Virale Recombinatie

Cellen worden soms door meer dan één virus tegelijk geïnfecteerd. Wanneer de genomen van allebei de virussen vrijkomen voor replicatie in dezelfde cel, kunnen vergelijkbare regio's van hun genomen aan elkaar binden en sequenties uitwisselen in een proces dat recombinatie wordt genoemd. Als alternatief kunnen virussen met gesegmenteerde genomen segmenten verwisselen in een proces dat herschikking wordt genoemd.

Virale recombinatie kan nieuwe ziekten veroorzaken

Sommige ziekten kunnen meerdere soorten infecteren. Varkens kunnen bijvoorbeeld worden geïnfecteerd door bepaalde menselijke en vogelvirussen, naast de virussen die varkens gewoonlijk infecteren. Omdat virussen kunnen recombineren wanneer ze dezelfde cel samen infecteren, kunnen varkens zich gedragen als "mengvaten" die virussen van andere soorten recombineren om nieuwe virussen te creëren die soms mensen kunnen infecteren. Dit zorgwekkende fenomeen vertegenwoordigt een route waardoor besmettelijk materiaal van andere soorten de menselijke populatie kan binnendringen. Ziekten die van dieren op mensen overgaan, worden zoönosen genoemd. Mensen kunnen zeer vatbaar zijn voor dergelijke virussen omdat we nog nooit zijn blootgesteld aan deze virussen waardoor we nog geen immuniteit hebben kunnen genereren.

Influenza A is een goed voorbeeld van de “mengvat” -theorie van virale ziekten. Onderzoek heeft aangetoond dat varkens-, vogel- en menselijke influenza A-virussen opnieuw zijn gerangschikt in varkensgastheren. Deze gebeurtenissen leverden virussen op met "dubbel virale verschuivingen" die genen bevatten van menselijke en vogelvirussen en virussen met "drievoudige virale verschuivingen" die genen bevatten van menselijke, vogel- en varkensvirussen. In Nederland werd een virus met een virale verschuiving bestaande uit menselijke en vogelgriepgenen overgedragen van varkens op mensen.