In-vitro-Fluoreszenz Resonanz Energietransfer verwenden, um die Dynamik der Proteinkomplexe auf einer Millisekunde Zeitskala studieren

Unsere Methode hilft, die Kinetik einer Proteinkomplexbildung zu untersuchen. Es beschreibt, wie eng ein Proteinkomplex ist und ob die Proteinkomplexbildung durch andere Proteine gestört wird. Diese Technik ermöglicht die quantitative Untersuchung der Protein-Protein-Interaktion mit Hilfe der Fluoreszenz als Reporter, unser Assay kann die Assoziation und Disassoziation eines Proteinkomplexes in Echtzeit überwachen.

Entwerfen Sie zunächst den FRET-Assay, beginnend mit den Daten für den COL1 CAND1-Komplex aus der Proteindatenbank. Laden Sie die Struktur in PyMOL, und gehen Sie dann zum Assistentenmenü und verwenden Sie die Messfunktion, um den Abstand zwischen der ersten Aminosäure von CAND1 und der letzten Aminosäure von COL1 abzuschätzen. Laden Sie dann den Online-Spektrenbetrachter und sehen Sie sich die Anregungs- und Emissionsspektren von 7-Amino-4-Methylcoumarin und FlASH gleichzeitig an.