Геном широкий наблюдения ошибок транскрипции в эукариотических организмов

8K просмотров

Цитируется: 11

09:30 мин.

13 сентября 2018 г.

10.3791/57731-v

13 сентября 2018 г.

8K просмотров

Clark Fritsch¹^,² , Jean-Francois Pierre Gout³^,⁴ , Marc Vermulst¹

¹Center for Mitochondrial and Epigenomic Medicine, Children's Hospital of Philadelphia, ²Department of Cellular and Molecular Biology, University of Pennsylvania, ³Department of Biological Sciences, Mississippi State University, ⁴Center for Mechanisms of Evolution, Biodesign Institute, Arizona State University

Этот протокол обеспечивает исследователей с новым инструментом для мониторинга верности транскрипции в несколько модельных организмов.

Больше видео

Метод кругового секвенирования

точность РНК-полимеразы

Saccharomyces cerevisiae

Drosophila melanogaster

Caenorhabditis elegans

циркуляризация фрагментов РНК

РНК-лигаза T4

обратная транскрипция

синтез второй цепи

лигирование адаптеров

селекция по размеру с помощью магнитных частиц

ПЦР-амплификация

очистка библиотеки

Chapters in this video

0:04

Заголовок

0:38

Циклизация РНК и обратная транскрипция по типу катящегося кольца

2:51

Синтез второй цепи кДНК и репарация

3:45

Лигирование адаптеров и селекция по размеру

6:21

ПЦР-амплификация и финальная очистка на магнитных частицах

7:53

Результаты: контроль качества, биоинформатический анализ и ожидаемые результаты анализа C-seq

8:54

Заключение