Name: Mechaniczna separacja i solubilizacja białek zewnętrznych i wewnętrznych podwarstw perywiteliny z jaj kurzych (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-01-27T13:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 12 s
Description: Poznaj metodę mechanicznej separacji podwarstw perywiteliny z jaj kurzych i ich solubilizacji białkowej. Protokół zapewnia minimalne straty białek i wysoką jakość próbek do analizy proteomicznej.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Jesteśmy wdzięczni Philippe'owi Didierowi i Karine Anger (INRAE, PEAT, 37380, Nouzilly, Francja, https://doi.org/10.15454/1.5572326250887292E12) za dostarczenie niezapłodnionych jaj Isa-brown. Dziękujemy również Uniwersytetowi w Tours we Francji za sfinansowanie studiów doktoranckich M. Bregeona. Prace te otrzymały wsparcie finansowe od Francuskiej Narodowej Agencji Badawczej (EQLIPSE, ANR-19-CE21-0006).

1. PL, IPL i OPL
<ol>
	<li>Pobieranie próbek PL
	<ol>
		<li>Świeżo zniesione, niezapłodnione jajo należy rozbić ręcznie i za pomocą separatora do jaj leżącego na szklanej zlewce, aby oddzielić żółtko od białka. Usuń gradówkę małymi nożyczkami i rozwałkuj żółtko na bibule filtracyjnej, aby usunąć przylegające białko, które wygląda jak przezroczysta i widoczna struktura (<silna klasa = "xfig" >Rysunek 2A). 
		UWAGA: Uważaj, aby nie przebić PL nożyczkami. Użycie pęsety zamiast nożyczek do usuwania gradówek może spowodować pęknięcie PL, a następnie wyciek żółtka. Etap zwijania bibuły filtracyjnej ma kluczowe znaczenie i powinien być wykonany bardzo szybko ze względu na właściwości absorpcyjne filtra bibułowego, które mogą spowodować pęknięcie PL. Bardzo ważne jest również, aby używać niezapłodnionej komórki jajowej od dnia zniesienia, aby zoptymalizować sukces tego pierwszego kroku i wszystkich kolejnych kroków. Alternatywnie można użyć jaj, które były przechowywane krócej niż 10 dni w chłodnym środowisku, ale eksperymentatorzy muszą wziąć pod uwagę potencjalne ryzyko zmian PL.</li>
		<li>Zanurzyć żółtko w krystalizatorze zawierającym 10 mM Tris-HCl pH 8, który został wcześniej schłodzony do 4 °C i usunąć obszar PL nad krążkiem kiełkowym w strefie 1 cm za pomocą nożyczek (<klasa silna="xfig">Rysunek 2B). 
		UWAGA: Początkowo PL był zanurzany w wodzie dejonizowanej, ale takie podejście ma pewne wady, takie jak brak kontroli pH i trudności z późniejszym oddzieleniem podwarstw (krok 1.2). W związku z tym przetestowano kilka warunków, w tym stężenie Tris (<klasa silna = "xfig" >Rysunek 3A) i pH (<klasa silna = "xfig" >Rysunek 3B). Stosowanie buforu o pH 8, zamiast wody dejonizowanej lub demineralizowanej, jest zgodne z fizjologią jaj (pH białka jaja wynosi około 7,8 w dniu zniesienia)14 i minimalizuje utratę białka. W przeciwieństwie do tego, podejrzewa się, że kwaśne lub bardzo zasadowe pH powoduje destrukturację PL i wczesną solubilizację białek (<silna klasa = "xfig">Rysunek 3B). Stwierdzono, że bufor złożony z 10 mM Tris-HCl pH 8 jest optymalny, ponieważ szanuje fizjologię jaj i nie powoduje znaczącej solubilizacji białek (stężenie białka w buforze roboczym pozostaje minimalne, <silna klasa = "xfig" >Rysunek 3A,B).</li>
		<li>Rozerwij PL małymi nożyczkami w buforze. Przytrzymaj dwie krawędzie pękniętego PL kleszczami i oderwij PL od żółtka.</li>
		<li>Utrzymuj PL za pomocą kleszczy i przepłucz PL kilka razy w kilku kąpielach 10 mM Tris-HCl, pH 8, aż nie będzie widoczny ślad żółtka. Na tym etapie upewnij się, że PL jest czysta, biała i unosi się w buforze. Można go przetworzyć w kroku 1.2 w celu separacji podwarstw lub bezpośrednio w kroku 2.1 w przypadku analiz biochemicznych.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Próbkowanie OPL i IPL
	<ol>
		<li>Rozłóż całą próbkę PL, umieszczając OPL w górę na plastikowej szalce Petriego i utrzymując ją płaską z jak najmniejszą liczbą zmarszczek. Przykryj próbkę 10 mM Tris-HCl pH 8, 50 mM NaCl. Użyj plastikowej szalki Petriego (a nie szkła), aby ograniczyć ruchy PL, ponieważ PL lepiej przylega do plastiku.
		<ol>
			<li>Aby zlokalizować stronę OPL, spójrz na lokalizację pozostałych gradówek, które są przyczepione do OPL, a nie IPL. Ten etap wymaga małego stężenia NaCl (50 mM), aby ułatwić separację podwarstw. 
			UWAGA: Na podstawie wykresu przedstawionego w Rysunek 3C i literature11, stężenie to nie powinno prowadzić do znacznej utraty białka. Początkowo do oddzielenia podwarstw używano wody dejonizowanej, jak opisano wcześniej1,5,6, ale technika ta okazała się bardzo pracochłonna i doprowadziła do zmiany integralności strukturalnej PL. W związku z tym przetestowano różne stężenia NaCl (<klasa silna = "xfig" >Rysunek 3C), ponieważ sól ułatwiła oddzielenie dwóch podwarstw. Warto jednak zauważyć, że zastosowanie stężenia NaCl >100 mM zwiększa solubilizację/uwalnianie białka z PL, co nie jest tutaj celem (będzie to celem w kroku 2) (<silna klasa="xfig">Rysunek 3C). Dodanie 50 mM NaCl do 10 mM buforu Tris-HCl pH 8 ułatwia oddzielenie dwóch podwarstw i minimalizuje utratę białka.</li>
		</ol>
		</li>
		<li>Pokrój cały PL na kawałki o wymiarach około 2 cm x 3 cm małymi nożyczkami. Mechanicznie oddziel dwie warstwy każdego elementu PL za pomocą ultraprecyzyjnych kleszczyków z końcówką pod lornetkowym mikroskopem preparacyjnym (<silna klasa = "xfig">Rysunek 4). Otrzymane próbki IPL i OPL należy przechowywać pojedynczo w mikroprobówkach w temperaturze -80 °C, aż do dalszego użycia. 
		UWAGA: W tym miejscu protokół można wstrzymać. Należy zauważyć, że wydajność i łatwość oddzielenia dwóch warstw w dużej mierze zależy od świeżości jaja. Rzeczywiście, przechowywane jaja wykazują drastyczne modyfikacje wewnętrzne spowodowane szybkim wzrostem pH białka jaja i późniejszą zmianą indeksu żółtkowego z powodu rozluźnienia (i osłabienia) PL. IPL jest bardziej kruchy w porównaniu z OPL. Dlatego lepiej jest umieścić czoło OPL powyżej i oddzielić dwie podwarstwy, ciągnąc OPL za pomocą kleszczy. Z obydwoma podwarstwami należy obchodzić się z najwyższą ostrożnością.</li>
	</ol>
	</li>
</ol>
2. Obróbka próbki do solubilizacji białek i analizy SDS-PAGE
<ol>
	<li>Solubilizacja białek pierwotnych
	<ol>
		<li>Liofilizowane próbki IPL i OPL pojedynczo. Po zakończeniu liofilizacji należy pokroić około 1 mg z każdej próbki do czystych mikroprobówek z szczelną nakrętką. Pozostałe próbki należy przechowywać w szczelnie zamkniętych probówkach do dłuższego przechowywania w temperaturze -80 °C. 
		UWAGA: Zastosowanie mikroprobówek z szczelną nakrętką zapewnia hermetyczne i szczelne zamknięcie, aby zapobiec ponownemu nawodnieniu próbki i zabezpieczyć próbki.</li>
		<li>Zmieszać 1 mg każdej liofilizowanej podwarstwy z 400 μl 50 mM Tris pH 7, 500 mM NaCl. Użyj mieszalnika-młyna 2 razy przez 5 minut przy 30 Hz, aby rozbić struktury OPL i OPL w mikrocząstkach i ułatwić solubilizację białek. Zebrać 400 μl próbek zawierających OPL i IPL w dwóch czystych mikroprobówkach. 
		UWAGA: Zastosowany tutaj bufor został wybrany w celu zwiększenia solubilizacji białek (w przeciwieństwie do kroku 1). Bufor ten został oparty na wynikach przedstawionych w <silna klasa="xfig">Rysunek 3, które pokazują wzrost solubilizacji białek przy pH 7 (<silna klasa="xfig">Rysunek 3B) i przy użyciu 0,5 M NaCl (<silna klasa="xfig">Rysunek 3C). W tym miejscu protokół można wstrzymać. Na tym etapie próbki mogą być wykorzystane do oczyszczania białek z głównych białek PL lub przetworzone do kroku 2.2.</li>
	</ol>
	</li>
	<li>Solubilizacja białek do elektroforezy
	<ol>
		<li>Dodać 5 razy bufor próbki SDS-PAGE (100 μL, 0,25 M Tris-HCl, 0,05% błękitu bromofenolowego, 50% glicerolu, 5% SDS, 5% beta-merkaptoetanolu, pH 6,8) do każdych 400 μL próbki i podgrzewać w temperaturze 100 °C przez 5 min. 
		UWAGA: W tym miejscu można wstrzymać działanie protokołu, a próbki można przechowywać w temperaturze -80 °C. Na tym etapie protokołu OPL i IPL są całkowicie rozwiązane. Wydajność solubilizacji próbki można ocenić, odwirowując próbki przez 5 minut przy 10 000 x g. Całkowita solubilizacja charakteryzuje się brakiem widocznego osadu po odwirowaniu. Tak więc po całkowitej sorozpuśnieniu przyjmuje się, że 1 mg liofilizowanej podwarstwy odpowiada 1 mg białek (stężenie białka w próbce 500 μL wynosi 2 mg/ml). Rzeczywiście, PL składa się w ponad 80% z białka2,15. Użycie 5-krotnego buforu próbki ogranicza rozcieńczenie próbki, ale można również zastosować 1-krotny lub 2-krotny bufor próbki.</li>
		<li>Załadować maksymalnie 20 μg białek/linię na żel poliakrylamidowy SDS (żel o gradiacji 4%–20%) i przeprowadzić elektroforezę pod napięciem 120 V przy użyciu pionowego systemu elektroforezy. 
		UWAGA: Stosowanie żelu o gradiach 4%–20% nie jest obowiązkowe, ale jest preferowane w tym przypadku, ponieważ OPL i IPL wykazują białka o masie cząsteczkowej w zakresie od <10 kDa do >250 kDa. Przydatne może być również przechowywanie żelu do układania w stosy (który zwykle jest usuwany), ponieważ obecność nierozpuszczalnych białek lub agregatów białkowych na dnie studzienek wskazywałaby na słabą rozpuszczalność i możliwy brakujący etap podczas przygotowywania próbki.</li>
		<li>Po elektroforezie usuń żele ze szklanych płytek i zabarwij roztworem Coomassie Brilliant Blue (50%H2O, 40% EtOH, 10% kwas octowy i R250 Coomassie Brilliant Blue) przez 30 min.</li>
		<li>Odbarwić roztworem składającym się z 50%H2O, 40% EtOH, 10% roztworu kwasu octowego, aż tło żelu stanie się jasnoniebieskie.</li>
		<li>Na koniec przenieś żel na szalki Petriego zawierające wodę dejonizowaną, aby uzyskać odbarwienie i ponowne uwodnienie żeli poliakrylamidowych. Białka powinny wyglądać jak niebieskie paski na przezroczystym tle.</li>
	</ol>
	</li>
</ol>

<ol><li>Mann, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proteomic+analysis+of+the+chicken+egg+vitelline+membrane%5BTitle%5D)+AND+%22Proteomics%22%5BJournal%5D)">Proteomic analysis of the chicken egg vitelline membrane.</a> Proteomics. 8 (11), 2322-2332 (2008).</li>
<li>Chung, W. H., Lai, K. M., Hsu, K. -C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+study+on+histological+structures+of+the+vitelline+membrane+of+hen+and+duck+egg+observed+by+cryo-scanning+electron+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Agricultural+and+Food+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Comparative study on histological structures of the vitelline membrane of hen and duck egg observed by cryo-scanning electron microscopy.</a> Journal of Agricultural and Food Chemistry. 58 (3), 1794-1799 (2010).</li>
<li>Kido, S., Doi, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Separation+and+Properties+of+the+Inner+and+Outer+Layers+of+the+Vitelline+Membrane+of+Hen%27s+Eggs%5BTitle%5D)+AND+%22Poultry+Science%22%5BJournal%5D)">Separation and Properties of the Inner and Outer Layers of the Vitelline Membrane of Hen's Eggs.</a> Poultry Science. 67 (3), 476-486 (1988).</li>
<li>Steele, M. G., Meldrum, W., Brillard, J. P., Wishart, G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+interaction+of+avian+spermatozoa+with+the+perivitelline+layer+in-vitro+and+in-vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Reproduction+and+Fertility%22%5BJournal%5D)">The interaction of avian spermatozoa with the perivitelline layer in-vitro and in-vivo.</a> Journal of Reproduction and Fertility. 101 (3), 599-603 (1994).</li>
<li>Bain, J. M., Hall, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Observations+on+the+development+and+structure+of+the+vitelline+membrane+of+the+hen%27s+egg%3A+an+electron+microscope+study%5BTitle%5D)+AND+%22Australian+Journal+of+Biological+Sciences%22%5BJournal%5D)">Observations on the development and structure of the vitelline membrane of the hen's egg: an electron microscope study.</a> Australian Journal of Biological Sciences. 22 (3), 653-665 (1969).</li>
<li>Damaziak, K., Kieliszek, M., Buclaw, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+structure+and+protein+of+vitelline+membranes+of+precocial+%28ring-necked+pheasant%2C+gray+partridge%29+and+superaltricial+%28cockatiel+parrot%2C+domestic+pigeon%29+birds%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Characterization of structure and protein of vitelline membranes of precocial (ring-necked pheasant, gray partridge) and superaltricial (cockatiel parrot, domestic pigeon) birds.</a> PLoS One. 15 (1), 0228310(2020).</li>
<li>Bellairs, R., Harkness, M., Harkness, R. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+vitelline+membrane+of+the+hen%27s+egg%3A+a+chemical+and+electron+microscopical+study%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Ultrastructure+Research%22%5BJournal%5D)">The vitelline membrane of the hen's egg: a chemical and electron microscopical study.</a> Journal of Ultrastructure Research. 8 (3-4), 339-359 (1963).</li>
<li>Kido, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+vitelline+membrane+outer+layer+protein+I%2C+VMO-I%3A+amino+acid+sequence+and+structural+stability%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Characterization of vitelline membrane outer layer protein I, VMO-I: amino acid sequence and structural stability.</a> Journal of Biochemistry. 117 (6), 1183-1191 (1995).</li>
<li>Damaziak, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+analysis+of+structure+and+strength+of+vitelline+membrane+and+physical+parameters+of+yolk+of+ostrich%2C+emu%2C+and+greater+rhea+eggs%5BTitle%5D)+AND+%22Poultry+Science%22%5BJournal%5D)">Comparative analysis of structure and strength of vitelline membrane and physical parameters of yolk of ostrich, emu, and greater rhea eggs.</a> Poultry Science. 97 (3), 1032-1040 (2018).</li>
<li>Kirunda, D. F., McKee, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Relating+quality+characteristics+of+aged+eggs+and+fresh+eggs+to+vitelline+membrane+strength+as+determined+by+a+texture+analyzer%5BTitle%5D)+AND+%22Poultry+Science%22%5BJournal%5D)">Relating quality characteristics of aged eggs and fresh eggs to vitelline membrane strength as determined by a texture analyzer.</a> Poultry Science. 79 (8), 1189-1193 (2000).</li>
<li>Back, J. F., Bain, J. M., Vadehra, D. V., Burley, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proteins+of+the+outer+layer+of+the+vitelline+membrane+of+hen%27s+eggs%5BTitle%5D)+AND+%22Biochimica+Et+Biophysica+Acta%22%5BJournal%5D)">Proteins of the outer layer of the vitelline membrane of hen's eggs.</a> Biochimica Et Biophysica Acta. 705 (1), 12-19 (1982).</li>
<li>Waclawek, M., Foisner, R., Nimpf, J., Schneider, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+chicken+homologue+of+zona+pellucida+protein-3+is+synthesized+by+granulosa+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+of+Reproduction%22%5BJournal%5D)">The chicken homologue of zona pellucida protein-3 is synthesized by granulosa cells.</a> Biology of Reproduction. 59 (5), 1230-1239 (1998).</li>
<li>Okumura, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+newly+identified+zona+pellucida+glycoprotein%2C+ZPD%2C+and+dimeric+ZP1+of+chicken+egg+envelope+are+involved+in+sperm+activation+on+sperm-egg+interaction%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemical+Journal%22%5BJournal%5D)">A newly identified zona pellucida glycoprotein, ZPD, and dimeric ZP1 of chicken egg envelope are involved in sperm activation on sperm-egg interaction.</a> Biochemical Journal. 384, Pt 1 191-199 (2004).</li>
<li>Guyot, N., Rehault-Godbert, S., Nys, Y., Baron, F. Understanding the natural antibacterial defences of egg white and their regulation. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aGuyot%2C+N+%22Achieving+Sustainable+Production+of+Eggs+Volume+1%22">Achieving Sustainable Production of Eggs Volume 1</a>. Roberts, J. 1, Burleigh Dodds Science Publishing Limited. Cambridge, UK. 161-193 (2016).</li>
<li>Trziszka, T., Smolinska, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemical+Characterization+of+the+Vitelline+Membrane+of+Hens+Eggs%5BTitle%5D)+AND+%22Food+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Chemical Characterization of the Vitelline Membrane of Hens Eggs.</a> Food Chemistry. 8 (1), 61-70 (1982).</li>
<li>Berardinelli, A., Ragni, L., Giunchi, A., Gradari, P., Guarnieri, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Physical-mechanical+modifications+of+eggs+for+food-processing+during+storage%5BTitle%5D)+AND+%22Poultry+Science%22%5BJournal%5D)">Physical-mechanical modifications of eggs for food-processing during storage.</a> Poultry Science. 87 (10), 2117-2125 (2008).</li>
<li>Kelley, A. J. The effects of storage time on vitelline membrane protein banding patterns and interior egg quality of eggs from nonmolted and molted hens. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Texas+A%26M+University%22">Texas A&M University</a>. , Master of Science Thesis (2003).</li>
<li>Schafer, A., Drewes, W., Schwagele, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+vitelline+membrane+proteins+of+fresh+and+stored+eggs+via+HPLC%5BTitle%5D)+AND+%22Zeitschrift+F%C3%BCr+LebensmittelUntersuchung+Und-Forschung+A.+Food+Research+and+Technology%22%5BJournal%5D)">Analysis of vitelline membrane proteins of fresh and stored eggs via HPLC.</a> Zeitschrift Für LebensmittelUntersuchung Und-Forschung A. Food Research and Technology. 206 (5), 329-332 (1998).</li>
<li>Romanoff, A. L. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRomanoff%2C+AL+%22The+avian+embryo%3A+Structural+and+functional+development%22">The avian embryo: Structural and functional development</a>. , The Macmillan Company. New York, NY. (1960).</li>
<li>Haas, H. J., Spratt, N. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Contributions+to+an+analysis+of+the+avian+vitelline+membrane%27s+potential+to+promote+outgrowth+of+the+yolk+sac-serosal+membrane%5BTitle%5D)+AND+%22The+Anatomical+Record%22%5BJournal%5D)">Contributions to an analysis of the avian vitelline membrane's potential to promote outgrowth of the yolk sac-serosal membrane.</a> The Anatomical Record. 184 (2), 227-231 (1976).</li>
<li>Jensen, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultrastructural+changes+in+the+avian+vitelline+membrane+during+embryonic+development%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Embryology+and+Experimental+Morphology%22%5BJournal%5D)">Ultrastructural changes in the avian vitelline membrane during embryonic development.</a> Journal of Embryology and Experimental Morphology. 21 (3), 467-484 (1969).</li>
<li>Barbato, G. F., Cramer, P. G., Hammerstedt, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+practical+in+vitro+sperm-egg+binding+assay+that+detects+subfertile+males%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+of+Reproduction%22%5BJournal%5D)">A practical in vitro sperm-egg binding assay that detects subfertile males.</a> Biology of Reproduction. 58 (3), 686-699 (1998).</li>
<li>New, D. A. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Adhesive+Properties+and+Expansion+of+the+Chick+Blastoderm%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Embryology+and+Experimental+Morphology%22%5BJournal%5D)">The Adhesive Properties and Expansion of the Chick Blastoderm.</a> Journal of Embryology and Experimental Morphology. 7 (2), 146-164 (1959).</li>
<li>New, D. A. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+New+Technique+for+the+Cultivation+of+the+Chick+Embryo%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Embryology+and+Experimental+Morphology%22%5BJournal%5D)">A New Technique for the Cultivation of the Chick Embryo.</a> Journal of Embryology and Experimental Morphology. 3 (4), 326-331 (1955).</li>
<li>Kido, S., Janado, M., Nunoura, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Macromolecular+components+of+the+vitelline+membrane+of+hen%27s+egg.+I.+Membrane+structure+and+its+deterioration+with+age%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Macromolecular components of the vitelline membrane of hen's egg. I. Membrane structure and its deterioration with age.</a> Journal of Biochemistry. 78 (2), 261-268 (1975).</li>
<li>Kido, S., Janado, M., Nunoura, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Macromolecular+components+of+the+vitelline+membrane+of+hen%27s+egg.+II.+Physicochemical+properties+of+glycoprotein+I%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Macromolecular components of the vitelline membrane of hen's egg. II. Physicochemical properties of glycoprotein I.</a> Journal of Biochemistry. 79 (6), 1351-1356 (1976).</li>
<li>Kido, S., Janado, M., Nunoura, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Macromolecular+components+of+the+vitelline+membrane+of+hen%27s+egg.+III.+Physicochemical+properties+of+glycoprotein+II%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Macromolecular components of the vitelline membrane of hen's egg. III. Physicochemical properties of glycoprotein II.</a> Journal of Biochemistry. 81 (5), 1543-1548 (1977).</li>
<li>Réhault-Godbert, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ovalbumin-related+protein+X+is+a+heparin-binding+ov-serpin+exhibiting+antimicrobial+activities%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biological+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Ovalbumin-related protein X is a heparin-binding ov-serpin exhibiting antimicrobial activities.</a> Journal of Biological Chemistry. 288 (24), 17285-17295 (2013).</li>
<li>Gautron, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ovotransferrin+is+a+matrix+protein+of+the+hen+eggshell+membranes+and+basal+calcified+layer%5BTitle%5D)+AND+%22Connective+Tissue+Research%22%5BJournal%5D)">Ovotransferrin is a matrix protein of the hen eggshell membranes and basal calcified layer.</a> Connective Tissue Research. 42 (4), 255-267 (2001).</li>
<li>Guyot, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proteomic+analysis+of+egg+white+heparin-binding+proteins%3A+towards+the+identification+of+natural+antibacterial+molecules%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+Reports%22%5BJournal%5D)">Proteomic analysis of egg white heparin-binding proteins: towards the identification of natural antibacterial molecules.</a> Scientific Reports. 6, 27974(2016).</li>
<li>Guyot, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((function%2C+and+evolution+of+Gga-AvBD11%2C+the+archetype+of+the+structural+avian-double-beta-defensin+family%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">function, and evolution of Gga-AvBD11, the archetype of the structural avian-double-beta-defensin family.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117 (1), 337-345 (2020).</li>
<li>Mori, M., Masuda, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proteins+of+the+vitelline+membrane+of+quail+%28Coturnix+coturnix+japonica%29+eggs%5BTitle%5D)+AND+%22Poultry+Science%22%5BJournal%5D)">Proteins of the vitelline membrane of quail (Coturnix coturnix japonica) eggs.</a> Poultry Science. 72 (8), 1566-1572 (1993).</li>
</ol>

Autorzy nie mają nic do ujawnienia.

Sukces obecnego protokołu opiera się na dwóch krytycznych etapach, które zostały niezależnie zoptymalizowane: mechanicznej separacji OPL i IPL, które muszą być jak najmniej destrukturyzujące, a następnie całkowitej solubilizacji białek każdej podwarstwy, która jest odwrotnie, destrukturalizacją i denaturacją. Podkreślono w nim również kilka konkretnych punktów, które należy wziąć pod uwagę, aby zapewnić pomyślne osiągnięcie każdego kroku.
Protokół nie zależy od koloru skorupki jaja, masy jaja, rodzaju produkcji ani szczepu genetycznego kury. Zależy to jednak od świeżości jajka. Rzeczywiście, jajo ulega głębokim wewnętrznym modyfikacjom fizykochemicznym szybko po złożeniu, chociaż zmiany te mogą być opóźnione, gdy przechowywanie odbywa się w warunkach chłodniczych14,15. Utrata dwutlenku węgla przez pory skorupki jaja podczas przechowywania powoduje wzrost pH białka jaja (z 7,8 do 9,5), podczas gdy pewna wymiana wody zachodzi między żółtkiem a białkiem w całej PL. Obie modyfikacje negatywnie wpływają na strukturę molekularną i histologiczną PL, która staje się osłabiona i mniej napięta14,15, prawdopodobnie z powodu fizykochemicznych modyfikacji zawartości białka 16,17,18. Zakłada się, że oddzielenie podwarstw stanie się bardzo trudne w przypadku przechowywanych jaj, zwłaszcza jeśli przechowywanie odbywa się przez długi czas w temperaturze pokojowej. Do tej pory protokół przeprowadzano przy użyciu jaj przechowywanych krócej niż 4 dni w temperaturze 4 °C, a maksymalny czas przechowywania jaja w celu skutecznego pobrania próbek podwarstw PL nie jest jeszcze znany. Ponadto, jeśli celem jest analiza każdej podwarstwy, kluczowe jest użycie niezapłodnionych jaj. W dniu zniesienia zarodek zapłodnionej komórki jajowej ma 23 godziny, a jego rozwój jest bardzo szybki, jeśli jajo jest inkubowane. Rzeczywiście, rozwój embrionalny i wzrost niektórych struktur pozaembrionalnych rozszerza się przy użyciu PL jako podłoża, które w ten sposób ulega szybkiej degradacji i jest zastępowane przez pozaembrionalny woreczek żółtkowy19.
Po ręcznym oddzieleniu żółtka od białka jaja, żółtko należy oczyścić ze śladów białka jaja oraz z gradówki, która pozostała ściśle związana z PL. Wskazówka polega na tym, aby ostrożnie zwinąć żółtko na bibułę filtracyjną i wykonać obszerne płukanie żółtka w roztworach buforowych (10 mM Tris-HCl pH 8). pH użyte do buforu jest zgodne z fizjologicznym pH białka jaja14 i wykazano, że minimalizuje utratę białka (ryc. 3). Zastosowanie buforu chłodzonego pomoże następnie usunąć PL z żółtka, ponieważ w temperaturze 4 °C bufor ułatwi usuwanie PL, ponieważ żółtko lipidowe cofa się i staje się mniej płynne w tej temperaturze. Dodatkowe płukania pozwolą na usunięcie resztek żółtka z PL. Ważne jest również, aby wyciąć strefę odpowiadającą krążkowi zarodkowemu, ponieważ ta struktura, która zawiera żeńskie przedjądrze, może nie być reprezentatywna dla PL. Jest to miejsce zapłodnienia i namnażania się komórek zarodkowych po zapłodnieniu komórki jajowej. Ma on mieć określony skład, który może nie być reprezentatywny dla całego PL, co jest powodem, dla którego został usunięty. Ten konkretny krok jest znacznie ułatwiony, gdy żółtko jest zanurzone w zimnym buforze. Chociaż ta struktura dysku rozrodczego została odrzucona w niniejszym protokole (poza celami), szczegółowe analizy tego obszaru w zapłodnionych jajach mogą być bardzo przydatne dla naukowców zainteresowanych badaniem ewolucji zawartości PL (proteomika i aktywność) i struktury (mikroskopia elektronowa) we wczesnych stadiach embriogenezy 19,20,21 . Na tym etapie cała PL jest strukturalnie nienaruszona i może być przetworzona do dalszej analizy strukturalnej za pomocą mikroskopii elektronowej (rysunek 2), do kroku 1.2 lub do kroku 2.1 (jeśli celem jest analiza całego PL).
Krok 1.2 należy przeprowadzić pod lornetkowym mikroskopem preparacyjnym, ponieważ PL jest bardzo cienki i kruchy (około 10 μm grubości). Rozdzielenie podwarstw jest prawie niemożliwe w wodzie lub w buforze pozbawionym minimalnej ilości soli, a początkowe próby użycia tych opcji doprowadziły do poważnych uszkodzeń PL. Tak więc bufor wybrany do tego etapu pozostaje w fizjologicznym pH (pH 8) i zawiera 50 mM NaCl. Ten krok jest żmudny i musi być wykonywany ostrożnie i delikatnie, aby zapobiec rozdarciu PL. Po rozdzieleniu dwie podwarstwy można łatwo zidentyfikować, ponieważ wykazują one szczególne cechy fizyczne (nieprzezroczyste lub półprzezroczyste). Brak jednorodności IPL w świetle mikroskopu powinien odzwierciedlać niepełną separację, a tym samym obecność pozostałych plamek OPL obecnych na IPL. Ponadto bardzo trudno jest poddać obróbce całą membranę, a użycie kawałków o wymiarach 2 cm x 3 cm znacznie zwiększa szanse na sukces. Otrzymana w ten sposób podwarstwa nadaje się do badania histologicznego za pomocą mikroskopii elektronowej (ryc. 1). Warto zauważyć, że specyficzna struktura liniowa (o grubości od 0,05 do 1 μm) zwana membraną ciągłą (CM) jest widoczna na mikrofotografii (rysunek 1) i pozostaje zwykle przyczepiona do jednej lub drugiej podwarstwy podczas procesu separacji. Wcześniej opublikowano, że przy użyciu stosunkowo wysokiego molomatu soli do separacji (500 mM), CM pozostał przyłączony do OPL7, podczas gdy użycie wody5 będzie sprzyjać przyłączeniu CM do IPL. W tym protokole do osiągnięcia określonych celów stosuje się niską molowość soli (strukturalnie nienaruszona podwarstwa PL i minimalna utrata białek), co oznacza, że ten CM jest prawdopodobnie związany z IPL. Jednak dodatkowa analiza IPL i OPL za pomocą transmisyjnej mikroskopii elektronowej jednoznacznie potwierdziłaby tę hipotezę. Warstwy PL, OPL lub IPL uzyskane na końcu etapu 1 mogą być również wykorzystane do testów in vitro do analiz wiązania plemnika z komórką jajową22 lub do analizy wczesnych etapów rozwoju embrionalnego23,24.
Krok 2 odnosi się do rozpuszczania zawartości białka, częściowo (krok 2.1) lub całkowicie (krok 2.2). PL i/lub OPL są najpierw liofilizowane w celu usunięcia cząsteczek wody i umożliwienia precyzyjnych pomiarów masy. Rzeczywiście, PL składa się głównie z wody (88%)7, podczas gdy sucha masa zawiera głównie białka (od 80% do 90% w zależności od badań), węglowodany, tłuszcze i minerały 2,7,25. Biorąc pod uwagę, że woda zawarta w PL jest usuwana przez liofilizację, że węglowodany są zasadniczo odzyskiwane w glikoproteinach PL oraz że tłuszcz i minerały pochodzące z żółtka są zasadniczo odrzucane przez intensywne płukanie, zakłada się, że otrzymany PL składa się prawie wyłącznie z białek. Zatem wartość wagowa uzyskana po całkowitej liofilizacji powinna odpowiadać głównie białkom. Równa ilość PL, OPL i/lub IPL jest następnie rozcieńczana w buforze zawierającym 0,5 M NaCl. Wysoka molowość soli w połączeniu z mechanicznym niszczeniem sieci włóknistej przez mielenie znacznie ułatwia solubilizację białek w warunkach niedenaturacyjnych. Po tym etapie następuje całkowita rozpuszczalność przy użyciu wrzącego detergentu SDS i środka redukującego beta-merkaptoetanolu (krok 2.2). Rzeczywiście, niektóre białka IPL to glikoproteiny rozpuszczalne w SDS 25,26,27, a głównymi składnikami OPL są rozpuszczalne w NaCl 1,11. Korzystając z tego protokołu, nie zaobserwowaliśmy żadnych pozostałych osadów nierozpuszczalnych białek po odwirowaniu, co wskazuje, że solubilizacja była prawdopodobnie zakończona. Białka z PL, OPL i/lub IPL zostały następnie przeanalizowane za pomocą SDS-PAGE. Uzyskane profile białek są zgodne z opublikowaną literaturą 2,4,11,16, ale rozdzielczość i intensywność sygnału jest znacznie lepsza i znacznie bardziej jednorodna między różnymi niezależnymi próbkami IPL i OPL.
Ponadto porównanie ilościowe między OPL i IPL jest możliwe dzięki dokładności masy, którą wywnioskowaliśmy dla odpowiednich podwarstw 2,7. Co więcej, zarówno profile OPL, jak i IPL są bardzo różne i z wyjątkiem słabego pasma o masie 14 kDa i 75 kDa, obie podwarstwy PL nie mają widocznie wspólnych pasm o tej samej masie cząsteczkowej. Obserwacja ta potwierdza skuteczność separacji podwarstw bez znaczącego zanieczyszczenia krzyżowego. Zgodnie z jedyną opublikowaną analizą proteomiczną PL1, najintensywniejsze prążki w OPL (<30 kDa) powinny odpowiadać lizozymowi (14 kDa), białku zewnętrznej warstwy błony witeliny 1 (17 kDa), ptasiej beta-defensyny 11 (pozorna masa cząsteczkowa 12 kDa), podczas gdy intensywne pasma IPL (>30 kDa) to prawdopodobnie białko Zona-Pellucida 1 (102 kDa) i białko Zona-Pellucida 3 (47 kDa). Dystrybucja bardzo obfitych białek PL: owotransferyny (78 kDa), białka X związanego z albuminą jaja kurzego (45 kDa), albuminy jaja kurzego (43 kDa)1 między podwarstwami pozostaje do wyjaśnienia. Rzeczywiście, wysoka masa cząsteczkowa tych białek (>30 kDa) sugeruje, że są to białka IPL w oparciu o profil SDS-PAGE, ale ich specyficzność tkankowa (białka ulegające ekspresji w jajowodach) raczej wiązałaby te białka z OPL 28,29. Co więcej, niektórzy sugerowali, że potencjalne zanieczyszczenie próbek PL białkiem jaja i białkami żółtka jaja z powodu niewystarczającego płukania1. Ten brak informacji jest podstawą do opracowania niniejszego protokołu, który będzie dalej wykorzystywany do pogłębionej proteomiki ilościowej PL, OPL i IPL.
Alternatywnie, począwszy od etapu 2.1 i po odwirowaniu w celu usunięcia substancji nierozpuszczalnej, możliwe jest wyekstrahowanie niektórych określonych białek w celu dalszej charakterystyki biochemicznej i biologicznej. Takie podejście zostało ostatnio zastosowane do scharakteryzowania aktywności biologicznej i/lub struktury 3D dwóch głównych składników OPL, białka zewnętrznej warstwy błony witeliny 1 (VMO1) i ptasiej beta-defensyny 11 (AvBD11)30,31. Dostępność tych białek w postaci oczyszczonych cząsteczek może również pomóc w wytwarzaniu specyficznych przeciwciał do dodatkowych eksperymentów, takich jak immunohistochemia, lub do opracowania testów ilościowych, w tym testów immunoenzymatycznych.
Dwa główne ograniczenia tego protokołu to (1) wyzwanie związane z separacją podwarstw, zwłaszcza jeśli jaja były przechowywane dłużej niż 4 dni w temperaturze 4°C oraz (2) fakt, że całkowita rozpuszczalność białek wymaga redukujących i denaturujących, które pogarszają wewnętrzną aktywność biologiczną otrzymanych próbek. Jeśli chodzi o pierwsze ograniczenie, separacja mechaniczna wymaga umiejętności technicznych, ale jest łatwa do osiągnięcia po 2 lub 3 szkoleniach eksperymentalnych. Niektóre małe kawałki IPL mogą pozostać przymocowane do OPL i odwrotnie, ponieważ obie podwarstwy są ściśle powiązane. Jednak zanieczyszczenie jednej podwarstwy przez drugą powinno być minimalne, jeśli oddzielanie mechaniczne jest wykonywane ostrożnie. Typowe profile IPL i OPL SDS-PAGE po optymalnym rozdzieleniu podwarstw przedstawiono na rysunku 5. Jeśli chodzi o drugie ograniczenie, etapy eksperymentalne przedstawione w tym artykule zostały zoptymalizowane pod kątem analiz proteomicznych, w celu zapewnienia wyczerpującej listy białek tworzących każdą podwarstwę. W celu dalszej charakterystyki aktywności biologicznej każdego białka konieczne jest zatrzymanie się na etapie 2.1.2, przed zastosowaniem warunków denaturacji (etap 2.2.1, użycie buforu z SDS i beta-merkaptoetanolem, a następnie gotowanie). Warto jednak zauważyć, że białka powstałe w kroku 2.1.2 są tylko białkami rozpuszczalnymi w soli, podczas gdy białka nierozpuszczalne w soli tworzą agregaty. Jedną z możliwości dalszej oceny ich aktywności może być produkcja białek nierozpuszczalnych w soli jako białek rekombinowanych przy użyciu systemów heterologicznych (E. coli, bakulowirus, drożdże itp.).
Protokół ten może zostać dostosowany do innych jaj ptasich w celu przeprowadzenia badań porównawczych, aby lepiej docenić oryginalność każdego gatunku. Rzeczywiście, PL wykazuje pewną specyfikę dla ptaków zarówno pod względem strukturalnym, jak i pod względem składu białkowego, prawdopodobnie ze względu na adaptację do nowych środowisk, ale także ze względu na specyfikę rozwojową 2,6,9,32. Opracowanie tego protokołu, który wymaga umiarkowanego poziomu technicznego i klasycznego sprzętu/materiałów, otwiera nowe możliwości badawcze w dziedzinie badań nad rozmnażaniem ptaków i specjacją.

Celem tej metody jest dostarczenie protokołu, który pozwala na późniejszą biochemiczną charakterystykę warstwy perivitelinowej (PL), cienkiej warstwy białkowej otaczającej żółtko jaja i odgrywającej fundamentalną rolę w rozmnażaniu gatunków ptaków. PL, nazywana również w literaturze "błoną witelinową", jest trójwymiarową siecią grubych włókien składającą się z kilku rodzajów glikoprotein. Składa się z wewnętrznej warstwy perywiteliny (IPL) (w kontakcie z żółtkiem), która jest montowana w jajniku, oraz z zewnętrznej warstwy perywiteliny (OPL, w kontakcie z bielą), leżącej na IPL (<klasa silna = "xfig">Rysunek 1) i wytwarzanej przez lejek. Ta ostatnia tkanka jest lejkowatym górnym segmentem jajowodu, który otrzymuje dojrzały pęcherzyk żółtkowy po owulacji oraz miejscem, w którym następuje zapłodnienie. Wydzielanie OPL następuje po tych dwóch zdarzeniach, a po nim następuje kolejne odkładanie się białka jaja i skorupki jaja w innych określonych segmentach jajowodu. Fizjologiczne funkcje PL są związane nie tylko z zapłodnieniem i wczesnymi etapami embriogenezy, ale także z fizyczną i molekularną ochroną zarodka. Analiza proteomiczna jaj kurzych przeprowadzona na całym PL ujawniła obecność 137 różnych białek1, ale dystrybucja większości tych białek między IPL i OPL pozostaje do wyjaśnienia. Minimalna ilość danych dostępnych w literaturze wskazuje, że IPL i OPL wykazują bardzo różne profile białek2,3,4, co sugeruje różne właściwości strukturalne i funkcjonalne. Względny niedobór danych na temat rozmieszczenia białek między OPL i IPL jest prawdopodobnie spowodowany trudnością w oddzieleniu obu podwarstw, które są cienkie i osadzone.
Przedstawiona tutaj metoda opisuje warunki, które należy zastosować do rozdzielenia dwóch podwarstw z ograniczonym wpływem na ich strukturę histologiczną, przy jednoczesnym zachowaniu zawartości białka, oraz do dostarczenia protokołu pozwalającego na całkowitą rozpuszczalność białek do późniejszej analizy przez proteomikę. Obejmuje dwa główne etapy: 1) pobieranie próbek PL i separację OPL/IPL oraz 2) obróbkę PL, OPL i IPL w celu solubilizacji białek i elektroforezy do analizy spektrometrii mas. Przepływ pracy jest przedstawiony w Rysunek 2. Warto zauważyć, że chociaż obecny protokół został zoptymalizowany pod kątem analiz proteomicznych (Krok 2.2), można go zatrzymać na niektórych etapach dla histologicznych (np. mikroskopia elektronowa), analiz immunohistochemicznych, badań funkcjonalnych (Krok 1) oraz dla oczyszczania białek rozpuszczalnych w soli w celu scharakteryzowania ich struktury i aktywności biologicznej (Krok 2.1) (<klasa silna = "xfig">Rysunek 2).
Pierwszym krokiem jest usunięcie całkowitego PL z żółtka jaja (Rysunek 2, krok 1.1). Wszystkie opublikowane metody rozpoczynają się od ręcznego oddzielenia białka od żółtka lub za pomocą separatora jaj. Następnie usuwa się pozostałe białko jaja kurzego i grubą gradówkę za pomocą kleszczy lub adsorpcji na bibule filtracyjnej5 (<silna klasa="xfig">Rysunek 2A). Następnie, techniki wybrane do próbkowania PL są zmienne w zależności od opublikowanych artykułów. Niektóre prace zawierają kilka przemyć żółtko w wodzie dejonizowanej lub destylowanej1,5,6, w 0,85 do 1% roztworze soli fizjologicznej2,7,8, w roztworach buforowych, takich jak 0,15 M Kwas NaCl/N-[Tris(hydroksymetylo)metylo]-2-aminoetanosulfonowy, pH 7,44 lub w 0,01N HCl (pH 2)3. Procedury te zastosowano do jaj kurczaków, kaczek, bażantów obrożnych, kuropatwy szarej, papug nimf, gołębi domowych lub ptaków bezgrzebieniowych2,6,9. Usuwanie PL, podczas gdy żółtko jaja jest przechowywane na szalce Petriego bez roztworów wodnych, może być bardzo pracochłonne, ponieważ PL jest kruche, a żółtko jaja ma tendencję do przyklejania się do PL1,5 i dlatego pozostaje trudne do późniejszego wyeliminowania. Stosowanie kwaśnego buforu lub roztworu przez godzinę w temperaturze 37 °C3 również nie jest preferowane, ponieważ takie warunki mogą zmienić strukturę PL i mogą spowodować utratę białka. Ważne jest również, aby usunąć obszar zawierający krążek rozrodczy, ponieważ strefa ta prawdopodobnie ma wyraźny wzór strukturalny i molekularny, który nie odzwierciedla całego PL4,6,10 (Rysunek 2B). Metoda ta wykorzystuje pomysły podkreślone w niektórych opublikowanych artykułach i proponuje pewne ulepszenia w celu ułatwienia próbkowania PL przy jednoczesnym zachowaniu jego integralności (Rysunek 2C).
Drugi krok polega na rozdzieleniu dwóch podwarstw (Rysunek 2, krok 1.2). Ten krok ma kluczowe znaczenie, ponieważ OPL i IPL są ze sobą ściśle powiązane. Ten krok należy przeprowadzić ostrożnie za pomocą kleszczy pod lornetkowym mikroskopem preparacyjnym. Publikacje opisujące separację OPL/IPL są dość ograniczone2,3,7,11, a niektóre z nich wykorzystują specyficzne warunki (kwaśny bufor w temperaturze 37 °C przez 1 h2,3), które mogą wpływać na strukturę histologiczną podwarstw i/lub przyczyniać się do utraty białka lub zanieczyszczenia żółtka lub bieli. Aby lepiej odróżnić OPL od IPL, niektórzy autorzy poinformowali o użyciu błękitu toluidynowego do lekkiego zabarwienia OPL (wewnętrzna warstwa pozostaje bezbarwna)11. W opracowanej metodzie zoptymalizowaliśmy warunki tak, aby separacja była łatwa do osiągnięcia i nie wymagała użycia żadnego barwnika (<silna klasa="xfig">Rysunek 2D).
Drugim głównym krokiem jest solubilizacja białek tworzących każdą podwarstwę. Klasycznie osiąga się to poprzez zmieszanie czystego liofilizowanego 1, dried2,6, lub świeżo przygotowanego3,4,11 PL/sublayers bezpośrednio z buforem Laemmli używanym do elektroforezy. Inni autorzy preferowali wstępną solubilizację warstw w 1% NaCl, w 1% roztworze buforującym SDS2,3,11 lub w roztworze zawierającym inhibitory proteazy i SDS6 w temperaturze pokojowej lub Triton, a następnie inkubacja w temperaturze 45 °C12, pod ciągłym energicznym mieszaniem. Niektórzy autorzy opisali również protokół, w którym PL inkubowano w buforze fosforanowym, soli fizjologicznej lub moczniku i poddawano sonikacji13. Po wszystkich tych zabiegach nastąpiło odwirowanie i rozcieńczenie w buforze Laemmli, a wszystkie mają tę wadę, że niepełną rozpuszczalność białek z warstw mają tę zaletę, że nierozpuszczalna substancja (osad otrzymany po odwirowaniu) jest odrzucana z próbki, która ma być poddana analizie.
Ponadto, stosowanie warunków denaturacji (mocznik, detergent, wysoka temperatura, itp.) przez niektórych autorów do solubilizacji białek nie jest zgodne z późniejszym oczyszczaniem białek w celu ich charakteryzacji, ponieważ mogą one nieodwracalnie dezaktywować białka, zakłócać ich aktywność biologiczną, a także pogarszać ich strukturę 3D. Dla tego konkretnego kroku 2 protokół zawiera pierwszy podkrok pozwalający na solubilizację najliczniejszych białek w warunkach niedenaturujących po mechanicznej destrukturyzacji PL/OPL/IPL, która nie będzie kolidować z dalszymi badaniami białek, jeśli zajdzie taka potrzeba (<silna klasa = "xfig">Rysunek 2, krok 2.1), oraz drugi podkrok, który pozwala na całkowitą rozpuszczalność białek do elektroforezy i dogłębnej proteomiki (<silna klasa = "xfig">Rysunek 2, krok 2.2). Łączy w sobie sugestie zaczerpnięte z różnych opublikowanych prac i korekty wynikające z nowych pomysłów potwierdzonych badaniami eksperymentalnymi.

<table><tbody><tr><td>Lornetkowy mikroskop preparacyjny</td><td>Inżynieria wizyjna, Francja</td><td></td><td>Model Liofilizator Mantis Elite</td></tr><tr><td></td><td>Cryotec, Francja</td><td></td><td>Model Cosmos 80</td></tr><tr><td>Komórka do elektroforezy Mini-Protean II</td><td>Biorad, Hercules, USA</td><td>1652960</td><td>Dowolna aparatura przystosowana do elektroforezy białek</td></tr><tr><td>Młyn mieszający MM400</td><td>Retsch, Hann, Niemcy</td><td>20.745.0001</td><td>Młyn mieszający przystosowany do mielenia na sucho, mokro i kriogenicznie małych ilości próbek</td></tr><tr><td>Ultra drobne nożyczki preparacyjne ze stali nierdzewnej o długości 12 cm</td><td>Dutscher, Brumath</td><td>5066</td><td></td></tr><tr><td>Ultra precyzyjne kleszczyki do końcówek antymagnetyczne ze stali nierdzewnej 9,5 x 109,3 mm</td><td>Dutscher, Brumath</td><td>327005</td><td></td></tr></tbody></table>

mechaniczna separacja i solubilizacja białek zewnętrznych i wewnętrznych podwarstw perywiteliny z jaj kurzych

Mechanical Separation and Protein Solubilization of the Outer and Inner Perivitelline Sublayers from Hen's Eggs

Warstwa perywiteliny, która otacza żółtko jaja, odgrywa fundamentalną rolę w zapłodnieniu, obronie jaja i rozwoju ptasiego zarodka. Tworzą go dwie podwarstwy białkowe, które są ściśle ze sobą powiązane i tworzą je odrębne żeńskie narządy rozrodcze. Zakłada się, że obie struktury mają swoją własną specyfikę funkcjonalną, która pozostaje do zdefiniowania. Aby scharakteryzować funkcję białek tworzących każdą podwarstwę, pierwszym wyzwaniem jest ustalenie warunków, które pozwoliłyby na mechaniczne oddzielenie tych dwóch skomplikowanych warstw, przy jednoczesnym ograniczeniu wszelkich uszkodzeń strukturalnych. Drugim krokiem jest optymalizacja warunków eksperymentalnych w celu ułatwienia solubilizacji białek z tych dwóch podwarstw do późniejszych analiz biochemicznych. Skuteczność tego podejścia ocenia się, analizując profil białkowy każdej podwarstwy za pomocą elektroforezy w żelu dodecylosiarczanu sodu i poliakryloamidu (SDS-PAGE), która powinna być odrębna między tymi dwiema strukturami. Ta dwuetapowa procedura pozostaje prosta; wymaga klasycznego sprzętu biochemicznego i odczynników; i jest kompatybilny z dalszymi szczegółowymi badaniami proteomicznymi. Można go również przetransponować do innych jaj ptaków do celów biologii porównawczej, wiedząc, że wykazano, iż struktura i skład warstwy perywitelinowej mają cechy specyficzne dla gatunku. Ponadto niedenaturacyjne warunki opracowane dla separacji podwarstw (etap 1) umożliwiają ich analizę strukturalną za pomocą skaningowej i transmisyjnej mikroskopii elektronowej. Może również stanowić pierwszy etap do późniejszego oczyszczania białek w celu analizy ich odpowiedniej aktywności biologicznej i struktury 3D lub przeprowadzenia dalszych analiz immunohistochemicznych lub funkcjonalnych. Takie badania pomogłyby rozszyfrować fizjologiczną funkcję tych dwóch podwarstw, których integralność strukturalna i funkcjonalna jest decydującym kryterium sukcesu reprodukcyjnego.

OPL i IPL oddzielono od PL świeżo złożonego niezapłodnionego jaja, aby przeanalizować ich profile białkowe za pomocą SDS-PAGE. Schemat eksperymentalny całego protokołu przedstawiono na Rysunku 2. Rysunek 3 przedstawia uwalnianie białek przy różnych stężeniach Tris (Rysunek 3A), różnych wartościach pH (Rysunek 3B) oraz różnych stężeniach NaCl (Rysunek 3C). Otrzymane dwie podwarstwy obserwowano pod binokularowym mikroskopem dissectingowym, a ich wygląd przedstawiono na Rysunku 4, gdzie IPL jest półprzezroczysta, natomiast OPL jest gęsta, mętna i biaława. Cechy te mogą w części świadczyć o efektywności separacji podwarstw.
Po separacji OPL i IPL liofilizowano niezależnie, a ich zawartość białkową całkowicie rozpuszczono dzięki połączeniu rozcierania mechanicznego, zastosowaniu detergentu anionowego (SDS) oraz środka redukującego (beta-merkaptoetanolu), a następnie gotowaniu. Po migracji w żelu poliakryloamidowym (elektroforeza SDS-PAGE) próbki OPL i IPL wykazują odmienne profile elektroforetyczne (Rysunek 5), zgodnie z oczekiwaniami.
<img alt="Schemat mikroskopowy, warstwy OPL i IPL w siatkówce, analiza struktury, skala 5μm." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61739/61739fig01.jpg" data-altupdatedat="1788250015000" data-alt="Rycina 1"> 
Rycina 1: Struktura PL świeżo zniesionego niezapłodnionego jaja. Schematyczny rysunek oraz mikrografia z transmisyjnego mikroskopu elektronowego całego PL w przekroju poprzecznym (dane osobowe, ©Plateforme IBiSA de Microscopie Electronique, University and CHRU of Tours, Francja, S. Georgeault). Należy zauważyć, że obraz ten uzyskano z PL przygotowanego zgodnie z opisem w niniejszym protokole. OPL, zewnętrzna warstwa periwitellinowa; IPL, wewnętrzna warstwa periwitellinowa. Czarna grot strzałki wskazuje ciągłą membranę oddzielającą dwie podwarstwy. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61739/61739fig01large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.</a>
<img alt="Schemat procesu izolacji i analizy białek jaja; mikroskopia, SDS-PAGE w badaniach proteomicznych." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61739/61739fig02.jpg" data-altupdatedat="1788250015000" data-alt="Rysunek 2"> 
Rysunek 2: Schemat podsumowujący dwa główne etapy protokołu oraz przykłady zastosowań. Protokół został zoptymalizowany pod kątem analizy proteomicznej warstw PL, jednak na niektórych etapach można go przerwać w celu zastosowania w innych badaniach. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61739/61739fig02large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.</a>
<img alt="Wykresy analizy uwalniania białek; wpływ Tris, pH i NaCl; wykres słupkowy; dane dotyczące ilościowego oznaczania białek." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61739/61739fig03.jpg" data-altupdatedat="1788250015000" data-alt="Rycina 3"> 
Rysunek 3: Optymalizacja składu buforu do pobierania próbek PL. Krótko mówiąc, oczyszczone PL (n = 4) inkubowano przez 2 h w tej samej objętości różnych roztworów buforujących. Następnie usunięto PL, a stężenie białka oszacowano poprzez pomiar absorbancji przy 280 nm w pozostałym buforze.A) Wpływ stężenia Tris-HCl przy pH 8. (B) Wpływ pH (od 7 do 9). (C) Wpływ stężenia NaCl. Na podstawie tych wyników wyciągnięto wniosek, że bufor składający się z 10 mM Tris-HCl (pH 8) i 50 mM NaCl jest najodpowiedniejszy, ponieważ ogranicza utratę białek. Wyniki przedstawiono jako średnią ± odchylenie standardowe dla czterech różnych próbek PL. Analizy statystyczne przeprowadzono przy użyciu jednoczynnikowej analizy wariancji (ANOVA), a następnie testu wielokrotnych porównań Tukeya. Wartość p &lt;Wartość 0,05 uznano za istotną (ns – nieistotne; * p&lt;0,05, *** p&lt;0,001, **** p&lt;0.0001). <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61739/61739fig03large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.</a>
<img alt="złuszczone warstwy czosnku, OPL i IPL, pokazane w skali do analizy strukturalnej." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61739/61739fig4v2.jpg" data-altupdatedat="1788250015000" data-alt="Rysunek 4"> 
Rysunek 4: Cechy OPL i IPL pod binokularowym mikroskopem dissectingowym. Po rozdzieleniu IPL (po prawej) wydawała się półprzezroczysta, a OPL (po lewej) była nieprzezroczysta. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61739/61739fig04large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.</a>
<img alt="Wyniki elektroforezy SDS-PAGE porównujące próbki białek IPL i OPL pod kątem masy cząsteczkowej." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61739/61739fig5v2.jpg" data-altupdatedat="1788250015000" data-alt="Rysunek 5"> 
Rysunek 5: Analiza SDS-PAGE rozdzielonych warstw OPL i IPL z nowo zniesionego niezapłodnionego jaja. Żel akrylamidowy 4%–20% z późniejszym barwieniem błękitem Coomassie. Masa prążków standardu masy cząsteczkowej jest podana w kDa. Profil OPL składa się głównie z białek o masie cząsteczkowej &gt;30 kDa, natomiast główne prążki wykryte w profilu IPL mają masy cząsteczkowe &lt;30 kDa. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61739/61739fig05large.jpg" target="_blank">Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.</a>

Ten artykuł opisuje prostą metodę izolowania zewnętrznych i wewnętrznych podwarstw perywitelinowych jaj kurzych przy jednoczesnej minimalizacji zmian strukturalnych i optymalizacji solubilizacji białek w każdej podwarstwie do analiz proteomicznych.

Mechaniczna separacja i solubilizacja białek zewnętrznych i wewnętrznych podwarstw perywiteliny z jaj kurzych

The perivitelline layer that surrounds the egg yolk plays a fundamental role in fertilization, in egg defense, and in the development of the avian embryo. ...

Protokół ten zapewnia procedurę krok po kroku pobierania próbek podwarstw błony perywitelinowej z jaj ptaków w celu dalszego badania ich fizjologicznej roli w rozrodzie ptaków. Pobieranie próbek z membrany peryvitelinowej zostało zoptymalizowane na każdym etapie, aby ograniczyć wszelkie uszkodzenia strukturalne i molekularne. Protokół został dalej opracowany pod kątem dogłębnej proteomiki.Rozpocznij od pobrania próbki warstwy perywiteliny lub PL ze świeżo złożonej, niezapłodnionej komórki jajowej. Rozbij jajko i użyj separatora do jaj, aby oddzielić żółtko od białka. Usuń gradówkę małymi nożyczkami i rozwałkuj żółtko na bibule filtracyjnej, aby usunąć przylegającą albuminę, która wydaje się przezroczysta, ale widoczna struktura.Zanurz żółtko w krystalizatorze zawierającym 10-milimolowy Tris HCL o pH ósmym, który został wcześniej schłodzony do czterech stopni Celsjusza i usuń obszar PL nad krążkiem rozrodczym w strefie jednego centymetra za pomocą nożyczek. Rozerwij PL małymi nożyczkami wewnątrz bufora, a następnie przytrzymaj dwie krawędzie pękniętego PL kleszczami i oderwij je od żółtka. Opłucz PL kilka razy w kąpielach o stężeniu 10 milimolowym Tris HCL, aż nie będzie widać śladu żółtka.Upewnij się, że PL jest czysty, biały i pływający w buforze. Przetwarzaj PL w celu separacji podwarstw lub przejdź bezpośrednio do analiz biochemicznych. Aby oddzielić OPL i IPL, rozprowadź całą próbkę z OPL skierowanym do góry na plastikowej szalce Petriego wypełnionej 10-milimolowym Tris HCL i 50-milimolowym chlorkiem sodu i utrzymuj ją płasko z jak najmniejszą liczbą zmarszczek.Określ lokalizację pozostałych chalazae, które są przyczepione tylko do OPL. Następnie pokrój całą PL na kawałki o długości około dwóch do trzech centymetrów małymi nożyczkami. Mechanicznie oddziel dwie warstwy za pomocą ultraprecyzyjnych kleszczyków z końcówką pod mikroskopem preparacyjnym.Otrzymane próbki IPL i OPL należy przechowywać pojedynczo w mikroprobówkach w temperaturze ujemnej 80 stopni Celsjusza do czasu dalszego użycia. Aby przeprowadzić pierwotną solubilizację białka, liofilizuj próbki IPL i OPL pojedynczo, aby usunąć pozostałą wodę, a następnie odetnij około jednego miligrama z każdej próbki i umieść ją w czystej mikroprobówce z szczelną nakrętką. Pozostałe próbki należy przechowywać w szczelnie zamkniętych probówkach w celu przedłużonego przechowywania w temperaturze minus 20 lub minus 80 stopni Celsjusza.Wymieszaj jeden miligram każdej liofilizowanej podwarstwy z 400 mikrolitrami 50 milimolowych Tris o pH siódmym i 500 milimolowym chlorku sodu. Użyj młynka miksującego dwa razy przez pięć minut przy 30 Hz, aby rozbić struktury na mikrocząstki i ułatwić solubilizację białek. Zbierz 400 mikrolitrów próbek do dwóch czystych mikroprobówek.Aby przygotować próbki do elektroforezy, dodaj 5-krotny bufor próbek SDS-PAGE do każdej próbki o pojemności 400 mikrolitrów i podgrzej ją do 100 stopni Celsjusza przez pięć minut. Załaduj maksymalnie 20 mikrogramów białek do każdego pasa żelu poliakrylamidowego SDS o gradiencie 4-20% i wykonaj elektroforezę przy napięciu 120 woltów. Po elektroforezie usuń żel ze szklanych płytek i zabarwij go roztworem Coomassie Brilliant Blue przez 30 minut, a następnie odbarwić roztworem składającym się z 50% wody, 40% etanolu i 10% kwasu octowego, aż tło żelu stanie się jasnoniebieskie.Przenieś żel na szalkę Petriego zawierającą wodę dejonizowaną w celu odbarwienia i ponownego nawodnienia. Białka powinny pojawiać się jako niebieskie paski z przezroczystym tłem. PL poddano różnym w celu zidentyfikowania warunków pozwalających na minimalną utratę białka i optymalną separację podwarstw.Pokazano tutaj białko uwalniane w różnych stężeniach Tris, pH i stężeniach chlorku sodu. Powstałe w ten sposób dwie podwarstwy obserwowano pod mikroskopem preparacyjnym. IPL jest półprzezroczysty, podczas gdy OPL jest gęsty, mętny i białawy.Po rozdzieleniu, OPL i IPL zostały zliofilizowane niezależnie, a ich zawartość białka została całkowicie rozpuszczona przy użyciu kombinacji mielenia mechanicznego, anionowego detergentu, środka redukującego i gotowania. Próbki wykazywały wyraźne profile elektroforetyczne na żelu poliakrylamidowym. Próbując zastosować ten protokół, należy pamiętać, że oddzielenie podwarstw jest krytycznym etapem procedury i musi być wykonane przy użyciu mikroskopu dwuokularowego w buforze zawierającym minimalne stężenie soli.Aby dokładniej wyjaśnić ich odpowiednią funkcję fizjologiczną, próbki podwarstwy błony periwitelinowej mogą być analizowane w celu charakterystyki histologicznej za pomocą mikroskopii elektronicznej oraz do badań funkcjonalnych przy użyciu testów obrazowania i migracji komórek.

mechanical-separation-protein-solubilization-outer-inner

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biochemia

Surowe i frakcjonowane ekstrakty z jaj Xenopus mogą służyć do pozyskiwania składników niezbędnych do rekonstrukcji procesów komórkowych w celu analizy morfologicznej i biochemicznej. Do przygotowania surowego ekstraktu wykorzystuje się lizę jaj oraz wirowanie różnicowe, który z kolei służy do sporządzenia ekstraktów frakcjonowanych oraz preparatów lekkich błon.

Przygotowanie i frakcjonowanie ekstraktów z jaj Xenopus laevis

Opisujemy metodę rozdzielania organelli według gęstości w żywych embrionach Drosophila. Embriony są zatapiane w agarze i poddawane wirowaniu. Technika ta pozwala na powtarzalne rozdzielenie głównych organelli wzdłuż osi przednio-tylnej embrionu. Metoda ta ułatwia przeprowadzanie eksperymentów kolokalizacyjnych i pozwala na uzyskanie frakcji organelli do analizy biochemicznej oraz eksperymentów z transplantacją.

In-vivo wirowanie zarodków Drosophila

Niniejszy protokół opisuje w szczególności ekstrakcję całkowitego IgY z żółtka jaja za pomocą precypitacji glikolem polietylenowym i przekazuje ogólne informacje na temat technologii IgY.

Technologia IgY: Wyodrębnianie przeciwciał kurzych z żółtka jaja poprzez wytrącanie glikolem polietylenowym (PEG)

Xenopus ekstrakt z jaj jest przydatnym systemem modelowym do badania punktu kontrolnego uszkodzeń DNA. Niniejszy protokół dotyczy przygotowania ekstraktów z jaj Xenopus oraz odczynników indukujących punkt kontrolny uszkodzeń DNA. Techniki te można zaadaptować do różnych metod wywołania uszkodzeń DNA w badaniach nad sygnałowaniem punktu kontrolnego uszkodzeń DNA.

Badanie punktu kontrolnego uszkodzeń DNA z wykorzystaniem ekstraktów z jaj Xenopus

Ten film przedstawia metodę izolowania blastomerów C. elegans z wczesnych zarodków. Otrzymane komórki nadają się do hodowli komórkowej lub eksperymentów ex vivo.

C. elegans (C. elegans) Rozwarstwienie blastomerów: metoda usuwania skorupki jaja i dysocjacji komórek embrionalnych

Zięba zebry (Taeniopygiaguttata) jest cennym organizmem modelowym; jednak wczesne etapy rozwoju zeberki nie zostały dokładnie zbadane. Protokół opisuje, w jaki sposób przeprowadzać preparację wczesnych zarodków do zastosowań rozwojowych i molekularnych.

Sekcja i dalsza analiza zarodków zięby zeberki we wczesnych stadiach rozwoju

Molekularne mechanizmy dekondensacji wysoce zagęszczonej chromatyny mitotycznej są źle zdefiniowane. Przedstawiamy bezkomórkowy test oparty na mitotycznych klastrach chromatyny wyizolowanych z komórek HeLa i ekstraktu z jaj Xenopus laevis, który wiernie odtwarza proces dekondensacji in vitro.

Test bezkomórkowy do badania dekondensacji chromatyny pod koniec mitozy

Tutaj prezentujemy protokół wprowadzający zestaw nowych eksperymentów ex-ovo i podejść do modelowania fizycznego do badania mechaniki morfogenezy podczas wczesnego skręcania mózgu u zarodków piskląt.

Badanie roli sił fizycznych we wczesnej morfogenezie embrionalnej piskląt

Prezentujemy metodę generowania in vitro samopodtrzymujących się oscylacji mitotycznych na poziomie pojedynczej komórki poprzez kapsułkowanie ekstraktów jajecznych Xenopus laevis w mikroemulsjach typu woda w oleju.

Rekonstrukcja oscylacji cyklu komórkowego w mikroemulsjach bezkomórkowych ekstraktów jajowych Xenopus

Opisujemy metodę przygotowania i obrazowania na żywo nierozcieńczonych ekstraktów cytoplazmatycznych z jaj Xenopus laevis.

Xenopus laevis (Xenopus laevis) Przygotowanie ekstraktu z jaj i metody obrazowania na żywo do wizualizacji dynamicznej organizacji cytoplazmy

Tutaj opisujemy protokół separacji żółtka, komórek ziarnistych i komórek osłonki w ptasich pęcherzykach przedowulacyjnych. Ta precyzyjna obsługa umożliwia krytyczne badania nad rolą tych warstw w funkcjach rozrodczych, pomagając w zrozumieniu rozwoju pęcherzyków włosowych, regulacji hormonalnej i badań nad chorobami w celu zwiększenia plonów rolnych i wglądu biomedycznego.

Oddzielanie ziarnistych pęcherzyków przedowulacyjnych i warstw komórek osłonki ptasich do dalszych zastosowań

Poznaj metodę mechanicznej separacji podwarstw perywiteliny z jaj kurzych i ich solubilizacji białkowej. Protokół zapewnia minimalne straty białek i wysoką jakość próbek do analizy proteomicznej.

Mechaniczna separacja i solubilizacja białek zewnętrznych i wewnętrznych podwarstw perywiteliny z jaj kurzych

Przeglądaj więcej filmów