Name: Automated quantificazione e analisi di procedure di conteggio delle cellule Uso ImageJ Plugin (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-11-17T15:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 1 s
Description: Impara a quantificare le cellule con i plugin ImageJ CCC e TC per analisi di emocitometro e saggi di migrazione. Questi strumenti open-source offrono conteggi rapidi e accurati per la biologia cellulare.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Questo lavoro è stato supportato dal Canadian Institute of Health Research to CP (OR 142730 e OR 89931). Ringraziamo Jelena Brkic per la sua idea iniziale di analisi delle particelle binarie in ImageJ.

<ol><li>Ricardo, R., Phelan, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Counting+and+Determining+the+Viability+of+Cultured+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp%22%5BJournal%5D)">Counting and Determining the Viability of Cultured Cells.</a> J. Vis. Exp. (16), e752(2008).</li>
<li>JoVE Science Education Database. Using a Hemacytometer to Count Cells. Basic Methods in Cellular and Molecular Biology. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://www.jove.com/science-education/5048/using-a-hemacytometer-to-count-cells">https://www.jove.com/science-education/5048/using-a-hemacytometer-to-count-cells</a> (2016).</li>
<li>Graham, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+coulter+principle%3A+foundation+of+an+industry%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Lab.+Autom%22%5BJournal%5D)">The coulter principle: foundation of an industry.</a> J. Lab. Autom. 8 (6), 72-81 (2003).</li>
<li>Ormerod, M. G., Imrie, P. R. Flow cytometry. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aOrmerod%2C+MG+%22Animal+Cell+Culture%22">Animal Cell Culture</a>. Walker, J. M., Pollard, J. W. , Humana Press. 543-558 (1990).</li>
<li>Eliceiri, K. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biological+Imaging+Software+Tools%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Methods%22%5BJournal%5D)">Biological Imaging Software Tools.</a> Nat. Methods. 9 (7), 697-710 (2013).</li>
<li>Louis, K. S., Siegel, A. C. Cell viability analysis using Trypan blue: manual and automated methods. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLouis%2C+KS+%22Mammalian+Cell+Viability%3A+Methods+and+Protocols%22">Mammalian Cell Viability: Methods and Protocols</a>. Stoddart, J. M. , Humana Press. 7-12 (2011).</li>
<li>Scott, W. N. Invasion and motility assays. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aScott%2C+WN+%22Cancer+Cell+Culture%3A+Methods+and+Protocols%22">Cancer Cell Culture: Methods and Protocols</a>. Langdon, S. P. , Humana Press. 225-229 (2004).</li>
<li>Justus, C. R., Leffler, N., Ruiz-Echevarria, M., Yang, L. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+Cell+Migration+and+Invasion+Assays%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp%22%5BJournal%5D)">In vitro Cell Migration and Invasion Assays.</a> J. Vis. Exp. (88), e51046(2014).</li>
<li>Luo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MicroRNA-378a-5p+promotes+trophoblast+cell+survival%2C+migration+and+invasion+by+targeting+Nodal%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">MicroRNA-378a-5p promotes trophoblast cell survival, migration and invasion by targeting Nodal.</a> J. Cell Sci. 125, 3124-3132 (2012).</li>
<li>Adorno, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Mutant-p53%2FSmad+Complex+Opposes+p63+to+Empower+TGFbeta-Induced+Metastasis%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A Mutant-p53/Smad Complex Opposes p63 to Empower TGFbeta-Induced Metastasis.</a> Cell. 137, 87-98 (2009).</li>
<li>Chung, T. K. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dysregulation+of+microRNA-204+mediates+migration+and+invasion+of+endometrial+cancer+by+regulating+FOXC1%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+J.+Cancer%22%5BJournal%5D)">Dysregulation of microRNA-204 mediates migration and invasion of endometrial cancer by regulating FOXC1.</a> Int. J. Cancer. 130, 1036-1045 (2012).</li>
<li>Kramer, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((et+al.+In+vitro+cell+migration+and+invasion+assays%5BTitle%5D)+AND+%22Mutat.+Res.%2FRev.+Mutat%22%5BJournal%5D)">et al. In vitro cell migration and invasion assays.</a> Mutat. Res./Rev. Mutat. 752, 10-24 (2013).</li>
<li>Al-Khazraji, B. K., Medeiros, P. J., Novielli, N. M., Jackson, D. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+automated+cell-counting+algorithm+for+fluorescently-stained+cells+in+migration+assays%5BTitle%5D)+AND+%22Biol.+Proced.+Online%22%5BJournal%5D)">An automated cell-counting algorithm for fluorescently-stained cells in migration assays.</a> Biol. Proced. Online. 13, 1-6 (2011).</li>
<li>Rasband, W. S. ImageJ. , National Institutes of Health. Bethesda, Maryland, USA. Available from:
 <a target="_blank" href="http://rsb.info.nih.gov/ij/">http://rsb.info.nih.gov/ij/</a> (2007).</li>
<li>Abramoff, M. D., Magalhaes, P. J., Ram, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Image+processing+with+ImageJ%5BTitle%5D)+AND+%22Biophotonics+Intern%22%5BJournal%5D)">Image processing with ImageJ.</a> Biophotonics Intern. 11, 36-42 (2004).</li>
<li>Grishagin, I. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automatic+cell+counting+with+ImageJ%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Biochem%22%5BJournal%5D)">Automatic cell counting with ImageJ.</a> Anal. Biochem. 473, 63-65 (2015).</li>
<li>Thomas, C. R., Paul, G. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Applications+of+image+analysis+in+cell+technology%5BTitle%5D)+AND+%22Curr.+Opin.+Biotech%22%5BJournal%5D)">Applications of image analysis in cell technology.</a> Curr. Opin. Biotech. 7 (1), 35-45 (1996).</li>
<li><a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Appreciating+data%3A+warts%2C+wrinkles+and+all%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Appreciating data: warts, wrinkles and all.</a> Nat. Cell Biol. 8, 203(2006).</li>
<li>Rossner, M., Yamada, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((What%27s+in+a+picture%3F+The+temptation+of+image+manipulation%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">What's in a picture? The temptation of image manipulation.</a> J. Cell Biol. 166, 11-15 (2004).</li>
<li><a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Count+objects+in+an+image+in+Adobe+Photoshop%5BTitle%5D)+AND+%22Helpx.adobe.com%22%5BJournal%5D)">Count objects in an image in Adobe Photoshop.</a> Helpx.adobe.com. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://helpx.adobe.com/photoshop/using/counting-objects-image.html">https://helpx.adobe.com/photoshop/using/counting-objects-image.html</a> (2016).</li>
</ol>

Gli autori dichiarano di non avere interessi finanziari concorrenti.

Passaggi critici, risoluzione dei problemi e limitazioni La natura stessa di metodi computazionali automatizzati, in particolare quelle di analisi delle particelle, richiede la capacità matematiche per definire queste particelle. Di conseguenza, la precisione di entrambi Calcolo cellulare Concentrazione e contatore dosaggio migrazione majorly dipende fedeltà dell&#39;immagine, cioè quanto strettamente l&#39;immagine catturata assomiglia membrana campione cellulare o dosaggio migrazione. È quind...

Nel conteggio delle cellule in vitro è un&#39;importante tecnica di base in una vasta gamma di esperimenti di coltura tissutale. Accuratamente determinare il numero di cellule in una coltura è essenziale per la riproducibilità sperimentale e standardizzazione 1,2. Conteggio cellulare può essere eseguita manualmente utilizzando un emocitometro e utilizzando una varietà di metodi automatizzati, ciascuno con i propri vantaggi e svantaggi 3,4,5. La maggior parte dei metodi automatizzati per il conteggio delle cellule appartengono ad una delle due classi, quelli che utilizzano il principio Coulter o citometria a flusso. Contaglobuli sfruttano cellule resistenza elettrica per determinare il numero di cellule e le dimensioni. Sono veloci, accurati e più economico rispetto citometri a flusso. Tuttavia, essi sono raramente utilizzati solo per il conteggio delle cellule a causa del loro costo considerevole rispetto al conteggio manuale 3. Flusso citometri, d&#39;altra parte, sono costosi ma hanno molte applicazioni, come il conteggio delle cellule, analisi della forma cellule, structure e cella di misura interna marcatori 4,5. Le macchine che utilizzano uno di questi due principi sono disponibili da molti produttori. Conteggio manuale è conveniente, ma richiede tempo e soggetto a bias mentre i metodi automatici sono dotati di una frazione del tempo richiesto per il conteggio manuale, ma utilizzando macchine costose 6. Altre procedure di coltura cellulare comune ha in saggi di motilità cellulare in vitro, vale a dire, la migrazione cellulare e dell&#39;invasione 7. saggi di migrazione e invasione sono comunemente usati per studiare la motilità cellulare e invasività in risposta ad una risposta chemiotattica. Inoltre, essi sono ampiamente utilizzati per studiare lo sviluppo embrionale, la differenziazione, la risposta infiammatoria, e le metastasi di più tipi di cellule 7-11. Le cellule che sono migrati o invaso attraverso la membrana porosa di un saggio di migrazione possono essere quantificati in due modi diversi. In primo luogo, colorando le cellule con un colorante fluorescente, dissociazione from la membrana, e la quantificazione usando un lettore di fluorescenza 12. Una limitazione di questo metodo di quantificazione è che nessun record può essere conservato delle membrane e non vi è alcuna possibilità per ulteriori analisi 13. Il secondo metodo di quantificazione è per migrato / celle da fissi e colorati con colorante fluorescente o più comunemente, con coloranti citologici, come violetto di cristallo, toluidina colorante blu o ematossilina invaso; quindi le cellule vengono quantificati utilizzando manualmente immagini microscopiche invertite di queste membrane che è un compito molto tempo 12,13. Per superare gli inconvenienti di conteggio manuale delle cellule, sono stati sviluppati due contatori di cellule automatizzati affidabili ed accurate per concentrazione cellulare e per il dosaggio di migrazione. Questi algoritmi automatizzati contatore di cellule sono stati sviluppati per ImageJ come plugin usando il linguaggio del computer Java di Oracle. ImageJ è uno strumento di elaborazione immagine pubblica e diffuso sviluppato dal National Institute of Health (NIH) 14,15; in tal modo, scrivendo questi plugin per ImageJ facilita l&#39;integrazione nella comunità biologica. Automazione del conteggio delle cellule assicura un throughput elevato e riproducibilità rispetto al conteggio manuale. Anche se altri software e plug-in disponibili possono essere utilizzati per calcolare la concentrazione cellulare attraverso l&#39;analisi delle immagini 5,16,17, cellulare Concentrazione calcolatore di plug-in è veloce e può anche gestire diluizioni di cellule e trattamenti. Inoltre, tutti i risultati ei calcoli di questi due contatori possono essere salvati ed esportati. I due plugin descritti nel presente documento sono ottimizzate per l&#39;impiego di un microscopio a contrasto di fase per l&#39;imaging cellulare dal vivo e ampio campo di vista (cattura tutta la membrana) di imaging per membrane dosaggio migrazione attraverso l&#39;uso di un ambito dissezione. I plugin sono liberamente disponibili per il download con le istruzioni di installazione da: http://peng.lab.yorku.ca/imagej-plugins.

<table><tbody><tr><td>Terreni liquidi classici HyClone: RPMI 1640 - Con L-Glutammina</td><td>Fisher Scientific</td><td>SH3002702</td><td>Terreni di coltura cellulare&nbsp;</td></tr><tr><td>Siero fetale boviano (FBS)</td><td>GIBCO BRL</td><td>P00015</td><td>Integratore multimediale</td></tr><tr><td>HTR8/SVneo linea cellulare trofoblasto</td><td>Le cellule sono state ottenute dal Dr. Charles Graham (Queen' s University, Kingston, Canada)</td><td></td><td>Il software è progettato per funzionare con qualsiasi linea cellulare.</td></tr><tr><td>Tripsina</td><td>GIBCO BRL</td><td>27250-018</td><td>Preparato allo 0,20% (p/v) in 10 & micro; M EDTA 1x PBS</td></tr><tr><td>Accutase</td><td>Innovative Cell Technologies</td><td>AT104</td><td></td></tr><tr><td>Piastre per colture cellulari da 10 cm</td><td>SARSTEDT</td><td>833902</td><td>Tutte le piastre trattate per colture tissutali saranno adatte</td></tr><tr><td>Inserti in membrana in poliestere Transwell - 8.0&nbsp; &micro; m Dimensione dei pori</td><td>Costar 3422 ordinato da Fisher Scientific</td><td>7200150</td><td>Per piastre a 24 pozzetti; Dimensione dei pori: 8,0 & micro; m; diametro 6,5 mm; 0,33 cm2 area</td></tr><tr><td>di crescita Coloranti e reagenti per ematologia HARLECO, EMD Millipore - Soluntions 1, 2 & 3</td><td>EMD Millipore e ordinati da VWR</td><td>65044A, B, & C</td><td>Il set di coloranti Hemacolor è composto da tre flaconi di polietilene da 500 ml (16,9 once) e include un fissativo al metanolo (Soluzione 1), un colorante eosina o acido (Soluzione 2) e un blu di metilene o un colorante basico (Soluzione 3)Applicatore</td></tr> <tr><td>con punta in cotone</td><td>Puritan Medical</td><td>806-WC</td><td></td></tr><tr><td>Lame di rasoio industriali a filo singolo</td><td>VWR</td><td>55411 - 055</td><td>Spessore: 0,30 mm (0,012")</td></tr><tr><td>Vetrini per microscopio - Prepuliti/Semplici</td><td>Fisher Scientific</td><td>12550A3</td><td>Dimensioni: 25 mm x 75 mm x 1,0 mm</td></tr><tr><td>Fisherbrand Cover Glasses - Rettangoli n. 1</td><td>Fisher Scientific</td><td>12-545E</td><td>Spessore: da 0,13 a 0,17 mm; Dimensioni: 50 mm x 22 mm</td></tr><tr><td>Fisher Chemical Permount Mounting Medium</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15-500</td><td></td></tr><tr><td>Leica Microscopio stereo da dissezione</td><td>Leica Microsystems</td><td></td><td>Il microsope è dotato di fotocamera per microscopio Leica Modello MC170 HD e il software della fotocamera è Leica App. Suite (LAS E2) Versione 3.1.1 [Build: 490]. Parti del microscopio:&nbsp; LED3000 Illuminazione spot Modello: MEB126, Leica M80 Optic Carrier Model M80, Obiettivo acromatico 1.0X, WD=90&nbsp; mm Modello: MOB306 & Acromatico obiettivo 0,32X, WD=303&nbsp; mm Modello: MOB315, obiettivo video 0,5X Modello: MTU-293</td></tr><tr><td>Assistente ematocitometro</td><td>Germania&nbsp;</td><td></td><td>0,100 mm Profondità - 0,0025 mm2</td></tr><tr><td>Microscopio a luce invertita Olympus</td><td>Corporation CKX41SF</td><td></td><td>Il microsope è dotato di Lumenera Infinity 1-2 2.0 Megapixel CMOS La fotocamera e il software della fotocamera sono Infinity analyze Versione 6.5.2</td></tr><tr><td>Armadio a flusso laminare 1300 Serie A2</td><td>Thermo Scientific&nbsp;</td><td>Modello: 1375</td><td>Qualsiasi cappa a flusso laminare per il lavoro di coltura cellulare sarà adatta&nbsp;</td></tr><tr><td>Incubatore per coltura cellulare</td><td>Thermo Scientific&nbsp;</td><td>Modello: 370</td><td>Qualsiasi incubatore per colture cellulari sarà adatto - Le cellule sono state coltivate in ambiente umido, 5% CO2, 37 gradi; C&nbsp;</td></tr><tr><td>ImageJ</td><td>NIH</td><td>Versione 1.50e</td><td>Versione minima richiesta</td></tr><tr><td>Java Runtime Environment</td><td>Oracle</td><td>Versione 1.8.0_66</td><td>Versione minima richiesta</td></tr></tbody></table>

automated quantificazione e analisi di procedure di conteggio delle cellule uso imagej plugin

Automated Quantification and Analysis of Cell Counting Procedures Using ImageJ Plugins

L&#39;Istituto Nazionale di ImageJ di salute è una potente suite di software, liberamente disponibile l&#39;elaborazione delle immagini. ImageJ ha algoritmi di analisi delle particelle complete che possono essere utilizzati in modo efficace per contare varie particelle biologiche. Quando il conteggio gran numero di campioni di cellule, l&#39;emocitometro presenta un collo di bottiglia per quanto riguarda il tempo. Allo stesso modo, contando le membrane da saggi di migrazione / invasione con la ImageJ plug cellulare contatore, anche se precisa, è il lavoro eccezionalmente intenso, soggettiva, e famoso per causare dolore al polso. Per rispondere a questa esigenza, abbiamo sviluppato due plugin all&#39;interno ImageJ per il solo compito di emocitometro automatizzata (o volume noto) e il conteggio delle cellule migrazione / invasione. Entrambi i plugin si basano sulla capacità di acquisire micrografie di alta qualità con il minimo di sfondo. Sono facili da usare e ottimizzato per il conteggio rapido e l&#39;analisi di campioni di grandi dimensioni con strumenti di analisi integrati per aiutare la calibrazione dei conteggi. Combinando il principio di bases of Cell Contatore con un&#39;analisi automatizzata algoritmo di conteggio e post-conteggio, questo aumenta notevolmente la facilità con cui saggi di migrazione possono essere elaborati senza alcuna perdita di precisione.

Calcolatrice cellulare Concentrazione La figura 1 presenta il processo globale di calibrazione CCC e l&#39;acquisizione di immagini numerabile. Figura 1A e 1B rappresentano l&#39;immagine di calibrazione P-Square e calcolo della lunghezza del P-square in pixel. CCC determina concentrazione cellulare in un dato volume utilizzando la formula: <img alt="E...

Questo articolo descrive la quantificazione dell'emocitometro e delle micrografie di migrazione/invasione attraverso due nuovi plugin open-source di ImageJ Cell Concentration Calculator e Migration assay Counter. Inoltre, descrive i protocolli di acquisizione e calibrazione delle immagini e discute in dettaglio i requisiti di input dei plug-in.

Automated quantificazione e analisi di procedure di conteggio delle cellule Uso ImageJ Plugin

The National Institute of Health&#39;s ImageJ is a powerful, freely available image processing software suite. ImageJ has comprehensive particle analysis ...

L'obiettivo generale di questo protocollo è utilizzare strumenti di analisi digitale per effettuare rapidamente conteggi accurati di cellule in una sospensione o su una membrana per saggi di migrazione e invasione. Questo protocollo può aiutare i ricercatori a quantificare il numero di cellule necessario per tecniche comuni e per saggi di motilità cellulare in vitro. Il vantaggio principale di questo metodo è che fornisce conteggi cellulari rapidi e precisi, includendo contemporaneamente diversi filtri e strumenti di analisi.Per iniziare, impostare l'illuminazione del microscopio al massimo. Passare all'obiettivo 4x e assicurarsi che siano utilizzati i filtri per contrasto di fase. Quindi, all'interno del software del microscopio, impostare le impostazioni di acquisizione dell'immagine ai valori predefiniti.Ora posizionare un emocitometro standard sul palchetto del microscopio ed acquisire un'immagine per la fase di calibrazione del volume dell'immagine. Regolare il tempo di esposizione secondo necessità. In ImageJ, all'interno del calcolatore di concentrazione cellulare, aprire l'immagine e fare clic sul pulsante Ottieni dimensione immagine.Questa azione compila le caselle di test

automated-quantification-analysis-cell-counting-procedures-using

Research

Ricerca

JoVE Journal

Biology

Biologia

Microdisegni adesivo che normalizzano architettura cellulare può essere utilizzato per aumentare la sensibilità nella rilevazione degli effetti dei farmaci, migliorare la riproducibilità e semplificare l'acquisizione automatica delle immagini e analisi. Tale tecnologia andrà a beneficio della droga / siRNA test di screening, eseguite su supporti convenzionali coltura cellulare e quindi soffrono di un eccessivo cellula-cellula variabilità.

Una migliore visualizzazione e analisi quantitativa degli effetti del farmaco utilizzando cellule Micropatterned

Descriviamo il metodo di prototipo per la produzione di vetrini al microscopio a fluorescenza rivestite con gelatina per la visualizzazione invadopodia-mediata degradazione della matrice. Tecniche di calcolo utilizzando il software disponibile sono presentati per quantificare i livelli risultanti di proteolisi matrice di singole cellule all'interno di una popolazione mista e per gruppi multicellulari che comprende interi campi microscopici.

Misurazione quantitativa della Invadopodia-mediata proteolisi della matrice extracellulare in singoli contesti e pluricellulari

Questo protocollo descrive la funzionalizzazione della superficie personalizzabile del sistema destiobiotina, streptavidina e APTES al fine di isolare specifici tipi di cellule di interesse. Inoltre, questo manoscritto copre le applicazioni, l'ottimizzazione e la verifica di questo processo.

Un metodo di isolamento delle cellule mirata tramite Glass funzionalizzazione superficiale

L'ameba sociale Dictyostelium discoideum è stata recentemente istituita come sistema per studiare il misfolding e la proteostasi delle proteine. Qui, descriviamo una nuova metodologia basata sull'imaging per studiare l'aggregazione proteica indotta dalla temperatura e la risposta allo stress cellulare in D. discoideum.

Studiando la proteina del sistema di controllo di qualità di<em&gt; D. discoideum</em&gt; Uso Cellulare Imaging a temperatura controllata

Questo manoscritto descrive un metodo per visualizzare e quantificare gli eventi di conversione localizzata in compartimenti subcellulari. L'approccio proposto in questo manoscritto richiede un sistema di imaging confocale base e reagenti ed è rapido ed economico.

Quantitativa immunofluorescenza su misura globale localizzato traduzione

L'articolo descrive la quantificazione di 1) le dimensioni e il numero di adereni focali e 2) l'indice di forma cellulare e la sua distribuzione da immagini confocali dei monostrati confluenti delle cellule MCF7.

Quantificazione dell'area di adesione del substrato cellulare e della distribuzione delle forme cellulari nei monostrati cellulari MCF7

Presentiamo un metodo che utilizza un approccio di analisi delle immagini generalizzabile basato sull'area per identificare i conteggi delle cellule. L'analisi di diverse popolazioni cellulari ha sfruttato le significative differenze di altezza e struttura cellulare tra diversi tipi di cellule all'interno di un algoritmo adattivo.

Algoritmo di analisi delle immagini basato sull'area per la quantificazione delle cocolture di macrofagi-fibroblasti

Qui, viene presentato un metodo per l'analisi della cinetica di aggregazione proteica nel nematode Caenorhabditis elegans. Gli animali di una popolazione sincronizzata con l'età vengono ripresi in diversi punti temporali, seguiti dal conteggio dell'inclusione semiautomatica in CellProfiler e dall'adattamento a un modello matematico in AmyloFit.

Monitoraggio della cinetica di aggregazione proteica in vivo utilizzando il conteggio automatico dell'inclusione in Caenorhabditis elegans

La determinazione delle unità formanti colonie (CFU) è la tecnica gold standard per quantificare i batteri, tra cui il Mycobacterium tuberculosis che può richiedere settimane per formare colonie visibili. Qui descriviamo un micro-CFU per la determinazione di CFU con una maggiore efficienza temporale, una riduzione dello spazio di laboratorio e del costo dei reagenti e la scalabilità per esperimenti a media e alta produttività.

Saggio dell'unità formante microcolonie per la valutazione dell'efficacia dei vaccini contro la tubercolosi

Questo articolo descrive i metodi passo dopo passo per automatizzare la quantificazione dei nuclei basata su immagini utilizzando un programma eseguibile open source convalidato in una gamma di densità cellulari. Questo programma fornisce un'alternativa che affronta le barriere relative ai costi, all'accessibilità per gli utenti con competenze tecnologiche limitate e alla convalida specifica dell'applicazione che può limitare l'utilità delle tecnologie esistenti.

Utilizzo delle librerie di visione artificiale per semplificare la quantificazione dei nuclei

Impara a quantificare le cellule con i plugin ImageJ CCC e TC per analisi di emocitometro e saggi di migrazione. Questi strumenti open-source offrono conteggi rapidi e accurati per la biologia cellulare.

Automated quantificazione e analisi di procedure di conteggio delle cellule Uso ImageJ Plugin

Esplora altri video