2014年1月10日
本文描述了一种用于保存睾丸生殖细胞三维染色质结构的方法,该方法被称为三维(3D)载片法。该技术可提高亚核结构检测的灵敏度,适用于免疫荧光、DNA和RNA荧光检测。 原位 杂交(FISH)
这种三维载玻片制备方法可保留细胞的三维染色质结构,已在小鼠睾丸生殖细胞中得到验证。首先,对曲细精管进行通透处理,以去除细胞质成分并提高染色试剂(如抗体和FISH探针)的可及性。固定细胞核材料后,使用镊子机械解离生殖细胞,并将样本滴加至载玻片上。
接下来,当对三维切片样本进行战略性应用时,需获取多个Z轴层面的数据,以完整覆盖细胞核的三维结构。利用COT技术,一种RNA FISH方法可显示细胞核内的新生RNA,从而检测细胞核中转录活跃的区域。我在麻省总医院基因实验室工作期间开发了该方法。
当时,我优化了用于棉花RNA荧光原位杂交(fluorescent in situ hybridization,简称FISH)以检测新生RNA的载玻片制备方法。棉花探针可与内含子及转座序列(tls)中的重复序列杂交,从而可视化活跃转录位点。棉花RNA FISH需要保持细胞核内RNA分布的完整性。
该右侧制备方法的关键在于,透化步骤必须在固定步骤之前进行。为了去除细胞质背景,将破裂的睾丸中的曲细精管在冰上用 PBS 分离,然后将数段长度为 5 至 10 毫米的曲细精管转移至含有 0.5% Triton X-100 的 500 微升 CSK 缓冲液中,在冰上孵育 6 分钟。随后,将所有曲细精管转移至四孔板中一个孔内的 4% PFA-PBS 溶液中,在室温下孵育 10 分钟。
接下来,在室温下将所有小管在 PBS 中孵育五分钟。孵育期间,在玻璃载玻片背面安装好细胞离心涂片装置和细胞离心涂片室,将所有小管转移至 30 µL PBS 中。然后用两把镊子的尖端将小管撕成碎片。
用两把镊子的尖端夹住小管,水平方向剪切小管。加入30 µL PBS后,通过移液混匀悬浮液,然后将其转移至微量离心管中,并加入PBS至总体积为1.3 mL。现在将100 µL悬浮液分别加入每个细胞离心涂片仪腔室中。Cyto。
在室温下以2000 RPM转速离心样品10分钟。使用含有PBS的共聚焦染色缸,在室温下将载玻片在实验台上干燥几分钟。在室温下洗涤载玻片5分钟。
然后将载玻片转移至70%乙醇中,至少孵育两分钟。在20微升反应体系中加入100纳克捕获的1D NA探针、20毫摩尔的核糖核苷酸钒酸盐复合物以及杂交缓冲液。使用PCR仪,在80摄氏度孵育10分钟,随后进行预退火。
在42摄氏度下静置,直至准备使用。随后依次将载玻片在80%乙醇中脱水两分钟,再在100%乙醇中脱水两分钟。在室温下于实验台上将载玻片完全晾干。
现在将载玻片置于42摄氏度的尖端盒室中。接着,短暂离心预热的探针,并直接用移液器将其加到脱水的载玻片上。轻轻盖上盖玻片,于42摄氏度下进行至少六小时的杂交步骤。
将 Coplan 瓶中的洗涤液置于水浴中,使用刀片在 42 摄氏度下预热 30 分钟,从载玻片边缘小心移除盖玻片,避免刮伤样本,随后将载玻片依次浸入洗涤液中,每瓶浸泡五分钟。首先放入第一瓶 Coplan 瓶(含 2×SSC 和 50% 甲酰胺),接着放入第二瓶 Coplan 瓶(含 2×SSC 和 50% 甲酰胺),最后放入两个含 2×SSC 的 Coplan 瓶中。
然后向样本中加入 20 µL DPI 封片剂,并盖上盖玻片。轻轻按压盖玻片,并用擦拭纸吸去多余的封片剂。本实验采用了一种 RNA FISH 技术,可同时检测新生转录产物以及定位于 XY 小体的蛋白质的免疫组织化学染色。
在此PACU中,精母细胞检测到异染色质蛋白CCB X1以及组蛋白变体H2A X的磷酸化形式位于XY小体上。经低渗溶液处理的表面铺展样本中,所得到的FISH结果显示信号在常染色质区域聚集。三维染色质结构被破坏,所有减数分裂染色体轴均可在单个Z平面内被捕获。
然而,3D 载玻片制备方法可在后续操作中保持完整的染色质结构。这种正确的制备方法适用于免疫荧光、DNA 和 RNA FISH 检测,以及这些检测方法的联合使用。
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本文介绍了一种新型的三维(3D)载玻片制备方法,该方法可保持睾丸生殖细胞的染色质结构。该方法提高了检测核内结构的灵敏度,适用于多种荧光技术。
保持天然染色质结构可实现对生殖细胞模型中转录活性和细胞核组织的准确评估。该方法通过在分化过程中维持DNA、RNA和蛋白质复合物之间的空间关系,支持靶点验证。它为早期发现工作流程中的机制性风险降低提供了可重复的平台。
该方法通过在生殖细胞模型中保持染色质结构,从而整合到发现生物学工作流程中,用于假设检验和通路阐明。