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DOI: 10.3791/53978-v
Zoltan Simandi*1, Attila Horvath*2, Peter Nagy1, Laszlo Nagy1,2,3
1Sanford-Burnham-Prebys Medical Discovery Institute at Lake Nona, 2Department of Biochemistry and Molecular Biology,Research Center for Molecular Medicine, Medical and Health Science Center, University of Debrecen, 3MTA-DE “Lendulet” Immunogenomics Research Group,University of Debrecen
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
This video presents an integrated set of methods for identifying and validating genomic regulatory elements known as enhancers. It highlights the workflow's adaptability for various cellular model systems.
Neste trabalho, fornecemos um fluxo de trabalho experimental de como os intensificadores ativos podem ser identificados e validados experimentalmente.
O objetivo geral deste vídeo é fornecer um conjunto integrado de métodos para identificar e validar experimentalmente os elementos reguladores geneômicos, os chamados intensificadores. Este método pode ajudar a responder a questões-chave na transcrição e regulação de eventos biológicos, incluindo seleção e uso de intensificadores, usando diferenciação celular ou em resposta a estímulos externos. A principal vantagem do fluxo de trabalho apresentado é que um protocolo pode ser facilmente adaptado e usado em qualquer sistema de modelo celular.
Vou demonstrar as etapas do procedimento. Para começar, escolha um aprimorador candidato com base na análise de seqüência de chips pré-existente. Use um navegador de genoma para visualizar os resultados do experimento de seqüência de chip desejado e identificar locais de ligação nas proximidades do gene de interesse.
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