우리의 실험은 HIV 양성 환자의 말초 혈액에서 translocating 세균 종의 시퀀싱 분석을 수행하는 방법을 보여줍니다.
Abstract
건강한 위장관은 생리학적으로 체액성 및 세포 점막 면역 시스템 1,2의 발전에 영향을 공생 미생물의 큰 다양성에 의해 식민지입니다.
Microbiota은 강한 점막 장벽을 통해 면역 시스템에서 격리됩니다. 감염 및 항생제는 정상적인 위장관의 장벽 가능한 면역 이상에 3 발생할 수 있습니다 상주 세균의 구성을 모두 변경하는 것으로 알려져 있습니다.
HIV는 면역 체계 활성화 4-7에 기여하는 등 lipopolysaccharide와 박테리아 DNA 조각과 같은 세균 bioproducts,의 체계 순환에 점막 면역 및 누설의 진보적인 장애와 위장 장애에 위반됩니다. 미생물 translocation은 HIV / AIDS immunopathogenesis 및 치료 4,8에 대한 응답으로 연관되어 있습니다.
우리는 HIV에 감염된 환자의 말초 혈액에 translocating 박테리아의 구성을 특징으로 목표. 우리의 목표를 추구하기 위해 우리는 시퀀싱 분석을 다음 panbacteric 16 ribosomial 유전자에 대해 PCR 반응을 설정합니다.
간단히, 모두 HIV에 감염된 건강한 과목에서 전체 혈액이 사용됩니다. 건강한 개인이 정상적인 창자 항상성을 제시 것을 감안할 때 microflora에 대한 translocation 이러한 환자에서 예상되지 않습니다. venipuncture와 플라즈마 분리하여 전체 혈액 컬렉션을 따라 DNA는 플라즈마에서 추출 및 유전자 9 ribosomial panbacteric 16에 대한 광범위한 PCR 반응을 수행하는 데 사용됩니다. 다음 PCR 제품 정화, 복제 및 시퀀싱 분석이 수행됩니다.
Protocol
HIV에 감염된 혈액 샘플 처리가 중요한 권고 사항이 필요합니다. 혈액의 모든 표본은 강력한 누출 방지 용기에 이송해야합니다. 컨테이너의 외관 및 표본 함께 모든 서류의 오염을 방지하기 위해 표본을 수집시주의해야합니다. 감염된 혈액을 처리하는 모든 사람은 장갑을 착용해야합니다. 장갑이 변경 및 손을 표본 처리 완료 후 세탁해야합니다. HIV에 감염된 혈액 샘플의 처리는 ?…
Discussion
<p class="jove_content"> 우리는 이에 HIV에 감염된 개인의 주변 혈액에 박테리아의 translocation을 특성화하기 위해 PCR / 시퀀싱 프로토콜을 보여줍니다.</p><p class="jove_content"EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) 함유 튜브에 수집한 플라즈마를 사용하는 경우> 대부분의 신뢰할 수있는 결과를 얻을 수 있습니다. 혈액 샘플링 후, 플라즈마는 haemolysis 및 DNA 조각 저하를 피하기 위해, 3분의 2 시간 이내에 원심 분리로 구분?…
Merlini, E., Bellistri, G. M., Tincati, C., d’Arminio Monforte, A., Marchetti, G. Sequencing of Bacterial Microflora in Peripheral Blood: our Experience with HIV-infected Patients. J. Vis. Exp. (52), e2830, doi:10.3791/2830 (2011).