocols in Human Genetics / Editorial Board, Jonathan L. Haines ... [et Al.]. Jul, 2010 | Pubmed ID: 20582916 Ab Initio Ricostruzione Di Cellule Specifiche Per Il Tipo Transcriptomes in Mouse Rivela La Struttura Multi-esonico Conservata Di LincRNAs Nature Biotechnology. May, 2010 | Pubmed ID: 20436462 Analisi Integrativa Del Transcriptome Melanoma Genome Research. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20179022 Mapping Di Metilazione DNA Genoma-scala Di Campioni Clinici a Singolo Nucleotide Risoluzione Nature Methods. Feb, 2010 | Pubmed ID: 20062050 ZBED6, Un Fattore Di Trascrizione Romanzo Derivato Da Una Trasposizione Del DNA Addomesticati Regola IGF2 Espressione E Muscolo Crescita PLoS Biology. Dec, 2009 | Pubmed ID: 20016685 Mirati Sequenziamento Next-generation Del Transcriptome Cancro Migliora La Rilevazione Di Varianti Di Sequenza E Trascrizioni Di Fusione Romanzo Genome Biology. 2009 | Pubmed ID: 19835606 Mappatura Completa Delle Interazioni a Lungo Raggio Rivela Pieghevoli Principi Del Genoma Umano Science (New York, N.Y.). Oct, 2009 | Pubmed ID: 19815776 ALLPATHS 2: Piccoli Genomi Assemblati Con Precisione E Con Elevata Continuità Da Brevi Letture Accoppiate Genome Biology. 2009 | Pubmed ID: 19796385 Sequenziamento Del Bisolfuro Di Alto-rendimento Nei Genomi Dei Mammiferi Methods (San Diego, Calif.). Jul, 2009 | Pubmed ID: 19442738 Ab Initio Costruzione Di Un Transcriptome Eucariotica Di Massicciamente Parallelo Sequenziamento Di MRNA Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19208812 Selezione Di Soluzione Ibrida Con Oligonucleotidi Lunghissima Per Massively Parallel Sequenziazione Mirata Nature Biotechnology. Feb, 2009 | Pubmed ID: 19182786 L'effetto Materno, Egoista Elemento Genetico Medea è Associato Un Trasposone Composito Tc1 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18621706 La Metilazione Del DNA Del Genoma-scala Mappe Di Pluripotenti E Cellule Differenziate Nature. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18600261 Il Genoma Di Tribolium Castaneum Da Modello Beetle E Pest Nature. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18362917 Scoperta Sistematica Di Motivi Normativi in Regioni Conservate Del Genoma Umano, Tra Cui Migliaia Di Siti Di CTCF Isolante Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2007 | Pubmed ID: 17442748 Approfondimenti Dal Genoma Del Biotrophic Fungine Pianta Patogeno Ustilago Maydis Nature. Nov, 2006 | Pubmed ID: 17080091 Ridotto Sequenziamento Del Bisolfuro Rappresentazione Per Analisi Comparativa Della Metilazione Del DNA Ad Alta Risoluzione Nucleic Acids Research. 2005 | Pubmed ID: 16224102 Sequenza Del DNA E L'analisi Del Cromosoma Umano 18 Nature. Sep, 2005 | Pubmed ID: 16177791 Valutare L'impatto Dei Dati Di Sequenza Genomica Comparativa Sull'annotazione Funzionale Del Genoma Della Drosofila Genome Biology. 2002 | Pubmed ID: 12537575 Hi-C: un metodo per studiare l'architettura tridimensionale dei genomi. Nynke L. van Berkum*1, Erez Lieberman-Aiden*2,3,4,5, Louise Williams*2, Maxim Imakaev6, Andreas Gnirke2, Leonid A. Mirny3,6, Job Dekker1, Eric S. Lander2,7,8 1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University, 5Department of Applied Mathematics, Harvard University, 6Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology, Harvard Medical School, 8Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology JoVE 1869 Biology
Hi-C: un metodo per studiare l'architettura tridimensionale dei genomi. Nynke L. van Berkum*1, Erez Lieberman-Aiden*2,3,4,5, Louise Williams*2, Maxim Imakaev6, Andreas Gnirke2, Leonid A. Mirny3,6, Job Dekker1, Eric S. Lander2,7,8 1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University, 5Department of Applied Mathematics, Harvard University, 6Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology, Harvard Medical School, 8Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology JoVE 1869 Biology