Zautomatyzowana kwantyfikacja interakcji komórek krwiotwórczych – komórek zrębu w obrazach histologicznych kości nieodwapnionej

Ogólnym celem tej procedury jest ilościowe określenie powiązań między określonymi podzbiorami komórek w szpiku kostnym. Osiąga się to poprzez pierwsze pobranie histologicznych skrawków kriogenicznych z guzów kości udowych myszy. W drugim etapie skrawki są barwione do analizy immunofluorescencyjnej i pozyskiwane są obrazy konfokalne.

Obrazy są następnie analizowane cyfrowo. Ostatecznie pozycje różnych typów komórek można symulować w celu obliczenia szybkości i częstotliwości kontaktu między określonymi komórkami immunologicznymi będącymi przedmiotem zainteresowania a ich mikrośrodowiskiem. Po raz pierwszy wpadliśmy na pomysł tej metody, gdy analizowaliśmy nisze mikrośrodowiskowe dla długowiecznych komórek plazmatycznych w szpiku kostnym i potrzebowaliśmy metody jednoznacznego ilościowego określenia powiązań komórkowych w tkance szpiku kostnego.