我々は、天然水に適用できる磁性細菌(MTB)を収集する方法を示しています。 MTBを単離して、細菌の自然な磁気を利用しています比較的簡単なセットアップを使用して堆積物試料から濃縮することができます。孤立したMTBは、次に光学および電子顕微鏡の両方を用いて詳細に調べることができます。
走磁性細菌(MTB)は、最初、特にマサチューセッツ州(米国)の塩性湿地に収集する堆積物試料から1975年1に記載された水生微生物である。それ以来、MTBは世界2世界中から層状水と土砂の列が発見されました。すべてのマウンテンバイクに共通する一つの特徴は、マグネタイト(Fe 3 O 4)および/ またはグレイジャイト鉄(Fe 3 S 4)、またはその両方3、4の細胞内、膜結合型磁気ナノ結晶であるmagnetosomesを含むことである。南半球では、それらは通常、磁石3,5の北の端に惹かれながら、北半球では、MTBは、典型的には、棒磁石の南の端に魅了されています。環境試料からMTBを隔離しようとするときに、このプロパティを利用することができる。
MTBを豊かにするための最も一般的な方法の1つは、天然源から堆積物と水を収集するために透明なプラスチック容器を使用することです淡水池など。北半球では、棒磁石の南の端は、堆積物 – 水界面でちょうど堆積物の上に容器の外側に接して配置されています。しばらくすると、細菌がピペットを用いて磁石の近くに容器内から削除することができ、その後キャピラリー競馬6と磁石を使用してさらに充実。かつて豊かに、細菌はハンギングドロップ法を用いた顕微鏡スライド上に配置し、光学顕微鏡で観察または銅グリッド上に堆積され、透過型電子顕微鏡(TEM)を用いて観察することができます。
この方法を使用して、孤立したMTBは、行動、鞭毛の種類と数、細胞の細胞形態、磁性結晶の形状、magnetosomes数、各セル内magnetosome鎖の数の組成を水泳などの特性を決定するために顕微鏡的に研究することができるnanomineral結晶、細胞内の液胞が存在する。
走磁性細菌は、必ずしもすべての水生環境8で発見されていないが、それらが発生した場合、それらは100のオーダーで見つけることができます- 2ミリリットル当たり1000個の細胞。光学顕微鏡を用いて、MTBを観察するためには、あなた自身のサ ンプル8で約50細菌/ mlが必要になります。あなたのサンプル中にないか、または少数のMTBがない場合は、どちらかあなたの…
The authors have nothing to disclose.
この作品は、米国国立科学財団(EAR-0920299およびEAR-0745808)からの補助金によって支えられて、米国国立科学財団(東アジア·太平洋担当)サマー研究所、アメリカ研究助成プログラムと大学院研究奨学金同窓会助成地質学会をオハイオ州立大学から。我々は彼らの洞察に満ちたコメントのためのエディタと二人の匿名査読者に感謝したいと思います。
Item Name | Company | Catalogue number | Comments (optional) |
Glass slides | Fisher Scientific | S95933 | |
Glass Pasteur pipets | Fisher Scientific | 13-678-6A | |
O-ring | Hardware store | ||
Cover slips | Fisher Scientific | 12-542B | |
Bar magnet | Fisher Scientific | S95957 | |
Container | Any | Any plastic or glass container that can hold at least 0.5 L and can be sealed | |
Cotton | Any | ||
Microscope with 60X dry lens | Zeiss | A 60X dry lens is not absolutely necessary, but this gives a high NA without using oil | |
Diamond pen | Fisher Scientific | 08-675 | |
0.22 mm filter | Fisher Scientific | 09-719C | |
1 ml syringe | Fisher Scientific | NC9788564 | |
Microcentrifuge tubes | Fisher Scientific | 02-681-320 | |
Formvar/Carbon 200 mesh, copper grids | Ted Pella Inc. | 01800 | |
Uranyl acetate | Ted Pella Inc. | 19481 | |
Tecnai Spirit TEM | FEI | ||
Tecnai F20 S/TEM | FEI |