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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
A sinalização sistêmica de cálcio acionada por glutamato extracelular é fundamental para a indução de respostas de defesa vegetal a ferimentos mecânicos e ataque herbívoro em plantas. Este artigo descreve um método para visualizar a dinâmica espacial e temporal de ambos os fatores usando plantas arabidopsis thaliana expressando biosensores fluorescentes sensíveis ao cálcio e glutamato.
As plantas respondem a tensões mecânicas, como ferimentos e herbívoros, induzindo respostas de defesa tanto nas partes danificadas quanto nas partes distais não danificadas. Após o ferimento de uma folha, ocorre um aumento na concentração de íons de cálcio citosos (sinal ca2+) no local da ferida. Este sinal é rapidamente transmitido para folhas não danificadas, onde as respostas de defesa são ativadas. Nossa pesquisa recente revelou que o glutamato vazando das células feridas da folha para o apoplasto ao seu redor serve como um sinal de ferimento. Este glutamato ativa os canais permeáveis ca2+ semelhantes ao receptor de glutamato, o que leva à propagação de sinal Ca2+ de longa distância em toda a planta. As características espaciais e temporais desses eventos podem ser capturadas com imagens em tempo real de plantas vivas expressando biosensores fluorescentes geneticamente codificados. Aqui introduzimos um método de imagem em tempo real em toda a planta para monitorar a dinâmica dos sinais ca2+ e mudanças no glutamato apoplástico que ocorrem em resposta ao ferimento. Esta abordagem usa um microscópio de fluorescência de campo largo e plantas de Arabidopsis transgênicas expressando Ca2+ à base de Proteína Fluorescente Verde (GFP) e biosensores de glutamato. Além disso, apresentamos metodologia para facilmente provocar a propagação de sinal Ca2+ induzida por feridas e glutamato. Este protocolo também pode ser aplicado a estudos sobre outras estações vegetais para ajudar a investigar como a sinalização sistêmica da planta pode estar envolvida em suas redes de sinalização e resposta.
As plantas não podem escapar de estresses bióticos, por exemplo, insetos que se alimentam deles, por isso desenvolveram sofisticados sistemas de sensoriamento de estresse e transdução de sinais para detectar e, em seguida, proteger-se de desafios como herbívoro1. Ao ferir ou atacar herbívoros, as plantas iniciam respostas rápidas de defesa, incluindo o acúmulo do ácido jasmônico fitohormônio (JA) não apenas no local ferido, mas também em órgãos distais não danificados2. Este JA então ambos desencadeiam respostas de defesa nos tecidos diretamente danificados e induz preventivamente defesas nas partes não danificadas da planta. Em Arabidopsis, o acúmulo de JA induzido pelo ferimento foi detectado em folhas distais e intactas em apenas alguns minutos de danos em outros lugares da planta sugerindo que um sinal rápido e de longa distância está sendo transmitido da folha3ferida . Vários candidatos, como ca2+,espécies reativas de oxigênio (ROS) e sinais elétricos, foram propostos para servir como esses sinais de ferida de longa distância nas plantas4,5.
Ca2+ é um dos mais versáteis e onipresentes segundo elementos mensageiros em organismos eucarióticos. Nas plantas, a mastigação de lagartas e o ferimento mecânico causam aumentos drásticos na concentração citosolic Ca2+ ([Ca2+]cyt) tanto na folha ferida quanto em folhas distantes desenroladas6,7. Este sinal sistêmico Ca2+ é recebido por proteínas de sensoriamento intracelular Ca2+,que levam à ativação de vias de sinalização de defesa a jusante, incluindo a biossíntese JA8,9. Apesar de inúmeros desses relatos que sustentam a importância dos sinais de Ca2+ nas respostas de feridas vegetais, as informações sobre as características espaciais e temporais dos sinais Ca2+ induzidos pelo ferimento são limitadas.
A imagem em tempo real usando indicadores Ca2+ geneticamente codificados é uma ferramenta poderosa para monitorar e quantificar a dinâmica espacial e temporal dos sinais Ca2+. Até o momento, foram desenvolvidas versões desses sensores que permitem a visualização de sinais ca2+ ao nível de uma única célula, para tecidos, órgãos e até plantas inteiras10. O primeiro biosensor geneticamente codificado para Ca2+ usado em plantas foi a proteína bioluminescente aequorin derivada da água-viva Aequorea victoria11. Embora esta proteína quemiluminescente tenha sido usada para detectar alterações de Ca2+ em resposta a várias tensões nas plantas12,13,14,15,16,17,18, não é adequada para imagens em tempo real devido ao sinal extremamente baixo luminescente que produz. Os indicadores Ca2+ baseados em Förster Resonance Energy Transfer (FRET), como os cameleons Amarelos, também foram usados com sucesso para investigar a dinâmica de uma gama de eventos de sinalização Ca2+ nas usinas19,20,21,22,23,24. Estes sensores são compatíveis com abordagens de imagem e, mais comumente, são compostos pela proteína de ligação Ca2+ calmodulin (CaM) e um peptídeo de ligação de CaM (M13) de uma quinase da cadeia de luz da miosina, tudo fundido entre duas proteínas fluorforas, geralmente uma Proteína Fluorescente Cyan (CFP) e uma variante de Proteína Fluorescente Amarela (YFP)10. A ligação Ca2+ ao CaM promove a interação entre CaM e M13 levando a uma mudança conformacional do sensor. Essa mudança promove a transferência de energia entre o PCP e o YFP, o que aumenta a intensidade da fluorescência do YFP, diminuindo a emissão de fluorescência do PCP. O monitoramento dessa mudança de CFP para fluorescência YFP fornece então uma medida do aumento do nível Ca2+. Além desses sensores FRET, biosensores ca2+ baseados em proteína única (FP) como GCaMP e R-GECO, também são compatíveis com abordagens de imagem vegetal e são amplamente utilizados para estudar as alteraçõesde citos [Ca2+] devido à sua alta sensibilidade e facilidade de uso25,26,27,28,29,30. Os GCaMPs contêm um único GFP circularmente permutado (cp), novamente fundido ao CaM e ao peptídeo M13. A interação dependente de Ca2+entre CaM e M13 provoca uma mudança conformacional no sensor que promove uma mudança no estado de protonação do cpGFP, aumentando seu sinal fluorescente. Assim, à medida que os níveis de Ca2+ aumentam, o sinal cpGFP aumenta.
Para investigar a dinâmica dos sinais ca2+ gerados em resposta a ferimentos mecânicos ou alimentação herbívora, utilizamos plantas transgênicas arabidopsis thaliana expressando uma variante GCaMP, GCaMP3, e um microscópio de fluorescência de campo largo6. Esta abordagem conseguiu visualizar a transmissão rápida de um sinal Ca2+ de longa distância do local da ferida em uma folha para toda a planta. Assim, um aumento nocite [Ca2+] foi imediatamente detectado no local da ferida, mas este sinal Ca2+ foi então propagado para as folhas vizinhas através da vasculatura poucos minutos após o ferimento. Além disso, descobrimos que a transmissão desse sinal de ferida sistêmica rápida é abolida em plantas arabidopsis com mutações em dois genes semelhantes a receptores de glutamato, Glutamato Receptor Like (GLR), GLR3.3 e GLR3.66. Os GLRs parecem funcionar como canais de aminoácidos fechados Ca2+ envolvidos em diversos processos fisiológicos, incluindo resposta à ferida3,crescimento do tubo de pólen31,desenvolvimento raiz32,resposta fria33e imunidade inata34. Apesar dessa função fisiológica bem compreendida e ampla das GLRs, as informações sobre suas propriedades funcionais, como sua especificidade de ligante, seletividade de íons e localização subcelular, são limitadas35. No entanto, estudos recentes relataram que GLR3.3 e GLR3.6 estão localizados nos phloem e xilem, respectivamente. As GLRs vegetais têm semelhanças com receptores de glutamato ionotrópicos (iGluRs)36 em mamíferos, que são ativados por aminoácidos, como glutamato, glicina e D-serina no sistema nervoso mamífero37. De fato, demonstramos que a aplicação de glutamato de 100 mM, mas não outros aminoácidos, no local da ferida induz um sinal ca2+ rápido e de longa distância em Arabidopsis,indicando que o glutamato extracelular provavelmente age como sinal de ferida nas plantas6. Esta resposta é abolida no mutante glr3.3/glr3.6 sugerindo que o glutamato pode estar agindo através de um ou ambos esses canais semelhantes a receptores e, de fato, o AtGLR3.6 foi recentemente mostrado como fechado por esses níveis de glutamato38.
Nas plantas, além de seu papel como aminoácido estrutural, o glutamato também foi proposto como um importante regulador de desenvolvimento39; no entanto, sua dinâmica espacial e temporal são mal compreendidas. Assim como no Ca2+, vários indicadores geneticamente codificados para glutamato foram desenvolvidos para monitorar a dinâmica deste aminoácido em células vivas40,41. IGluSnFR é um biosensor de glutamato uni FP baseado em GFP composto por cpGFP e uma proteína de ligação de glutamato (GLT) da Escherichia coli42,43. A mudança conformacional do iGluSnFR, que é induzido pela ligação de glutamato ao GLI, resulta em uma emissão de fluorescência GFP aprimorada. Para investigar se o glutamato extracelular age como uma molécula de sinalização na resposta à ferida vegetal, conectamos a sequência iGluSnFR com a sequência básica de secreção de peptídeo de sinal de chitinase (CHIB-iGluSnFR) para localizar esse biosensor no espaço apoplásico6. Esta abordagem permitiu a imagem de quaisquer alterações na concentração de glutamato apoplástico ([Glu]apo) usando plantas de Arabidopsis transgênicas expressando este sensor. Detectamos aumentos rápidos no sinal iGluSnFR no local do ferimento. Esses dados apoiam a ideia de que o glutamato vaza das células/tecidos danificados para o apoplasto ao ferimento e age como um sinal de dano ativando as GLRs e levando ao sinal Ca2+ de longa distância nas plantas6.
Aqui, descrevemos um método de imagem em tempo real em toda a planta usando biosensores geneticamente codificados para monitorar e analisar a dinâmica dos sinais de glutamato Ca2+ de longa distância e extracelulares em resposta ao ferimento6. A disponibilidade de microscopia de fluorescência de campo amplo e plantas transgênicas expressando biosensores geneticamente codificados fornece uma abordagem poderosa, mas facilmente implementada para detectar sinais de longa distância rapidamente transmitidos, como ondas ca2+.
1. Preparação do material vegetal
2. Preparação química
3. Configuração do microscópio e condução de imagens em tempo real
4. Análise de dados
A propagação de sinais de [Ca2+]cyt e [Glu]apo em resposta ao ferimento é apresentada na Figura 3, Figura 4, Filme S1e Filme S2. Cortar a petiola da folha 1 em plantas expressando GCaMP3 (em 0 s) levou a um aumento significativo nocite [Ca2+] que foi rapidamente induzido localmente através da vasculatura (aos 40 s) (Figura 3 e Filme S1). Posteriormente, o sinal foi rapidamente propagado para folhas vizinhas (folha 3 e 6) em poucos minutos (aos 80 s) (Figura 3 e Filme S1).
Ao cortar a folha 1 em plantas expressando CHIB-iGluSnFR, observou-se um rápido aumento deapo [Glu] em torno da região de corte (em 2 s). Este sinal foi propagado através da vasculatura localmente em poucos minutos (aos 160 s), mas não foi observado em folhas sistêmicas(Figura 4 e Filme S2).
Para a imagem em tempo real da propagação de sinal Ca2+ desencadeada pela aplicação de glutamato, a borda (aproximadamente 1 mm da ponta) da folha 1 em plantas expressando GCaMP3 foi cortada como mostrado na Figura 5A e no Filme S3. Cortar a borda da folha 1 causou um aumento decite local [Ca2+] (em 40 s), mas este sinal desapareceu em poucos minutos (em 124 s). Depois de esperar aproximadamente 10 minutos para a planta se recuperar, 10 μL de glutamato de 100 mM foi aplicado na superfície cortada da folha 1, o que causou um rápido e significativo aumento decit [Ca2+] localmente (aos 56 s) e propagação de sinal para folhas distais (a 104 s) (Figura 5B e Filme S4).
Para medir as mudanças nocite [Ca2+] induzido pelo ferimento na folha sistêmica, dois ROIs (ROI1 e ROI2) foram definidos na região base e ponta da folha 6 em plantas expressando GCaMP3 como mostrado na Figura 6A. A mudança de curso de tempo da intensidade do sinal GCaMP3 no ROI1 e ROI2 ao cortar a petiola da folha 1 foi medida(Figura 6B). Um aumento significativo docit [Ca2+] no ROI1 foi detectado anteriormente ao do ROI2 (Figura 6B). [Ca2+] cyt atingiu aproximadamente 100 s após o ferimento, durou mais de 10 minutos, e exibiu duas fases(Figura 6B).
Para determinar as velocidades da onda Ca2+ sobre o ferimento mecânico, o ponto de tempo de um aumento significativo de sinal acima dos valores pré-estimulados no ROI1 e ROI2 foi determinado (time-lag; ver Seção 4) (Figura 6C). Como a distância entre ROI1 e ROI2 foi de 2,7 mm neste caso (Figura 6A), a velocidade do sinal Ca2+ na folha 6 foi calculada como 0,15 mm/s. Para medir as alterações [glu]apo em resposta ao dano mecânico, o ROI1 foi definido nas proximidades do local de corte da folha marcado como L1 como mostrado na Figura 7A. [Glu] apo assinatura no ROI1 exibiu um único pico em aproximadamente 100 s após o ferimento(Figura 7B).

Figura 1: Numeração de folhas de roseta arabidopsis. As folhas arabidopsis são numeradas do mais antigo ao mais jovem (painel esquerdo). Um diagrama esquemático da posição das folhas é indicado no painel direito. L: folha, C: cotilledons. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Um microscópio de fluorescência usado neste estudo. [Ca2+]cyt e [Glu]apo dynamics foram imagens com um estereóscópio de fluorescência de campo largo. R: Controlador remoto, O: 1x lente objetiva, C: câmera sCMOS, T: Tubo de inclinação trinocular, S: Estágio, P: Material vegetal. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Transmissão de sinal Ca2+ induzida por feridas. O corte da petiola (seta branca, 0 s) da folha 1 (L1) na planta expressando GCaMP3 desencadeou um aumento decito local [Ca2+] (seta vermelha, 40 s) que foi transmitido para folhas sistêmicas [folha 3 (L3) e folha 6 (L6)] (setas laranjas, 80 s). Barra de escala, 5 mm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: Elevação deapo acionada pela ferida [Glu]. Cortar a folha 1 (L1) (seta branca, 0 s) em plantas expressando CHIB-iGluSnFR causou uma rápida elevação de [Glu]apo (seta vermelha, 80 s) que se propagava através da vasculatura (seta laranja, 160 s). Barra de escala, 2 mm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: Transmissão de sinal Ca2+ acionada por glutamato. (A) Cortar a borda (aproximadamente 1 mm da ponta) da folha 1 (L1) em plantas expressas GCaMP3 (seta branca, 0 s) causou um aumentode cite [Ca2+] (seta vermelha, 40 s). (B) A aplicação de glutamato de 100 mM à superfície cortada de L1 (seta branca, 0 s) causou um aumento decite local [Ca2+] (seta vermelha, 56 s) que rapidamente se propum a folhas distais [por exemplo, folha 3 (L3), folha 4 (L4) e folha 6 (L6)] (setas laranjas, 104 s). Barras de escala, 5 mm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6: [Ca2+] assinaturade cito em folhas sistêmicas em resposta ao ferimento mecânico. (A) Uma imagem expandida da folha 6 (L6) em plantas expressas GCaMP3 é mostrada na Figura 3. ROI1 (círculo azul) e ROI2 (círculo rosa) foram definidos na região de base e ponta, respectivamente. A seta branca indica o local de corte da petiole da folha 1 (L1). Neste caso, a distância entre ROI1 e ROI2 foi de 2,7 mm. (B) Quantificação de assinaturasde cite [Ca2+] em ROI1 e ROI2. Alterações na intensidade da fluorescência foram analisadas por meio de software de imagem. (C) Um traço expandido de dados em (B) entre 0 e 80 s. Os pontos de detecção de um aumento de Ca2+ no ROI1 e ROI2 foram definidos como t1 e t2, respectivamente,utilizando como critério um aumento para 2x o desvio padrão dos valores de pré-estimulação (2x SD, linha pontilhada). O valor de t2 - t1 foi definido como time-lag (Δt) no protocolo atual. A seta preta indica o tempo de corte. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 7: [Glu] assinaturaapo em resposta ao ferimento mecânico. (A) Uma imagem expandida da folha 1 (L1) em plantas expressas CHIB-iGluSnFR é mostrada na Figura 4. O ROI1 foi montado nas proximidades do local do corte. A seta branca indica a região do corte. (B) A quantitação da assinatura de [Glu]apo no ROI1 é monitorada usando software de imagem. A seta preta indica o tempo de corte. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Filme S1: Transmissão Ca2+ de longa distância após ferimentos mecânicos. O ferimento mecânico na petiola da folha 1 (L1) causou um aumentode cite [Ca2+] transmitido para folhas distais [por exemplo, folha 3 (L3) e folha 6 (L6)]. Clique aqui para baixar este filme.
Filme S2: Elevação dos níveis de glutamato apoplástico em resposta ao corte. O ferimento mecânico da folha 1 (L1) causou um aumento imediato noapo[Glu] . Clique aqui para baixar este filme.
Filme S3: Elevação dosníveis decite [Ca2+]em resposta ao corte. O ferimento mecânico na borda da folha 1 (L1) causou uma elevação decite local e imediata [Ca2+]. Clique aqui para baixar este filme.
Filme S4: Aplicação de glutamato desencadeia aumentos sistêmicos [Ca2+]cyt. A aplicação de glutamato de 100 mM acionou a transmissão Ca2+ para folhas sistêmicas [por exemplo, folha 3 (L3), folha 4 (L4) e folha 6 (L6)]. Clique aqui para baixar este filme.
Os autores não têm conflitos de interesse.
A sinalização sistêmica de cálcio acionada por glutamato extracelular é fundamental para a indução de respostas de defesa vegetal a ferimentos mecânicos e ataque herbívoro em plantas. Este artigo descreve um método para visualizar a dinâmica espacial e temporal de ambos os fatores usando plantas arabidopsis thaliana expressando biosensores fluorescentes sensíveis ao cálcio e glutamato.
Este trabalho foi apoiado por bolsas da Sociedade Japonesa para a Promoção da Ciência (17H05007 e 18H05491) para MT, da Fundação Nacional de Ciência (IOS1557899 e MCB2016177) e da Administração Nacional de Aeronáutica e Espaço (NNX14AT25G e 80NSSC19K0126) para a SG.
| Arabidopsis express GCaMP3 | Saitama University | ||
| Arabidopsis express CHIB-iGluSnFR | Saitama University | ||
| GraphPad Prism 7 | GraphPad Software | ||
| L-Glutamato | FUJIFILM Wako | 072-00501 | Dissolvido em meio de crescimento líquido [1/2x sais de MS, 1% (p/v) de sacarose e 0,05% (p/v) de MES; pH 5,1 ajustado com 1N KOH]. |
| Microsoft Excel | Microsoft Corporation | ||
| Murashige e Skoog (MS) médio | FUJIFILM Wako | 392-00591 | composição: 1x sais MS, 1% (p/v) de sacarose, 0,01% (p/v) de mioinositol, 0,05% (p/v) MES e 0,5% (p/v) goma gelana; pH 5,7 ajustado com 1N KOH. |
| Nikon SMZ25 estereomicroscópio | Nikon | ||
| NIS-Elements Análise AR Nikon | |||
| 1x lente objetiva (P2-SHR PLAN APO) Câmera | Nikon | ||
| sCMOS (ORCA-Flash4.0 V2) | Fotônica Hamamatsu | C11440-22CU | |
| Placa de Petri de plástico quadrada | Simport | D210-16 |