Расшифровка структурных эффектов активации соматических мутаций EGFR с помощью моделирования молекулярной динамики
10K просмотров
•
Цитируется: 7
•
15:05 мин.
•
20 мая 2020 г.
DOI :10.3791/61125-v
20 мая 2020 г.
•10K просмотров
1Structural Bioinformatics Laboratory, Biochemistry, Faculty of Science and Engineering, Åbo Akademi University, 2Medicity Research Laboratories and Institute of Biomedicine, University of Turku, 3Turku Bioscience Centre, University of Turku and Åbo Akademi University, 4Department of Oncology and Radiotherapy, University of Turku and Turku University Hospital
Цель этого протокола заключается в использовании молекулярной динамики моделирования для изучения динамических структурных изменений, которые происходят из-за активации мутаций белка киназы EGFR.
Chapters in this video
0:04
Introduction
0:47
Structure Preparation
4:12
System Setup
5:17
Molecular Dynamics Simulation
7:15
Visual Inspection Analysis
8:29
Root-Mean Square Deviation (RMSD) and Root-Mean Square Fluctuation (RMSF) Analysis
9:58
Hydrogen Bond Analysis
10:57
Free Energy Calculations
12:25
Representative Results: Molecular Dynamics Simulation of EGFR Somatic Mutations
14:23
Conclusion
Related Videos
© 2026 MyJoVE Corporation. Все права защищены.