John M. Coffin Department of Molecular Biology and Microbiology Tuffts University Biography Publications Institution JoVE Articles John M. Coffin has not added a biography. If you are John M. Coffin and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Replica Ristretta Di Xenotropico Murine Leukemia Virus Virus-correlate Nei Macachi Codino Journal of Virology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22238316 Caratterizzazione, Mappatura E La Distribuzione Dei Due Provirus Parentale XMRV Journal of Virology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22031947 Virus Di Leucemia Murina Endogeno: Rapporto XMRV E Sequenze Correlate Rilevati in Campioni Di DNA Umano Advances in Virology. 2011 | Pubmed ID: 22312358 Short-course Combivir Dopo Dose Singola Di Nevirapina Riduce Ma Non Elimina L'emergere Di Nevirapina Resistenza Nelle Donne Antiviral Therapy. Nov, 2011 | Pubmed ID: 22293443 Associazione Di Tva800 Più Di Una Molecola è Necessaria Per ASLV-A Voce Retrovirology. 2011 | Pubmed ID: 22099981 Identificazione, Caratterizzazione E Distribuzione Genomica Comparativa Del Gruppo Dei Retrovirus Endogeno Umano HERV-K (HML-2) Retrovirology. 2011 | Pubmed ID: 22067224 La Mancata Conferma XMRV/MLV Nel Sangue Dei Pazienti Con Sindrome Da Fatica Cronica: Uno Studio Multi-laboratory Science (New York, N.Y.). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21940862 Maggior Parte Delle Cellule T CD4 + Da Sangue Periferico Di Individui HIV-1-infected Contengono Soltanto Una Molecola Di DNA Di HIV Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21690402 Origine Ricombinante Di Retrovirus XMRV Science (New York, N.Y.). Jul, 2011 | Pubmed ID: 21628392 Ruolo Delle Varianti HIV-1 Bassa Frequenza Di Fallimento Della Terapia Antivirale Nevirapina Contenenti in Donne Precedentemente Esposti Alla Dose Singola Nevirapina Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. May, 2011 | Pubmed ID: 21576473 Stima Del Coefficiente Di Selezione Frequenza E Media Ricombinazione Efficace Per HIV Infezione Cronica Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21436045 Sequenze Clonale Recuperati Dal Plasma Di Pazienti Con Viremia Residua Di HIV-1 E Sulla Terapia Antiretrovirale Intensificato Sono Identici a Replica Virale RNAs Recuperato Da Riposa Cellule T CD4 + Circolanti Journal of Virology. May, 2011 | Pubmed ID: 21367910 Il Blood Xenotropic Murine Leukemia Virus-Related Virus Scientific Research Working Group: Missione, Progresso E Piani Transfusion. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21366602 Diversità Genetica Di Simian Immunodeficiency Virus Codifica HIV-1 Reverse Transcriptase Persiste Nei Macachi Nonostante La Terapia Antiretrovirale Journal of Virology. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21084490 Contaminazione Dei Campioni Di DNA Umani Con Mouse DNA Può Portare a False Rilevazione Delle Sequenze Simil-XMRV Retrovirology. 2010 | Pubmed ID: 21171973 Contaminazione Del DNA Del Mouse Nel Tessuto Umano Testato Per XMRV Retrovirology. 2010 | Pubmed ID: 21171966 HIV-1 Continua a Replicare E Si Evolvono in Pazienti Con Controllo Naturale Dell'infezione Da HIV Journal of Virology. Dec, 2010 | Pubmed ID: 20926564 L'effetto Di Intensificazione Di Raltegravir Sul Basso Livello Viremia Residua Nei Pazienti HIV-positivi in Terapia Antiretrovirale: Uno Studio Randomizzato Controllato PLoS Medicine. 2010 | Pubmed ID: 20711481 Schemi Di Ricombinazione Di Virus Dell'immunodeficienza Umana Di Tipo 1 Ex Vivo Forniscono La Prova Per Coadaptation Di Siti Distanti, Con Conseguente Purificazione Selezione Per Intersubtype Ricombinanti Durante La Replica Journal of Virology. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20504919 Comparison of PCR/clonazione Standard a Singolo Genome Sequencing Per L'analisi Delle Popolazioni Di HIV-1 Journal of Virological Methods. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20451557 I Tumori Indotti Nei Topi Da Inoculazione Diretta Del Plasmide DNA Che Esprime Sia Attivato H-ras E C-myc International Journal of Biological Sciences. 2010 | Pubmed ID: 20376206 Uso Flessibile Di Importazione Nucleare Percorsi Da HIV-1 Cell Host & Microbe. Mar, 2010 | Pubmed ID: 20227665 Antiretrovirale Intensificazione E Acido Valproico Mancanza Sostenuta Effetto Residuo Viremia HIV-1 O Infezione Di Cellule CD4 + a Riposo PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20186346 Multisito Adattamento in Presenza Di Ricombinazione Infrequenti Theoretical Population Biology. May, 2010 | Pubmed ID: 20149814 Varianti Inibitore-resistenti Di Bassa Frequenza Nonnucleoside Trascrittasi Inversa Contribuiscono Al Fallimento Dei Regimi Contenenti Efavirenz in Pazienti Trattamento Sperimentato The Journal of Infectious Diseases. Mar, 2010 | Pubmed ID: 20102272 Virus a RNA Non-Retrovirus Endogeno Elementi Nei Genomi Dei Mammiferi Nature. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20054395 Ottimizzazione Di PCR Allele-specific Utilizzando Sequenze Di Consenso Paziente-specifici Dell'HIV Per Disegno Dell'iniettore Journal of Virological Methods. Mar, 2010 | Pubmed ID: 19948190 Dinamiche Di Sottopopolazione RT-SHIV Nei Macachi Infettati Durante La Terapia Anti-HIV Retrovirology. 2009 | Pubmed ID: 19889213 Virologia. Un Nuovo Virus Per Le Vecchie Malattie? Science (New York, N.Y.). Oct, 2009 | Pubmed ID: 19815721 Persistente Viremia a Basso Livello in HIV-1 Controller D'elite E Il Rapporto Con I Parametri Immunologici The Journal of Infectious Diseases. Sep, 2009 | Pubmed ID: 19656066 Alta Efficienza Di HIV-1 Genomic RNA Imballaggio Eterozigote Formazione E Rivelata Dall'analisi Singolo Virione Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19628694 Probabile Ruolo Di Mutazioni APOBEC3G-mediata G-a-A in HIV-1 Evoluzione E Farmaco Resistenza PLoS Pathogens. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19343218 Semplificazione Del Regime Di Atazanavir-ritonavir Da Solo Come Terapia Antiretrovirale Manutenzione: Esiti Di Cliniche E Virologica 48-settimana Finale The Journal of Infectious Diseases. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19191590 Caricamento Granuli Litici Delle Cellule T CD8 + è Necessaria Per L'eliminazione Delle Cellule Infettate Da HIV Associato Controllo Immunitario Immunity. Dec, 2008 | Pubmed ID: 19062316 Attenuazione Di Mille Tagli The New England Journal of Medicine. Nov, 2008 | Pubmed ID: 19020330 Host-retrovirus Arms Race: Tagliare Il Bilancio Cell Host & Microbe. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18779045 Effetti Dei Retrovirus Sulla Funzione Del Genoma Ospite Annual Review of Genetics. 2008 | Pubmed ID: 18694346 Trascrittasi Inversa Di HIV-1 Connessione Sottodominio Mutazioni Riducono Il Degrado Del Modello RNA E Migliorano L'escissione AZT Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18667707 Acido Valproico Senza Terapia Antivirale Intensificata Ha Un Limitato Impatto Sulla Persistente Infezione Da HIV Di Cellule T CD4 + a Riposo AIDS (London, England). Jun, 2008 | Pubmed ID: 18525258 Interazioni Di Murino APOBEC3 E APOBEC3G Umane Con Virus Di Leucemia Murina Journal of Virology. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18448535 Basso Livello Viremia Persiste Per Almeno 7 Anni in Pazienti in Terapia Antiretrovirale Soppressiva Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18332425 Polimorfismo Frequente Presso I Siti Di Farmaco Resistenza in HIV-1 Proteasi E Della Trascrittasi Inversa AIDS (London, England). Feb, 2008 | Pubmed ID: 18301062 Oncogenicità Del DNA in Vivo: Induzione Di Tumore Con I Plasmidi Di Espressione Per Attivato H-ras E C-myc Biologicals : Journal of the International Association of Biological Standardization. May, 2008 | Pubmed ID: 18218323 Ruolo Di APOBEC3 Nella Diversità Genetica Tra Virus Della Leucemia Murina Endogeno PLoS Genetics. Oct, 2007 | Pubmed ID: 17967065 Upregulation Di CTLA-4 Da Parte Delle Cellule T CD4 + Specifiche Per L'HIV Correla Con La Progressione Della Malattia E Definisce Una Reversibile Disfunzione Immunitaria Nature Immunology. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17906628 Soppressione Della Viremia E L'evoluzione Del Virus Dell'immunodeficienza Umana Tipo 1 Resistenza Ai Farmaci in Un Modello Di Macaco Per Terapia Antiretrovirale Journal of Virology. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17855539 ARTE Sopprime Plasma HIV-1 RNA Per Un Punto Stabile Di Set Previsto Da Viremia Pretherapy PLoS Pathogens. Apr, 2007 | Pubmed ID: 17411338 Le Mutazioni Nel Dominio Di Connessione Delle Trascrittasi Inversa Di HIV-1 Aumentano 3 '-gruppi - 3'-timidina Resistenza Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2007 | Pubmed ID: 17179211 Cieco, Multicentrico Di Confronto Dei Metodi Per Rilevare Un Farmaco-resistente Mutante Del Virus Dell'immunodeficienza Umana Di Tipo 1 a Bassa Frequenza Journal of Clinical Microbiology. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16825395 Selezione E Persistenza Del Non-nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitor-resistente in Pazienti Avvio E Arresto Non Nucleosidici Terapia Del HIV-1 AIDS (London, England). Mar, 2006 | Pubmed ID: 16514300 Evoluzione Della Gamma Ampia in Retroviruses Conduce Alla Morte Delle Cellule Mediata Da Varianti Altamente Citopatici Journal of Virology. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16378958 Umani Endogeni Retrovirali Elementi Come Indicatori Di Eventi Di Ricombinazione Ectopica Nel Genoma Del Primate Genetics. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16157677 Deplezione Di Latente Infezione HIV-1 in Vivo: Uno Studio Di Proof-of-concept Lancet. Aug 13-19, 2005 | Pubmed ID: 16099290 Caratterizzazione Di Hortulanus Virus Della Leucemia Murina Endogena, Un Provirus Endogeno Che Codifica Un Virus Infettivo Leucemia Murina Di Un Sottogruppo Di Romanzo Journal of Virology. Jul, 2005 | Pubmed ID: 15956577 Preferenze Base Simmetriche Che Circonda L'HIV-1, Sarcoma/leucosi Aviaria Virus E Siti Di Integrazione Virus Murino Di Leucemia Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2005 | Pubmed ID: 15802467 Meccanismo Per L'abrogazione Di Analogico-mediata Nucleosidici Della Replicazione Dell'HIV-1: Equilibrio Tra Attività RNasi H E L'escissione Nucleotidica Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15684061 Relazione Tra Selezione Del Sito DNA-integrazione Retrovirale E Trascrizione Cellula Ospitante Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15659548 Collegato Virus Dell'immunodeficienza Umana Di Tipo 1 Droga Resistenza Multipla Mutazioni in Pazienti Con Esperienza Di Trattamento Sono Mancate Da Analisi Del Genotipo Standard Journal of Clinical Microbiology. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15635002 Caratterizzazione in Vitro Di Una Chimera Di Virus (HIV) Immunodeficiency Virus Umano Dell'immunodeficienza Delle Scimmie Esprimendo La Trascrittasi Inversa Di HIV Tipo 1 Per Studiare La Resistenza Antivirale Nei Macachi Pigtail Journal of Virology. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15564466 Evoluzione Dei Retrovirus: Fossili Nel Nostro DNA Proceedings of the American Philosophical Society. Sep, 2004 | Pubmed ID: 15551500 Single-strand Specificità Dei Conti Di APOBEC3G Per Deaminazione Minus-filamento Del Genoma Dell'HIV Nature Structural & Molecular Biology. May, 2004 | Pubmed ID: 15098018 Formazione Solista-LTR Retrovirus Endogeno Umano K E Polimorfismi Inserzionale: Implicazioni Per L'evoluzione Umana E Virale Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2004 | Pubmed ID: 14757818 Le Infezioni Di HIV-1 E Doppia Infezione Attraverso Percorsi Diretti E Cellulo-mediata Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2004 | Pubmed ID: 14707263 Nuovo in Tempo Reale Trascrittasi Inversa-avviato PCR Test Con Sensibilità Singola Copia Per Virus Dell'immunodeficienza Umana Di Tipo 1 RNA Nel Plasma Journal of Clinical Microbiology. Oct, 2003 | Pubmed ID: 14532178 Virologia. Armi Di Distruzione Di Mutational Science (New York, N.Y.). Aug, 2003 | Pubmed ID: 12920286 Meccanismi Di Estensione Di Gamma Avian Host Retrovirale Journal of Virology. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12767991 L'onda Solitaria Dell'evoluzione Asessuata Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2003 | Pubmed ID: 12525686 Un Elemento Correlati a Retrovirus Endogeno Romanzo Nel Genoma Umano Assomiglia a Una Trasposone DNA: Prove Per Un Collegamento Evolutivo? Genomics. Nov, 2002 | Pubmed ID: 12408960 Proposte Alternative Per L'utilizzo Di Farmaci Anti-HIV: è Opportuno? Drug Resistance Updates : Reviews and Commentaries in Antimicrobial and Anticancer Chemotherapy. Feb, 1999 | Pubmed ID: 11504471 Amplificazione e quantificazione di HIV-1 RNA in soggetti affetti da HIV con una carica virale inferiore il limite di rilevamento da parte di Standard saggi clinici Helene Mens1, Mary Kearney1, Ann Wiegand1, Jonathan Spindler1, Frank Maldarelli1, John W. Mellors2, John M. Coffin3 1The virology Core at the HIV Drug Resistance Program, NCI-Frederick, 2Division of Infectious Diseases, University of Pittsburgh, 3Department of Molecular Biology and Microbiology, Tuffts University JoVE 2960 Immunology and Infection
Amplificazione e quantificazione di HIV-1 RNA in soggetti affetti da HIV con una carica virale inferiore il limite di rilevamento da parte di Standard saggi clinici Helene Mens1, Mary Kearney1, Ann Wiegand1, Jonathan Spindler1, Frank Maldarelli1, John W. Mellors2, John M. Coffin3 1The virology Core at the HIV Drug Resistance Program, NCI-Frederick, 2Division of Infectious Diseases, University of Pittsburgh, 3Department of Molecular Biology and Microbiology, Tuffts University JoVE 2960 Immunology and Infection