Rilevamento somatici genetiche Alterazioni in campioni tumorali da Exon Capture e Sequencing Massively Parallel

L'obiettivo generale di questa procedura è identificare le mutazioni somatiche nei geni associati al cancro di cellule di tessuto tumorale utilizzando librerie di DNA multiplex con codice a barre, seguite da un sequenziamento massivo parallelo. Ciò si ottiene legando prima gli adattatori di sequenziamento con codice a barre ai frammenti di DNA isolati da tumori conservati. La seconda fase della procedura è l'ibridazione con oligonucleotidi biotinilati personalizzati, complementari a tutti gli esoni di rivestimento proteico di 279 oncogeni e geni oncosoppressori.

Il terzo passaggio consiste nell'eseguire il sequenziamento parallelo massivo dei pool di codici a barre dalle librerie acquisite. Il passo finale consiste nel cercare i dati di sequenza per le alterazioni associate al cancro per i 279 geni bersaglio. Questa procedura può rivelare mutazioni di sequenza, piccole inserzioni, piccole delezioni, alterazioni del numero di copie e alterazioni strutturali selezionate.