A Murine Cell Line Based Model of Chronic CDK9 Inhibition to Study Widespread Non-Genetic Transcriptional Elongation Defects (TE definitely ) in Cancers A Murine Cell Line Based Model of Chronic CDK9 Inhibition to Study Widespread Non-Genetic Transcriptional Elongation Defects (TEdefinitely) in Cancers

Étant donné que les cancers TEdeff sont un obstacle important contre l’immunothérapie, notre modèle pharmacologique est un outil avantageux parce qu’il imite convenablement les défauts transcriptionnels et épigénétiques répandus observés dans de tels cancers, et il permet d’étudier ces anomalies non génétiques pour obtenir de nouvelles idées, trouver de nouvelles utilisations pour les médicaments existants, ou trouver de nouvelles stratégies contre ces cancers. Il s’agit d’un modèle facile à établir et généralisable pour étudier les défauts transcriptionnels d’allongement dans les cancers, permettant d’étudier les interactions tumeur-immunitaire à la fois in vitro et in vivo. Cette méthode peut également être appliquée aux lignées de carcinome humain.

Nous l’avons testé sur T47D et CAL51 à court terme, donnant lieu à des caractéristiques similaires de type TEdeff. Le protocole que nous décrivons ici donne un cadre de base pour minimiser les variables connues critiques pour la génération de fonctionnalités de genre TEdeff par inhibition chronique cdk9. Cependant, il faut prendre soin d’optimiser la dose sublethal exacte de flavopiridol pour d’autres lignées murines.