Edward F. DeLong Division of Biological Engineering, Department of Civil and Environmental Engineering MIT - Massachusetts Institute of Technology Biography Publications Institution JoVE Articles Edward F. DeLong has not added a biography. If you are Edward F. DeLong and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Microbial Community Transcriptional Networks Are Conserved in Three Domains at Ocean Basin Scales Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2015 | Pubmed ID: 25775583 Genomic Potential for Nitrogen Assimilation in Uncultivated Members of Prochlorococcus from an Anoxic Marine Zone The ISME Journal. Feb, 2015 | Pubmed ID: 25700337 Microbial Eukaryote Diversity in the Marine Oxygen Minimum Zone off Northern Chile Frontiers in Microbiology. 2014 | Pubmed ID: 25389417 Oxygen at Nanomolar Levels Reversibly Suppresses Process Rates and Gene Expression in Anammox and Denitrification in the Oxygen Minimum Zone off Northern Chile MBio. 2014 | Pubmed ID: 25352619 Alien Invasions and Gut "island Biogeography" Cell. Oct, 2014 | Pubmed ID: 25303519 Reply to Schouten Et Al.: Marine Group II Planktonic Euryarchaeota Are Significant Contributors to Tetraether Lipids in the Ocean Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2014 | Pubmed ID: 25239231 Meeting Report: Ocean 'omics Science, Technology and Cyberinfrastructure: Current Challenges and Future Requirements (August 20-23, 2013) Standards in Genomic Sciences. Jun, 2014 | Pubmed ID: 25197495 Draft Genome Sequence of Marine Alphaproteobacterial Strain HIMB11, the First Cultivated Representative of a Unique Lineage Within the Roseobacter Clade Possessing an Unusually Small Genome Standards in Genomic Sciences. Jun, 2014 | Pubmed ID: 25197450 Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea: Sequencing a Myriad of Type Strains PLoS Biology. Aug, 2014 | Pubmed ID: 25093819 Ocean Microbes. Multispecies Diel Transcriptional Oscillations in Open Ocean Heterotrophic Bacterial Assemblages Science (New York, N.Y.). Jul, 2014 | Pubmed ID: 25013074 Planktonic Euryarchaeota Are a Significant Source of Archaeal Tetraether Lipids in the Ocean Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2014 | Pubmed ID: 24946804 Closely Related Phytoplankton Species Produce Similar Suites of Dissolved Organic Matter Frontiers in Microbiology. 2014 | Pubmed ID: 24748874 Functional Characterization of Flavobacteria Rhodopsins Reveals a Unique Class of Light-driven Chloride Pump in Bacteria Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. May, 2014 | Pubmed ID: 24706784 Single-cell Enabled Comparative Genomics of a Deep Ocean SAR11 Bathytype The ISME Journal. Jul, 2014 | Pubmed ID: 24451205 Distinct Dissolved Organic Matter Sources Induce Rapid Transcriptional Responses in Coexisting Populations of Prochlorococcus, Pelagibacter and the OM60 Clade Environmental Microbiology. Sep, 2014 | Pubmed ID: 24118765 Metagenomic Analysis of Size-fractionated Picoplankton in a Marine Oxygen Minimum Zone The ISME Journal. Jan, 2014 | Pubmed ID: 24030599 Metatranscriptomic and Functional Metagenomic Analysis of Methylphosphonate Utilization by Marine Bacteria Frontiers in Microbiology. 2013 | Pubmed ID: 24324460 Preface. Microbial Metagenomics, Metatranscriptomics, and Metaproteomics Methods in Enzymology. 2013 | Pubmed ID: 24060136 Pattern and Synchrony of Gene Expression Among Sympatric Marine Microbial Populations Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2013 | Pubmed ID: 23345438 Public Good Dynamics Drive Evolution of Iron Acquisition Strategies in Natural Bacterioplankton Populations Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Dec, 2012 | Pubmed ID: 23169633 Oxygen Minimum Zones Harbour Novel Viral Communities with Low Diversity Environmental Microbiology. Nov, 2012 | Pubmed ID: 23039259 Microbial Oceanography of Anoxic Oxygen Minimum Zones Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2012 | Pubmed ID: 22967509 Microbial Community Phylogenetic and Trait Diversity Declines with Depth in a Marine Oxygen Minimum Zone Ecology. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22919912 Experimental Incubations Elicit Profound Changes in Community Transcription in OMZ Bacterioplankton PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22615914 PhnY and PhnZ Comprise a New Oxidative Pathway for Enzymatic Cleavage of a Carbon-phosphorus Bond Journal of the American Chemical Society. May, 2012 | Pubmed ID: 22564006 Evolution. Microbial Evolution in the Wild Science (New York, N.Y.). Apr, 2012 | Pubmed ID: 22539708 Comparison of Large-insert, Small-insert and Pyrosequencing Libraries for Metagenomic Analysis The ISME Journal. Nov, 2012 | Pubmed ID: 22534608 深海水の改正に表面水の海洋微生物群集の転写応答 Environmental Microbiology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 21981709 永久的な海洋酸素極小ゾーンの微生物Metatranscriptomics Environmental Microbiology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 21210935 Draft Genome Sequence of Strain HIMB100, a Cultured Representative of the SAR116 Clade of Marine Alphaproteobacteria Standards in Genomic Sciences. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22675578 マリンPicocyanobacterium Prochlorococcus MIT9301によってホス活用 Environmental Microbiology. Oct, 2011 | Pubmed ID: 22004069 ダークオーシャンユビキタス細菌の系統のうちChemolithoautotrophyの可能性 Science (New York, N.Y.). Sep, 2011 | Pubmed ID: 21885783 Solemya軟口蓋の細胞内共生硫黄酸化遺伝子のMetatranscriptomic分析 Frontiers in Microbiology. 2011 | Pubmed ID: 21738524 自律収集、保存海洋BacterioplanktonのMetatranscriptomic分析 The ISME Journal. Dec, 2011 | Pubmed ID: 21716310 海洋フラボバクテリウムのプロテオロドプシン強化された成長に伴う光誘起転写反応 The ISME Journal. Oct, 2011 | Pubmed ID: 21472017 コミュニティトランスクリプトは、自然微生物群集におけるタンパク質配列保存のユニバーサルパターンを明らかに Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21426537 外洋の成層微生物群集の統合Metatranscriptomicとメタゲノム解析 The ISME Journal. Jun, 2011 | Pubmed ID: 21151004 "ゲノムプロキシ"マイクロアレイを用いたモントレー湾沿岸微生物ピコプランクトンの時系列分析 Environmental Microbiology. Jan, 2011 | Pubmed ID: 20695878 会議レポート:ISMB 2010でBioSharing Standards in Genomic Sciences. 2010 | Pubmed ID: 21304729 会議レポート:ISMB 2010でメタゲノミクス、メタデータおよびメタアナリシス(M3) Standards in Genomic Sciences. 2010 | Pubmed ID: 21304724 チリ沖酸素最小ゾーンウォーターズの謎めいた硫黄循環 Science (New York, N.Y.). Dec, 2010 | Pubmed ID: 21071631 微生物コミュニティのトランスクリプトームは、海の中の溶存有機物質の入れ替えに伴って発生する微生物と代謝経路を明らかに Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20807744 プロテオロドプシンは、タフ·タイムズの間に細菌の生存率を高める光駆動プロトンポンプ PLoS Biology. 2010 | Pubmed ID: 20436957 微生物MetatranscriptomicsのユニバーサルrRNAを減算プロトコルの開発と定量的分析 The ISME Journal. Jul, 2010 | Pubmed ID: 20220791 太平洋のCrenarchaeal AmoAの遺伝子と転写産物の存在量 Environmental Microbiology. Mar, 2010 | Pubmed ID: 20002133 機能的スクリーニングとメタゲノム解析によって明らかにされた海洋細菌に広く既知および新規ホスホン酸利用経路 Environmental Microbiology. Jan, 2010 | Pubmed ID: 19788654 Characterization of Canthaxanthin Biosynthesis Genes from an Uncultured Marine Bacterium Environmental Microbiology Reports. Dec, 2009 | Pubmed ID: 23765931 北太平洋亜熱帯循環の駅ALOHAで4000メートルの深さに置かれている微生物群集の比較メタゲノム解析 Applied and Environmental Microbiology. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19542347 Metatranscriptomicsは、オーシャンの水柱のユニークな微生物のsmall RNAを明らかに Nature. May, 2009 | Pubmed ID: 19444216 バイオームのゲノムから微生物オーシャン Nature. May, 2009 | Pubmed ID: 19444206 RRNAを標的DNAプローブを使用したモントレーベイ、カリフォルニア州沿岸に係留海洋Bacterioplanktonのリアルタイム、自律検知近く Environmental Microbiology. May, 2009 | Pubmed ID: 19210704 つの独立した分子的手法とアラスカのMesothermicの石油貯留層から生産水における微生物の多様性を特徴づける Environmental Microbiology. Jan, 2009 | Pubmed ID: 18771500 海洋微生物集団における組換え、クローン発散と環境のゲノムパターン The ISME Journal. Oct, 2008 | Pubmed ID: 18580971 微生物のエンジンは、そのドライブは地球の物質循環 Science (New York, N.Y.). May, 2008 | Pubmed ID: 18497287 北太平洋亜熱帯循環で4000 M鉛直プロファイルからリボソームDNA含有Bacterioplanktonゲノム断片の系統解析 Environmental Microbiology. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18494796 海洋表層水中の微生物群集の遺伝子発現 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18316740 海洋微生物群集のプロファイリングをするための "ゲノム·プロキシのマイクロアレイの設計とテスト Environmental Microbiology. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18028413 近代的な微生物の海の風景。フォワード Nature Reviews. Microbiology. Oct, 2007 | Pubmed ID: 19086145 Planctomyceteゲノムとナミビアとオレゴン州沿岸湧昇システムとその相互比較から新規海洋PlanctomycetesのFosmids The ISME Journal. Sep, 2007 | Pubmed ID: 18043661 熱帯海洋窒素固定シアノバクテリアの低ゲノム多様性 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17971441 微生物学。熱力学的エッジでの生活 Science (New York, N.Y.). Jul, 2007 | Pubmed ID: 17641187 モントレー湾と北太平洋亜熱帯循環の推定と古細菌の硝化の量的分布 Environmental Microbiology. May, 2007 | Pubmed ID: 17472632 プロテオロドプシン光化学遺伝子クラスターは、多様な海洋微生物の門の中で共進化のトレンドと共通の祖先を出展 Environmental Microbiology. Apr, 2007 | Pubmed ID: 17359257 未開マリンCrenarchaeote Cenarchaeum Symbiosumのゲノム解析 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2006 | Pubmed ID: 17114289 古細菌のpre-mRNAのスプライシング:ヘテロオリゴマースプライシングエンドヌクレアーゼへの接続 Biochemical and Biophysical Research Communications. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16781672 ディープ明らかの古ミステリー Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16618931 ゲノム諸島とProchlorococcusの生態と進化 Science (New York, N.Y.). Mar, 2006 | Pubmed ID: 16556843 炭素同化と海洋Crenarchaeotaの環境ゲノム解析による提案アンモニア酸化の経路 PLoS Biology. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16533068 海洋浮遊細菌と古細菌の間のプロテオロドプシン遺伝子水平転移 Nature. Feb, 2006 | Pubmed ID: 16482157 シックス·南極の海洋浮遊細菌からのDNA断片の比較ゲノム解析 Applied and Environmental Microbiology. Feb, 2006 | Pubmed ID: 16461708 オーシャンの内部の層状微生物群集の中でコミュニティゲノミクス Science (New York, N.Y.). Jan, 2006 | Pubmed ID: 16439655 微生物海洋学におけるゲノムの視点 Nature. Sep, 2005 | Pubmed ID: 16163343 メタゲノム解析は、マリンスポンジDiscodermia Dissolutaに関連付けられている微生物の多様なポリケチド合成酵素遺伝子群を明らかに Applied and Environmental Microbiology. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16085882 Crenarchaeaにおけるヒストン Journal of Bacteriology. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16030242 連続フローバイオリアクターにおける嫌気的メタン酸化古細菌、および硫酸還元菌の成長と個体群動態 Applied and Environmental Microbiology. Jul, 2005 | Pubmed ID: 16000782 海洋における微生物群集ゲノミクス Nature Reviews. Microbiology. Jun, 2005 | Pubmed ID: 15886695 微生物学。微生物の生命ディープブレス Science (New York, N.Y.). Dec, 2004 | Pubmed ID: 15622564 メタン生成を元に戻す:環境ゲノミクスと仮説をテストする Science (New York, N.Y.). Sep, 2004 | Pubmed ID: 15353801 異なるSAR86サブグループハーバー発散Proteorhodopsins Environmental Microbiology. Sep, 2004 | Pubmed ID: 15305915 微生物集団のゲノムとエコロジー:前方の道路 Environmental Microbiology. Sep, 2004 | Pubmed ID: 15305912 微生物学:野生型の再構築 Nature. Mar, 2004 | Pubmed ID: 14999264 プロテオロドプシン遺伝子は発散海洋細菌の分類群に分散されています Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2003 | Pubmed ID: 14566056 地中海とレッド海からの新規プロテオロドプシン変異体 Environmental Microbiology. Oct, 2003 | Pubmed ID: 14510837 メタン酸化古細菌に関連付けられているメチルコエンザイムM還元酵素A(MCRA)遺伝子の同定 Applied and Environmental Microbiology. Sep, 2003 | Pubmed ID: 12957937 連続フローバイオリアクターにおける嫌気性メタン酸化古細菌の生育およびメタン酸化速度 Applied and Environmental Microbiology. Sep, 2003 | Pubmed ID: 12957936 PsbA解析により明らかにされた海洋ピコプランクトンのうち、分子多様性 Environmental Microbiology. Mar, 2003 | Pubmed ID: 12588300 微生物学:パッケージ内のすべての Nature. Oct, 2002 | Pubmed ID: 12384680 微生物集団のゲノムとエコロジー Current Opinion in Microbiology. Oct, 2002 | Pubmed ID: 12354561 ディープからの電力 Nature Biotechnology. Aug, 2002 | Pubmed ID: 12148004 複数の古細菌グループは、無酸素冷湧水堆積物中のメタン酸化を仲介する Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. May, 2002 | Pubmed ID: 12032340 微生物システム科学に向けて:生物群系へのゲノムから、微生物の視点を統合する Environmental Microbiology. Jan, 2002 | Pubmed ID: 11966814 海洋酸素非発生型好気性Phototrophs〜における予想外の多様性 Nature. Feb, 2002 | Pubmed ID: 11832943 遠洋海洋細菌と古細菌の検出のための蛍光標識オリゴヌクレオチド及びポリヌクレオチドプローブとの比較 Applied and Environmental Microbiology. Feb, 2002 | Pubmed ID: 11823205 単一集団で、2つの異なる海洋県で古細菌遺伝子型変異体の比較ゲノム解析 Applied and Environmental Microbiology. Jan, 2002 | Pubmed ID: 11772643 メタゲノムライブラリの大規模スクリーン Vinh D. Pham1, Tsultrim Palden1, Edward F. DeLong1 1Division of Biological Engineering, Department of Civil and Environmental Engineering, MIT - Massachusetts Institute of Technology JoVE 201 Biology 自然と実験室での微生物群集 - インタビュー Edward F. DeLong1 1Division of Biological Engineering, Department of Civil and Environmental Engineering, MIT - Massachusetts Institute of Technology JoVE 202 Biology
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