March 24th, 2023
O presente protocolo descreve dois métodos para medir a atividade da caspase através de um substrato fluorogênico usando citometria de fluxo ou um espectrofluorômetro.
Este protocolo permite aos pesquisadores identificar se a atividade da caspase ocorre em conjunto com a morte celular, identificando assim diferentes modos de morte celular. A vantagem desta técnica é a flexibilidade para avaliar a atividade da caspase em um ensaio de base populacional ou célula única. Demonstrando o procedimento estarão Stefanie Rufli, uma graduada em PhD, e Jing Tong, um estudante de doutorado visitante do laboratório de Wendy Wei-Lynn Wong.
Depois de diferenciar e colher os macrófagos derivados da medula óssea ou BMDMs, conforme descrito no manuscrito, semeie-os em uma placa de seis poços na densidade de uma vez 10 para a sexta célula por mililitro. Trate as células com SMAC mimético por 16 horas. Para preparar o lisado celular, transfira a placa contendo células tratadas para o gelo e colete o meio de cultura celular em um tubo de 1,5 mililitro.
Centrífuga a 300 G por cinco minutos a quatro graus Celsius. Aspirar o meio e colocar o tubo no gelo. Em seguida, adicione um mililitro de PBS frio à placa de cultura celular para lavar as células.
Depois de aspirar todo o PBS, adicione 100 microlitros de tripsina às células. Uma vez que as células são separadas da placa, colete-as no tubo de 1,5 mililitro. Depois de centrifugar a suspensão celular, remova o sobrenadante e ressuspenda o pellet em tampão de lise DISC de 100 microlitros.
Incubar a amostra no gelo durante 20 minutos e, em seguida, centrifugar o lisado para peletizar a fracção insolúvel. Transfira 25 microlitros de lisado para uma placa branca de fundo plano de 96 poços para o ensaio de atividade de caspase-3/7 e 10 microlitros para uma placa transparente de fundo plano de 96 poços para o ensaio de ácido bicinchonínico ou BCA. Para a quantificação de proteínas, preparar uma gama de concentrações séricas de albumina ou BSA bovinas como proteína padrão.
Uma vez que o BSA padrão é adicionado à placa de fundo plano de 96 poços contendo as amostras, misture os reagentes BCA um e dois na proporção de 50 para um e adicione 200 microlitros a cada amostra no padrão. Após incubação a 37 graus Celsius por 30 minutos, medir a absorbância a 562 nanômetros em um instrumento fluorométrico e quantificar a concentração de proteína com a curva padrão. Para realizar um ensaio de base populacional, inicie o instrumento fluorométrico e aqueça a máquina a 30 graus Celsius.
Defina o comprimento de onda de excitação e emissão em 360 e 465 nanômetros, respectivamente. Em seguida, prepare uma mistura de reação mestre no gelo, conforme descrito no manuscrito, para determinar a atividade da caspase. Adicione 75 microlitros da mistura a cada amostra e padrão para obter um volume total de reação de 100 microlitros.
Meça imediatamente a fluorescência usando a configuração do instrumento fluorométrico e registre leituras individuais a cada minuto por 40 minutos para determinar a cinética da reação. Após a semeadura, colha as células aderentes, conforme demonstrado anteriormente, em um tubo de poliestireno de cinco mililitros. Em seguida, centrifugar a amostra a 300 G por cinco minutos a quatro graus Celsius e remover o sobrenadante.
Para preparar a mistura de coloração, pegue um microlitro do substrato fluorogênico e dilua-o com 150 microlitros de PBS. Adicione 50 microlitros de mistura de coloração por amostra, incube-a no escuro a 37 graus Celsius por 30 minutos e misture a cada 15 minutos. Neste ensaio de base populacional, os dados representativos do ensaio cinético para a atividade da caspase-3/7 mostraram aumento da clivagem do substrato com aumento da concentração mimética de SMAC.
No entanto, o aumento na concentração nanomolar de 500 foi insignificante com base em uma ANOVA one-way comum com comparações múltiplas. A análise da atividade da caspase-3/7 por citometria de fluxo indicou uma mudança na fluorescência para as células tratadas com miméticos SMAC em comparação com as células não tratadas, o que também foi evidente na intensidade de fluorescência mediana plotada e o aumento na concentração nanomolar de 500 foi significativo. O procedimento deve ser realizado no gelo.
No entanto, no ensaio de base populacional, as amostras não podem ser deixadas no gelo indefinidamente. Após a etapa de lise, as amostras devem ser processadas ou congeladas imediatamente. A imagem da atividade da caspase usando microscopia de células vivas seria um método adicional para obter informações cinéticas em um único nível celular.
Este protocolo descreve métodos para medir a atividade da caspase usando citometria de fluxo ou um espectrofluorímetro, permitindo aos pesquisadores avaliar os mecanismos de morte celular.
Quantitative measurement of caspase activity is critical for de-risking early-stage drug discovery targeting cell death pathways. This protocol enables robust assessment of apoptosis and pyroptosis mechanisms, supporting predictive confidence in target validation and mechanistic studies. Reliable caspase assays inform portfolio decisions by clarifying pathway engagement and compound effects in disease-relevant systems.
This caspase activity assay integrates into the discovery-to-preclinical continuum, supporting both early mechanistic studies and later-stage translational research.