-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

KR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ko_KR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
단백질 관련 신생 DNA 농축 및 시퀀싱을 통한 DNA 복제 가닥 단백질의 가닥 특이적 분석
단백질 관련 신생 DNA 농축 및 시퀀싱을 통한 DNA 복제 가닥 단백질의 가닥 특이적 분석
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Strand-Specific Analysis of Proteins at Replicating DNA Strands by Enrichment and Sequencing of Protein-Associated Nascent DNA Method

단백질 관련 신생 DNA 농축 및 시퀀싱을 통한 DNA 복제 가닥 단백질의 가닥 특이적 분석

Full Text
1,014 Views
08:53 min
May 2, 2025

DOI: 10.3791/67120-v

Srinivasu Karri1, Quinn Dickinson1, Zhiming Li2, Chuanhe Yu1, Zhiguo Zhang3

1Hormel Institute,University of Minnesota, 2West China School of Public Health and West China Fourth Hospital, State Key Laboratory of Biotherapy,Sichuan University, 3Institute for Cancer Genetics, Department of Pediatrics and Department of Genetics and Development,Columbia University Medical Center

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This research addresses the mechanism of epigenetic inheritance, specifically focusing on the parent histone recycling process during DNA replication. Using yeast and mouse embryonic stem cells, the study employs the enrichment and sequencing of protein-associated nascent DNA (eSPAN) to analyze histone deposition. This approach reveals important insights into chromatin replication dynamics.

Key Study Components

Research Area

  • Epigenetic inheritance
  • Histone recycling during DNA replication
  • Chromatin dynamics

Background

  • Parental histone recycling is a fundamental step in epigenetic inheritance.
  • The study identifies key players in this process, including helicase complexes and DNA polymerases.
  • Traditional methods have limitations that eSPAN effectively addresses.

Methods Used

  • Enrichment and sequencing of protein-associated nascent DNA (eSPAN).
  • Model organisms include yeast and mouse embryonic stem cells.
  • High-throughput sequencing technologies utilized for data analysis.

Main Results

  • Revealed the mechanism of parental histone deposition biased toward the lagging strand in wild-type yeast.
  • Identified distinct nucleosome patterns surrounding autonomously replicating sequences.
  • Confirmed roles of identified proteins in histone transfer processes.

Conclusions

  • The study advances understanding of chromatin replication and its epigenetic implications.
  • Findings contribute to the broader field of molecular biology by elucidating mechanisms of epigenetic inheritance.

Frequently Asked Questions

What is the significance of histone recycling in DNA replication?
Histone recycling is crucial for maintaining epigenetic information during DNA replication, affecting gene expression and cellular identity.
How does eSPAN improve upon previous methods?
eSPAN provides a powerful tool for studying protein interactions with nascent DNA, allowing for greater insights into histone transfer processes.
What model systems were used in this study?
The study utilized yeast and mouse embryonic stem cells to explore histone dynamics in chromatin.
What were the key findings regarding strand bias in histone deposition?
In wild-type yeast, parental histone deposition was observed to have a slight bias towards the lagging strand during replication.
What role do DNA polymerases play in histone recycling?
DNA polymerases are involved in the deposition of parental histones on newly replicated DNA, ensuring proper epigenetic inheritance.
How do the findings impact our understanding of epigenetic inheritance?
These findings enhance our understanding of how epigenetic information is preserved during cell division, impacting future research in genetics and developmental biology.

단백질 관련 신생 DNA의 풍부화 및 시퀀싱(eSPAN)은 두 개의 복제 DNA 가닥에서 염색질 관련 단백질의 상대적 풍부도를 검출하기 위해 개발되었으며, 이를 통해 염색질 복제와 그 결합 과정에 대한 분자적 통찰을 밝혀냈습니다. 이 프로토콜은 효모 및 마우스 배아 줄기(ES) 세포에서의 eSPAN 절차를 설명합니다.

우리의 연구는 후성유전학적 유전의 메커니즘에 초점을 맞추고 있습니다. 특히, DNA 복제는 후성유전학적 유전의 첫 번째 방출 단계를 나타내는 부모의 히스톤 재활용 과정과 결합되었습니다. DNA 복제에 관여하는 여러 부모 히스톤 증착은 부모 히스톤 재활용에 중요한 역할을 하는 것으로 확인되었습니다.

여기에는 D 헬리카제 복합체, DNA 중합효소 및 보호 복합체를 위한 복제가 포함됩니다. 전통적인 유전 및 생화학적 접근 방식은 이 연구 분야에서 사용되는 가치였습니다. 전통적으로 부모의 히스톤 전달 과정을 이해하기 위해 고처리량 염기서열분석 방법이 사용되고 있습니다.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Empty Value 219호 염색질 복제 DNA 복제 히스톤 변형 BrdU 선도 가닥 지연 가닥 부모 히스톤 전달 PCNA 후생유전학적 유전 DNA 중합효소

Related Videos

효소 복제 DNA의 직접 관찰 어세을 스트레칭 단일 분자 DNA를 사용하여

17:03

효소 복제 DNA의 직접 관찰 어세을 스트레칭 단일 분자 DNA를 사용하여

Related Videos

19.3K Views

의 전체 순서의 NGS 분석을위한 Transposase 기반 기술에 의해 gDNA를 농축 BRCA1 BRCA2, 9 유전자

08:15

의 전체 순서의 NGS 분석을위한 Transposase 기반 기술에 의해 gDNA를 농축 BRCA1 BRCA2, 9 유전자

Related Videos

12.7K Views

포유 동물 세포에서 초기 DNA에 바인딩 단백질의 시험 BrdU의 칩 슬롯 서양 기술을 사용하여

09:14

포유 동물 세포에서 초기 DNA에 바인딩 단백질의 시험 BrdU의 칩 슬롯 서양 기술을 사용하여

Related Videos

9.5K Views

사이트 특정 복제 막힘의 유도 E. 대장균 형광 리프레 운영자 시스템을 사용하여

11:19

사이트 특정 복제 막힘의 유도 E. 대장균 형광 리프레 운영자 시스템을 사용하여

Related Videos

9.6K Views

G2-seq: 높은 처리량 시퀀싱 기반 기술을 늦게 게놈의 복제 확인

06:40

G2-seq: 높은 처리량 시퀀싱 기반 기술을 늦게 게놈의 복제 확인

Related Videos

6.3K Views

동시 매핑 및 인간 미토 콘 드리 아 DNA에 Ribonucleotides의 정량

12:35

동시 매핑 및 인간 미토 콘 드리 아 DNA에 Ribonucleotides의 정량

Related Videos

9.9K Views

고처리량 프리마제 프로파일링을 사용하여 DNA 프리마제에 의한 DNA 서열 인식

08:04

고처리량 프리마제 프로파일링을 사용하여 DNA 프리마제에 의한 DNA 서열 인식

Related Videos

9.2K Views

DNA 단백질 상호 작용을 연구하는 CD 분광법

06:48

DNA 단백질 상호 작용을 연구하는 CD 분광법

Related Videos

7.7K Views

Fast Protein 액체 크로마토그래피 시스템을 사용한 6X-His-Tagged 단백질의 친화성 정제

07:19

Fast Protein 액체 크로마토그래피 시스템을 사용한 6X-His-Tagged 단백질의 친화성 정제

Related Videos

3.9K Views

SV40 기반 인간 에피솜 내에서 구조가 형성되기 쉬운 DNA 반복을 통한 복제의 전기영동 분석

05:22

SV40 기반 인간 에피솜 내에서 구조가 형성되기 쉬운 DNA 반복을 통한 복제의 전기영동 분석

Related Videos

1.3K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code