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다량체 단백질 복합체는 다양한 생물학적 과정에 필수적입니다.
다량체-PAGE에 의해 천연 상태의 단백질 복합체를 분리하려면 원하는 복합체를 포함하는 조직 용해물을 섭취하십시오. Blue native PAGE용 겔 어셈블리에 용해물을 로드합니다.
청색 음이온 염료가 포함된 알칼리성 실행 완충액으로 시스템을 채우고 전원 공급 장치에 연결합니다. 알칼리성 pH에서 염료 분자는 단백질 복합체에 결합하여 변성 없이 전체적으로 음전하를 부여합니다. 이 음전하를 띤 온전한 단백질 복합체는 젤을 통해 파란색 띠로 이동합니다.
최소한의 실행 후 온전한 단백질이 분해 겔로 이동하도록 허용한 후 복합체가 포함된 스트립을 절제합니다. 가교제가 포함된 용액에서 스트립을 배양하여 반응성이 근위 단백질의 아민 그룹과 상호 작용하여 다량체 복합체를 안정화시킵니다.
가교 용액을 담금질 시약으로 교체하여 반응되지 않은 가교제의 활성을 가라앉힙니다. 음이온 세제인 SDS를 첨가하여 원래 크기와 구성을 유지하면서 온전한 단백질 복합체에 균일한 음전하를 부여합니다.
처리된 스트립을 새 카세트에 넣고 새 SDS-PAGE 젤로 다시 캐스팅합니다. 전기영동 동안 음전하를 띤 가교 단백질 복합체는 양극을 향해 이동하고 겔에서 고분자량 밴드로 나타납니다.
이 절차를 시작하려면 텍스트 프로토콜에 설명된 대로 파란색 천연 폴리아크릴아미드 겔 전기영동을 준비합니다. 전극을 전원 공급 장치에 연결하고 염료 밴드가 분해층으로 약 2cm 진행될 때까지 겔의 단백질을 150V에서 전기 영동합니다. 이 시점에서 전원 공급 장치를 중지하고 분리하십시오.
전기영동 장치를 분해한 후 젤 카세트의 유리판을 분리합니다. 스태킹 레이어를 제거하고 폐기합니다.
염료 앞면의 하단 가장자리 바로 아래에서 젤을 조심스럽게 자르고 이 절단이 가능한 한 매끄럽고 직선되도록 주의하십시오. 그런 다음 사용하지 않은 젤 조각을 버립니다. 젤 스트립의 가장자리를 따라 사용하지 않는 부분을 잘라냅니다.
스트립을 작은 용기에 담은 인산염 완충 식염수 10밀리리터에 조심스럽게 넣고 30분 동안 장동으로 부드럽게 혼합하여 평형을 이룹니다. 평형 후 PBS를 폐기하고 다른 10밀리리터로 교체하십시오.
디메틸 설폭사이드에 용해된 25밀리몰 DSP 500마이크로리터를 PBS에 피펫팅하고 이전과 같이 30분 동안 계속 혼합합니다. 30분 후 DSP 용액을 붓습니다. 2% 도데실 황산나트륨을 함유한 0.375몰 Tris-HCl, pH 8.8 10밀리리터를 첨가하여 반응되지 않은 DSP를 담금질합니다. 15분 동안 장동을 계속합니다.
겔 스트립이 담금질되는 동안 표준 방법에 따라 SDS-PAGE 겔 용액을 준비합니다. 중합 시약을 첨가하지 마십시오. 담금질 후 파란색 천연 젤 스트립을 실온으로 되돌리고 스트립을 새 젤 카세트에 주조합니다.
이렇게 하려면 젤을 조심스럽게 집어 깨끗한 젤 카세트 스페이서 플레이트에 놓습니다. 스트립이 이전 방향에서 뒤집히도록 방향을 지정하고 염료 전면의 하단이 새 카세트의 상단에 가장 가깝습니다.
상단 가장자리가 커버 플레이트의 상단 가장자리가 있는 위치와 같도록 스트립을 배치합니다. 염료 전면이 유리판의 수평 가장자리와 평행한지 확인하십시오. 절제된 스트립의 한쪽을 스페이서 벽 중 하나에 밀어 넣고 다른 쪽에는 젤을 붓고 단백질 표준품 또는 사다리를 넣을 수 있는 공간을 남겨 둡니다. 젤 스트립의 아래쪽 가장자리에 들쭉날쭉하거나 고르지 않은 부분이 있으면 조심스럽게 잘라냅니다.
젤 스트립이 올바르게 배치되면 커버 플레이트를 스페이서 플레이트 위에 놓습니다. 가한 압력을 가하여 갇힌 기포를 밀어냅니다. 제조업체의 지침에 따라 젤 주입 장치를 계속 조립하십시오.
상판을 놓을 때 젤 스트립이 가끔 움직입니다. 스트립을 상판 가장자리에 약간 걸어두는 데 도움이 되므로 주걱으로 조정하여 이동을 수정할 수 있습니다.
분리 겔 완충액에 중합 시약을 첨가하고 혈청학적 피펫을 사용하여 준비된 겔 카세트에 붓습니다. 젤 카세트를 절제된 파란색 천연 PAGE 젤 스트립 아래 약 2cm까지 채워 스태킹 층을 위한 공간을 남겨둡니다. 그런 다음 부은 젤 위에 부탄올 100마이크로리터를 넣고 부탄올을 붓기 전에 분해층이 중합될 때까지 30분 동안 기다립니다.
다음으로, 중합 시약을 스태킹 겔 용액에 첨가합니다. 혈청학적 피펫을 사용하여 스태킹층을 부어 젤 카세트에 남아 있는 모든 빈 공간을 채웁니다. 스태킹 층을 부을 때 젤 카세트를 기울여 젤 스트립 아래 공간을 채우고 기포가 갇히지 않도록 합니다.
스태킹 젤 완충액이 겔 스트립 아래의 빈 공간을 채우면 젤 카세트를 점차적으로 수평 기초로 되돌립니다. 절제된 젤 스트립 옆의 빈 공간을 거의 넘칠 때까지 스태킹 젤 완충액으로 계속 채웁니다. 그런 다음 적층이 30분 동안 중합되도록 합니다.
적층이 중합된 후 주입 장치에서 젤 카세트를 제거하고 증류수로 헹구고 제조업체의 지침에 따라 전기 영동 장치를 조립합니다.
내부 챔버를 1X SDS-PAGE 실행 버퍼로 완전히 채웁니다. 그런 다음 제조업체가 지정한 수준까지 외부 챔버를 채웁니다. 절제된 젤 스트립 옆의 공간에 분자량 사다리 또는 적절한 단백질 표준물질을 넣습니다.
전극을 전원 공급 장치에 부착하고 샘플을 120볼트에서 전기영동합니다. 쿠마시 염료가 젤에서 떨어지면 실행을 중지하고 전원 공급 장치를 분리하십시오. 전기 블로팅 및 항체 기반 단백질 검출의 표준 방법을 사용하여 겔을 분석합니다.