Name: Protocollo aggiornato per lassemblaggio e luso dellarray di minibioreattori (MBRA) (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-09-05T14:10:00.000+00:00
Duration: 9 min 38 s
Description: Scopri l'assemblaggio e l'uso dell'array di minibioreattori (MBRA) per studiare la dinamica delle comunità microbiche intestinali ad alto rendimento. Questo metodo consente di analizzare i meccanismi di resistenza alla colonizzazione dei patogeni.

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<ol><li>Gilbert, J. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+understanding+of+the+human+microbiome%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Med%22%5BJournal%5D)">Current understanding of the human microbiome.</a> Nat Med. 24 (4), 392-400 (2018).</li>
<li>Sarkar, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Perspective%3A+simple+state+communities+to+study+microbial+interactions%3A+examples+and+future+directions%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Perspective: simple state communities to study microbial interactions: examples and future directions.</a> Front Microbiol. 13, 801864(2022).</li>
<li>Van de Wiele, T., Van den Abbeele, P., Ossieur, W., Possemiers, S., Marzorati, M. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aVan+de+Wiele%2C+T+%22The+impact+of+food+bioactives+on+health%3A+in+vitro+and+ex+vivo+models%22">The impact of food bioactives on health: in vitro and ex vivo models</a>. , Springer. Cham. (2015).</li>
<li>McDonald, J. A. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+microbial+community+reproducibility%2C+stability+and+composition+in+a+human+distal+gut+chemostat+model%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Methods%22%5BJournal%5D)">Evaluation of microbial community reproducibility, stability and composition in a human distal gut chemostat model.</a> J Microbiol Methods. 95 (2), 167-174 (2013).</li>
<li>Feria-Gervasio, D., Denis, S., Alric, M., Brugère, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+maintenance+of+a+human+proximal+colon+microbiota+using+the+continuous+fermentation+system+P-ECSIM%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">In vitro maintenance of a human proximal colon microbiota using the continuous fermentation system P-ECSIM.</a> Appl Microbiol Biotechnol. 91 (5), 1425-1433 (2011).</li>
<li>Auchtung, J. M., Robinson, C. D., Farrell, K., Britton, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MiniBioReactor+arrays+%28MBRAs%29+as+a+tool+for+studying+C.+difficile+physiology+in+the+presence+of+a+complex+community%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">MiniBioReactor arrays (MBRAs) as a tool for studying C. difficile physiology in the presence of a complex community.</a> Methods Mol Biol. 1476, 235-258 (2016).</li>
<li>Robinson, C. D., Auchtung, J. M., Collins, J., Britton, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Epidemic+Clostridium+difficile+strains+demonstrate+increased+competitive+fitness+compared+to+nonepidemic+isolates%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Immun%22%5BJournal%5D)">Epidemic Clostridium difficile strains demonstrate increased competitive fitness compared to nonepidemic isolates.</a> Infect Immun. 82 (7), 2815-2825 (2014).</li>
<li>Auchtung, J. M., Robinson, C. D., Britton, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cultivation+of+stable%2C+reproducible+microbial+communities+from+different+fecal+donors+using+minibioreactor+arrays+%28MBRAs%29%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">Cultivation of stable, reproducible microbial communities from different fecal donors using minibioreactor arrays (MBRAs).</a> Microbiome. 3 (1), 42(2015).</li>
<li>Auchtung, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+simplified+microbial+communities+that+inhibit+Clostridioides+difficile+infection+through+dilution%2Fextinction%5BTitle%5D)+AND+%22mSphere%22%5BJournal%5D)">Identification of simplified microbial communities that inhibit Clostridioides difficile infection through dilution/extinction.</a> mSphere. 5 (4), e00387-e00320 (2020).</li>
<li>Hobson, C. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MiniBioReactor+array+%28MBRA%29+in+vitro+gut+model%3A+A+reliable+system+to+study+microbiota-dependent+response+to+antibiotic+treatment%5BTitle%5D)+AND+%22JAC+Antimicrob+Resist%22%5BJournal%5D)">MiniBioReactor array (MBRA) in vitro gut model: A reliable system to study microbiota-dependent response to antibiotic treatment.</a> JAC Antimicrob Resist. 4 (4), dlac077(2022).</li>
<li>Auchtung, T. A., Lerma, A. I., Schuchart, K., Auchtung, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluating+effects+of+antibiotics+across+preclinical+models+of+the+human+gastrointestinal+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiologyopen%22%5BJournal%5D)">Evaluating effects of antibiotics across preclinical models of the human gastrointestinal microbiota.</a> Microbiologyopen. 14 (4), e70030(2025).</li>
<li>Naimi, S., Viennois, E., Gewirtz, A. T., Chassaing, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+impact+of+commonly+used+dietary+emulsifiers+on+human+gut+microbiota%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">Direct impact of commonly used dietary emulsifiers on human gut microbiota.</a> Microbiome. 9 (1), 66(2021).</li>
<li>Bolyen, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((interactive%2C+scalable+and+extensible+microbiome+data+science+using+QIIME+2%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2.</a> Nat Biotechnol. 37 (8), 852-857 (2019).</li>
<li>Hobson, C. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+microbiota-dependent+response+to+anticancer+treatment+in+an+in+vitro+human+microbiota+model%3A+a+pilot+study+with+hydroxycarbamide+and+daunorubicin%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">A microbiota-dependent response to anticancer treatment in an in vitro human microbiota model: a pilot study with hydroxycarbamide and daunorubicin.</a> Front Cell Infect Microbiol. 12, 886447(2022).</li>
<li>Jensen, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dietary+fiber+monosaccharide+content+alters+gut+microbiome+composition+and+fermentation%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Dietary fiber monosaccharide content alters gut microbiome composition and fermentation.</a> Appl Environ Microbiol. 90 (8), e00964-e01024 (2024).</li>
<li>Ghimire, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Positive+synergistic+effects+of+quercetin+and+rice+bran+on+human+gut+microbiota+reduces+Enterobacteriaceae+family+abundance+and+elevates+propionate+in+a+bioreactor+model%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Positive synergistic effects of quercetin and rice bran on human gut microbiota reduces Enterobacteriaceae family abundance and elevates propionate in a bioreactor model.</a> Front Microbiol. 12, 751225(2021).</li>
<li>Hu, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Minibioreactor+arrays+to+model+microbiome+response+to+alcohol+and+tryptophan+in+the+context+of+alcohol-associated+liver+disease%5BTitle%5D)+AND+%22NPJ+Biofilms+Microbiomes%22%5BJournal%5D)">Minibioreactor arrays to model microbiome response to alcohol and tryptophan in the context of alcohol-associated liver disease.</a> NPJ Biofilms Microbiomes. 10 (1), 132(2024).</li>
<li>Jens, J. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MBRA-2%3A+A+modified+chemostat+system+to+culture+biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiol+Spectr%22%5BJournal%5D)">MBRA-2: A modified chemostat system to culture biofilms.</a> Microbiol Spectr. 11 (1), e02928-e03022 (2023).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>&nbsp; Guida V-tap, misure standard da 0-80 a 5/8"</td><td>Strumenti Big Gator</td><td>STD500NP&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>0,22 &mu; m filtro per siringhe</td><td>Pescatore</td><td>SLGVR33RS</td><td></td></tr><tr><td>2mag MIXdrive 60 Agitatore (solo azionamento)</td><td>2MAG</td><td>MF 41060</td><td></td></tr><tr><td>Aghi ipodermici Air-tite, 22G x3"</td><td>VWR</td><td>89219-274</td><td></td></tr><tr><td>BD 1mL Slip Tip Siringhe sterili sterili</td><td>Pescatore</td><td>14-823-434</td><td></td></tr><tr><td>Bioreattore</td><td>Proto-Laboratori</td><td>NA</td><td>Stampato in 3D con DMS Somos Watershed Plastic. Vedere il file supplementare 1 per il modello</td></tr><tr><td>Supporti per bioreattori</td><td>Proto-Laboratori</td><td>NA</td><td>Stampato in 3D in PA 12 nero. Vedere il file supplementare 2 per il modello.</td></tr><tr><td>Tappo per flacone solvente Diba Omnifit Q-Series, GL38/38-430 (vetro), 2 attacchi UNF(F) senza valvole, blu</td><td>Cole Parmer</td><td>EW-21942-86</td><td></td></tr><tr><td>Tubo Diba Omnifit, PTFE, diametro esterno 1/8" (3,2 mm) x diametro interno 1,5 mm</td><td>Cole Parmer</td><td>EW-21942-76</td><td></td></tr><tr><td>Adattatore Dibafit, fondo piatto 1/4"-28 UNF(M) con diametro interno di 3,2 mm, PEEK</td><td>Cole Parmer</td><td>EW-21941-49</td><td></td></tr><tr><td>IRWIN 12001ZR Chiave per maschi #0-1/4" Impugnatura a T</td><td>Amazzone</td><td>B00004YOB0</td><td></td></tr><tr><td>Irwin Hanson Rubinetto per frazione SAE in acciaio ad alto tenore di carbonio da 1/4 di pollice. 1 pz</td><td>Zoro</td><td>G7695682</td><td></td></tr><tr><td>Loctite Heavy Duty Epoxy Quick Set 8-Fluid Ounce Bottiglia</td><td>Amazzone</td><td>B0044F59N0</td><td></td></tr><tr><td>Connettore Luer Lock da maschio a maschio</td><td>Darwin Microfluidica</td><td>DM-MM-LUER-PP&nbsp;</td><td>Alternativa: Strategic Applications Inc Connettore Luer Maschio-Maschio - 10/pz - Fisher - NC9876577</td></tr><tr><td>Raccordi adattatori Masterflex, Luer a Luer, Nylon, Avantor</td><td>VWR</td><td>MFLX45502-56</td><td></td></tr><tr><td>Raccordo Masterflex, nylon, dritto, adattatore femmina Luer-portagomma, 1/16" ID</td><td>VWR</td><td>MFLX45502-00</td><td></td></tr><tr><td>Raccordo Masterflex, nylon, dritto, adattatore femmina da Luer a portagomma, diametro interno 3/32"</td><td>VWR</td><td>MFLX45502-02</td><td></td></tr><tr><td>Raccordo Masterflex, nylon, dritto, femmina Luer a portagomma, 1/8"</td><td>VWR</td><td>MFLX45502-04</td><td></td></tr><tr><td>Raccordo Masterflex, Nylon, Dritto, Adattatore Luer Lock Maschio a Portagomma, 1/8</td><td>VWR</td><td>MFLX45505-04</td><td></td></tr><tr><td>Raccordo Masterflex, Nylon, Dritto, Luer maschio x 1/4-28 UNF</td><td>VWR</td><td>MFLX45505-82</td><td></td></tr><tr><td>Raccordo Masterflex, polipropilene, gomito, adattatore Luer femmina a Luer femmina</td><td>VWR</td><td>MFLX45508-26</td><td></td></tr><tr><td>Tubo per pompa Masterflex Ismatec, 2 fermi, Tygon S3 E-Lab, diametro interno 0,89 mm</td><td>VWR</td><td>MFLX96460-26</td><td></td></tr><tr><td>Tubo per pompa Masterflex Ismatec, 2 fermi, Tygon S3 E-Lab, diametro interno 1,14 mm</td><td>VWR</td><td>MFLX96460-30</td><td></td></tr><tr><td>Masterflex&reg; Tubo di trasferimento, C-Flex, bianco opaco, 1/8" ID x 1/4" OD; 25 piedi</td><td>VWR</td><td>MFLX06424-67</td><td></td></tr><tr><td>Mohr' s Pinchcock per tubi&nbsp;</td><td>VWR</td><td>470201-374</td><td></td></tr><tr><td>rondelle parafango in gomma neoprene &frac12; &rdquo; OD x &frac14; &rdquo; ID x 1/16" Spessore&nbsp;</td><td>Amazzone</td><td>B01A29F1R0</td><td></td></tr><tr><td>Setti in gomma con guarnizione di precisione</td><td>Sigma Aldrich</td><td>Z553905</td><td></td></tr><tr><td>Micro ancorette Spinbar</td><td>VWR</td><td>58948-375</td><td></td></tr><tr><td>Tetra-incisione</td><td>Compagnia R.S. Hughest</td><td>TE-500</td><td></td></tr><tr><td>Supporto per tubi</td><td>Proto-Laboratori</td><td>NA</td><td>Stampato in 3D in PA 12 nero. Vedere il file supplementare 3 per il modello.</td></tr><tr><td>Pompa a cartuccia multicanale Watson-Marlow 205S</td><td>Watson-Marlow</td><td>020.3724.00A</td><td>Scontate, alternative: Pompe peristaltiche digitali Ismatec IPC MFLX7800142 - FISHER - 113-200-014 o Masterflex Pompa peristaltica Ismatec IPC, da 0,1 a 11,25 giri/min, 24 canali, 115/230 V CA, Avantor, VWR, MFLX78006-48-CH</td></tr></tbody></table>

protocollo aggiornato per l'assemblaggio e l'uso dell'array di minibioreattori (mbra)

Updated Protocol for the Assembly and Use of the Minibioreactor Array (MBRA)

Per facilitare la crescita di batteri anaerobi, come quelli che si trovano nel tratto gastrointestinale, l'MBRA può essere installato e utilizzato all'interno di camere anaerobiche. Per dimostrare la capacità di far crescere comunità batteriche complesse direttamente da siti rilevanti nel corpo umano, è stato preparato un campione fecale umano e coltivato in questo sistema. Tutto il lavoro è stato svolto in una camera anaerobica impostata a 37°C e le colture sono state coltivate nel nostro terreno di coltura per bioreattore, BRM37.
Il liquame fecale è stato preparato scongelando le feci umane in modo anaerobico e quindi mescolandolo con soluzione salina tamponata con fosfato (PBS) fino a una concentrazione finale del 25% p/v. Dopo aver confermato la sterilità, sono state inoculate nove camere del bioreattore con 3 ml dello stesso impasto fecale. Le comunità microbiche sono state coltivate durante la notte senza input di terreni o rimozione dei rifiuti, ottenendo colture batch separate per un periodo di 16 ore. Quindi, le pompe di alimentazione sono state accese e impostate su una portata di 1,92 ml all'ora. Dopo quattro giorni di flusso continuo, i campioni sono stati raccolti dai bioreattori e analizzati per la composizione della comunità microbica utilizzando il sequenziamento genico dell'rRNA 16S seguito dal denoising con Deblur e dalla classificazione tassonomica con il database SILVA 138 SSU in QIIME 213. Un totale di 65 generi sono stati rilevati in tutte e nove le repliche, ma i bioreattori erano dominati da soli 18 generi, ciascuno dei quali comprendeva almeno il 2% di abbondanza in una delle nove repliche (Figura 5). I bioreattori hanno mostrato un'elevata riproducibilità tale che 22 dei 65 generi sono stati rilevati in tutte e nove le repliche e altri 17 generi sono stati rilevati in almeno la metà delle repliche. La maggior parte dei generi assenti da almeno un reattore (37 su 43 generi) erano specie rare, ciascuna con abbondanza relativa inferiore al 2% nei bioreattori. In sintesi, le colture MBRA a flusso continuo hanno supportato comunità microbiche complesse e riproducibili derivate dallo stesso campione di feci, anche dopo colture batch separate per 16 ore all'interno di ciascuna camera del bioreattore.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/68788/68788fig1.jpg"> 
Figura 1: L'array di minibioreattori (MBRA). MBRA completamente assemblato, comprese le etichette per l'albero dei tubi della linea di alimentazione e di scarico, le camere del bioreattore e la striscia del bioreattore. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/68788fig1large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/68788/68788fig2.jpg"> 
Figura 2: Guida all'incisione in PTFE e layout della porta MBRA. (A) Diagramma di flusso da seguire per l'incisione dei terreni e delle cannucce in PTFE di scarto. (B) Ogni camera del bioreattore contiene una porta per una cannuccia media + luer maschio filettato, una cannuccia di scarto + luer maschio filettato e un setto + luer maschio filettato. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/68788fig2large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/68788/68788fig3.jpg"> 
Figura 3: Alberi della linea di alimentazione e di scarto MBRA. Immagini rappresentative da seguire nell'assemblaggio di (A) albero della linea di alimentazione e (B) albero della linea di scarico. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/68788fig3large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/68788/68788fig4.jpg"> 
Figura 4: Tappo di bottiglia del supporto e sistema di livelli di scarto. (A) Un esempio di tappo di bottiglia assemblato della serie Q utilizzato per estrarre i supporti negli MBRA. (B) Un'immagine del sistema di raccolta dei rifiuti a più livelli. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/68788fig4large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/68788/68788fig5.jpg"> 
Figura 5: Abbondanza relativa dei generi batterici. (A) Il grafico a barre sovrapposte mostra l'abbondanza relativa di tutti i generi che comprendono almeno il 2% di abbondanza in uno qualsiasi dei campioni visualizzati. (B) Metriche di diversità alfa degli OTU osservati e della diversità di Shannon tra tutte e nove le camere del bioreattore. Tutte e nove le camere del bioreattore sono state inoculate con lo stesso impasto fecale preparato da feci umane. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/68788fig5large.jpg" target="_blank">Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.</a>
Tabella 1: Componenti MBRA. Immagini e descrizioni di tutte le singole parti necessarie per assemblare completamente l'MBRA, insieme alla quantità necessaria per ogni componente. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/Table1.xlsx" target="_blank">Clicca qui per scaricare questa tabella.</a>
Tabella 2: Guida alla risoluzione dei problemi. Problemi comuni riscontrati con l'esecuzione dell'MBRA, insieme alle loro potenziali cause e soluzioni consigliate. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/Table2.xlsx" target="_blank">Clicca qui per scaricare questa tabella.</a>
Fascicolo supplementare 1: File Stl per la stampa 3D delle strisce di array di minibioreattori. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/Supplementary%20File%201.stl" target="_blank">Clicca qui per scaricare questo file.</a>
Fascicolo supplementare 2: File Stl per la stampa 3D dei supporti del bioreattore utilizzati per ancorare i bioreattori alle piastre di agitazione. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/Supplementary%20File%202.stl" target="_blank">Clicca qui per scaricare questo file.</a>
File supplementare 3.: File Stl per la stampa 3D dei portatubi utilizzati per organizzare i rifiuti C-flex e i tubi di alimentazione che si estendono dagli MBRA. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/68788/Supplementary%20File%203.stl" target="_blank">Clicca qui per scaricare questo file.</a>

Protocollo aggiornato per l'assemblaggio e l'uso dell'array di minibioreattori (MBRA)

The human microbiome comprises diverse and dynamic microbial communities that play essential roles in host health. Understanding these communities and ...

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Biologia

Fonte: Hemmerich, J., et al. Protocollo per l'ottimizzazione della produzione di proteine eterologhe utilizzando la tecnologia automatizzata dei microbioreattori. J. Vis. Esp. (2017).Questo video dimostra l'uso di un microbioretore automatizzato per monitorare la crescita batterica e la secrezione di proteine fluorescenti in risposta a diverse formulazioni di mezzi. Un batterio geneticamente modificato che esprime una proteina fluorescente secretoria viene coltivato sotto selezione antibiotica...

Monitoraggio della crescita batterica in formulazioni di mezzi distinti con un microbioreattore automatizzato

In questo protocollo viene introdotta la fabbricazione, l'impostazione e il funzionamento di base di un bioreattore microfluidico picolitro (PLBR) per l'analisi di singole cellule di microrganismi procarioti. I microrganismi rilevanti a livello industriale sono stati analizzati come prova di principio che consente di comprendere il tasso di crescita, la morfologia e l'eterogeneità fenotipica in determinati periodi di tempo, difficilmente possibili con i metodi convenzionali.

Bioreattore microfluidico picolitro per l'analisi microbica di singole cellule: fabbricazione, configurazione del sistema e funzionamento

Utilizzando un bioreattore pneumatico, dimostriamo l'assemblaggio, il funzionamento e le prestazioni di questo sistema di bioreattore monouso per la crescita di cellule di mammifero.

La coltivazione di cellule di mammifero utilizzando un singolo-uso del sistema pneumatico Bioreattore

Viene presentato un nuovo progetto di reattore, denominato bioreattore ad alta densità (HDBR), per la coltivazione e lo studio di comunità microbiche ad alta densità. Qui, l'HDBR viene applicato con successo in una configurazione di fotobioreattore (PBR) per lo studio del metabolismo dell'azoto da parte di una comunità di alghe miste ad alta densità.

Un bioreattore Novel per l&#39;alta densità di coltivazione diverse comunità microbiche

Lo sviluppo delle comunità microbiche dipende da una combinazione di fattori, tra cui l'architettura ambientale, l'abbondanza dei membri, i tratti e le interazioni. Questo protocollo descrive un ambiente sintetico e microfabbricato per il monitoraggio simultaneo di migliaia di comunità contenute nei pozzetti di femtoliter, in cui si possono approssimare fattori chiave come la dimensione e il confinamento di nicchia.

Assemblea e monitoraggio dello sviluppo microbico della comunità all&#39;interno di una piattaforma di array Microwell

Questo manoscritto descrive un approccio generico per la progettazione su misura di media di coltura microbica. Questa opzione è attivata da un flusso di lavoro iterativo che unisce Kriging sperimentale design e microbioreactor tecnologia per una velocità effettiva coltivazione sufficiente, che è supportata da robotica lab per aumentare affidabilità e velocità nella gestione dei mezzi liquidi preparazione.

Protocollo generico per l'ottimizzazione della produzione di proteine eterologhe utilizzando tecnologia automatizzata di Microbioreactor

Un protocollo dettagliato per il funzionamento simultaneo di 48 colture parallele sotto varie condizioni in un sistema di microbioreactor è presentato. Processo di coltura cellulare, raccolta e analisi di titolo dell'anticorpo successivi sono descritti.

Uso di High-Throughput Microbioreactor sistema automatizzato per la produzione del modello IgG1 in cellule CHO

Qui, presentiamo una procedura dettagliata per eseguire un progetto di esperimento in un micro-bioreattore automatizzato seguito dal raccolto cellulare e dalla quantificazione delle proteine utilizzando una colonna di proteine A.

Ottimizzazione dei processi mediante microreattori automatizzati ad alta velocità effettiva nella coltivazione delle cellule ovaio dell'ammasso cinese

Qui, presentiamo un protocollo per ottenere la produzione su larga scala di cellule aderenti attraverso un sistema completamente chiuso basato su microcarrier solubili di grado GMP. La coltivazione di cellule staminali mesenchimali umane, cellule HEK293T e cellule Vero è stata convalidata e ha soddisfatto sia le richieste di quantità che i criteri di qualità per l'industria della terapia cellulare e genica.

Produzione di celle su larga scala basata su microcarrier porosi solubili di grado GMP

Questo protocollo descrive in dettaglio l'assemblaggio di array di mini-bioreattori da utilizzare per la coltura a flusso continuo di comunità fecali complesse in condizioni anaerobiche. Discutiamo anche i metodi per l'assemblaggio, l'inoculazione e il campionamento dei reattori per ulteriori analisi.

Assemblaggio di bioreattori per la coltura continua di comunità fecali complesse

Un protocollo è descritto per la produzione di cellule dipendenti dall'ancoraggio per microtrasportatori e microbioreatori come potenziali terapie cellulari. Rivolgendosi a un caso d'uso della sindrome da difficoltà respiratoria acuta, sono illustrati un rendimento cellulare comparabile e un'espressione genica favorevole rispetto alle condizioni di processo basate su fiaschette. Questo protocollo è estendibile ad altre celle dipendenti dall'ancoraggio e indicazioni del bersaglio.

Produzione basata su microbioreattori di cellule stromali mesenchimali dipendenti dall'ancoraggio, preparate per la sindrome da difficoltà respiratoria acuta

Scopri l'assemblaggio e l'uso dell'array di minibioreattori (MBRA) per studiare la dinamica delle comunità microbiche intestinali ad alto rendimento. Questo metodo consente di analizzare i meccanismi di resistenza alla colonizzazione dei patogeni.

Protocollo aggiornato per l'assemblaggio e l'uso dell'array di minibioreattori (MBRA)

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