Platforma maszyn wirtualnych dla profesjonalistów niezajmujących się informatyką do wykorzystania głębokiego uczenia do klasyfikowania sekwencji biologicznych danych metagenomicznych

Różnorodne zadania klasyfikacji sekwencji biologicznych, takie jak klasyfikacja gatunków, klasyfikacja funkcji genów i klasyfikacja gospodarzy przewodowych, są oczekiwanymi procesami w wielu analizach danych metagenomicznych. Ponieważ dane metagenomiczne zawierają dużą liczbę gatunków i genów Novo, w wielu badaniach potrzebne są organizmy klasyfikujące o wysokiej wydajności. Biolodzy często napotykają trudności ze znalezieniem odpowiednich narzędzi do klasyfikacji sekwencji i notacji dla konkretnego zadania i często nie są w stanie samodzielnie skonstruować odpowiedniego organizmu z powodu braku niezbędnej wiedzy matematycznej i obliczeniowej.

Techniki głębokiego uczenia stały się ostatnio popularnym tematem i wykazują dużą przewagę w wielu zadaniach klasyfikacyjnych. Do tej pory opracowano wiele wysoce pakietowych pakietów głębokiego uczenia, które umożliwiają biologom konstruowanie ram głębokiego uczenia zgodnie z własnymi potrzebami bez dogłębnej wiedzy na temat szczegółów organizmu. W tym samouczku przedstawiamy wskazówki dotyczące konstruowania łatwej w użyciu struktury uczenia głębokiego do klasyfikacji sekwencji bez konieczności posiadania wystarczającej wiedzy matematycznej lub umiejętności programowania.