Abstract
原子間力分光法は、表面や界面での分子を研究する理想的なツールです。共有結合的にAFMチップ上に結合する単一分子の多種多様の実験プロトコルが提示される。同時に、AFMチップはAFMチップに結合した単一の分子を研究するための前提条件でチップと基板との間の非特異的相互作用を防止するために不動態化される。固体表面にバイオインターフェイス上の接着力、密着長さ、およびこれらの分子の自由エネルギーを決定するための分析がすぐに提示され、さらに読み出し用の外部参照が提供される。例分子は、ポリ（アミノ酸）、ポリチロシン、グラフトポリマーPI- グラム -PSおよびリンPOPE（1-パルミトイル-2- oleoyl- のsn -glycero -3-ホスホエタノールアミン）である。これらの分子は、CH 3 -SAMsのような異なる表面、水素終端ダイヤモンドから脱着や各種溶剤条件下における脂質二重層をサポートされています。最後に、力分光法の利点は、単一分子実験は真に単一分子実験で研究されているかどうかを決定するための手段を含む、議論されている。
Introduction
過去30年間に、原子間力顕微鏡（AFM）は、すべての3つの次元での分子の空間分解能を提供し、様々な溶媒中で動作させることができるので、生物学1,2および合成3の材料および表面を研究するための貴重なイメージング技術であることが判明している環境。加えて、AFM-単一分子力分光法（SMFS）はpNからμN政権に至るまで力を測定することが可能になり、4,5の折り畳みタンパク質に例えば前例のない洞察を与えている、高分子物理学6から8、および単一分子-表面相互作用9 -単一分子ではなく、分子のアンサンブルを研究の背後にある12 .theの根拠は、多くの場合、稀な事象や隠された分子状態をマスクする効果を平均化することを避けることである。さらに、このような等輪郭長、クーン長、接着自由エネルギー、などの分子パラメータの多数であることができる得。これは、以下の実施例に詳述されている。典型的なAFM-SMFS実験では、プローブ分子は、リンカー分子を介して非常に鋭い先端部に連結されている。チップ自体は曲げられる片持ち梁の端部に配置されている。先端が表面と接触した場合、プローブ分子は、この表面と相互作用する。表面から分子を分離するために、先端部の後退時にカンチレバーのたわみ、力、ひいては自由エネルギーを観察することによって決定することができる。意味のある統計値を得るために、いわゆる力 - 距離曲線の多数を取得しなければならない。さらに、真の単一分子実験（ すなわち 、1つを使用して、全実験期間にわたって同じプローブ分子）を有するプローブ分子は、AFMチップに共有結合されるべきである。ここで、共有結合を介して単一分子カンチレバーの官能化のための実験プロトコルが提示される。単一分子は、アミノまたはチオ介して結合することができるいずれかAFMチップのL群。コンジュゲーションプロセスは、使用されるポリマーの溶媒和特性を考慮して、溶剤（有機及び水性）広範な種類の中で行うことができる。
最初の部分では、共有結合的にAFMチップを、リンカー分子を介して単一分子（「プローブ分子」）を取り付けるための一般的なプロトコールが記載されている。この目的のために、有機NHS-またはマレイミド化学を13に使用される。 3つの例示的分子のためのプロトコルと共に、データ収集及びデータ解析プロセスが記載され、さらに読み出し用の参照が提供される。例分子である：（リニア）ポリマーチロシン、グラフトポリマーPI-G -PSおよび脂質POPE。これは共有結合システインを添付する例えば、プロトコルのわずかな変動が含まれています。また、セクションは、そのようなダイヤモンド表面、CH 3 -self組織化単分子膜と脂質二重層として異なる面の準備に専念しています。これらのインタフェースは、箴を持っているEN良い参照と例であることを。
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Protocol
注：準備、データ収集及びデータ解析ステップを含むプロセスフローの概要について、図2を参照してください。
1.試薬のセットアップ
注：すべての化学物質は、取り扱いに注意しなければならないため、白衣、手袋と目の保護を使用する必要があります。すべての操作は、実験室フード内で実行する必要があります。具体的には、特別な手袋はクロロホルムを用いた場合に着用してください。
- 急速にそのような乾燥クロロホルムなどの低含水量で化学薬品を使用し、週間以上乾燥ではなく、保管してください。 APTES（（3-アミノプロピル）triethoxysilanが）およびPEG（ポリエチレングリコール）（ 表1参照）ため、-20℃で、窒素またはアルゴンガス下で両方の化学物質を保管吸湿性であり、PEGは、空気中で酸化を受ける。
- 大気中の酸素や水分に株式の頻繁な露出を避けるために、理想的に窒素を用いてグローブボックスシステム内で、小さいアリコートを準備atmosphe再。
2.機器のセットアップ
注：可能な交差汚染を回避するために、ステップごとに新鮮できれいな容器を使用する。
- きれいなガラス器具および60℃の超音波浴中で30分間、界面活性剤溶液中でピンセット。
- 超純水で2回徹底的にステップ2.1から機器をすすぎ、超音波処理。
- RCA溶液中のステップ2.1からの熱機器（超純水、過酸化水素及びアンモニア（5：1：1））に75℃で45分間オーブン中でC、その後、超純水でそれらをすすぐ。
- 最後に、乾燥窒素気流下、オーブン（100℃、3時間）でガラス製品、ピンセットを乾燥する。
3.ヒント機能化
NOTE：ピンセット、船舶等は、ステンレス鋼、PTFE、ガラス、または該当する場合は、有機溶液中で化学的に安定である任意の他の材料から作られる。特に断りのない限り、Rにおける全てのステップを実行するT.必要なインキュベーション溶液の量は、カンチレバーチップの数に依存する。カンチレバーはすべての時点でそれぞれの溶液に浸漬されていることを確認します。
注：有機蒸気の吸入を避けるために、フードを使用してください。
- カンチレバー表面上のOH基の形成（「活性化」）（約0.5時間）。
- きれいなガラススライド上に、プラズマ室（100 W）に入れ、新鮮なカンチレバーチップ（10〜100 PN / NM：：SiNから、バネ定数材料）を配置するためにピンセットを使用してください。
- チャンバー（〜0.1ミリバール）を避難させる。
- 酸素ガスとの洪水室と再び避難する。
- （20％、継続時間：15分、プロセス圧力：0.25ミリバールパワー）プラズマプロセスをアクティブにします。
- カンチレバーのアミノシラン（約1時間）：
- プラズマプロセス中に、理想的には、これを行う- APTES溶液を2.5mlを調製し、ガラスシャーレ（ 表1参照）。
- Immediatelプラズマ処理後のYは、アセトン中で1秒間各カンチレバーを浸しAPTES溶液中で直後に配置します。
- RTで15分間インキュベートする。
- 慎重に10ミリリットルのアセトンに一回10ミリリットルのクロロホルムに二回カンチレバーチップをすすぐ。
- 任意の最終ステップ：清浄なガラススライド上に前工程からのプレースカンチレバーチップを70°Cで30分間、それらを焼く。表面活性化、 例えば、UV処理12のための代替戦略もあることに注意してください。
- PEG化（約2時間）：
注：手順を実行し3.3.1-3.3.4アミノシラン中に。 NHSおよびマレイミド基は、水性環境中で加水分解を受けやすいとPEG自体は空気中で酸化の対象となります。そのため（特にステップ間で）タイミングは重要なパラメータである。詳細については13を参照してください。- クロロホルム溶液を（ 表1参照）を準備。
- 結露を避けるために、、暖かいPEGは分量を開き、適切な量を計量する前に、室温まで粉末。
- アミノ基を有するポリマー又は脂質の結合のために、個別にそれらが完全に解決されるまで、それらをボルテックスすることにより、クロロホルム溶液中でNHS-PEG-NHS（6 kDa）のメチル-PEG-NHS（5kDaの）を解く。濃度については、表1を参照してください。
- 代わりに。チオール基を有するポリマーのカップリングのために別々にクロロホルム溶液中のMal-NHS-PEGとメチル-PEG-NHSを解決する。
- NHS-またはマレイミドおよびメチル末端PEG分子（：500、典型的には1）との間に一定の数の比を調整するために必要に応じて溶液を混合する。理想的な比率は、準備、実験一連のサイクルで反復的に決定されなければならないことに留意されたい。
- クロロホルムの蒸発を防止するためにクロロホルム、飽和雰囲気中で1時間PEG溶液にカンチレバーチップをインキュベートする。
- 分子抱合を探る（> 1時間）。
注：以下の3.4.1-3.4.3では、AFMチップの異なるプローブ分子の共有結合のための3つの例が記載されている。各分子のためのプロトコルを調整する必要がある。実施例1及び3-NHS化学で実施例2において、チオール官能化ポリマーPI- gが -PSがマレイミド化学を介してPEGに結合され、一方、使用されていることにも注意。詳細については、14を参照してください。- ポリ（アミノ酸）、ポリ-D-チロシン（40-100 kDa）のための
- 1MのNaOHでポリチロシン共役プローブ分子を溶解させる。 1 mg / mlの濃度に調整。
- 官能化の直前にスピン脱塩カラム（7 kDaのMWCO）を用いてホウ酸ナトリウム緩衝液（pH 8.1）のためのNaOHを交換
- その後のホウ酸緩衝液5ミリリットルとエタノール5ml、最後にして、クロロホルム5mlで最初のカンチレバーをすすぐ。
- ポリチロシンホウ酸緩衝溶液中で1時間、カンチレバーチップをインキュベートした後、ホウ酸緩衝液ですすぎ超純水。測定まで超純水に保管してください。
- 線形バックボーン（ポリイソプレン、119 kDaの）を有するグラフトされた側鎖（ポリスチレン、88 kDa）の14を有するポリマーについては、
- 乾燥クロロホルムにPI-G -PSを溶かす。 4 mg / mlのへの接合溶液の濃度を調整します。
- クロロホルム5mlのカンチレバーをすすぎ、共役溶液中で少なくとも1時間インキュベートする。
- クロロホルム5mlに再度リンスし、クロロホルム飽和環境でクロロホルム中で測定まで保存し（クロロホルム蒸発を防ぐため）。
- 脂質POPEのために
- 乾燥クロロホルムにPOPEに溶解する。 20 mMの濃度を調整します。
- 脂質溶液中で1時間、カンチレバーのインキュベーション前に5mlのエタノールと超純水5mlを有するカンチレバーをすすぐ。
- インキュベーション後、5mlのクロロホルム、エタノ5mlでカンチレバーをすすぐlで（この順序で）暖かい、超純水5mlの未結合プローブ分子を除去し、クロロホルム残基を取り除くために。すぐに官能化されたヒントを参考にしてください。必要になるまで代わりに、クロロホルムに保管してください。
- ポリ（アミノ酸）、ポリ-D-チロシン（40-100 kDa）のための
図1 NHS化学の例を用いて、先端官能化プロセスを示す（A）概略図。 （B）化学結合は、アミノ基を介して先端にプローブ分子を取り付けるために採用。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
4.表面の準備
- 自己組織化単分子膜（SAM）
注：最初に、例えば表面が、自己組織化単分子膜を選択した。文献15を参照してください - それぞれ30分間超音波浴中の洗剤溶液および2回、超純水でクリーンなガラススライド。次に、追加の洗浄工程として、15分間、75℃で（ステップ2.3参照）RCA溶液中に置く。
- コート10nmのクロム、ニッケル、真空コーター中で100nmの金でスライド。そして、前に次のステップに直接RCA溶液中に再び冷蔵庫、清潔に保管してください。
- 12時間2 mMの1-ドデカン/エタノール溶液中に前の手順のスライドをインキュベートします。チオール基は金表面に結合した疎水性単層自己アセンブル。エタノール、超純水でスライドをすすぎ後、窒素ガスの流れによるドライ。 CCDカメラ10とゴニオメーターでの静的接触角測定と調製された表面の疎水性を確認する。
注：第二の例のための表面としては、水素終端ダイヤモンドが選ばれました。以前に16記載のように表面処理を行った。
注：最後の例では、表面支持された脂質二重層（SLB）を表面として使用した。そのような表面を得るために、リン脂質POPCからなる大型の単層小胞（LUVを）の溶液（0.1 mg / mlで）を押出法により形成した。その後、LUV溶液50μlを、新たに切断したマイカシート（A = 1 cm 2で）上に置き、30分間インキュベートした。最後に、この溶液を超純水20mlで洗浄した。のSLBの準備の詳細については、17,18を参照してください。
5.データ集録
注：実験では、液体中で測定する機能を提供し、AFMを使用します。データ収集およびデータ分析手順は関係なく使用AFMモデルの適用可能である。さらに、いくつかの実験ではtemperaturを制御する可能性を有することが有利である液体セル内の電子。カンチレバーの偏向は、レーザビームの偏向方法19を介して検出した。ばね定数は、熱雑音法20を用いて測定した。
- 体液中の測定に適しているAFMカンチレバーホルダーに官能化カンチレバーを挿入します。
- AFMにサンプリングされる（調製は上記参照）の表面を入れて、液体でそれをカバーしています。どちらも、カンチレバーと表面が今表面に向かって指しているカンチレバーの先端で液中に浸漬する必要があります。多くの場合、液体の滴が十分であることに注意してください。いずれの場合においても流体の蒸発は、閉じた流体セルを用いて、例えば 、避けるべきである。
- 該当する場合、コントローラ上の所望の温度を調整します。
- システムは、少なくとも半時間平衡化しましょう。
- 効果を減衰任意の表面を除外するために、遠く離れた表面からカンチレバーとカンチレバーの熱雑音スペクトルを記録します。通常1ことに注意してください0以上のスペクトルは、十分な信号対雑音比を得るために、蓄積されなければならない。
- 表面アプローチ。先端形状と先端官能化を節約するためにアプローチプロセスは注意深く行わなければならないことに留意されたい。これは、間欠接触モードで接近、例えば、によって達成することができる。
- NM /ボルトで測定された逆の光てこ感度（InvOLS）を決定します。硬い表面に対してカンチレバー先端を押すことでこれを行います。
- フォトダイオード電圧の変化対ピエゾ移動距離の傾きを測定することにより、InvOLSを決定します。カンチレバーの先端が表面に接触している力 - 距離曲線の一部にラインを取り付けます。脂質二重層のようなソフト面を含む実験では、脂質二重層（「欠陥スポット」）で覆われていない領域でこの手順を実行する。
- 熱雑音スペクトルに高調波発振器を適合させることによりバネ定数（PN / nm）を決定します。使用ばね定数決定のための自動化されたソフトウェア機能と、そうでなければ文献20を参照してください。
- 実験を開始します。
- 各実験条件での数々の力 - 距離曲線を記録します。 1μmの距離を撤回、5 kHzの、1ミクロン/秒の先端速度のサンプリングレート：通常、実験パラメータに次の値を使用します。
注：場合によっては、検討した実験のダイナミクスに応じて、それは（「滞留時間」）の表面に接触して先端にある程度の時間を待機する必要があるかもしれない。
注：この実験特有のパラメータは、上記の値から大幅に逸脱することができます。 - 長期の測定中に、フォトダイオードを再配置することによって随時フォトダイオード上のレーザ位置をゼロ。
- オプション：すべての力曲線の後、別のXY位置にAFMチップを再配置。
- 実験の終了時に、感度およびスプリングを決定CONSTAシステムの一貫性および安定性を確認するために再度のnt。
注：実験前と後のばね定数と感度を比較することは、システムの特性およびチップの特性は実験の過程にわたって変化しないままであったことを確実にするための手段である。ばね定数の差が（<= 15％）が大きすぎない場合には、バネ定数の決定の本質的な不確実性も15％程度であるので、それらは、平均することができる。大きな違いの場合は、最初に見つけると、さらなる実験を続行する前に、変化する見かけのばね定数の原因を排除することをお勧めします。
- 各実験条件での数々の力 - 距離曲線を記録します。 1μmの距離を撤回、5 kHzの、1ミクロン/秒の先端速度のサンプリングレート：通常、実験パラメータに次の値を使用します。
6.データ準備
注：典型的には、ニュートンとナノメートル単位を変換するだけでなく、データが記載されている修正するための実験の特定のタイプとは無関係に行われ、このセクションの一般的データ準備工程において。実験特定のデータ分析はBRであるieflyそれぞれの代表的な実施例のセクションで以下にさらに説明する。
- 一般的に、すべてのデータの準備を行い、解析ソフトウェアIGOR Proを6に基づいて、 例えば家庭書き込まアルゴリズムによって自動的に繰り返す。
- InvOLS [NM / V]とばね定数[nNの/ nm]とでそれを掛けることによって発効[V]生の偏向信号（DEFL）を変換します。
- 表面（アンロードカンチレバー）から十分な距離でカンチレバー上の力が0 NNのになるように力を相殺した。
- ：実際の先端位置（表面に対して測定した場合にも、分離と呼ばれる）を考慮にカンチレバーの曲げをとるのz *を計算する
- のz * = 0は、表面のz位置に対応するように* zのオフセット。
注：ここで、Fは 、したがって、先端に作用する力であり、曲げ（ステップ6.2で決定された。）は、カンチレバーのs、zは測定されたz軸センサ位置（直接計器により与えられる）、kは （ステップ5.8で決定された）ばね定数を表している。
サンプル調製、データ収集とデータ分析を示す図2.プロセスフロー図。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
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Representative Results
以下では、上記の結果は、例えば分子 、すなわちポリマーのポリ（アミノ酸）、ポリチロシン、グラフトポリマーPI- グラム -PSおよびリンPOPE記載、提示されている。まず、各実施例について、データ収集及びデータ準備のための試し特定の詳細が提供される。その後、これらの分子は異なる表面から脱着された実験用の例示的な結果（CH 3 -SAMs、水素終端ダイヤモンドと脂質二重層）が示されている。接着力、密着長さと自由エネルギーの決定は、導入される。
例1：自己組織化単分子膜からポリチロシンの脱着
エタノールの様々なコンテンツを持つ別のソリューションで疎水性のSAMからのポリチロシンの脱離を測定した。上述の少なくとも300力dと各溶液にカンチレバーInvOLSとバネ定数を決定したistanceトレースは各溶液について記録した。つの実験セットの実験はすべて、同一の単一のポリ（アミノ酸）を測定したことを確認するために、一日に単一のカンチレバーを用いて行った。カンチレバーの延長/後退速度は0.5ミクロン/秒であり、表面上の滞留時間は1秒であった。力距離トレースは一定の力のプラトーを示した。それぞれのプラトーはシグモイド曲線とプラトー力ならびにプラトーの長さを決定し、ヒストグラムにプロットした取り付けた。ヒストグラムは、ガウスピーク値を装着しただけでなく、分布の標準偏差（誤差）で抽出した。力の高原の最後まで、システムが平衡状態にあると台地の下の面積は、したがって、ポリマー長さ当たりの自由エネルギーに等しい。台地の端でのみ離脱プロセス自体は非平衡状態にある。このため、典型的な実験のためにプラトー長がequilibriより長い UMの長さ（約30％）と、S字状の下の面積は、接着自由エネルギー21の上限見積もりに適合します。
（赤で表示）純水中でメチル-SAM上のポリチロシンの図3.（A）強制距離トレース（後退）。単一の分子は、ベースライン（ゼロ力）への力の単一工程降下に見られるように脱着する。シグモイドフィットは黒で表示され、抽出されたプラトー長プラトー力は矢印で示されている。 （B）は、純粋な水および異なるモルのエタノール含有量を有する水/エタノール混合物中での測定のために抽出されたプラトー力のヒストグラム。 （C）は、同じ実験設定のプラトー長ヒストグラム。 （D）ピークプラトー力対ピークプラトー長さ。」456 / 52456fig3large.jpg「ターゲット= "_空白">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図3Aは、純水中で測定されたポリチロシンのシングル力-距離トレースを示しています。プラトー力及びプラトーの長さが抽出される。 SAMから脱着された先端の唯一つの分子が存在する場合には、プラトーの長さのヒストグラム（通常の実験で長ヒストグラムのガウスフィットの標準偏差は、約5〜20nmである）、狭い単峰性の分布を示している。プラトー長さヒストグラムで唯一の狭いピークがあるかどうその逆に、1は、全体の実験セットが1と同じポリマーで行われたことを比較的確認することができます。この理由は、polytyrosinesサイズ（50〜100 kDa）の高度にpolydispersiveあることである。そのため、全く同じ長さの2つのポリマーは、非常にありそうである。エタノールを追加すると、ポリチロシンと表面10,22との間の疎水性相互作用を弱める図3Bに示される別の溶媒条件プラトー力ヒストグラムに見られるように、下側プラトー力従ってより低い吸着自由エネルギーを導き。今では、単一のポリチロシンのプラトー長さが異なる吸着自由エネルギーのためにどのように変化するかを調べることができる。 図3Cに見られるように、プラトーの長さは、エタノールの添加と共に減少する。同時にプラトー力が減少（ 図3D）。
脱着プロセスのすべての関連するパラメータ、すなわち輪郭長、クーン長、吸着自由エネルギー及び固有単量体脱離速度を得るために、人は一定の距離実験によって、上述の測定を組み合わせる必要がある。詳細については、21を参照してください。
実施例2：グラフトポリマーPI- gの脱離は、疎水性ダイヤモンドから-PS
図4AのPI-G -PSを用いて得られた図4（b）典型的な力-距離曲線が示されている。表面上の滞留時間は1秒であったとカンチレバーの速度/秒で1μmであった。一定の力（ 図4A）または破裂のいずれかのイベントプラトー（ 図4B）が観察された。一定力のプラトーは、プラトーの高さは、シグモイドフィットを用いて決定した値と、ヒストグラム（ 図4C）にプロットした。表面（ 図4Bの力-距離曲線の最初のピーク）と先端の直接相互作用に起因する非特異的な接着ピークを除外するには、表面から一定の距離で最大の力を決定した。これらの破裂イベントの得られた値は、ヒストグラム（ 図4D）にプロットした。さらなる分析のためのヒストグラムは、ガウシアンでフィットさせ、最大の高さは、平均値として選ばれましたデータ点。この種の実験で側鎖とそのアーキテクチャの存在の影響14を調べた。
図4フォース距離後退ポリスチレン側鎖でグラフト化された線形ポリイソプレン骨格（PI- グラム -PS）を用いて行っ曲線のいずれか一定の力（A）もしくは破裂イベント（B）のプラトーが観察される。一定力の台地のために、プラトーの高さはシグモイドフィットを用いて決定し、破断イベントのため、最大の破断力（D）が決定されるのに対し、ヒストグラム（C）にプロットされている。 これの拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください図。
例3：シングルフォーの抽出脂質二重層からspholipid（POPE）
図5Aは、単一分子の抽出プロセスの概略図を示す。抽出の測定は、垂直に支持脂質二重層（図示せず）に向かってPOPE官能化AFMチップに近づいて行った。 POPC二重層とチップの接触時に、小さな力（〜100 pNの）は、約4秒間のフィードバックループによって一定に保たれる。 POPE分子は、この滞留時間の間に二重層に挿入した場合、それが引き出され又は二重層からAFM先端を後退させる際に二重層から「抽出」。これは、特徴的な力 - 距離曲線が得られる。その形状は、基本的にはPEGリンカーの伸縮弾性によって決定され、ひも状鎖（WLC）モデル23によって装着することができる。 50以上の曲線の重ね合わせは、 図5Bに示されている。真の単一分子事象は、単一峰力ヒストグラムによって認識することができる（ 図5C オング>）。特定の分子パラメーターのサイズ（ 例えば、二重層中の脂質の平均寿命時間）へのさらなる洞察を得るためには、異なる力負荷率との測定を行う必要があることに留意されたい。シングル脂質抽出実験のさらなる分析のために24を参照してください。
脂質二重層から単一分子を抽出するための模式図を図5（A）。脂質分子に共有先端に連結されていることに留意されたい。したがって、力抽出サイクルの多くの100以上千も、1つの同一分子で行うことができる。 （B）50以上の抽出曲線9の重ね合わせ。 （C）（B）に示す例の引き抜き力分布のヒストグラム。.JPG「ターゲット= "_空白">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
| ステップ | 目的 | 溶質 | 溶剤 | 典型的な比率または濃度 |
| シラン化 | カンチレバー表面にアミノ基を作る | APTES（3-アミノプロピル）トリエトキシシラン（ 例えば、Vectabond™） | 乾燥アセトン | 午前1時50分（v / v）の - 1：100（v / v）の |
| PEG化 | アミノ基またはチオール反応基と、カンチレバー表面を提供 | NHS-PEG-NHSまたはマル-PEG-NHS | 乾燥クロロホルム | 0.25から25 mMの |
| PEG化 | 受動化カンチレバー表面 | メチル-PEG-NHS | 乾燥クロロホルム | 25 mMの |
| プローブ分子のコンジュゲーション | 二官能性PEGのアミノ基またはチオール基を介して結合するプローブ分子 | プローブ分子（ポリマー、脂質、 など ） | 乾燥クロロホルムまたはホウ酸緩衝液 | 0.1〜10 mMの |
表1.ソリューションは、先端機能化のために必要。
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Discussion
最後の数十年の間に、単一分子実験は分子メカニズムに前例のない洞察を提供し、生命科学とそれ以降で非常に貴重なアプローチであることが判明しました。 SMFS実験の良い有意義な統計値を達成するために、理想的には、同一の分子は、実験の全体にわたって使用されている。分子のアンサンブルを用いた実験とは対照的に、SMFS実験は稀な事象と隠された分子状態を検出することができる。単一分子実験の別の利点は、分子動力学シミュレーション24,25によってモデル化することができることである。
28 -上記のカンチレバー機能化プロトコルは、以前に26を公表された手順の修正バージョンです。活性化およびシラン化した後、AFMカンチレバーは、ポリエチレングリコールの二つの異なる種類（PEG）分子（リンカー分子）との混合物で官能化されている。
N-ヒドロキシスクシンイミドによって第（NHS）基（またはチオール反応性マレイミド基）で終端され、ここで後でプローブ分子（「NHS-PEG」、「マル-PEG」）に結合体化される。先端機能化の概略については、図1を参照してください。 PEGの目的は3つあります。まず、それは先端面を不動態化、したがって、非特異的吸着を防ぐことができます。第二に、特定のメチル-PEG / NHS-PEGの比を使用してチップ表面にNHS-PEG濃度を調整することを可能にする。第三に、プローブ分子からチップを分離するので、直接チップ - 表面相互作用からの干渉なしに分子 - 表面相互作用の定量化を可能にする。その後、プローブ分子を共有結合NHS-PEG（またはマル-PEG）を介して先端部に連結されている。
このプロトコルは、確認しますその＆＃内のすべての結合（*）8220;カップリングチェーン「 先端OH * *シラン* PEG *プローブ分子は 、共有結合、したがって、非常に強いです。これは次に、一つの同じプローブ分子は、実験の全期間にわたって測定されることを可能にする。これが真の単一分子力分光法を示す代表的な結果のセクションで、上記で例示されています。
どのように真に単一分子が測定されていることを確認することができますか？一定の力のプラトーを持つ単一のトレースについては、ベースラインへの単一の低下が十分です。複数のポリマーが同時に脱着された場合、各ポリマーは、異なる時点で切り離されるように、力は、いくつかの個別の段階でゼロになる。より困難それは同じ単一分子毎回かどうかを判断することです。したがって、剥離長さの分布を評価する必要がある。単一のピークを有する狭い分布はその1と同じ単一分子は、すべての力拡張トレースでプローブした良い兆候です。割り込みを持つ単一のトレースのUREイベントは、すべてのトレースの重ね合わせは、（1と同じ）単一分子が測定されたかどうかを判断するための最良の方法です。あるいは、各トレースは、（WLC）モデルと、両方の持続長を取り付けることができ、所定の力で破断長さをプロットすることができる。これら2つのパラメータの分布は狭く、単峰性でなければならない。
結論として、AFMチップの単一分子の多種多様の結合のための準備手順が提示されている。 AFMの小さな先端（半径〜10 nm）を、その横方向の位置決め機能とその力の感度が、ほぼすべての液体に生物学的および非生物表面上の単一分子の接着特性を研究するための理想的なツールにする。
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Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Materials | |||
| Hellmanex III alkaline liquid concentrate (detergent solution) | Hellma | ||
| RCA (ultrapure water, hydrogen peroxide (35%), ammonia (32%); 5:1:1(v/v/v)) | Sigma | ||
| Vectabond reagent / APTES (3-Aminopropyl)triethoxysilane | Vectorlabs | ||
| Dry acetone (< 50 ppm H2O) | Sigma | ||
| Dry chloroform (> 99.9%) | Sigma | ||
| Triethylamine | Sigma | ||
| Ultrapure water | Biochrom, Germany | ||
| Di-sodium tetraborate (> 99.5%) | Biochrom, Germany | ||
| Boric Acid | Biochrom, Germany | ||
| Monofunctional α-methoxy-ω-NHS PEG, 5 kDa, “methyl-PEG-NHS” | Rapp, Germany | ||
| Heterobifunctional α,ω-bis-NHS PEG, 6 kDa, “NHS-PEG-NHS” | Rapp, Germany | ||
| Heterobifunctional α-maleimidohexanoic- ω-NHS PEG, 5 kDa, “Mal-PEG-NHS” | Rapp, Germany | ||
| Probe molecule (polymer, lipid, etc.) | |||
| Equipment | |||
| Sufficient amount of glass crystallising dishes with spout (10 ml), glass Petri dishes (500 µl) and glass lids | VWR International GmbH, Germany | ||
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Laboratory oven model UF30 | Memmert, Germany | ||
| Temperature controlled sonicator | VWR International GmbH, Germany | ||
| Plasma system "Femto", 100 W | Diener, Germany | ||
| One separate glass syringe for each organic solvent | VWR International GmbH, Germany | ||
| Vortex mixer | VWR International GmbH, Germany | ||
| Microcentrifuge tubes (0.5 ml or 1.5 ml) | Eppendorf | ||
| Pipettes: 10-100 µl, 50-200 µl and 100-1,000 µl | Eppendorf | ||
| AFM with temperature controlled fluid cell (e.g. MFP-3D with BioHeater) | Asylulm Research, Santa Barbara | ||
| Soft SiN cantilevers cantilever, typically made from silicon nitride (SiN) (spring constant less than 100 pN/nm, e.g. MLCT) | Bruker AXS, Santa Barbara |
References
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