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Articolo metodologico

Simulazione Laboratorio di ferro (II) ricchi di Precambriano Marine Upwelling sistema per esplorare la crescita di batteri fotosintetici

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DOI:

10.3791/54251

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24 luglio 2016

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In questo articolo

Sommario

Abbiamo simulato un sistema di risalita marino ferruginosa Precambriano in una colonna a flusso continuo verticale la produzione su scala. L'obiettivo era quello di capire come i profili geochimici di O 2 e Fe (II) evolversi come cianobatteri producono O 2. I risultati mostrano l'istituzione di un chemoclino a causa di Fe (II) l'ossidazione da parte fotosinteticamente prodotte O 2.

Abstract

Un concetto convenzionale per la deposizione di alcuni Precambriani a banda ferro Formazioni (BIF) parte dal presupposto che il ferro ferroso [Fe (II)] risalita da fonti idrotermali nell'oceano Precambriano stato ossidato dall'ossigeno molecolare [O 2] prodotto da cianobatteri. I BIFs più antichi, depositati prima del grande evento di ossidazione (GOE) a circa 2,4 miliardi di anni (Gy) fa, avrebbero potuto formata da ossidazione diretta di Fe (II) anoxygenic photoferrotrophs in condizioni anossiche. Come metodo per testare i modelli geochimiche e mineralogiche che si sviluppano in diversi scenari biologici, abbiamo progettato una colonna a flusso verticale lunga 40 cm per simulare un anossica Fe (II) -rich rappresentativo di un antico oceano sistema di risalita marino su scala di laboratorio . Il cilindro è stato confezionato con una matrice di perle di vetro poroso per stabilizzare i gradienti geochimici, e campioni di liquido per la quantificazione di ferro potrebbe essere presa in tutta la colonna d'acqua. Ossigeno disciolto erarilevato in modo non invasivo tramite optodes dall'esterno. I risultati di esperimenti biotici che coinvolgevano flussi risalita di Fe (II) dal basso, una luce diversa pendenza dall'alto, e cianobatteri presenti nella colonna d'acqua, mostrano chiara evidenza la formazione di Fe (III) precipitati minerali e sviluppo di un chemoclino tra Fe (II) e O 2. Questa colonna consente di testare ipotesi per la formazione delle BIFs coltivando cianobatteri (e in futuro photoferrotrophs) in condizioni Precambriani marine simulate. Inoltre si ipotizza che il nostro concetto di colonna permette la simulazione di diversi ambienti chimici e fisici - tra cui i sedimenti marini o lacustri poco profonde.

Introduzione

Il Precambriano (4,6-,541 Gy fa) atmosfera vissuto un graduale accumulo di fotosinteticamente prodotte ossigeno (O 2), forse punteggiato da cambiamenti passo alla cosiddetta "Grande Oxidation Event" (GOE) a circa 2,4 Gy fa, e di nuovo in Neoproterozoic (1-,541 Gy fa) come O 2 atmosferica abbiano raggiunto livelli moderni 1. I cianobatteri sono i resti evolutivi dei primi organismi capaci di fotosintesi oxygenic 2. Studi e prove modellazione geochimica supportano il ruolo di ambienti costieri poco profondi a ospitare comunità attive di cianobatteri o di organismi capaci di fotosintesi oxygenic o fototrofi oxygenic, generando....

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Protocollo

1. Preparazione di coltura medio

Nota: Le informazioni sulle attrezzature necessarie, prodotti chimici e materiali di consumo per la preparazione del terreno di coltura è elencato nella tabella 1 italiche codici alfanumerici tra parentesi si riferiscono alle apparecchiature dettagliati nella tabella 2 e mostrato in Figura 1..

  1. Preparare 5 L di media Marine phototroph (MP) (di seguito indicato come "media") seguendo il protocollo di Wu et al. 16. Regolare il pH a 6,8 utilizzando anossica e sterile 1 M HCl o 0,5 M Naco 3. Come fonte di Fe (II), aggiu....

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Risultati

esperimento di controllo

Esperimenti di controllo abiotici (10 giorni) hanno dimostrato concentrazioni costantemente basse di ossigeno (O 2 <0,15 mg / L) senza variazioni significative del Fe (II) -profile nella colonna d'acqua risalita. La formazione di precipitati (presumibilmente Fe (III) (oxyhydr-) ossidi) nel serbatoio medio e la leggera diminuzione del (II) concentrazione c.......

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Discussione

comunità microbiche nel mare Precambriano sono stati regolati da, o modificati a seguito della loro attività e le condizioni geochimiche prevalenti. In interpretare le origini di BIF, ricercatori generalmente dedurre la presenza o l'attività dei microrganismi basato sulla sedimentologia o geochimica BIF, ad esempio, Smith et al. 23 e Johnson et al. 24. Lo studio degli organismi moderni in ambienti moderni che hanno analoghi geochimici per ambienti antichi è anche un v.......

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

Ringraziamenti

Mark Nordhoff assistito nella progettazione e realizzazione di collegamenti dei tubi. Ellen Struve ha contribuito a selezionare e acquisire le attrezzature utilizzate.

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Fiaschetta Widdel (5 L)Ochs110015labor-ochs.de
Bottiglie di vetro (5 L)RotilaboY682.1carlroth.com
Pipette di vetro (5 ml)51714labor-ochs.de
0,22 &; m Unità filtro Steritop (0,22  µ m Membrana in polietersulfone)MilliporeX337.1carlroth.com
Siringa
sterile in vetro Luer Lock, riempita con cotoneC681.1carlroth.com
aghi in acciaio inossidabile Luer Lock (150 mm, 1.0  mm ID)201015labor-ochs.de
NaClSigma433209sigmaaldrich.com
MgSO4Sigma208094sigmaaldrich.com
CaCl2SigmaC4901sigmaaldrich.com
NH4ClSigmaA9434sigmaaldrich.com
KH< sub>2PO4SigmaP5655sigmaaldrich.com
KBrSigmaP3691sigmaaldrich.com
KClSigmaP9541sigmaaldrich.com Cilindro
di vetroY310.1carlroth.com
Lana7377.2carlroth.com
Perle di vetro (ø 0.55 - 0.7& nbsp; mm)11079105biospec.com
tappo in gomma butilica (ø 1,2 cm)271024labor-ochs.de
Piastra di Petri, vetro (ø 8,0  cm)T939.1carlroth.com
CollaOTTOSEAL S68adchem.de
Foglio per sensore ottico di ossigeno (per l'analisi dell'ossigeno, vedi sotto)– su richiesta –presens.de
Tubo in gomma (35 mm, 7  mm ID)770350labor-ochs.de
Connettore tubo Luer Lock (3,0 mm, Luer lock maschio = LLM)P343.1carlroth.com
Connettore tubo Luer Lock (3,0 mm, Luer lock femmina = LLF)P335.1carlroth.com
Tubo in gomma (25 mm, 0,72 mm ID)2600185newageindustries.com
Tubo in gomma (50 mm, 7  770350labor-ochs.de
Ago in acciaio inossidabile Luer Lock (150 mm, 1,0 mm ID)201015Siringa in
vetro Luer Lock labor-ochs.de (10 ml)C680.1carlroth.com
Cotone sciolto –
Tappo in gomma butilica (ø 1.75 cm)271050labor-ochs.de
Ago in acciaio inossidabile (40 mm, 1.0  AgoSterican4665120bbraun.de
Luer Lock (150 mm, ID 1,5 mm)201520Posizione labor-ochs.de
: Parte del connettore femmina Luer Lock a C.7
CollaOTTOSEAL S68adchem.de
Ago in acciaio inossidabile (120 mm, 0,7 mm ID)Sterican4665643bbraun.de
Tubi in gomma (40 mm, diametro interno 0,74 mm)2600185newageindustries.com
Guaina termorestringente (35  mm, 3 mm ID ristretto)541458 - 62conrad.de
MorsettoSTHC-C-500-4tekproducts.com
Connettore per tubo Luer Lock (1,0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Tappo in plastica Luer Lock (LLM)CT69.1carlroth.com
Bottiglia di vetro (5 L)RotilaboY682.1carlroth.com
Tappo in gomma butilica (per GL45)444704labor-ochs.de
Capillare in acciaio inox (300 mm, 0,74 mm ID)56736sigmaaldrich.com
Capillare in acciaio inox (50 mm, 0,74 mm ID)56737sigmaaldrich.com
Guaina termoretraibile (35 mm, 3  mm ID ristretto)541458 - 62conrad.de
Tubo in gomma (100 mm, 0,74 mm ID)2600185newageindustries.com
Connettore tubo Luer Lock (1,0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Siringa in vetro Luer Lock (10 ml)C680.1carlroth.com
Cotone sfuso –
Tappo in gomma butilica (ø 1.75 cm)271050labor-ochs.de
Ago in acciaio inossidabile (40 mm, 0.8  Siringabbraun.de 4657519Sterican
(5 ml)C679.1carlroth.com
Tappo in gomma butilica (ø 1,75 mm)271050labor-ochs.de
Tubo in gomma (40 mm, 0,74 mm ID)2600185newageindustries.com
Flacone in vetro (2 L)RotilaboX716.1carlroth.com
Tappo in gomma butilica (per GL45)444704labor-ochs.de
Capillare in acciaio inossidabile (50 mm, diametro interno 0,74 mm)56736sigmaaldrich.com
Tubo in gomma (diametro interno 30 mm x 0,74 mm)2600185tubo in
gomma newageindustries.com (diametro interno 100 mm x 0,74 mm)2600185connettore per
tubo Luer Lock newageindustries.com (1,0 mm, LLF)P334.1carlroth.com
Connettore Luer Lock a 3 vie (LLF, 2x LLM)6134cadenceinc.com
Sorgente luminosaSamsungSI-P8V151DB1USsamsung.com
Pompa peristalicaIsmatecEW-78017-35coleparmer.com
Tubo di pompaggio (0.89  mm ID)EW-97628-26coleparmer.com
Capillare in acciaio inossidabile (200 mm, 0,74 mm ID)56736
sigmaaldrich.com Capillare in acciaio inossidabile (400 mm, 0,74 mm ID)56737sigmaaldrich.com
Pacchetto di gas Supel-Inert Foil (Tedlar - PFC) (10 L)30240-Usigmaaldrich.com
Tubo in gomma (30 mm, 6  mm ID)770300labor-ochs.de
Connettore per tubo Luer Lock (3,0 mm, LLM)P343.1carlroth.com
Connettore per tubo Luer Lock (3,0 mm, LLF)P335.1carlroth.com
Siringa a tenuta di gas (20  ml)C681.1carlroth.com
bruciatore...
Misuratore di ossigeno a fibra ottica per la quantificazione dell'ossigenoPresensTR-FB-10-01presens.de
Pompa...
Colla siliconica per optodi all'ossigenoPresensPS1presens.de
di vetro polimerica in acciaio inossidabile polimerica per tubo in vetro Luer lock Bunsen a vuoto

Riferimenti

  1. Lyons, T. W., Reinhard, C. T., Planavsky, N. J. The rise of oxygen in Earth's early ocean and atmosphere. Nature. 506 (7488), 307-315 (2014).
  2. Raymond, J., Blankenship, R. E. The origin of the oxygen-evolving complex. Coord. Chem. Rev. 252 (3-4), 377-383 (2008).
  3. Kendall, B., Reinha....

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