2019年5月14日
本文介绍了一种整合性工作流程,用于鉴定循环肿瘤细胞(CTCs)的表型和分子特征。我们将活细胞免疫染色与单个及成簇CTCs的机器人显微操作相结合,并利用基于单细胞的技术进行后续分析,评估其定植转移的能力。
该方案具有重要意义,因为它能够从混合细胞群体中检测并分离单个细胞,进而实现单细胞分辨率的下游分析。该技术的主要优势在于能够将循环肿瘤细胞(CTCs)从血细胞中单独分离出来,适用于多种需要高纯度样本的分析。首先启动显微操作仪软件,然后打开显微操作仪。
将显微操作仪连接至计算机,点击“连接并初始化设备”以在显微镜载物台上初始化机械臂。每次操作设备后,均需用乙醇清洁防护柜的内外表面,并关闭防护柜,以便通过计算机操控设备。在机械臂上安装一根新的20至30微米玻璃毛细管,并通过系统冲洗系统油,以清除管路中的任何气泡。
用70%乙醇填充灭菌罐一,用无菌无核酸酶水填充灭菌罐二,用无菌杜氏磷酸盐缓冲液(Dulbecco's PBS)填充缓冲液罐。用70%乙醇对毛细管进行两次灭菌,然后将灭菌罐一更换为灭菌罐二,使用灭菌功能以水冲洗毛细管至少三次。在显微操作软件中,新建一个实验,并从自动和手动选择模式中选择挑取实验的类型。
配置甲板托盘,指定灭菌罐、缓冲罐和沉积托盘的位置,并将所选沉积托盘中液体罐的温度设置为四摄氏度。将含有释放的CTC溶液的超低吸附板置于显微操作仪柜内显微镜下方。取下培养板盖,关闭操作柜。
将每孔含有20 µL CTC培养基的384孔板离心,确保培养基完全沉降至各孔底部,并将该孔板放入4 °C指定存放托盘的目标位置。手动选择用于挑取的显微镜物镜以及所有必要通道的曝光时间。选择“显示孔导航器”以查看并选定挑取用孔板的类型。
然后,在视野中心无细胞的CTC溶液所在孔的中央校准拾取位置。使用传感器轻轻将毛细管接触培养板底部,并将拾取位置设定在培养板底部上方0.05毫米处。每次小心地将机械臂降低10微米,以避免损坏毛细管。
选择细胞类型和拾取参数。对于单细胞拾取,请选择手动模式。使用操纵杆在孔内移动玻璃毛细管,并将毛细管置于距离孔边缘至少一毫米处的目标单个细胞上方。
然后手动添加颗粒,并选择“激活颗粒挑选”以开始挑选。当所有细胞都被选中后,离心培养板,使细胞沉淀至各孔底部。使用抗上皮细胞黏附分子抗体进行生物氨基染色,可清晰地区分CD45阳性事件,从而在悬浮液中准确识别癌细胞。
精确的CTC分离表现为仅吸取目标细胞,而不吸取周围的污染细胞。正如所预期的,与单个CTC相比,CTC细胞簇在体外培养56天内表现出更强的存活能力。值得注意的是,CTC细胞簇也具有更高的增殖速率,因此最终细胞数量更高,表明肿瘤细胞之间的直接接触会影响肿瘤细胞的存活率和增殖速率。
直接从乳腺癌患者体内分离的循环肿瘤细胞(CTCs)进行单细胞RNA测序,揭示了来源于单个CTC、CTC簇或CTC-白细胞簇的单细胞的t分布随机邻域嵌入(t-SNE)图谱。请务必安装玻璃毛细管以去除显微操作仪流体系统中的气泡,并校准拾取位置,以确保高效地进行单细胞捕获。这些单细胞可被接种培养,或进一步用于下一代测序,从而实现体外分析,并在单细胞分辨率下对CTC进行表征,以研究转移过程。
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本文介绍了一种用于鉴定循环肿瘤细胞(CTCs)表型和分子特征的整合工作流程。该方法结合了活细胞免疫染色和机器人显微操作技术,通过基于单细胞的分析技术实现深入研究。
循环肿瘤细胞(CTCs)的单细胞显微操作可实现高纯度分离及下游分子分析,对于理解转移机制至关重要。该工作流程通过解析簇内异质性,提高识别与转移相关通路的预测可信度,并为早期阶段的项目筛选提供依据。该方法使CTC表征成为转化肿瘤学及基于风险调整的推进决策中的战略性资源。
这种微操作与分析工作流程通过实现循环肿瘤细胞(CTC)的精确分离与表征,连接了早期发现、先导物识别和转化研究。