September 19th, 2018
Капиллярного изоэлектрической фокусировки является метод на основе антител, сверхчувствительная, высокая пропускная способность, позволяя подробную характеристику белков и их изоформы биологических пробах крайне мала. Ниже описывается протокол для обнаружения и количественного определения специфических белков и их изоформы автоматизированные и роботизированные образом.
Этот метод может помочь ответить на ключевые вопросы в области биомедицинских исследований, такие как открытие биомаркеров, открытие лекарств, диагностика и скрининг лекарств или антител. Основным преимуществом этого метода является то, что он имеет высокую пропускную способность и может обнаруживать белковые изоформы в высоко воспроизводимой манере. Последствия этого метода распространяются на диагностику многих заболеваний, поскольку он может измерять пораженные белки или их изоформы.
Хотя этот метод может дать представление о путях сигнализации клеток, он также может быть применен к другим системам, где конкретные белки должны быть проанализированы. Визуальная демонстрация этого метода имеет решающее значение, как анализ шаги трудно узнать из-за трюков, таких как удаление пузырьков, загрузка пластины, и так далее. Во-первых, подготовить образец разбавляя смесь, добавив один микролитер ингибитора DMSO смеси и два микролитров ингибиторов протеазы до 47 микролитров разбавления образца, так что окончательная концентрация DMSO и ингибиторы протеазы является одним X.Dilute ранее изолированных белковых лизатов с использованием образца разбавляя смесь для получения желаемых концентраций.
Далее добавьте 3,325 микролитров стандартной лестницы, шесть микролитров ингибитора протеазы и три микролитера ингибитора DMSO до 137,675 микролитров анолитного премикса. Вихрь образца по крайней мере 15 секунд и держать на льду. Смешайте два подготовленных раствора в соотношении один-три, чтобы окончательные концентрации ингибиторов протеазы DMSO и стандартной лестницы изоэлектрической точки были одним X, а белки в капилляре достигли конечных желаемых концентраций.
После того, как белки добавляются в образец смеси, все шаги будут выполняться на льду или при четырех градусах Цельсия. Поместите 384-хорошо пластины на льду. Загрузите десять микролитров смеси образца в соответствующий колодец пластины, согласно макету шаблона анализа, разработанному с помощью автоматизированного программного обеспечения западной системы blotting.
После этого разбавляют первичные и вторичные антитела разбавлением антител. Затем пипетка десять микролитров первичных антител и 15 микролитров вторичных антител в каждую колодец. Затем смешайте люминол и перекись XDR в соотношении один к одному.
Pipette 15 микролитров перекиси люминола смешивают в каждую колодец. После того, как образцы и reagants были добавлены в тарелку, центрифуга в течение десяти минут при 2500 раз G и четыре градуса по Цельсию, чтобы спина вниз жидкости и удалить пузырьки. Если пузырьки все еще существуют, удалите их вручную, используя тонкий наконечник пипетки.
Откройте автоматизированное программное обеспечение западной системы blotting и нажмите new'from меню файлов. Перейти к макет панели и назначить места для reagants и образцов в 384-хорошо пластины. Сделайте reagant назначение, нажав на колодец в любом месте блока.
Выберите ряд блока по 12 скважин каждый. Далее перейдите на панели инструментов макета и вставьте образец, первичный, вторичный или люминол строки блока. Перейдите на протокольный стекоть и выберите место рейганта в тарелке.
Затем нажмите ячейку в столбце образца и выберите reagant из выпадают меню. Таким же образом, выберите рейгант места для первичного, вторичного и люминола для каждого цикла. Нажмите на клетки по одному в первичном или вторичном столбце антитела и при необходимости измените время инкубации.
Затем добавьте циклы, нажав кнопку Add'button в разделе протокола. В панели шаблона введите информацию, относящуюся к образцу, такую как идентичность первичных и вторичных антител, их номера каталога и разбавления. Сохраните новый файл анализа.
Перед нажатием кнопки start'button быстро проверьте макет, чтобы убедиться, что все правильно. Теперь нажмите start'to начать запуск. Программное обеспечение будет побуждать пользователя удалить отходы, пополнить воду и капиллярную коробку, добавить анолит и католит в лоток ресурса, добавить буфер стирки, а также загрузить пластину в охлажденный лоток образца.
Панель состояния инструмента будет отображаться на экране компьютера через пару минут после начала запуска. Нажмите на сводку запуска, чтобы увидеть панели состояния и разделения. Чтобы наблюдать разделение электрофорез в капилляре, играть фильм разделения для этого капилляра, нажав на желаемый цикл, а затем нажав кнопку воспроизведения в панели управления.
Откройте файл запуска и выберите вкладку экрана анализа. Нажмите edit'and'and'to изменить диапазон точков. Применить соответствующий стандарт изоэлектрической точки.
Добавьте пик подгонки и добавьте пиковое имя. Наконец, выберите данные для использования во вкладке пиков и экспорт данных для дальнейшего анализа. Здесь показана электроферограмма фосфорилированных внеклеточных сигнальных киназы из сосудистого эндотелиального фактора роста, стимулируемого лисатами.
Наблюдается очень высокая индукция фосфорилированных белков с сосудистым эндотелиальным фактором роста. Вставка показывает эндогенный контроль погрузки, HSP 70, что указывает на аналогичную загрузку образцов как для необработанных, так и для обработанных образцов. В обычном иммуноблоте были обнаружены только две полосы, несмотря на то, что фосфорилированные внеклеточные сигнально-регулируемые белки киназы были решены в четыре пика капиллярным изоэлектрическим фокусирующим анализом.
Здесь показана электроферограмма внеклеточных сигнально-регулируемых киназо из сосудистых эндотелиальных факторов роста, стимулируемых лисатами. Вставка показывает тот же контроль загрузки, используемый параллельно. Обычный иммунобло показывает только две полосы, соответствующие внеклеточной сигнал-регулируемой киназы один и внеклеточный сигнал регулируется киназы два.
В то время как с капиллярной изоэлектрической фокусировки, внеклеточный сигнал регулируется киназы белки были решены в шесть пиков, что соответствует всем четырем различным фосфорилированных пиков и два не-фосфорилированных пиков. После освоения, этот метод может быть сделано в течение нескольких часов, в зависимости от количества циклов, если она выполняется должным образом. При попытке этой процедуры, важно помнить, чтобы использовать более высокие концентрации антител по сравнению с обычными иммуноблотами.
Визуальная демонстрация этого метода имеет решающее значение, как анализ шаги трудно узнать из-за трюков, таких как удаление пузырьков, загрузка пластины, и так далее. После просмотра этого видео, вы должны иметь хорошее понимание того, как разработать анализ, подготовить образцы, запустить анализ, и анализировать данные для наблюдения различных изоформ вашего белка.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
Капиллярное изоэлектрическое фокусирование - это ультрачувствительная методика на основе антител для характеристики белков и их изоформ из малых биологических образцов. Этот протокол позволяет автоматизированное обнаружение и количественное определение специфических белков.
Capillary isoelectric focusing (cIEF) addresses the discovery-stage challenge of detecting low-abundance protein isoforms from limited biological samples, such as tissue biopsies, with high sensitivity and reproducibility. By enabling quantitative, high-throughput analysis of protein charge variants, the method enhances predictive confidence in target validation and supports early go/no-go decisions in drug development pipelines. Its automation and minimal sample requirements reduce technical variability, improving data reliability for portfolio triage and mechanistic de-risking in preclinical research.
Positioned within the discovery continuum, capillary isoelectric focusing supports hypothesis testing in early discovery, enables assay readiness for screening, and provides quantitative readouts that inform lead identification and preclinical validation stages.