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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
È stato stabilito un metodo per riattivare le cellule staminali neurali quiescenti negli espianti cerebrali di Drosophila in coltura. Utilizzando questo metodo, il ruolo dei segnali sistemici può essere disaccoppiato dai segnali intrinseci del tessuto nella regolazione della quiescenza, dell'ingresso e dell'uscita delle cellule staminali neurali.
Le cellule staminali neurali (NSC) hanno la capacità di proliferare, differenziarsi, subire apoptosi e persino entrare e uscire dalla quiescenza. Molti di questi processi sono controllati dalla complessa interazione tra i programmi genetici intrinseci NSC con i fattori estrinseci NSC, locali e sistemici. Nell'organismo modello genetico, Drosophila melanogaster, le NSC, note come neuroblasti (NB), passano dalla quiescenza alla proliferazione durante la transizione embrionale a quella larvale. Durante questo periodo, le larve emergono dai loro gusci d'uovo e iniziano a gattonare, alla ricerca di nutrienti dietetici. In risposta all'alimentazione animale, il corpo grasso, un organo endocrino con capacità di accumulo lipidico, produce un segnale, che viene rilasciato sistemicamente nell'emolinfa circolante. In risposta al segnale derivato dal corpo grasso (FBDS), i peptidi insulino-simili a Drosophila (Dilps) vengono prodotti e rilasciati dai neuroni neurosecretori del cervello e dalla glia, portando all'attivazione a valle della segnalazione della crescita della PI3-chinasi nei NB e nella loro nicchia gliale e tracheale. Sebbene questo sia il modello attuale di come i NB passano dalla quiescenza alla proliferazione, la natura del segnale estrinseco FBDS rimane sfuggente. Per capire meglio come i segnali sistemici estrinseci NB regolano l'uscita dalla quiescenza, è stato sviluppato un metodo per coltivare i primi cervelli larvali in vitro prima dell'alimentazione animale. Con questo metodo, i fattori esogeni possono essere forniti ai terreni di coltura e NB uscita dalla quiescenza analizzata. Abbiamo scoperto che l'insulina esogena è sufficiente per riattivare i NB dalla quiescenza negli espianti di tutto il cervello. Poiché questo metodo è adatto per schermi su larga scala, miriamo a identificare ulteriori segnali estrinseci che regolano la quiescenza NB rispetto alle decisioni di proliferazione. Poiché i geni e i percorsi che regolano le decisioni di proliferazione NSC sono conservati evolutivamente, i risultati di questo test potrebbero fornire informazioni sul miglioramento delle terapie rigenerative nella clinica.
Le cellule staminali sono di grande interesse per il loro potenziale di utilizzo nella medicina rigenerativa 1,2. Molti animali, specialmente quelli longevi, mantengono le cellule staminali all'interno dei loro tessuti adulti. Queste cellule staminali residenti funzionano per mantenere l'omeostasi tissutale e sono utilizzate per la riparazione a seguito di lesioni fisiche o malattie 3,4. La maggior parte delle cellule staminali negli animali adulti sono quiescenti, uno stato relativamente dormiente caratterizzato dall'arresto del ciclo cellulare e dall'inattivazione della segnalazione della crescita5. In risposta a segnali estrinseci, le cellule staminali escono dalla quiescenza, entrano nel ciclo cellulare e iniziano a generare progenie figlia specifica per il loro tipo di tessuto. Ad esempio, al fine di montare una risposta immunitaria efficace, le cellule che presentano l'antigene inducono cellule T ingenue quiescenti ad entrare nel ciclo cellulare e ad espandersi clonalmente6. In risposta al danno muscolare scheletrico, le cellule staminali satelliti muscolari entrano nel ciclo cellulare e generano mioblasti figli per sostituire le miofibrille danneggiate 5,7. Mentre è chiaro che le cellule staminali quiescenti rispondono ai segnali estrinseci, in molti casi, la natura del segnale estrinseco rimane poco chiara, così come il meccanismo di attivazione delle cellule staminali indotte dal cue. Ottenere una migliore comprensione di come le cellule staminali quiescenti rispondono ai segnali estrinseci ed entrano nel ciclo cellulare aiuterà nello sviluppo di migliori terapie con cellule staminali nella clinica e aumenterà le conoscenze scientifiche.
Per decenni, gli organismi modello sono stati utilizzati per scoprire i geni e le vie di segnalazione cellulare che regolano la proliferazione delle cellule staminali durante lo sviluppo e in età adulta. In Drosophila, le cellule staminali neurali (NSC), note come neuroblasti (NB), si dividono durante lo sviluppo per generare tutti i neuroni e glia che alla fine si integrano, formando il circuito neurale richiesto per la funzione cerebrale 8,9. Come altre cellule staminali, le NB si dividono asimmetricamente per auto-rinnovarsi e, in alcuni casi, simmetricamente per espandere il pool di cellule staminali. I NB sono specificati durante l'embriogenesi e la maggior parte entra in quiescenza verso la fine, in coincidenza con il declino delle riserve di nutrienti materni (Figura 1). Dopo che l'embriogenesi è completa, le larve si schiudono e iniziano a nutrirsi. In risposta all'alimentazione animale, i NB si riattivano dalla quiescenza e riprendono le divisioni cellulari 10,11,12,13,14,15,16. Poiché il SNC Di Drosophila è relativamente semplice e poiché i NB entrano ed escono dalla quiescenza in momenti definiti, l'uso di Drosophila per studiare la regolazione della quiescenza, dell'entrata e dell'uscita, si rivela ideale.

Figura 1: Proliferazione relativa di CB NB (neuroblasti cerebrali centrali, rosso) e MB NB (neuroblasti del corpo a fungo, blu) nel corso dello sviluppo. Alla fine dell'embriogenesi, la maggior parte dei NB (linea rossa) cessa la proliferazione ed entra nella quiescenza. La quiescenza continua fino a quando le larve appena schiuse consumano il loro primo pasto completo. I punti temporali di messa a fuoco per questa metodologia sono indicati in cerchi rossi (1, quiescenza e 2, riattivazione). Gli MB NB (blu) sono un sottoinsieme di NB del cervello centrale che si dividono continuamente durante lo sviluppo (4 per emisfero cerebrale). Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
In risposta all'alimentazione animale, le vie di segnalazione della crescita PI3-chinasi e TOR diventano attive nei NB e nella loro nicchia gliale e tracheale 10,11,15,16. Quando i nutrienti dietetici vengono ritirati o quando i livelli di PI3-chinasi sono ridotti, i NB non riescono a riattivarsi e anche la crescita di glia e trachea viene ridottadi 10,11,15,16. Il modello attuale postula che la riattivazione nb sia accoppiata alla crescita larvale da parte del corpo grasso, che rilascia un segnale sistemico in risposta all'alimentazione animale 12,17,18. Questo segnale, che rimane sfuggente, probabilmente promuove l'espressione e il rilascio del peptide insulino-simile alla Drosophila (Dilps) nel cervello, che porta all'attivazione a valle della PI3-chinasi nei NB e nella loro nicchia gliale e tracheale. Per comprendere meglio la natura dei segnali sistemici, abbiamo sviluppato un metodo per riattivare i NB quiescenti negli espianti cerebrali in coltura. Con questo metodo, la riattivazione dei NB può essere analizzata in assenza di segnali sistemici di animali interi. I fattori esogeni possono essere riforniti ai terreni di coltura e la riattivazione NB è stata analizzata in base all'incorporazione dell'analogo della timidina, EdU. Utilizzando questo metodo, abbiamo determinato che l'insulina esogena è sufficiente per riattivare i NB quiescenti negli espianti cerebrali. Il lavoro futuro sarà finalizzato all'identificazione di ulteriori fattori che, una volta aggiunti, regolano positivamente o negativamente la quiescenza NB negli espianti cerebrali.
1. Raccolta delle larve di Drosophila
NOTA: Preparare il piatto di lievito, la pasta d'uva e il condominio Fly prima di iniziare:

Figura 2: Rappresentazione visiva della bottiglia di mosca invertita (condominio) con adulti Drosophila maschi e femmine. La bottiglia di plastica ha piccole forature, generate con un ago da 18 G, per lo scambio di ossigeno. La bocca della bottiglia è sigillata con un tappo di succo d'uva agar e viene invertita e conservata in un incubatore a 25 °C. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
2. Preparazione di terreni di coltura e strumenti
3. Dissezioni e colture cerebrali

Figura 3: Larve di Drosophila in un piatto di vetro con SSM. Le pinze sono posizionate correttamente per la dissezione. La posizione del cervello larvale (grigio scuro) è posteriore ai ganci della bocca (nero), ed entrambi sono mostrati all'interno della larva. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: Coltura cerebrale e immunocolorazione. (A) Cervello intero in un piatto di coltura a 12 pozzetti contenente 1 mL di SSM. Il piatto di coltura viene quindi posto in un incubatore a 25 °C per 24 ore. (B) Mini vassoio a 72 pozzetti che contiene gli espianti cerebrali durante l'immunocolorazione. I cervelli vengono lavati e le soluzioni trasferite utilizzando una micropipetta P20 impostata su 10 μL. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
4. Test di proliferazione, fissazione del cervello e colorazione degli anticorpi
5. Montare e immaginare il cervello

Figura 5: Schema che mostra il vetrino del microscopio, l'orientamento e i tipi di cellule nel cervello larvale. (A) Rappresentazione visiva del vetrino del microscopio su cui è montato un cervello larvale ed è pronto per essere ripreso. (B) Viene anche mostrato un orientamento da utilizzare per l'orientamento dei tessuti. (C) Vetrino per microscopio pronto per l'imaging su un microscopio confocale. (D) Cartone animato che mostra alcuni dei tipi di cellule nel cervello larvale. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
6. Analisi dei dati
I cervelli selvatici dell'OregonR appena nati sono stati sezionati e coltivati per 24 ore nei media di Schneider integrati (SSM) con insulina. I tessuti sono stati fissati e macchiati secondo il protocollo. Sono stati utilizzati anticorpi primari generati contro Deadpan (Dpn) per rilevare NB e Scribble per etichettare le membrane cellulari. L'analogo della timidina 5-etinil-2′-deossiuridina (Edu) è stato aggiunto per rilevare l'ingresso nella fase S e la riattivazione NB. Abbiamo trovato NB Edu positivi e Dpn positivi di grandi dimensioni dopo 24 ore in coltura (Figura 6A-C). Successivamente, i cervelli selvatici dell'OregonR appena nati sono stati coltivati per 24 ore in mezzi Schneiders integrati senza insulina. Dopo 24 ore in coltura, non abbiamo trovato NB Edu positivi e Dpn positivi di grandi dimensioni diversi dai quattro NB del corpo del fungo e un NB ventrolaterale (Figura 6D-F). Il corpo del fungo e i neuroblasti ventrolaterali sono un sottoinsieme dei neuroblasti cerebrali centrali che si dividono continuamente durante la transizione da embrionale a larvale. Concludiamo che l'insulina esogena è sufficiente per riattivare i neuroblasti dalla quiescenza negli espianti cerebrali coltivati nei mezzi di Schneider.
Durante l'imaging confocale, sono stati occasionalmente osservati alcuni emisferi cerebrali con danni. Il danno che abbiamo trovato consisteva in fori di piccole e grandi dimensioni nel tessuto cerebrale espiantato (Figura 6G, H). Questi tessuti sono stati esclusi dall'analisi. Oltre al time point di 24 ore, anche i cervelli sono stati coltivati con successo per 48 ore (dati non mostrati). Dopo 48 ore in coltura, abbiamo riscontrato un ulteriore aumento del numero di CB NB positivi edU positivi e un aumento del numero di cervelli con danni ai tessuti. Ciò suggerisce che coltivare cervelli a lungo termine è probabilmente fattibile; tuttavia, è necessario prestare molta attenzione per evitare danni ai tessuti.

Figura 6: Imaging confocale. (A-C) L'insulina esogena è sufficiente per riattivare i NB quiescenti. (A) Una proiezione di intensità massima di un emisfero cerebrale che mostra i NB positivi di Deadpan (Dpn) ed Edu dopo 24 ore di coltura in presenza di insulina. (B) Una singola immagine Z slice dello stesso emisfero cerebrale con Scribble (Scrib) immunocolorante marcatura membrane cellulari. (C) Elevato ingrandimento di NB nell'inserto nel pannello B. Immagini in scala di grigi a canale singolo con unione dei colori in basso a destra. (D-F) I NB rimangono quiescenti in assenza di insulina esogena. (D) Una proiezione di intensità massima di un emisfero cerebrale che mostra NB positivi Dpn ed Edu dopo 24 ore di coltura in assenza di insulina. (E) Una singola pila Z dello stesso emisfero cerebrale con immunocolorazione Scrib. (F) Elevato ingrandimento di NB nell'inserto nel pannello E. Immagini in scala di grigi a canale singolo con unione dei colori in basso a destra. Arrowhead indica uno dei NB da 4 MB, che si dividono continuamente e non entrano ed escono dalla quiescenza (fare riferimento alla Figura 1). (G,H) Esempi di espianti cerebrali danneggiati, non utilizzati nell'analisi. (G) Una singola fetta Z di un emisfero cerebrale con grandi fori nel tessuto. (H) Una singola fetta Z di un emisfero cerebrale mostra piccoli fori nel tessuto. Barra di scala: 10 μm. La linea tratteggiata bianca indica la linea mediana. Anteriore è su e posteriore è giù. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
| Ingrediente/Quantità | 1 L (~125 piatti d'uva) |
| Succo d'uva | 250 ml |
| Saccarosio | 25 gr |
| Acqua | 750 ml |
| Bacto Agar | 18,75 g |
| Tegosept (10%) | 4 ml |
| Acido propionico | 5 ml |
Tabella 1: Ricetta per fare piatti d'uva. Seguire i passaggi descritti nella sezione 1.2.
| Ingrediente (concentrazione iniziale) | Per fare 5 ml | Concentrazione finale |
| Drosophila media di Schneider | 3,89 ml | |
| Siero bovino fetale (100%) | 500 μL | 10% |
| Glutammina (200 mM) | 500 μL | 20 mM |
| Penicillina (5000 unità/mL), Streptomicina (50.000 μg/mL) | 100 μL | 1000 U/mL Penna, 1 mg/mL streptococco |
| Insulina (10 mg/mL) | 10 μL | 0,02 mg/ml |
| glutatione (50 mg/mL) | 5 μL | 0,05 mg/ml |
| In un cappuccio sterile, usando la tecnica sterile, aggiungere tutti gli ingredienti insieme in un tubo conico da 14 ml. Metterlo sul ghiaccio fino all'uso. |
Tabella 2: Ricetta per la realizzazione di supporti integrati di Schneider (SSM). La tabella elenca il volume di tutti gli ingredienti necessari per preparare 5 ml di SSM.
| Ricetta per fare fissativo | ||
| Ingrediente (concentrazione iniziale) | Per fare 40 ml | Concentrazione finale |
| Formaldeide di grado EM 16% | 10 ml | 4% |
| Tampone PEM pH 7,0 | 29,96 ml | |
| Triton X-100 | 40 ml | 0.10% |
| Mescolare tutti gli ingredienti insieme. Aliquota 1 mL in tubi microcentrifuga e conservare a -20 °C. Non ricongelare le aliquote dopo lo scongelamento. | ||
| Ricetta per il buffer PEM | ||
| Ingrediente (concentrazione iniziale) | Per fare 100 ml | Concentrazione finale |
| TUBI pH 6.8 (500 mM) | 20 ml | 100 metri |
| EGTA (500 mM) | 2 ml | 10 mM |
| MgSO4 (1 m) | 100 ml | 1 mM |
| Acqua | 77,9 ml |
Tabella 3: Ricetta per la produzione di buffer fissativo e PEM. La tabella elenca le sostanze chimiche e le rispettive concentrazioni per la preparazione del tampone fissativo e PEM.
Gli autori non hanno interessi in competizione.
È stato stabilito un metodo per riattivare le cellule staminali neurali quiescenti negli espianti cerebrali di Drosophila in coltura. Utilizzando questo metodo, il ruolo dei segnali sistemici può essere disaccoppiato dai segnali intrinseci del tessuto nella regolazione della quiescenza, dell'ingresso e dell'uscita delle cellule staminali neurali.
Riconosciamo il programma LSAMP Bridges to Doctorate for funding (CNK) e NIH / NIGMS (R01-GM120421 e R35-GM141886). Siamo grati al Dr. Conor Sipe per la Figura 1. Ringraziamo anche tutti i membri del laboratorio Siegrist per il loro continuo supporto e tutoraggio. Ringraziamo in particolare Chhavi Sood e Gary Teeters per l'attenta lettura del manoscritto e per aver fornito commenti.
| 10 µ L Puntali per pipette | Denville Sci | P2102 | |
| 1000 µ L Puntali per pipette | Denville Sci | P2103-N | |
| 1000 µ L Pipettor | Gilson | P1000 | |
| 16% paraformaldeide (10 x 10 mL) | Microscopia elettronica Scienze | 2912.60.0000 | Utilizzato per la fissazione di cervelli larvali |
| 20 &; L Pipetta | Gilson | P20 | |
| 200 & micro; L Puntali per pipette | Denville Sci | 1158U56 | |
| Piastre di coltura multipozzetto a 24 pozzetti | Fisher Scientific | 50-197-4477 | |
| Piastre Petri da 35 mm | Fisher Scientific | 08-757-100A | Piastra per uva Ingredienti |
| 4 gradi Frigorifero C | Fisher Scientific | Fornisce una temperatura ideale per incubazioni di >24 ore in soluzione anticorpale | |
| 63x Obiettivo | Lecia | ||
| Lievito secco attivo | La maggior parte dei supermercati | ||
| Agarosio | Fisher Scientific | 214010 | Ingredienti del piatto d'uva |
| Click-iT EdU Kit di proliferazione cellulare per l'imaging, Alexa Fluor 647 colorante | Thermo Fisher Scientific | C10340 | per etichettare le cellule proliferanti |
| Microscopio confocale | Leica | SP8 | |
| Vetrini coprioggetti 22 mm x 22 mm x 1 mm , confezione da 10 da 4 oz | Fisher Scientific | 12-544-10 | Due vetrini coprioggetti sono super incollati alle estremità del vetrino del microscopio. Questo crea uno spazio che consente ai cervelli di fluttuare in antidissolvenza durante l'immagine. |
| Vetrini coprioggetti, 22 mm x 50 mm x 1 mm | Fisher Scientific | 12-545E | Il vetrino coprioggetti viene posizionato su due vetrini coprioggetti quadrati sul vetrino del microscopio, assicurando che il cervello nell'antidissolvenza non si muova durante l'imaging. |
| Microscopio da dissezione | Zeiss | Stemi 2000 | |
| Ethanol 200 proof (100%), Decon Labs, bottiglia da 1 gallone | Fisher Scientific | 2701 | Utilizzato per lavare via le larve prima della tenuta di 24 ore nel terreno di coltura |
| Siero fetale bovino (10%) | Sigma | F4135-100ML | Integratore per terreni di coltura cellulare. |
| Pinze fini per la dissezione | Strumenti di scienze fini | 11295-20 | Forcepts utilizzati nelle dissezioni. Funzionano meglio se affilati. |
| Bottiglie per Incrocio | Genessee Scientific | 32-130 | Questa bottiglia viene utilizzata come contenitore che permette alle mosche di deporre le uova sul piatto d'uva. |
| Piatto di dissezione in vetro (3 pozzetti) | Questi non sono più disponibili | ||
| Glutatione | Sigma | G6013 | Fornisce protezione ossidativa durante la coltura cellulare. |
| Siero di capra | Sigma | G9023- 10ML | Agente bloccante |
| Piastre d'uva | Fatto in casa | Fatto in casa | Piastre di succo d'uva/agarosio per la raccolta di uova appena schiuse |
| Immagine J | Imagej.net/fiji/downloads | Download gratuito: https://fiji.sc | Piattaforma di imaging che viene utilizzata per contare le cellule e la riattivazione Edu |
| Incubatore | Thermo Fisher Scientific | Assicura che la temperatura, l'umidità e l'esposizione alla luce siano esattamente le stesse durante l'esperimento. | |
| Insulina | Sigma | I0516 | Variabile indipendente dell'esperimento |
| a | flusso laminare | Per l'aliquotazione di terreni di coltura | |
| L-Glutammina | Sigma | G7513 | Fornisce supporto durante la coltura cellulare |
| Nunc Mini vassoi Microwell a 72 pozzetti | Fisher Scientific | 12-565-154 | Le fasi di immunocolorazione vengono eseguite in questo vassoio |
| Parafilm | Fisher Scientific | S37440 | Film utilizzato per sigillare le piastre al fine di prevenire l'evaporazione |
| Pen-Strep | Sigma | P4458-100ml | Antibiodics utilizzato per prevenire la contaminazione batterica delle cellule durante la coltura. |
| Tampone fosfato, pH7.4 | Prodotto in casa | Prodotto in casa | Solvente utilizzato per lavare il cervello dopo le fasi di fissaggio e colorazione |
| Pick | Fine Science Tools | 10140-01 | Utilizzato per raccogliere le larve dal piatto d'uva |
| Acido propionico | Fisher Scientific | A-258 | Ingredienti del piatto d'uva |
| Coniglio 405 | Abcam | ab175653 | Anticorpi utilizzati per l'immunocolorazione |
| Rat 555 | Abcam | ab150166 | Anticorpi utilizzati per l'immunocolorazione |
| Rb Scribble | Un regalo da Chris Doe | Anticorpi utilizzati per l'immunocolorazione | |
| Rt Deadpan | Abcam | ab195173 | Anticorpi utilizzati per l'immunocolorazione |
| Schneiders Culture Medium | Life Tech | 21720024 | Contiene sostanze nutritive che aiutano le cellule a crescere e proliferare |
| SlowFade Diamond Antifade (5 x 2 mL) | Life Tech | S36963 | Reagente che fornisce protezione contro lo sbiadimento dei fluorofori |
| Acqua sterile | Autoclave Acqua Milli-Q prodotta in casa | Necessario per le soluzioni | |
| Saccarosio | Fisher | S2-12 | Ingredienti Vetrini |
| microscopio Superfrost | FisherScientific | 12-544-7 | |
| Supercolla | La maggior parte dei supermercati | ||
| Tegosept | Genesee Scientific | 20-259 | Ingredienti del piatto d'uva |
| Triton-X 100 | Sigma | T9284-100ML | PBT |
| Welch's 100% succo d'uva d'uva | La maggior parte dei supermercati | Ingredienti del piatto d'uva |