RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ko_KR
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
실험실 토양 온난화 실험은 일반적으로 여러 챔버에서 두 개 이상의 일정한 온도를 사용합니다. 정교한 환경 챔버를 제시함으로써 현장 토양 온도의 크기와 진폭을 모방 하고 토양 배양 연구의 실험 설계를 개선하는 정확한 온도 제어 방법을 제공합니다.
토양에 대한 온난화 영향에 대한 연구는 현실적이고 정확한 온도 표현이 필요합니다. 실험실 배양 연구에서 널리 채택 된 방법은 여러 챔버에서 일정한 온도를 렌더링하고 저온 챔버와 고온 챔버 간의 토양 반응을 비교하여 토양 변화에 대한 온난화 영향을 도출하는 것이 었습니다. 그러나 일반적으로 사용되는 이 방법은 현장 조건에서 관찰된 실제 온도의 크기와 진폭을 모두 모방하지 못하여 잠재적으로 그러한 연구의 유효성을 훼손합니다. 정교한 환경 챔버가 점점 더 사용 가능해짐에 따라 토양 배양 연구를 위한 대체 온도 제어 방법을 검토하는 것이 필수적입니다. 이 프로토콜은 최첨단 환경 챔버를 도입하고 토양 배양의 실험 설계를 개선하기 위해 기존 및 새로운 온도 제어 방법을 모두 보여줍니다. 이 프로토콜은 주로 온도 모니터링 및 프로그래밍, 토양 수집, 실험실 배양 및 온난화 효과 비교의 네 단계로 구성됩니다. 온도 제어의 다른 방법과 그에 따른 대조적 인 온난화 시나리오를 보여주기 위해 한 가지 예가 제시 될 것입니다. 즉, 단계적 온난화 (SW)라고하는 일정한 온도 설계와 점진적 온난화 (GW)로 시뮬레이션 된 현장 온도 설계 뿐만 아니라 토양 호흡, 미생물 바이오 매스 및 세포 외 효소 활성에 미치는 영향입니다. 또한 특정 기후 변화 연구 요구 (예 : 극심한 열)를 충족시키기 위해 온도 변화 시나리오를 다양 화하는 전략을 제시합니다. 온도 제어 프로토콜과 권장되는 잘 조정되고 다양한 온도 변화 시나리오는 연구자가 실험실에서 신뢰할 수 있고 현실적인 토양 배양 실험을 수립하는 데 도움이 될 것입니다.
지구 표면 온도는 금세기 1.8-6.4 °C증가 할 것으로 예상됩니다 1,2. 지구 온난화는 토양에서 대기로의 CO2 플럭스를 증가시켜 온난화 3,4,5,6에 긍정적 인 피드백을 초래할 수 있습니다. 미생물 군집은 온난화에 대한 토양 호흡 반응을 조절하는 데 중요한 역할을하기 때문에7,8, 미생물 호흡의 변화와 온난화에 따른 기본 미생물 메커니즘이 연구 초점이었습니다. 가열 케이블(9)과 개방형 상부 챔버(10)를 통해 현장 조건에서 전개된 토양 온난화 실험은 온도(11)와 같은 자연 토양 특징을 포착하는 데 유리했지만 설치 및 유지 보수 비용이 높아 적용이 제한되었습니다. 또는 다른 온도에 적용되는 토양 배양 실험이 유리한 선택입니다. 실험실에서 토양 배양의 주요 이점은 잘 제어된 환경 조건(예: 온도)이 현장 실험 설정(12,13)에서 다른 교란 요인으로부터 일요인 효과를 풀 수 있다는 것입니다. 성장 챔버와 현장 실험 (예 : 식물 성장) 간의 차이에도 불구하고 실험실 결과에서 현장으로의 번역은 쉽게 가능합니다14. 실험실 환경에서 토양 샘플을 배양하면 온난화에 대한 토양 반응에 대한 기계론적 이해를 향상시키는 데 도움이 될 수 있습니다15.
우리의 문헌 검토는 과거 토양 배양 연구에서 몇 가지 온도 제어 방법과 결과적으로 뚜렷한 온도 변화 모드를 확인했습니다(표 1). 첫째, 온도를 제어하는 데 사용되는 도구는 대부분 인큐베이터, 성장 챔버, 수조 및 드물게 가열 케이블을 통해 이루어집니다. 이러한 기기를 감안할 때 세 가지 일반적인 온도 변화 패턴이 생성되었습니다(그림 1). 여기에는 가장 많이 구현된 모드인 항온(CT), 0이 아닌 항온 변화율의 선형 변화(LC) 및 일주 유형의 온도로 특징인 비선형 변화(NC)가 포함됩니다. CT 패턴의 경우, 온도는 시간이 지남에 따라 크기가 변할 수 있지만 배양 중에 일정 시간 동안 일정한 온도가 유지됩니다 (그림 1B). LC의 경우 온도 변화율은 서로 다른 연구에서 두 자릿수 이상으로 달라질 수 있습니다 (예 : 0.1 ° C / 일 대 3.3 ° C / h; 표 1); NC의 경우 대부분 사용 된 계측기의 고유 용량에 의존하여 다양한 모드로 이어졌습니다. 그럼에도 불구하고 일종의 주간 온도 변화가 가열 케이블 또는 인큐베이터16,17을 통해 주장되었습니다. 그러나, 이들 실험에서의 챔버 온도는 검증되지 않았다. 표 1의 다른 주요 검토 결과에는 0-40 °C의 배양 온도 범위가 포함되며 대부분은 5-25 °C 사이입니다. 실험 기간은 몇 시간(<1일)에서 거의 2년(~725일)까지 다양했습니다. 또한 배양 된 토양은 주로 미국, 중국 및 유럽에 위치한 우세한 광물 지평선, 유기 지평선, 심지어 오염 된 토양이있는 산림, 초원 및 경작지 생태계에서 수집되었습니다 (표 1).
세 가지 주요 온도 변화 모드를 감안할 때 과거 연구에서 달성 된 몇 가지 뚜렷한 온난화 시나리오가 표 2에 요약되었습니다. 여기에는 단계적 온난화 (SW), 다양한 크기의 SW (SWv), 점진적 온난화 선형 (GWl), 비선형 적으로 점진적 온난화 (GWn) 및 점진적 일주 온난화 (GWd)가 포함됩니다.
요약하면, 과거의 토양 배양은 일반적으로 현장의 평균 공기 또는 토양 온도를 포착했습니다. 많은 경우, 표 1에 도시된 바와 같이, 인큐베이터 또는 챔버는 고정된 온도에서 수동으로 프로그래밍되었지만 원하는 대로 온도를 자동으로 조정할 수 없었고, 시간에 따른 온도 변화의 모드 및 속도를 제어하는 능력이 부족하여(식 1), 따라서 국소 토양의 일주 온도를 모방하는 데 어려움을 초래했습니다. 반면에 두 번의 실험16,17에서 시도되었지만 배양 실험에서 점진적 온난화 (GWd)를 명시 적으로 모방 한 연구는 확인되지 않았습니다 (표 1). 문헌 검토에 따르면, 주요 장애물은 열악한 실험 설계, 특히 주간 또는 기타 점진적인 온난화 시나리오의 구현 및 검증을 가능하게하는 정교한 도구가 부족하다는 것입니다.
(식 1)
여기서ΔT 는 온도 변화량, m 은 온도 변화 모드, r 은 온도 변화율, t 는 변화의 지속 시간입니다.
토양 배양에서 실험적 엄격함을 향상시키기 위해이 연구에서는 정확하고 정교한 온도 제어 방법이 제시됩니다. 점점 더 가용성이 높아지고 경제적으로 실행 가능한 최첨단 환경 챔버를 채택한 새로운 설계는 현장 토양 온도(예: 주간 패턴)의 정확한 시뮬레이션을 가능하게 할 뿐만 아니라 가능한 극한 온도 변화를 고려하여 기기 편향의 인공물을 최소화하는 신뢰할 수 있는 방법을 제공합니다. 현재의 토양 배양 설계는 연구자들이 배양 및 연구 요구를 충족시키는 최적의 전략을 식별하는 데 도움이 될 것입니다. 이 방법의 전반적인 목표는 토양 생지 화학자에게 토양 배양 설계를 개혁하기위한 고도로 운영 된 접근법을 제시하는 것입니다.
1. 온도 모니터링 및 프로그래밍
2. 토양 수집 및 균질화
3. 실험실 배양
4. 온난화 효과 비교
선택된 최첨단 챔버는 목표 온도를 고정밀로 복제하고(그림 2A, B, E, F) 배양 실험의 기술적 요구 사항을 충족했습니다. 쉬운 사용 및 작동을 감안할 때 이는 토양 온난화 연구 및 식물 연구와 같은 다른 응용 분야에서 온도 시뮬레이션을 개선하는 기술을 의미했습니다. 이 절차는 테네시 중부의 스위치 그래스 경작지를 기반으로 한 최근 사례 연구에서 사용되었습니다.
연구 결과에 따르면 대조군 치료에 비해 온난화는 온난화 시나리오 (SW 및 GW) 모두에서 훨씬 더 큰 호흡 손실 (Rs 및 Rc)을 가져 왔으며 GW는 SW에 비해 온난화로 인한 호흡 손실 (Rc)을 81 % 대 40 %로 두 배로 늘 렸습니다 (그림 3). 42일째에 MBC와 EEA도 SW와 GW에서 유의하게 달라 MBC가 GW보다 SW에서 더 높았습니다(69% 대 38%; 그림 4) 글리코시다아제 및 퍼 옥시 다제 (예 : AG, BG, BX, CBH, NAG, AP, LAP)는 SW 시나리오보다 GW에서 유의하게 높았습니다 (그림 5).

그림 1 : 표 1에서 개념화 된 토양 온난화 실험의 온도 변화 모드 그림. (A) 대부분의 연구에서 채택한 항온 (CT). (B) 다양한 크기의 일정한 온도 (CTv). (씨,디) 양수 및 음수 비율의 선형 변화(LC). (E, F) 불규칙한 패턴과 일주 패턴이 있는 비선형 변화(NC). 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 프로그래밍을 통해 목표가 지정된 온도와 24시간 테스트 기간 동안의 챔버 온도. (A,B) 목표 온도 (회색 선) 및 챔버 온도 기록 (점선) 제어 및 단계적 온난화 (SW)의 온난화 처리; (씨,디) 목표 온도 (회색 선) 및 챔버 온도 기록 (점선) 제어 및 점진적 온난화 (GW)의 온난화 처리; (E, F) 패널 C 및 D의 레코드에 대해 파생된 온도 차이입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3 : 42 일 토양 배양 실험에서 SW 및 GW에서 통제 (중공) 및 온난화 (어두운) 처리하에 평균 (± SE) 누적 토양 호흡률 (Rc, μg CO2-C · g soil-42). 삽입물은 다음 측정까지Rs가 일정하다고 가정하고 누적 호흡을 추정하기 위해 적용된 토양 호흡률(Rs, μg CO2-C·h-1·g soil-1)을 보여줍니다. (A) 단계적 온난화 (SW) 및 (B) 점진적 온난화 (GW). 각 컬렉션에서 N = 4입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 4 : 42 일 토양 배양 실험에서 SW 및 GW에서 제어 및 온난화 처리중인 평균 (± SE) MBC. MBC = 미생물 바이오매스 탄소; 각 컬렉션에서 N = 4입니다. S는 온난화 시나리오 (SW 대 GW)의 유의 한 효과를 나타내며, p < 0.05에서, 3 원 반복 측정 ANOVA를 기반으로합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5 : 42 일 배양 실험에서 SW 및 GW에서 대조군 및 온난화 처리하에 평균 (± SE) 글리코시다제 및 퍼 옥시다제 (μmol 활성 h-1·gsoil-1). BX=β1,4-자일로시다제; AP = 산성 인산 가수 분해 효소; 랩 = 류신 아미노펩티다아제; NAG = β -1,4-N- 아세틸 글루코사미니다 제; 옥스 = 산화 효소; 포 = 페놀 산화효소; 당 = 과산화 효소. 각 컬렉션에서 N = 4입니다. S는 온난화 시나리오 (SW 대 GW)의 유의한 효과를 나타내며, p < 0.05에서, 3원 반복 측정 ANOVA를 기반으로 한다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
표 1 : 토양 배양 연구에서 온도 제어 방법 및 온도 변화 모드에 대한 문헌 검토 12,13,16,17,20,21,22,23,24,25,2 6,27,28,29, 30,31,32,
33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50, 51,
52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62.
총 46개의 연구가 검토에 포함되었습니다. 이 표를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
표 2 : 주요 온도 변화 모드 및 문헌 검토를 기반으로 한 해당 온난화 시나리오 (표 1). 가능한 온도 변화 및 온난화 조건의 넓은 범위를 나타 내기 위해 5 가지 모드와 시나리오가 설정되었습니다. 이 표를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 공개 할 것이 없습니다.
실험실 토양 온난화 실험은 일반적으로 여러 챔버에서 두 개 이상의 일정한 온도를 사용합니다. 정교한 환경 챔버를 제시함으로써 현장 토양 온도의 크기와 진폭을 모방 하고 토양 배양 연구의 실험 설계를 개선하는 정확한 온도 제어 방법을 제공합니다.
연구를 지원하는 데 사용되는 자금 출처에는 미국 국립 과학 재단(NSF) HBCU−EiR(No. 1900885), 미국 농무부(USDA) 농업 연구 서비스(ARS) 1890년대 교수 연구 안식년 프로그램(No. 58-3098-9-005), USDA NIFA 보조금(No. 2021-67020-34933) 및 USDA Evans-Allen Grant(No. 1017802)가 있습니다. 테네시 주 내슈빌에 있는 TSU의 메인 캠퍼스 농업 연구 및 확장 센터(AREC) 직원들의 도움에 감사드립니다.
| 토양 호흡 측정을 위한 | 10mL-Syringe | Fisher Scientific | 14-826-13 |
| Composer 소프트웨어 | TestEquity | 모델 #107 | 배양 온도 설정을 위한 |
| 환경 챔버 | TestEquity | 모델 #107 | 토양 배양을 위한 |
| 환경 가스 분석기 | PP 시스템 EGM5 | 토양호흡 측정을 | |
| 토양 배양용 | 여과지 | Fisher Scientific | 1005-125 | 토양 배양
| 메이슨 항아리 | 볼 | 15381-3 | 토양부화용 |
| 오븐 | Fisher Scientific | 15-103-0520 | 토양 수분 측정용 |
| 플라스틱 지퍼 씰 보관 가방 | 토양수집용 | Fisher Scientific | 09-800-16 |
| 플레이트 리더 | 분자 장치 | 토양 | 세포 외 효소 분석을 위한 | FilterMax F5
| R 소프트웨어 | The R Foundation | R 버전 4.1.3 (2022-03-10) | 통계 컴퓨팅용 |
| 냉장고/냉동고 | Fisher Scientific | 13-991-898 | 토양 저장용 |
| 스크루 드라이버 | Fisher Scientific | 19-313-447 | 토양 수집 |
| Sharpie | Fisher Scientific | 50-111-3135 | 토양 수집용 |
| Sieve | Fisher Scientific | 04-881G | 토양 시료 체질용 |
| 실리콘 Septa | Duran Wheaton kimble | 224100-070 | 토양 배양에 사용되는 메이슨 항아리 |
| 수집용 | 토양 오거 | AMS | 350.05 |
| SpecWare 소프트웨어 | 온도수집 간격 설정용 | Spectrum Technologies | WatchDog E2700(3340WD2) |
| 프로브 | Spectrum Technologies | WatchDog E2700(3340WD2) | 토양 온도 측정 |
| 토양 미생물 바이오매스 분석을 위한 | TOC/TN 분석기 | Shimadzu | TOC-L 시리즈 |