David Fenyo Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry Rockefeller University Biography Publications Institution JoVE Articles David Fenyo has not added a biography. If you are David Fenyo and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications The GPMDB REST Interface Bioinformatics (Oxford, England). Feb, 2015 | Pubmed ID: 25697819 Use of ENCODE Resources to Characterize Novel Proteoforms and Missing Proteins in the Human Proteome Journal of Proteome Research. Feb, 2015 | Pubmed ID: 25369122 Pathway Analysis and Transcriptomics Improve Protein Identification by Shotgun Proteomics from Samples Comprising Small Number of Cells--a Benchmarking Study BMC Genomics. 2014 | Pubmed ID: 25521637 A Robust Pipeline for Rapid Production of Versatile Nanobody Repertoires Nature Methods. Dec, 2014 | Pubmed ID: 25362362 Super-resolution Imaging Reveals That Loss of the C-terminus of Connexin43 Limits Microtubule Plus-end Capture and NaV1.5 Localization at the Intercalated Disc Cardiovascular Research. Nov, 2014 | Pubmed ID: 25139742 Ischemia in Tumors Induces Early and Sustained Phosphorylation Changes in Stress Kinase Pathways but Does Not Affect Global Protein Levels Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2014 | Pubmed ID: 24719451 Integrated Chromosome 19 Transcriptomic and Proteomic Data Sets Derived from Glioma Cancer Stem-cell Lines Journal of Proteome Research. Jan, 2014 | Pubmed ID: 24266786 Super-resolution Fluorescence Microscopy of the Cardiac Connexome Reveals Plakophilin-2 Inside the Connexin43 Plaque Cardiovascular Research. Nov, 2013 | Pubmed ID: 23929525 Developments in Biobanking Workflow Standardization Providing Sample Integrity and Stability Journal of Proteomics. Dec, 2013 | Pubmed ID: 23856607 Atypical and Classical Memory B Cells Produce Plasmodium Falciparum Neutralizing Antibodies The Journal of Experimental Medicine. Feb, 2013 | Pubmed ID: 23319701 A Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP) to Characterize the Sets of Proteins Encoded in Chromosome 17 Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23259914 Chromosome 19 Annotations with Disease Speciation: a First Report from the Global Research Consortium Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23249167 Comparative Proteomic Analysis of the ATP-sensitive K+ Channel Complex in Different Tissue Types Proteomics. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23197389 Strategy for Identifying Dendritic Cell-processed CD4+ T Cell Epitopes from the HIV Gag P24 Protein PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22860026 序列和结构趋同的广泛和烈性模仿 CD4 绑定的艾滋病毒抗体。 Science (New York, N.Y.). Sep, 2011 | Pubmed ID: 21764753 高容量离子阱耦合到飞行时间质谱计的全面链接扫描没有扫描的损失。 International Journal of Mass Spectrometry. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21516228 建模基于质谱技术的大规模蛋白质分析。 Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2011 | Pubmed ID: 21082431 建模蛋白质组学实验的设计。 Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835802 用质谱的蛋白定量。 Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835801 使用全球蛋白质组机的质谱蛋白质鉴定。 Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835799 亚洲大洋洲人类蛋白质组组织膜蛋白质组学倡议。制备和鉴定的标准碳酸洗膜。 Proteomics. Nov, 2010 | Pubmed ID: 20486120 杯杜松子酒议案显示复制叉级数是非常统一整个酵母基因组。 Molecular Systems Biology. 2010 | Pubmed ID: 20212525 实验室间研究定性基准液相色谱-质谱平台性能的酵母性能标准。 Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Feb, 2010 | Pubmed ID: 19858499 半胱氨酸丰富肽毒液成分快速敏感分析。 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19380747 四个组蛋白变体标记种锥体 Polycistronic 转录单位的边界。 Genes & Development. May, 2009 | Pubmed ID: 19369410 样品制备的比较使用稳定同位素标记的细胞培养中氨基酸的蛋白质组学变化的评价。 Journal of Proteome Research. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19140678 EphB 信号效应器 SILAC 使用线性离子阱 Orbitrap 质谱仪的筛查。 Journal of Proteome Research. Nov, 2008 | Pubmed ID: 18816084 验证的内源性多肽标识使用串联质谱数据的数据库。 Journal of Proteome Research. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18549260 磷酸化的磷酸肽质谱指纹的有效标识。 Analytical Chemistry. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18321079 噬菌体 T4 编码修改的大肠埃希氏大肠杆菌 RNA 聚合酶的快速分离与鉴定: 泛型方法研究噬菌体/主机交互。 Journal of Proteome Research. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18271525 DNA 梯用于重现蛋白质分馏的钠十二烷基硫酸盐-聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS) 的定量蛋白质组学。 Journal of Proteome Research. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18189343 信息学发展: 挑战和解决方案进行质谱质谱分析法。 Mass Spectrometry Reviews. Jan-Feb, 2008 | Pubmed ID: 17979143 一种自动的方法液相色谱-质谱数据进行扫描设置重大的多肽和蛋白质,包括量化分析和互动式的确认。 Journal of Proteome Research. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17559249 提高成功率的蛋白质组学分析的建模蛋白丰度分布和实验设计。 Nature Biotechnology. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17557102 Neuropeptidomics 战略具体和敏感识别的内源性多肽。 Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17401030 确定蛋白质鉴定数据集的整体优点: Rho 图和 Rho 得分。 Journal of Proteome Research. May, 2007 | Pubmed ID: 17397212 检测项目及肽中使用二维信号强度地图数据可视化的液相色谱/质谱法测定数据的修改。 Rapid Communications in Mass Spectrometry : RCM. 2006 | Pubmed ID: 16628601 基于 LC MS 蛋白质的鉴定的可重复性。 Journal of Experimental Botany. 2006 | Pubmed ID: 16551682 SwePep,为内源性多肽和质谱法设计一个数据库。 Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16501280 优化搜索条件大规模基于指纹识别的蛋白质。 Proteomics. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16485258 评价、 比较和准确基准公开提供几个 MS/MS 的搜索算法: 敏感性和特异性的分析。 Proteomics. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16047398 在复杂的混合物中的蛋白质鉴定。 Journal of Proteome Research. Mar-Apr, 2005 | Pubmed ID: 15822914 信号网络中超量表达鳞癌细胞的表皮生长因子受体酪氨酸。 Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Apr, 2005 | Pubmed ID: 15657067 找到蛋白质序列使用徘徊。 Current Protocols in Bioinformatics / Editoral Board, Andreas D. Baxevanis ... [et Al.]. Oct, 2004 | Pubmed ID: 18428719 这项研究的吸收、 分布、 代谢、 排泄和毒性蛋白质组学方法。 Journal of Biomolecular Techniques : JBT. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15585823 蛋白质鉴定结果作为函数的蛋白序列的数目的统计意义中搜索的结果。 Journal of Proteome Research. Sep-Oct, 2004 | Pubmed ID: 15473685 廉洁: 蛋白识别算法配上准确的统计意义的结果。 Journal of Proteome Research. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14998160 评估基于质谱技术的大规模蛋白标识,使用一般的评分方案的统计意义的一种方法。 Analytical Chemistry. Feb, 2003 | Pubmed ID: 12622365 一个模块化交联探索蛋白质相互作用的方法。 Journal of the American Chemical Society. Mar, 2003 | Pubmed ID: 12603129 蛋白质组学中的信息学和数据管理。 Trends in Biotechnology. Dec, 2002 | Pubmed ID: 12570158 一种模型的随机匹配大众和其使用自动化测试质谱蛋白质组学研究中的意义。 Proteomics. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11921442 雷达、 自动化蛋白质组质谱分析的生物信息学解决方案充分盖蛋白质鉴定和档案关系数据库中的数据。 Proteomics. Jan, 2002 | Pubmed ID: 11788990 MALDI样品制备:超薄层的方法 David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biology
MALDI样品制备:超薄层的方法 David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biology