Évaluation fonctionnelle des variantes BRCA1 à l’aide d’éditeurs de base à base de CRISPR

En induisant efficacement des mutations ponctuelles à l’aide de l’éditeur de bases de cytosine à base CRISPR, la fonctionnalité des variantes BRCA1, qui est importante pour la prévention et le diagnostic des maladies, peut être identifiée. L’avantage de cette technique est qu’elle mute directement brca1 exprimé endogènement, qui surmonte la limitation de l’évaluation fonctionnelle utilisant BRCA1 exogènement exprimé. L’identification de la perte des mutations de fonction de BRCA1 peut être employée pour prévoir le risque de développer des cancers liés aux mutations brca1, telles que des cancers du sein, de l’ovaire, de la prostate, et du pancréas.

Il peut également être utilisé pour trouver des cibles médicament potentielles en recherchant des gènes essentiels dont la viabilité est réduite par épuisement fonctionnel. Pour commencer, obtenez la séquence du génome BRCA1 de GenBank à NCBI et recherchez les 20 sites cibles de la paire de base avec la séquence de motifs adjacents protospacer, NGGNCCN, autour de la mutation d’intérêt. La mutation d’intérêt devrait être située dans quatre à huit nucléotides dans l’extrémité PAM-distal des séquences cibles d’ARN guide.