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原子間力顕微鏡で脳ポリソームでピアリング
原子間力顕微鏡で脳ポリソームでピアリング
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JoVE Journal Neuroscience
Peering at Brain Polysomes with Atomic Force Microscopy

原子間力顕微鏡で脳ポリソームでピアリング

Full Text
8,808 Views
08:49 min
March 16, 2016

DOI: 10.3791/53851-v

Lorenzo Lunelli1, Paola Bernabò2, Alice Bolner2, Valentina Vaghi1, Marta Marchioretto2, Gabriella Viero2

1Laboratory of Biomolecular Sequence and Structure Analysis for Health,Fondazione Bruno Kessler, 2Institute of Biophysics,CNR Unit at Trento

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a detailed protocol for imaging mammalian polysomes using atomic force microscopy (AFM). The method allows for high-resolution imaging without the need for sample fixation or labeling.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Biochemistry
  • Cell Biology

Background

  • Polysome organization is underexplored despite extensive ribosome structure characterization.
  • Understanding ribosome organization is crucial for insights into gene expression regulation.
  • This method can be applied to various organisms, including yeast and bacteria.
  • Visual demonstration is essential due to the complexity of handling polysomal samples.

Purpose of Study

  • To provide a reliable protocol for the purification and imaging of brain polyribosomes.
  • To facilitate the study of translational control and gene expression.
  • To enable imaging in near-physiological conditions.

Methods Used

  • Atomic force microscopy (AFM) for imaging.
  • Purification of brain polyribosomes on mica.
  • Imaging without heavy post-processing or 3D reconstruction.
  • Handling techniques for sample absorption and washing.

Main Results

  • Successful imaging of polyribosomes at nanoscale resolution.
  • Identification of ribosomes and naked RNA strands in samples.
  • Insights into the organization of mammalian polyribosomes.
  • Potential applications in studying translational controls across different organisms.

Conclusions

  • The protocol enhances understanding of ribosome organization in polysomes.
  • It provides a valuable tool for researchers studying gene expression.
  • The method's applicability to various organisms broadens its impact.

Frequently Asked Questions

What is the main advantage of this imaging method?
The method allows for imaging without sample fixation or labeling, preserving near-physiological conditions.
Can this method be applied to organisms other than mammals?
Yes, it can also be applied to yeast, bacteria, and insects.
Who are the demonstrators of this protocol?
The procedure will be demonstrated by Paola Bernabo and Lorenzo Lunelli.
What challenges are associated with handling polysomal samples?
Handling polysomal samples for absorption on mica and washing steps can be tricky and require experience.
What insights can this method provide?
It can help answer key questions about ribosome organization and its impact on gene expression.
Is heavy post-processing required for the images obtained?
No, the method allows for obtaining images without heavy post-processing or 3D reconstruction.

リボソームの構造は広範囲に特徴付けられていますが、ポリソームの組織化はまだ十分に研究されていません。この知識不足を克服するために、ここでは、空気中および液体中の原子間力顕微鏡(AFM)による哺乳類のポリソームの正確なイメージングのための詳細な準備プロトコルを示します。

このプロトコルの全体的な目標は、雲母上の脳ポリリボソームの正確な精製と沈着のための詳細なパイプラインを提供し、重い後処理や3D再構成分析を必要とせずにナノスケールの解像度で数千の画像を取得することです。この方法は、遺伝子発現の再配線におけるポリソーム内のリボソーム組織の影響の理解など、翻訳および翻訳制御の分野における重要な質問に答えるのに役立ちます。この技術の主な利点は、サンプルの固定や標識が不要であることと、生理学的に近い条件で測定を行い、リボソームと裸のRNAスタンドを簡単に同定できることです。

この方法は、哺乳類のポリリボソームの組織化に関する洞察を提供するだけでなく、酵母、細菌、昆虫などの他の微生物にも適用でき、遺伝子発現の翻訳制御に関与する状況にも適用できます。マイカの吸収と洗浄ステップのためのポリソームサンプルの取り扱いは非常に難しく、取り扱いスキルと経験が必要なため、この方法の視覚的なデモンストレーションは重要です。手順を実演するのは、パオラ・ベルナーボとロレンツォ・ルネッリです。

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