Quantificazione di site-specific Protein lisina acetilazione e stechiometria Succinylation usando la spettrometria totale di acquisizione dati-indipendente

L'obiettivo generale di questo nuovo flusso di lavoro è determinare l'occupazione o la stechiometria delle modifiche post-traduzionali delle proteine in specifici siti di acetilazione. Questo nuovo flusso di lavoro della spettrometria di massa fornisce un livello più elevato di precisione nella quantificazione. Questo metodo può aiutare a rispondere a domande chiave sulla regolazione reversibile delle proteine mediante modificazioni post-traduzionali, come l'acetilazione della lisina o i siti di succinilazione sono i più altamente modificati e possono alterare la funzione delle proteine. Il vantaggio principale di questa tecnica è che la stechiometria a livello di sito dell'acetilazione e della succinilazione e della succinilazione della lisina è determinata con precisione e il metodo può determinare la stechiometria da peptidi con più residui di lisina. Questa tecnica è molto rilevante perché rivela la stechiometria di acetilazione e succinilazione o la proporzione modificata rispetto a non modificata, invece di misurare una variazione di abbondanza relativa adimensionale. Ho avuto l'idea di questo metodo per la prima volta quando mi sono reso conto che l'utilizzo di acquisizioni indipendenti dai dati e la quantificazione basata su MS2 per l'analisi stechiometrica avrebbe migliorato notevolmente l'accuratezza della misurazione. Prepara tre repliche di 100