पारंपरिक स्लैब जेल वैद्युतकणसंच (SGE) प्रयोगों में एक जटिल उपकरण और उच्च रासायनिक खपत की आवश्यकता होती है। यह काम एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करता है जो कम समय की सीमा के भीतर डीएनए टुकड़ों को अलग करने के लिए कम लागत वाली विधि का वर्णन करता है।
स्लैब जेल वैद्युतकणसंचलन (एसजीई) डीएनए टुकड़ों के अलग होने के लिए सबसे आम तरीका है; इस प्रकार, यह व्यापक रूप से जीव विज्ञान और अन्य लोगों के क्षेत्र में लागू होता है हालांकि, पारंपरिक SGE प्रोटोकॉल काफी थकाऊ है, और प्रयोग में एक लंबा समय लगता है। इसके अलावा, एसजीई प्रयोगों में रासायनिक खपत बहुत अधिक है। यह काम एक एसजीई चिप के आधार पर डीएनए टुकड़ों के अलग होने के लिए एक सरल विधि का प्रस्ताव करता है। चिप एक उत्कीर्णन मशीन द्वारा बनाई गई है। ऑप्टिकल संकेत के उत्तेजना और उत्सर्जन तरंग दैर्ध्य के लिए दो प्लास्टिक शीट का उपयोग किया जाता है। डीएनए बैंड के प्रतिदीप्ति संकेत स्मार्टफोन द्वारा एकत्र किया जाता है इस पद्धति को मान्य करने के लिए, 50, 100, और 1,000 बीपी डीएनए सीढ़ी अलग हो गए थे। परिणाम दर्शाते हैं कि 5,000 बीपी से छोटा डीएनए सीढ़ी 12 मिनट के भीतर हल किया जा सकता है और इस पद्धति का उपयोग करते समय उच्च संकल्प के साथ यह इंगित करता है कि यह पारंपरिक एसजीई विधि के लिए आदर्श विकल्प है।
स्लैब जेल वैद्युतोसोरिसिस (एसजीई) डीएनए टुकड़ा अलग 1 , 2 , 3 , 4 , 5 के लिए सबसे प्रभावी तरीका है और इस प्रकार 6 , 7 , 8 के जैव रासायनिक और जैविक विश्लेषणों में एक बहुमुखी उपकरण माना जाता है। हालांकि, कई प्रयोगों से संकेत मिलता है कि एसजीई निम्नलिखित चार समस्याओं से प्रतिबंधित है: (1) पृथक्करण कई घंटे और दिन भी लेते हैं; (2) रासायनिक खपत बहुत अधिक है; (3) इसके लिए एक जटिल तंत्र की आवश्यकता होती है ( उदाहरण के लिए, 2 डी वैद्युतकणसंचलन सेल, वैद्युतकणसंचलन बिजली की आपूर्ति, और जेल इमेजिंग सिस्टम); (4) जेल इमेजिंग सिस्टम केवल जब प्रयोग समाप्त हो जाता है तो अलग डीएनए टुकड़े का निरीक्षण कर सकता है। इसके अलावा, नैदानिक ब्रोमाइड (एटीबीआर), जो सामान्यतः एसजीई 9 में प्रयोग किया जाता है ,Ass = "xref"> 10, उत्परिवर्तनीय और कैंसरजन्य 11 , 12 है । इस प्रकार, एटब्रे युक्त जैल सौंपते समय दस्ताने को हमेशा पहना जाना चाहिए
एसईजी की तुलना में केशिलरी वैद्युतोसोरिसिस (सीई) के कई फायदे 13 , 14 , 15 , 16 , 17 हैं , जैसे स्वत: संचालन, छोटे पृथक्करण समय और कम खपत। हालांकि, सीई यंत्र काफी महंगा है। इसलिए, उन सीमाओं पर काबू पाने के लिए, डीएनए के विभाजन के लिए एक प्रणाली विकसित की गई है ( चित्रा 1 )। इस तरह की प्रणाली न केवल रासायनिक खपत को कम कर सकती है और एसजीई प्रयोग के समय (<8 मिनट) को बचा सकती है, लेकिन यह स्मार्टफोन द्वारा एगारोस जेल में डीएनए अलग प्रक्रिया की रीयल-टाइम ट्रैकिंग भी कर सकती है। इस प्रोटोकॉल में वर्णित प्रक्रियाओं का पालन करके, छात्रों shouएलडी एसजीआई चिप डिजाइन और तैयार करने में सक्षम हो, चिप में agarose जेल तैयार करें, एक स्मार्टफोन के साथ एक सरल एसजीई प्रणाली की स्थापना करें, और agarose जेल में डीएनए प्रवासन प्रक्रिया रिकॉर्ड करें।
एगरोस जेल वैद्युतकणसंचलन को व्यापक रूप से डीएनए, आरएनए, और प्रोटीन के अलग होने के लिए उपयोग किया जाता है। यह काम पारंपरिक जेल वैद्युतकणसंचलन प्रोटोकॉल को बदलने के लिए एक नई विधि का प्रस्ताव है। परिणाम …
The authors have nothing to disclose.
चीन की नेशनल नॅचुरल साइंस फाउंडेशन (नंबर 21205078) और चीन की उच्च शिक्षा के डॉक्टरल कार्यक्रम (नो .123-23120110002) के लिए हम रिसर्च फंड से आभार व्यक्त करते हैं। यह काम आंशिक रूप से चीन के राष्ट्रीय प्रमुख अनुसंधान एवं विकास कार्यक्रम (2016 YFB1102303), चीन के राष्ट्रीय मूल अनुसंधान कार्यक्रम (973 कार्यक्रम, 2015 सीबी 352001) और चीन के राष्ट्रीय प्राकृतिक विज्ञान फाउंडेशन (61378060) द्वारा समर्थित था।
10×TBE | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | T1051 |
50bp DNA ladder | Takara Bio Inc. | 3421A |
100bp DNA ladder | Takara Bio Inc. | 3422A |
1kbp DNA ladder | Takara Bio Inc. | 3426A |
SYBR GREEN | Takara Bio Inc. | 5760A |
Agarose | Sigma-Aldrich Corporate | V900510 |