2015年12月23日
这是一种快速且成本效益高的方案,用于表达分泌型糖基化哺乳动物蛋白,并通过单步纯化获得足量均一的蛋白,适用于X射线晶体学及其他生物物理研究。
该哺乳动物蛋白表达技术的总体目标是生产出适合进行结构、生物物理和功能研究的、呈天然折叠状态的毫克级蛋白质。该技术的主要优势在于,它是一种快速且简便的方案,可用于获得分泌型哺乳动物蛋白,并达到结构研究所需的纯度和浓度。通常我们发现,蛋白产量方面的问题大多与细胞的健康状况和存活率有关。
通过密切监测细胞活力以及培养基中的糖含量,可显著提高蛋白产量并延长细胞的使用时间。监测细胞密度也非常重要。我们发现,如果在转染前任何时刻细胞密度超过每毫升200万个细胞,则蛋白产量将显著降低。进行293F细胞的大规模培养时,需在1升293F培养基中添加10毫升100倍浓度的谷氨酰胺和5毫升100倍浓度的青霉素-链霉素。
在无血清条件下,抗生素的浓度已足够高,而降低抗生素浓度可在转染过程中提高细胞存活率,从而提升蛋白表达量。转染前一天,在标准组织培养孵育箱中,将 293F 细胞以 300 毫升培养基接种于 1 升聚碳酸酯带挡板锥形瓶(带通气盖)中,于 37°C、8% 二氧化碳条件下振荡培养。转染当天,将细胞稀释至密度为每毫升 50 万个细胞。通过向培养基中添加占总体积 10% 的 2%(重量/体积)Cell Boost(293F 培养基中),补充培养体系。
在此步骤中加入卡夫(kafu)以控制蛋白质糖基化。在无血清培养基中制备DNA和转染试剂溶液,孵育5分钟。接着,将转染试剂以1毫升为增量逐次加入DNA溶液中,并充分混匀。
室温下轻轻孵育30分钟,使试剂与DNA复合物形成。然后将溶液逐滴加入细胞中,转染后的细胞表达蛋白72至96小时,以纯化糖蛋白。首先将培养液倾入离心瓶中,在1300 ×g条件下离心20分钟,使细胞沉淀。收集上清液,如有必要,可再次离心,或使用0.22微米滤膜过滤,以澄清上清液。
接下来,加入10%体积的10×镍-硝酸盐上样、三乙酸或镍-NTA结合缓冲液。然后在4°C条件下,将2毫升镍-NTA悬浊液加入层析柱中,制备重力柱,并用10个柱体积的1×结合缓冲液在4°C下进行平衡。将上清液流经树脂,并收集穿流组分。
将上清液流穿液加入柱子后,用10个柱体积的洗涤缓冲液洗涤。然后用5个柱体积的洗脱缓冲液洗脱蛋白。如果需要进行去糖基化处理且最终体积为0.5毫升,则使用离心浓缩器将EIT浓缩至0.43毫升,并在16,000 ×g、4°C条件下离心,沉淀任何杂质。
然后加入 50 微升 500 毫摩尔的柠檬酸钠(pH 5.5)和 20 微升内切酶 HF。将混合物在室温下孵育两小时以去除内切酶 HF,首先用磷酸盐缓冲液洗涤淀粉树脂三次。将蛋白质与洗涤后的树脂在 4 摄氏度下孵育一小时。
孵育后,在1000 × g下离心5分钟,使树脂沉淀,收集上清液。使用适当截留分子量的离心过滤装置,将蛋白质浓缩并置换至所示储存缓冲液中。以下是经镍亲和层析纯化后,氯霉素处理细胞中表达的分泌蛋白的代表性SDS-PAGE结果。
第一泳道为去糖基化前的蛋白质,第二泳道为经Endo HF酶切去糖基化后的蛋白质。糖基化蛋白的迁移位置约高出10千道尔顿,去糖基化后则坍缩为单一蛋白条带,其分子量与预测值一致,且仅经过一步纯化。结晶筛选采用悬滴法进行。
上方图像显示初始的晶体初筛结果,下方图像显示优化后的结晶条件。这表明目标蛋白的生物化学均一性可能是决定结晶成功的关键因素,而优化的哺乳动物表达系统能够产生适合结晶的蛋白质。经镍柱纯化的蛋白可进一步通过尺寸排阻色谱法进行纯化。
这一步骤对于评估蛋白质表达水平以及优化条件以获得正确折叠的蛋白质也具有重要意义。目标蛋白质应为层析洗脱液中的主要组分,且其洗脱体积应与该蛋白质的分子量相符。较早的洗脱时间可能提示蛋白质发生聚集或错误折叠。掌握此方法后,可有效进行相关分析。
如果操作得当,该技术可在四天内完成。在进行此操作过程中,保持细胞培养的无菌条件至关重要。在完成此操作后,还可采用其他方法,如尺寸排阻色谱法、多角度光散射、差示扫描量热法和荧光测定法,以评估蛋白质的寡聚状态及其热稳定性。
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本方案概述了一种快速且成本效益高的方法,用于生产分泌型糖基化哺乳动物蛋白。该方法强调了细胞健康状况和培养条件监测的重要性,以获得适用于结构研究的高产量蛋白。
天然折叠的哺乳动物糖蛋白的快速、可扩展生产是早期药物发现中结构生物学和生物物理表征的关键瓶颈。本方案可实现分泌蛋白的高效生成及单步纯化,直接支持基于结构的药物设计和作用机制去风险化。简化的实验流程降低了时间和成本障碍,加快了从靶点验证到先导化合物鉴定的进程。
该方法整合了早期发现与先导物鉴定之间的界面,为结构、生物物理和功能研究流程提供高质量的蛋白质试剂。