Name: Rilevamento rapido e specifico delle infezioni da Acinetobacter baumannii utilizzando un sistema basato su amplificazione della polimerasi ricombinasi/Cas12a (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-04-25T13:10:00.000+00:00
Duration: 7 min 59 s
Description: Scopri un metodo rapido per rilevare Acinetobacter baumannii utilizzando l'amplificazione della polimerasi ricombinasi e CRISPR-Cas12a. Questo protocollo offre elevata specificità e sensibilità per il controllo delle infezioni.

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<ol><li>Lenie, D., Alexandr, N., Harald, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+increasing+threat+in+hospitals%3A+Multidrug-resistant+Acinetobacter+baumannii%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">An increasing threat in hospitals: Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii.</a> Nat Rev Microbiol. 5 (12), 939-951 (2007).</li>
<li>Li, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+detection+of+Acinetobacter+baumannii+and+molecular+epidemiology+of+carbapenem-resistant+A.+baumannii+in+two+comprehensive+hospitals+of+Beijing%2C+China%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid detection of Acinetobacter baumannii and molecular epidemiology of carbapenem-resistant A. baumannii in two comprehensive hospitals of Beijing, China.</a> Front Microbiol. 6, 997(2015).</li>
<li>Wu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+diagnostic+test+that+uses+isothermal+amplification+and+lateral+flow+detection+sdaA+can+detect+tuberculosis+in+60+min%5BTitle%5D)+AND+%22J+Appl+Microbiol%22%5BJournal%5D)">A diagnostic test that uses isothermal amplification and lateral flow detection sdaA can detect tuberculosis in 60 min.</a> J Appl Microbiol. 130 (6), 2102-2110 (2020).</li>
<li>Huang, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cas12a-based+fluorescent+microfluidic+system+for+rapid+on-site+human+papillomavirus+diagnostics%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">A cas12a-based fluorescent microfluidic system for rapid on-site human papillomavirus diagnostics.</a> Appl Microbiol Biotechnol. 107 (20), 6287-6297 (2023).</li>
<li>Piepenburg, O., Williams, C. H., Stemple, D. L., Armes, N. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+detection+using+recombination+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Plos+Biology%22%5BJournal%5D)">DNA detection using recombination proteins.</a> Plos Biology. 4 (7), 1115-1121 (2006).</li>
<li>Abudayyeh, O. O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((C2c2+is+a+single-component+programmable+RNA-guided+RNA-targeting+CRISPR+effector%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector.</a> Science. 353 (6299), aaf5573(2016).</li>
<li>Chen, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a+target+binding+unleashes+indiscriminate+single-stranded+DNase+activity%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a target binding unleashes indiscriminate single-stranded DNase activity.</a> Science. 360 (6387), eaar6245(2018).</li>
<li>Xiong, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+detection+of+SARS-CoV-2+with+CRISPR-Cas12a%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">Rapid detection of SARS-CoV-2 with CRISPR-Cas12a.</a> PLoS Biol. 18 (12), e3000978(2020).</li>
<li>Gootenberg, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nucleic+acid+detection+with+crispr-Cas13a%2FC2C2%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Nucleic acid detection with crispr-Cas13a/C2C2.</a> Science. 356 (6336), 438-442 (2017).</li>
<li>Harrington, L. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Programmed+DNA+destruction+by+miniature+CRISPR-Cas14+enzymes%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Programmed DNA destruction by miniature CRISPR-Cas14 enzymes.</a> Science. 362 (6416), 839-842 (2018).</li>
<li>Li, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a+has+both+cis-+and+trans-cleavage+activities+on+single-stranded+DNA%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Res%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a has both cis- and trans-cleavage activities on single-stranded DNA.</a> Cell Res. 28 (4), 491-493 (2018).</li>
<li>Wang, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cas12aVDet%3A+A+CRISPR%2FCas12a-based+platform+for+rapid+and+visual+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Cas12aVDet: A CRISPR/Cas12a-based platform for rapid and visual nucleic acid detection.</a> Anal Chem. 91 (19), 12156-12161 (2019).</li>
<li>Huang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultra-sensitive+and+high-throughput+crispr-p+owered+COVID-19+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Biosens+Bioelectron%22%5BJournal%5D)">Ultra-sensitive and high-throughput crispr-p owered COVID-19 diagnosis.</a> Biosens Bioelectron. 164, 112316(2020).</li>
<li>Zhang, W. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reverse+transcription+recombinase+polymerase+amplification+coupled+with+CRISPR-Cas12a+for+facile+and+highly+sensitive+colorimetric+SARS-CoV-2+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Reverse transcription recombinase polymerase amplification coupled with CRISPR-Cas12a for facile and highly sensitive colorimetric SARS-CoV-2 detection.</a> Anal Chem. 93 (8), 4126-4133 (2021).</li>
<li>Marraffini Luciano, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas+immunity+in+prokaryotes%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas immunity in prokaryotes.</a> Nature. 526 (7571), 55-61 (2015).</li>
<li>Mohanraju, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diverse+evolutionary+roots+and+mechanistic+variations+of+the+CRISPR-Cas+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Diverse evolutionary roots and mechanistic variations of the CRISPR-Cas systems.</a> Science. 353 (6299), aad5147(2016).</li>
<li>Makarova, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+updated+evolutionary+classification+of+CRISPR-Cas+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">An updated evolutionary classification of CRISPR-Cas systems.</a> Nat Rev Microbiol. 13 (11), 722-736 (2015).</li>
<li>Li, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a-assisted+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Discovery%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a-assisted nucleic acid detection.</a> Cell Discovery. 4 (1), 20(2018).</li>
<li>Li, L., Li, S., Wu, N., Wu, J., Wang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Holmesv2%3A+A+CRISPR-Cas12b-assisted+platform+for+nucleic+acid+detection+and+DNA+methylation+quantitation%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Synth+Biol%22%5BJournal%5D)">Holmesv2: A CRISPR-Cas12b-assisted platform for nucleic acid detection and DNA methylation quantitation.</a> ACS Synth Biol. 8 (10), 2228-2237 (2019).</li>
<li>Liang, M., Li, Z., Wang, W., Liu, J., Zhang, L. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+CRISPR-Cas12a-derived+biosensing+platform+for+the+highly+sensitive+detection+of+diverse+small+molecules%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Communications%22%5BJournal%5D)">A CRISPR-Cas12a-derived biosensing platform for the highly sensitive detection of diverse small molecules.</a> Nat Communications. 10 (1), 3672(2019).</li>
<li>Aquino-Jarquin, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas14+is+now+part+of+the+artillery+for+gene+editing+and+molecular+diagnostic%5BTitle%5D)+AND+%22Nanomedicine%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas14 is now part of the artillery for gene editing and molecular diagnostic.</a> Nanomedicine. 18, 428-431 (2019).</li>
<li>Zetsche, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cpf1+is+a+single+RNA-guided+endonuclease+of+a+class+2+CRISPR-Cas+system%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cpf1 is a single RNA-guided endonuclease of a class 2 CRISPR-Cas system.</a> Cell. 163 (3), 759-771 (2015).</li>
<li>Fonfara, I., Richter, H., Bratovic, M., Le Rhun, A., Charpentier, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+CRISPR-associated+DNA-cleaving+enzyme+Cpf1+also+processes+precursor+CRISPR+RNA%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">The CRISPR-associated DNA-cleaving enzyme Cpf1 also processes precursor CRISPR RNA.</a> Nature. 532 (7600), 517-521 (2016).</li>
<li>Swarts, D. C., John, V. D. O., Jinek, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structural+basis+for+guide+RNA+processing+and+seed-dependent+DNA+targeting+by+CRISPR-Cas12a%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Structural basis for guide RNA processing and seed-dependent DNA targeting by CRISPR-Cas12a.</a> Mol Cell. 66 (2), 221-233 (2017).</li>
<li>Jiang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cpf1+assisted+genome+editing+of+Corynebacterium+glutamicum%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cpf1 assisted genome editing of Corynebacterium glutamicum.</a> Nat Commun. 8, 15179(2017).</li>
<li>Yan, M. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a-assisted+recombineering+in+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a-assisted recombineering in bacteria.</a> Appl Environ Microbiol. 83 (17), e00947-e01017 (2017).</li>
<li>Ashraf, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+multiplex+pcr+assay+for+simultaneous+detection+of+nine+clinically+significant+bacterial+pathogens+associated+with+bovine+mastitis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Probes%22%5BJournal%5D)">A novel multiplex pcr assay for simultaneous detection of nine clinically significant bacterial pathogens associated with bovine mastitis.</a> Mol Cell Probes. 33, 57-64 (2017).</li>
<li>Zhu, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+rapid+on-site+visualization+platform+based+on+RPA+coupled+with+CRISPR-Cas12a+for+the+detection+of+genetically+modified+papaya+%27huanong+no.1%27%5BTitle%5D)+AND+%22Talanta%22%5BJournal%5D)">A rapid on-site visualization platform based on RPA coupled with CRISPR-Cas12a for the detection of genetically modified papaya 'huanong no.1'.</a> Talanta. 277, 126437(2024).</li>
<li>Zheng, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+developments+in+lateral+flow+immunoassay+for+nucleic+acid+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Analyst%22%5BJournal%5D)">Rapid developments in lateral flow immunoassay for nucleic acid detection.</a> Analyst. 146 (5), 1514-1528 (2021).</li>
<li>Wang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishment+and+clinical+application+of+a+RPA-LFS+assay+for+detection+of+capsulated+and+non-capsulated+Haemophilus+influenzae%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Establishment and clinical application of a RPA-LFS assay for detection of capsulated and non-capsulated Haemophilus influenzae.</a> Front Cell Infect Microbiol. 12, 878813(2022).</li>
<li>Wang, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+sensitive+recombinase+polymerase+amplification+combined+with+lateral+flow+strips+for+detecting+Candida+albicans%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Biochem%22%5BJournal%5D)">Rapid and sensitive recombinase polymerase amplification combined with lateral flow strips for detecting Candida albicans.</a> Anal Biochem. 633, 114428(2021).</li>
<li>Ma, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+and+efficient+method+for+potential+point-of-care+diagnosis+of+human+papillomavirus+genotypes%3A+Combination+of+isothermal+recombinase+polymerase+amplification+with+lateral+flow+dipstick+and+reverse+dot+blot%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Bioanal+Chem%22%5BJournal%5D)">A simple and efficient method for potential point-of-care diagnosis of human papillomavirus genotypes: Combination of isothermal recombinase polymerase amplification with lateral flow dipstick and reverse dot blot.</a> Anal Bioanal Chem. 411 (28), 7451-7460 (2019).</li>
<li>Sun, Y., Yu, L., Liu, C., Ye, S., Huang, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((One-tube+SARS-CoV-2+detection+platform+based+on+RT-RPA+and+CRISPR%2FCas12a%5BTitle%5D)+AND+%22J+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">One-tube SARS-CoV-2 detection platform based on RT-RPA and CRISPR/Cas12a.</a> J Transl Med. 19 (1), 74(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>&nbsp;-20 &deg; C Congelatore</td><td>Haier</td><td>HYCD-290</td><td>Cina</td></tr><tr><td>Agarosio Basic</td><td>BioFroxx</td><td>1110GR100</td><td>Cina</td></tr><tr><td>Tutti gli oligonucleotidi e crRNA sono stati sintetizzati dall'azienda</td><td>www.comatebio.com</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Cas12a substrato di taglio - ssDNA - fluorescente tipo</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>DNA-FAM-BHQ</td><td>Cina</td></tr><tr><td>Cas12a substrato di taglio - ssDNA - tipo di carta di prova</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>DNA-FAM-BIO</td><td>Cina</td></tr><tr><td>Apparecchio per elettroforesi</td><td>BIO-RAD</td><td>POWER</td> PAC1000 <td>USA</td></tr><tr><td>Strumento PCR quantitativo a fluorescenza</td><td>BIO-RAD</td><td>CFX Connect</td><td>USA</td></tr><tr><td>Sistema di imaging su gel</td><td>BIO-RAD</td><td>Gel Doc 2000</td><td>USA</td></tr><tr><td>https://ezassay.com/rna</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>https://www.ezassay.com/primer&nbsp;&nbsp;</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast</tr><tr><td>Striscia di carta a flusso laterale (Biotina/FAM)</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>HD-FMBO</td><td>Cina</td></tr><tr><td>LbaCas12a (Cpf1) proteina potenziata</td><td>EZassay Biotech. Co. Ltd.</td><td>CAS-12E-001</td><td>Cina</td></tr><tr><td>LED Transilluminatore</td><td>LABGIC</td><td>BL-20</td><td>Cina</td></tr><tr><td>Acetato di magnesio, MgOAc</td><td>TwistDx</td><td>TABAS03KIT</td><td>UK</td></tr><tr><td>Microcentrifuga</td><td>allsheng</td><td>Mini-6k</td><td>Cina</td></tr><tr><td>PCR strip tubes</td><td>PCR strip tubes</td><td>PST-0208-FT-C</td><td>Cina</td></tr><tr><td>TGrade Dry Bath Incubator</td><td>Tiangen biochemical technology&nbsp;</td><td>OSE-DB-01</td><td></td></tr><tr><td>Cina Tianamp batteri DNA kit Tiangen</td><td>tecnologia biochimica</td><td>DP302-02</td><td></td></tr><tr><td>Cina TIANamp Kit DNA batterio.</td><td>TIANGEN BIOTECH&nbsp; (PECHINO) CO.; Ltd.</td><td>DP302</td><td>&nbsp; Cina&nbsp;</td></tr><tr><td>TransStart&nbsp; FastPfu&nbsp; DNA polimerasi&nbsp;</td><td>TransGen Biotech. Co. Ltd.</td><td>AP221</td><td>&nbsp; Cina&nbsp;</td></tr><tr><td>Kit di base TwistAmp</td><td>Kit</td> universale di purificazione <td>del DNA TwistDX TABAS03KIT</td><td>Regno Unito</td></tr><tr><td></td><td>Tecnologia biochimica Tiangen&nbsp;</td><td>DP214-03</td><td>Cina</td></tr></tbody></table>

rilevamento rapido e specifico delle infezioni da acinetobacter baumannii utilizzando un sistema basato su amplificazione della polimerasi ricombinasi/cas12a

Rapid and Specific Detection of Acinetobacter baumannii Infections Using a Recombinase Polymerase Amplification/Cas12a-based System

In questo studio, presentiamo una nuova piattaforma diagnostica portatile denominata A. baumannii-DETECTR, che integra l'efficienza di amplificazione isotermica di RPA e il sistema CRISPR-Cas12a per l'identificazione rapida e affidabile sul campo di A. baumannii. Lo schema del test DETECTR è illustrato nella Figura 1.
Dodici coppie di primer sono state progettate utilizzando strume...

Rilevamento rapido e specifico delle infezioni da Acinetobacter baumannii utilizzando un sistema basato su amplificazione della polimerasi ricombinasi/Cas12a

Acinetobacter baumannii, a gram-negative bacterium, is notorious for causing severe infections with high mortality rates. Rapid and accurate detection of ...

rapid-specific-detection-acinetobacter-baumannii-infections-using

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Immunology and Infection

Immunologia e Infezioni

Abbiamo recentemente riportato un nuovo approccio per generare sonde DNAzyme fluorogenici che possono essere applicati per impostare un semplice, "mix-e-leggere" test di fluorescenza per la rilevazione batterica. Queste sonde di DNA specifiche catalizzare il clivaggio di un cromoforo-modificato DNA-RNA chimerico substrato in presenza della miscela grezza extracellulare (CEM) prodotta da un batterio specifico, così traducendo rilevamento batterica nella generazione del segnale di fluorescenza.

Rilevazione di batteri utilizzando DNAzimi fluorogenici

Provided è un protocollo per lo sviluppo di un test di amplificazione della polimerasi ricombinasi in tempo reale per quantificare la concentrazione iniziale di campioni di DNA utilizzando un termociclatore o un microscopio e un riscaldatore per tavolini. Viene anche descritto lo sviluppo di un controllo positivo interno. Vengono forniti script per l'elaborazione di dati grezzi di fluorescenza in tempo reale.

Sviluppo di un Quantitative ricombinasi Polymerase Amplificazione Assay con un controllo positivo interno

Questo protocollo descrive come costruire un sistema a catena di polimerasi a flusso continuo basato su un chip microfluidico e come costruire un sistema di elettroforesi capillare in laboratorio. Presenta un metodo semplice per l'analisi degli acidi nucleici in laboratorio.

Amplificazione di Escherichia coli in un chip microfluidico PCR a flusso continuo e sua rilevazione con un sistema di elettroforesi capillare

In questo lavoro, è stato sviluppato un metodo di rilevamento rapido, sensibile e portatile per Candidatus Liberibacter asiaticus basato sull'amplificazione della polimerasi ricombinasi combinata con CRISPR-Cas12a.

Rilevamento di Candidatus liberibacter asiaticus distribuibile sul campo utilizzando l'amplificazione della polimerasi ricombinasi combinata con CRISPR-Cas12a

Presentiamo un protocollo che combina l'amplificazione della polimerasi ricombinasi con un sistema CRISPR/Cas12a per il rilevamento di tracce di virus a DNA e costruisce una microscopia portatile per smartphone con una classificazione assistita dall'intelligenza artificiale per il rilevamento di virus a DNA point-of-care.

Sistema di rilevamento del virus del DNA basato su RPA-CRISPR/Cas12a-SPM e Deep Learning

Descriviamo una procedura semplice per la complementazione cromosomica a singola copia di un gene della pompa di efflusso utilizzando un sistema di espressione basato su mini-Tn7 in un ceppo ingegnerizzato di Acinetobacter baumannii con deficit di eflusso. Questo preciso strumento genetico consente un'espressione genica controllata, che è fondamentale per la caratterizzazione delle pompe di efflusso in patogeni multiresistenti ai farmaci.

Caratterizzazione di sistemi di efflusso multifarmaco in Acinetobacter baumannii utilizzando un ceppo batterico carente di efflusso e un sistema di espressione genica a singola copia

Vari agenti patogeni batterici possono causare infezioni del tratto respiratorio e portare a gravi problemi di salute se non rilevati con precisione e trattati tempestivamente. Il rilevamento rapido e accurato di questi patogeni tramite amplificazione isoterma mediata da loop fornisce una gestione e un controllo efficaci delle infezioni del tratto respiratorio in ambito clinico.

Rilevamento rapido di agenti patogeni batterici che causano infezioni del tratto respiratorio inferiore tramite amplificazione isotermica mediata da loop basata su chip microfluidico

Qui, presentiamo la preparazione passo dopo passo dell'amplificazione isotermica premiscelata e liofilizzata basata sulla ricombinasi e delle reazioni basate su CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats), che possono essere utilizzate per il rilevamento di biomarcatori di acidi nucleici di patogeni di malattie infettive o altri marcatori genetici di interesse.

Diagnostica point-of-care basata su CRISPR con reagenti premiscelati e liofilizzati

In questo protocollo, viene illustrato un saggio combinato di amplificazione della polimerasi ricombinasi CRISPR/Cas12a per la rilevazione del patogeno invasivo delle piante, Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4.

Saggio combinato di amplificazione della polimerasi ricombinata CRISPR/Cas12a per il rilevamento di Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4

Qui, descriviamo una procedura semplice e rapida per rilevare il DNA da agenti patogeni delle api, come Lotmaria passim e Nosema ceranae, utilizzando una lisi cellulare pronta per l'amplificazione, l'amplificazione della polimerasi ricombinasi e i saggi CRISPR/Cas12a.

Rilevamento del DNA in loco di parassiti tripanosomatidi e nosema ceranae attraverso lisi alcalina accoppiata al sistema RPA/CRISPR/Cas12a

Scopri un metodo rapido per rilevare Acinetobacter baumannii utilizzando l'amplificazione della polimerasi ricombinasi e CRISPR-Cas12a. Questo protocollo offre elevata specificità e sensibilità per il controllo delle infezioni.

Rilevamento rapido e specifico delle infezioni da Acinetobacter baumannii utilizzando un sistema basato su amplificazione della polimerasi ricombinasi/Cas12a (Video) | JoVE Journal

Rilevamento rapido e specifico delle infezioni da Acinetobacter baumannii utilizzando un sistema basato su amplificazione della polimerasi ricombinasi/Cas12a

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