Name: Identificatie en kwantificering van gestoorde metabolieten bij ernstig zieke patiënten met behulp van op NMR gebaseerde metabolomics (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-11-29T14:20:00.000+00:00
Duration: 11 min 2 s
Description: Leer NMR-gebaseerde metabolomics om gestoorde metabolieten bij ernstig zieke patiënten te identificeren. Deze methode onthult biochemische verstoringen bij ARDS voor gepersonaliseerde behandeling.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<meta charset="utf8"></head><body>Metabolomics met behulp van NMR-spectroscopie om ontregelde metabolieten te identificeren

<table><tbody><tr><td>Centirfuge</td><td>Sigma aldrich</td><td>3-18KS</td><td></td></tr><tr><td>Chenomx NMR suite&nbsp;</td><td>NMR Suite, v9, Chenomx Inc., Edmonton, Canada</td><td></td><td>NMR metaboliet kwantificatiesoftware</td></tr><tr><td>Co-axial insert</td><td>Sigma aldrich</td><td>Z278513</td><td></td></tr><tr><td>Deuterim oxide</td><td>Sigma aldrich</td><td>151882</td><td></td></tr><tr><td>Eppendorf tubes</td><td>Tarsons</td><td>500020</td><td></td></tr><tr><td>Metaboanalyst</td><td>Wishart Research Group</td><td></td><td>Metabolomics statistische analysesoftware</td></tr><tr><td>NMR tube</td><td>Wilmad</td><td>Z412007</td><td>5mm diameter</td></tr><tr><td>Pipette</td><td>Eppendorf research plus</td><td>3123000039</td><td>0-100 &mu;l</td></tr><tr><td>Sample collection vials</td><td>Tarsons cryo chill vials</td><td>523194</td><td></td></tr><tr><td>Sodium azide</td><td>Sigma aldrich</td><td>S2002</td><td></td></tr><tr><td>Sodium chloride crystal</td><td>Sigma aldrich</td><td>S9625</td><td></td></tr><tr><td>Sodium phosphate dibasic</td><td>Sigma aldrich</td><td>567550</td><td></td></tr><tr><td>Sodium phosphate monobasic</td><td>Sigma aldrich</td><td>S0751</td><td></td></tr><tr><td>Topspin 3.6.4</td><td>Bruker</td><td></td><td>NMR verwerkings- en analysetool</td></tr><tr><td>Tsp salt</td><td>Sigma aldrich</td><td>269913</td><td></td></tr></tbody></table>

identificatie en kwantificering van gestoorde metabolieten bij ernstig zieke patiënten met behulp van op nmr gebaseerde metabolomics

Identification and Quantification of Deranged Metabolites in Critically Ill Patients Using NMR-Based Metabolomics

Identificatie en kwantificering van gestoorde metabolieten bij ernstig zieke patiënten met behulp van op NMR gebaseerde metabolomics

Metabolomics is emerging as a significant approach to reflect the individual's response to pathophysiological conditions. Nuclear magnetic resonance (NMR) ...

identification-quantification-deranged-metabolites-critically-ill

Research

JoVE Journal

Biology

Biologie

Een methode voor het metaboliet extractie van microbiële gemeenschappen plankton wordt gepresenteerd. Hele gemeenschap bemonstering wordt bereikt door middel van filtratie op speciaal geprepareerde filters. Na lyofilisatie worden waterige oplosbare metabolieten geëxtraheerd. Deze aanpak maakt het voor de toepassing van milieu-metabolomics tot de trans-omics onderzoek van de natuurlijke of experimentele microbiële gemeenschappen.

Concentratie van de metabolieten van Low-density Planktonische Gemeenschappen voor het milieu Metabolomics met behulp van nucleaire magnetische resonantie spectroscopie

Een progressieve kolonisatie procedure wordt beschreven om nader te beoordelen de impact ervan op de host levermetabolisme. Colonization is gecontroleerd non invasief door het evalueren van de urinaire excretie van microbiële metabolieten door co-NMR-based metabool profiel, terwijl levermetabolisme wordt beoordeeld door de hoge resolutie Magic Angle Spinning (HR MAS) NMR profilering van intact biopsie.

Het beoordelen van de lever metabole veranderingen tijdens Progressieve kolonisatie van Kiemvrije Mouse door 1 H NMR-spectroscopie

Metaboliet profilering is waardevol geweest in de studie van het metabolisme in gezondheid en ziekte. Gebruik te maken van de normale fasen vloeistofchromatografie gekoppeld aan een hoge resolutie massaspectrometrie met polariteit schakelen en een snelle duty cycle, beschrijven we een protocol bij de polaire metabole samenstelling van biologisch materiaal met een hoge gevoeligheid, nauwkeurigheid en resolutie te analyseren.

Een strategie voor de gevoelige, Large Scale Quantitative Metabolomics

De neurochemie van het zoogdierbrein verandert bij vele neurologische en systemische ziekten. Karakteristieke profielen van cerebrale metabolieten kunnen efficiënt worden verkregen op basis van ruwe extracten van hersenweefsel. Hiervoor wordt hoge-resolutie NMR-spectroscopie gebruikt, wat een gedetailleerde kwantitatieve analyse van metabolietenconcentraties (metabolomics) mogelijk maakt.

Metabolomic Analyse van de hersenen van de rat door de hoge resolutie nucleaire magnetische resonantie spectroscopie van Tissue Extracten

Dit artikel presenteert het gebruik van PSYCHE en SAPPHIRE-PSYCHE bij de metabole profilering van planten en bevat gedetailleerde procedures voor monstervoorbereiding en optimale Pure Shift NMR-spectraregistratie. Er worden voorbeelden besproken waarmee de resolutiewinst die wordt bereikt door homonucleaire ontkoppeling een uitgebreider begrip van het systeem mogelijk maakt.

Pure Shift nucleaire magnetische resonantie: een nieuw hulpmiddel voor plantmetabolomics

We bouwden een ongerichte metabolomische workflow die XY-Meta en metaX samen integreerde. In dit protocol hebben we laten zien hoe we XY-Meta kunnen gebruiken om een lokspectrale bibliotheek te genereren uit open access spectrareferentie, en vervolgens FDR-controle uitgevoerd en de metaX gebruikt om de metabolieten te kwantificeren na het identificeren van de metabolomics-spectra.

Een geïntegreerde workflow van identificatie en kwantificering op FDR Control-Based Untargeted Metabolome

Dit protocol integreert een op maat gemaakt bioreactorsysteem met gehyperpolariseerde ¹³C NMR-spectroscopie om het real-time pyruvaatmetabolisme in levende cellen te meten, waardoor de reproduceerbaarheid en kinetische nauwkeurigheid voor metabole studies en toepassingen voor het screenen van geneesmiddelen worden verbeterd.

Real-time metabole detectie in levende cellen met behulp van gehyperpolariseerde 13C NMR

Kwantificering van DNA dubbel-strengs strepen met behulp van γH2AX vorming als een moleculaire marker is uitgegroeid tot een onmisbaar instrument in straling biologie. Hier laten we zien het gebruik van een immunofluorescentie assay voor de kwantificering van γH2AX foci na blootstelling van cellen aan straling.

Kwantificering van γH2AX Foci in reactie op ioniserende straling

De urease de methode van monstervoorbereiding voor GC / MS analyse van intermediaire metabolieten wordt gepresenteerd door de uitvinder ervan. De methode maakt een stap-follow-up van de pasgeboren screening op aangeboren afwijkingen door tandem massaspectrometrie door het kwantificeren van koolhydraten, organische en aminozuren allemaal in een enkel proces.

Een stap Metabolomica: Koolhydraten, organische-en aminozuren gekwantificeerd in een uniforme procedure

Combinatie van genomics, co-expressie gen analyse en de identificatie van doelverbindingen via metabolisme geven gen functionele annotatie.

Annotatie van Plant functie van een gen via gecombineerde Genomics, metabolomics en Informatica

Leer NMR-gebaseerde metabolomics om gestoorde metabolieten bij ernstig zieke patiënten te identificeren. Deze methode onthult biochemische verstoringen bij ARDS voor gepersonaliseerde behandeling.

Identificatie en kwantificering van gestoorde metabolieten bij ernstig zieke patiënten met behulp van op NMR gebaseerde metabolomics (Video) | JoVE Journal

Identificatie en kwantificering van gestoorde metabolieten bij ernstig zieke patiënten met behulp van op NMR gebaseerde metabolomics

Meer video's verkennen