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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
在这里, 我们提出了一个协议, 以显示如何实现细胞 photoconversion 是通过紫外线照射到特定区域表达荧光蛋白, Eos, 在活体动物。
动物和植物组织由细胞的不同的人口组成。这些细胞随着时间的推移相互作用, 以建立和维持组织, 并可能导致疾病时中断。科学家们通过在细胞子集中表达荧光蛋白, 开发出巧妙的技术来研究这些细胞在完整组织中的特性和自然动力学。然而, 有时, 实验需要更多的细胞在组织内的可视化, 有时候是在单细胞或细胞群的方式。为了实现这一目标, 并在细胞中显示单个细胞, 科学家们利用了荧光蛋白的单细胞 photoconversion。为了演示这项技术, 我们在这里展示了如何将紫外线照射到一个在完整的、活的斑马鱼身上表达出感兴趣的 Eos 细胞。然后, 我们在24小时后对那些 photoconverted Eos+单元格进行映像, 以确定它们在组织中的变化。我们描述了两种技术: 单细胞 photoconversion 和 photoconversions 的细胞群。这些技术可用于可视化细胞相互作用, 细胞命运和分化, 细胞迁移, 使其成为一种技术, 适用于许多生物学问题。
多个不同的细胞相互作用, 建立和维持复杂的动物和植物组织。这些细胞往往是夹层和难以区分与邻居在一个单一的细胞水平没有高分辨率显微镜, 需要固定的组织。然而, 要了解这些组织是如何形成的, 如何保持, 并成为病态, 就必须研究组织内的单个细胞在一段时间内是如何相互作用的。理想情况下, 这些实验要求在不需要固定的情况下, 用非侵入性的方式对组织内的单个细胞进行标记。科学家们现在已经开发了许多技术来完成这个任务1,2,3,4。
水母绿色荧光蛋白 (GFP) 的发现和实施是一种令人兴奋的方法, 允许在组织环境1中标记不同的细胞。使用特定于单元格的启动器, 可以从遗传学上选择标记为1的单元格子集。或者, 病毒诱导的 gfp 表达可以用于 gfp3,4的用户选择的表达式。虽然很有用, 基因介导的 GFP 表达不允许用户选择的表达在组织中的细胞子集;和病毒表达的 GFP, 虽然有利, 可侵入。随着 GFP 衍生物的出现和像 Brainbow 这样的巧妙的技术, 在组织中表达出不同的荧光蛋白更稀少, 它已经成为可能的可视化单个细胞和它们之间的相互作用在复杂的组织2,5. 但是, 这些方法以随机方式标记单元格。如果所需的实验需要对实验者定义的单个细胞或细胞的数量进行可视化, 那么它们是有限的。通过这样的实验 , 有一个基因表达的荧光蛋白 , 可以纵 , 以区别 , 在一个单一的细胞的方式 , 它从其他荧光和非荧光细胞 , 这将是有利的。
为了实现这一目标, 并可视化一个复杂的活体组织内单细胞生物学, 科学界使用的单一细胞 photoconversion 的独特的荧光蛋白6,7,8。使用 photoconvertible 蛋白的基因控制表达 (即, eos, 枫等), 当暴露于紫外线 (488 nm) 光时, 从绿色到红色荧光状态过渡, 我们可以区分单个细胞与它的荧光标记邻居6,7,8。这种方法利用连接到我们共焦显微镜的仪器, 它可以将激光栈中的光定向到感兴趣的衍射有限区域。使用此技术, 我们可以用用户定义的方式 (9、10、11) 来标记单个单元格或更大的填充。这项技术是微创与单细胞注射的病毒 GFP。作为概念的证明, 我们表明, 我们可以 photoconvert 在神经节内的单个细胞在周围神经系统和 photoconvert 更大的人群, 如位于脊髓腹侧的细胞9,10, 11,12。然后, 我们可以想象这些 photoconverted 细胞群24小时后, 以了解他们的运动和分化过程中的发展。
所有动物研究都是由圣母大学机构动物保育和使用委员会批准的。
1. 斑马鱼标本的制备
2. 显微镜安装和预转换成像
3. 单细胞 Photoconversion
4. photoconversion 后成像
Photoconversion 荧光蛋白可用于标记组织中的不同细胞6。为了证明这一点, Tg (sox10: eos)鱼9被用来表达 photoconvertible 蛋白 eos 下的调节序列sox10。Tg (sox10: eos)动物在 48 hpf 第一次安装, 然后成像, 以检测任何可能发生的非特定 photoconversion。然后, 将 eos 未转换的荧光信号与小 Eos photoconverted 荧光信号进行可视化 (图 10)。动物被保存在黑暗中, 以确保非特定的 photoconversion 是最小的。然后, 利用共焦显微镜的建立, 将感兴趣的区域暴露在紫外线照射下。为了确认单个细胞由于紫外线照射而 photoconverted, 我们采取了跨越 photoconverted 地区的 z 栈。与成功的 photoconversion 一致的是, 在感兴趣的区域之外没有被转换的 eos 的发现, 并且 photoconverted eos 在感兴趣的区域清楚地存在。由此产生的图像显示一个神经节内的单个单元格, 它的标记肯定来自其邻居 (图 10)。
为了证明这种 photoconversion 技术的实用性, 细胞的数量也暴露在紫外线照射下。在这个范例中, 拍摄了预 photoconversion 图像, 没有 photoconverted 的 Eos 信号存在。其次, 脊髓的腹侧被暴露在紫外线下使用一条线 (图 11)。为了确认成功的 photoconversion, photoconversion 后的图像被采取, 并在腹脊髓细胞 photoconverted Eos 在我们绘制的兴趣线的位置可视化 (图 11)。非 photoconverted Eos 信号在所有其他区域都可见。为了扩展这种技术, 我们在 photoconversion 24 小时后拍摄了相同的图像。在这些图像中, photoconverted Eos+细胞被看到散落在脊髓区域的背部和腹部位置 (图 12)。这些数据符合假设, 即腹侧脊柱细胞重新定位到背部的位置, 如前所述的10。这两种技术结合在一起, 证明了 Eos 的 photoconversion 可以用来在一个组织区域内以用户定义的方式来可视化单个细胞或细胞的数量。这有助于更好地理解细胞迁移、通讯和动力学等细胞特性。

图 1: 捕获和焦点窗口.屏幕截图的软件描绘的位置捕获和焦点窗口和实验室特定的 "鱼消融全芯片" 下拉标签。看到红色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 2: c488 激光参数.捕获窗口的截图, 显示 c488 激光器的特定参数。曝光率为300毫秒, 激光功率为5。强化是75。看到红色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 3: Photoconversion 激光参数."焦点" 窗口中 "photomanipulation" 选项卡的屏幕快照, 概述了 photoconversion 所需的特定激光设置。Laserstack 功率为2。双击 "大小" 为4。光栅块大小为1。看到红色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 4: 高级 Photoconversion 激光参数.捕获窗口中高级激光设置的截图。这将使用 "photomanipulation" 选项卡打开到 "捕获首选项" 窗口。双击重复设置为2。看到红色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 5: 预转换成像参数.屏幕截图的焦点和捕捉窗口。突出显示预转换图像所需的捕获窗口特定参数。捕获设置为 "鱼映像"。在捕获类型下检查3D 框。和3D 捕获设置指定为;范围为 35, 平面数为 36, 步长为 1, 偏移量为-15。还选择了 "当前位置" 和 "当前范围" 框。看到红色的盒子。描述如何在 "捕获" 窗口 (左) 上选择单个或多个点, 以及如何在焦点窗口 (右) 上选择单个点。看到绿色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 6: 打开 Photoconversion 窗口.根据先前设置的参数选择了描述 timelapse 捕获类型的截图。看到红色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 7: 设置 Photoconversion.显示 "圆" 工具 (顶部) 位置和显示 (右) 的捕获控制窗口的屏幕截图。看到红色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 8: 单单元格 Photoconversion.屏幕截图, 描绘了圆圈 photoconversion 工具的使用和右击下拉菜单。"酶所有区域" 转换操作位于右击下拉菜单中。看到红色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 9: 后 Photoconversion c561Laser 参数.捕获窗口的截图, 显示 c561 激光器的特定参数。曝光率为500毫秒, 激光功率为10。强化是75。看到红色的盒子。请单击此处查看此图的较大版本.

图 10: 单单元格 Photoconversion.(A). Tg (sox10: eos)斑马鱼的示意图和共聚焦 z 投影在 48 hpf 显示在 photoconversion 前周围神经系统的背根神经节。虚线表示根背节脊髓进入的近似位置。(B). Tg (sox10: eos)斑马鱼的示意图和共聚焦 z 投影在 48 hpf 显示 photoconversion 期间周围神经系统的背根神经节。虚线表示背根脊柱脊髓进入。黄色圆圈表示转换站点和照明螺栓表示 UV 光曝光。(C). Tg (sox10: eos)斑马鱼的示意图和共聚焦 z 投影在 48 hpf 显示 photoconversion 后周围神经系统的背根神经节。虚线表示背根脊柱脊髓进入。CNS 是中枢神经系统的简称, 而三七总苷是周围神经系统的简称 (-c)。缩放条等于 10 um。请单击此处查看此图的较大版本.

图 11: 在较大的脊髓区域 Photoconversion 过程.(A). Tg (sox10: eos)斑马鱼的示意图和共聚焦 z 投影在 48 hpf 显示在 photoconversion 前脊髓腹区的 OPCs 和背根神经节。虚线表示脊髓背侧区域。(B). Tg (sox10: eos)斑马鱼的示意图和共聚焦 z 投影 48 hpf 显示 photoconversion 期间脊髓腹区的 OPCs 和背根神经节。实心黄线表示 photoconversion 的选定区域。虚线表示脊髓背侧区域。(C). Tg (sox10: eos)斑马鱼的示意图和共聚焦 z 投影在 48 hpf 显示 photoconversion 后脊髓腹区的 OPCs 和背根神经节。虚线表示脊髓的背侧区域。缩放条等于 10 um。

图 12: 细胞跟踪和可视化后 photoconversion.(A). Tg (sox10: eos)的示意图 48 hpf 的斑马鱼脊髓, 显示 photoconversion 后脊髓腹区 OPCs 和背根神经节。闪电指示 UV 光转换。(B). Tg (sox10: eos)斑马鱼脊髓的共聚焦 z 投影 48 hpf 开始于 photoconversion 后脊髓腹区的 OPCs 和背根神经节。闪电指示 UV 光转换。缩放条等于 10 um。
作者没有什么可透露的。
在这里, 我们提出了一个协议, 以显示如何实现细胞 photoconversion 是通过紫外线照射到特定区域表达荧光蛋白, Eos, 在活体动物。
我们感谢伯纳德 Kulemaka 和史密斯实验室的成员为他们提供有用的评论和试剂指导, Sam 康奈尔和布伦特. 雷德福3i 的成像问题和黛博拉砰, 凯伦注意和凯斯图尔特为斑马鱼护理。这项工作得到了圣母大学、伊丽莎白和迈克尔?加拉格尔家族的支持, 在巴黎圣母院, 圣母大学斑马鱼研究中心, 圣母大学的干细胞和再生医学中心。圣母.所有动物研究都是按照圣母大学 IACUC 博士的要求进行的。
| Tg(sox10:eos)斑马鱼动物 | 鱼是从圣母大学的鱼类设施中获得并杂交 | ||
| 100 X 15 毫米培养皿 | VWR | 25384-302 | |
| 培养基 | 胚胎培养基每周制备一次,由圣母大学的鱼类设施提供,含有 5 L RO 水、30 μL 亚甲蓝和 200 mL 盐原液。 | ||
| 0.8% 低熔点琼脂糖 | dot Scientific Inc | 9012-36-6 | |
| 35 X 10 mm 玻璃盖玻片底部培养皿 | Ted Pella, Inc. | 14021-20 | |
| 针式解剖探针 | |||
| 0.002% 3-氨基苯甲酸酯(三卡因) | Fluka 分析 | 型A5040-250G | |
| 荧光解剖显微镜,带 GFP 滤光片 | 的激光器Zeiss Axiozoom | ||
| 共聚焦显微镜,带激光器激发 GFP 和 RFP 滤光片组 | 3i 转盘共聚焦 | ||
| 用于光转换的紫外光源(激光) | 405 nm 激光 | ||
| Slidebook 软件 | 3i | ||
| 亚甲蓝 | Kordon |