Summary
살 모 넬 라 종 /Shigella 종 설사에 기인 하는 일반적인 병원 체. 여기, 우리는 살 모 넬 라 종의 심사에 대 한 높은 처리 플랫폼을설명/Shigella 종 실시간 PCR를 사용 하 여 결합 가이드 문화.
Abstract
급성 위장염의 지저분한 구두 전송 시간, 특히 때 감염 발생 합니다 음식과 물을 처리 하는 사람들은 살 모 넬 라 종/Shigella 종에 의해 살 모 넬 라 종/Shigella 종의 검출을 위한 표준 방법은 직접 문화 이지만 노동 집약 및 시간이 걸리는. 여기, 우리가 살 모 넬 라 종/Shigella 종 검사, 실시간 중 합 효소 연쇄 반응 (PCR) 가이드 문화를 함께 사용 하 여에 대 한 높은 처리 플랫폼을 설명 합니다. 두 가지 주요 단계가 있습니다: 실시간 PCR와 인도 문화. 우리 방법의 각 단계를 설명 하는 첫 번째 단계 (실시간 PCR)에 대 한: 컬렉션, 사전 농축, DNA 추출 및 실시간 PCR. 실시간 PCR 결과 긍정적인 경우 (가이드 문화) 2 단계 수행 됩니다: 선택적 문화, 생 화 확 적인 식별 및 serological 특성화. 우리는 또한 그것에서 생성 하는 대표적인 결과를 보여 줍니다. 여기에 설명 된 프로토콜의 살 모 넬 라 종, 특정, 민감한 빠르고 높은 처리량 검열을 위한 가치 있는 플랫폼 될 것 이라고 /Shigella 종
Introduction
설사 아직도 높은 발생률과 일반적인 건강 문제는 세계적으로1,2율입니다. 일부 환자 (예: 느슨한과 물 변, 화장실에가 서 긴급), 주에 대 한 다양 한 증상을 보여 사망률은 상대적으로 낮은 사회 경제적 영향 매우 높은3,4하 게 하는. 더 심각 하 게, 일부 환자도 치료5경우 과민성 대 장 증후군을 개발할 수 있습니다. 박테리아, 바이러스 및 설사6을 일으킬 수 있는 기생충의 다양 한 종류가 있다입니다. 살 모 넬 라 종 /Shigella 종 급성 위장염7,,89,,1011의 전송에 대 한 가장 흔한 박테리아 중입니다. 따라서, 많은 군 법률이 나 규정 일반 살 모 넬 라 종 발행Shigella 종 음식과 물을 처리 하는 사람들 중 심사 /. 예를 들어 중국 정부 의무 살 모 넬 라 종에 대 한 법률을 발행 했다 /Shigella 종 심사는 일년에 한 번.
살 모 넬 라 종에 대 한 표준 방법 /Shigella 종 탐지는 박테리아 문화. 박테리아 문화 및 연속 생화학 식별 및 혈 청 학적인 특성을 통해 질병 발발 관리 및 항균 프로 파일링 응급 환자 치료를 촉진 수 있는 박테리아의 종류를 확인할 수 있습니다. 12. 그것은 또한 살 모 넬 라 종 중 감염의 소스를 추적 도움이 수 /Shigella 종 발발13. 그러나,이 방법은 노동 집약 (필요한 수동 작업) 고 시간이 (몇 일), 특히 많은 수의 샘플7의 테스트에 대 한입니다. 또한, 비-culturable (VBNC) 살 모 넬 라 종 하지만 가능한 /Shigella 종일부 대변 샘플에 있을 수 있습니다14. 이러한 단점에 비추어 많은 실험실 하려고 살 모 넬 라 종의 검출을 위한 새로운 기술을 개발 /Shigella 종15,16,,1718 , 19 , 20 , 21 , 22 , 23 , 24 , 25. 이러한 모든 방법을 사용 하는 중 합 효소 연쇄 반응 (PCR)은 가장 일반적인 핵 산 증폭 검사 (NAAT). 이러한 NAAT 기반 방법의 한 가지 주요 한계는 죽은 박테리아, 심지어 세균 파편 포함 불완전 한 genomic DNA, 긍정적인 결과26, 질병의 정확한 진단에 크게 영향을 미칠 수 있는 게재 될 수 있습니다. 블랑코 외. 그 분자 분석 결과 매우 중요 한, 뿐만 아니라 가능한 살 모 넬 라 부분 게놈 뿐만 아니라 문화, 과거 감염 또는 오염26에서 죽거나 unviable 박테리아를 보여주었다. 따라서, 새로운 기술을 개발 한다.
여기, 우리는 결합 된 NAAT 메서드 및 경작을 기반으로 새로운 방법 설명. 그림 1에서 보듯이,이 새로운 방법 적용 실시간 PCR 처음 상영 하 고 긍정적인 샘플 박테리아 문화 및 식별에 대 한 전송 됩니다.
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Protocol
프로토콜은 주 국제 여행 의료 센터의 인간 연구 윤리 위원회에 의해 설정 하는 지침을 따릅니다. 실험 기간 동안 표준 살 균 작업을 사용 하십시오.
1. 문화 미디어 구성 및 준비
- 영양 국물 준비: 분해 1% 펩, 0.3% 쇠고기 추출 물, 염화 나트륨 0.5%, H2O 포도 당 0.1%, pH 7.5와 오토 클레이 브를 조정 15 분 동안 121 ° C에 그것.
- Selenite Cystine 매체 준비: 분해 펩 0.5%, 0.4% 유 당, 1% 나2HCO3, 0.4% 나트륨 수소 selenite, 0.001% H2O, L-시스 틴 7.0에 pH를 조정 하 고 5 분 동안 끓여.
- 준비 된 Xylose Lysine, Deoxycholate 천 (XLD) 배지: 디졸브 0.3% 효 모 추출 물, 0.5 %L-리 신, 0.375 %xylose, 유 당 0.75%, 0.75% 자당, 염화 나트륨 0.5%, 0.008% 페 놀 레드, 0.68% 나트륨 thiosulfate, 0.08% 염화 제 2 철 구 연산 염, 0.25% 나트륨 deoxycholate, H2O, 한 천 1.5% 고 pH 7.4에 조정. 그런 다음 5 분 동안 끓여 고 90 mm 접시에 부 어.
- 살 모 넬 라 비 천 배지 준비: 분해 한 천 1.5%, 0.7% 펩과 효 모 추출 물, 선택 시의 약 1.29% H2o. 그런 다음 5 분 동안 끓여 고 90 mm 접시에 부 어.
- 영양 한 천 배지 준비: 1% 펩, 0.3% 쇠고기 추출 물, 염화 나트륨 0.5%, H2O, 한 천 1.5%를 녹이 고 pH 7.3 조정. 그런 다음 압력솥 15 분 동안 121 ° C에서 90 mm 접시에 부 어.
- MacConkey agar (MAC) 접시 준비: 분해 펩 2%, 유 당 1%, 0.5% 염화 나트륨, 0.5% 소 담 즙 소금, 0.0025% 중립 빨강, 한 천 1.5%, H2O, 0.0001% 크리스탈 바이올렛 7.2에 pH를 조정 하 고. 그런 다음 압력솥 20 분 동안 115 ° C에서 90 mm 접시에 부 어.
2. 실시간 PCR
- 샘플 컬렉션
- 환자의 항문에는 항문 면봉을 삽입 3-5 cm 깊이, 주위에 360 ° 회전 하는 고.
- 살 균 컬렉션 튜브로 항문 면봉을 넣어. 마크 샘플 id입니다.
- 보내기 샘플 실험실 최대한 빨리.
참고: 샘플 24 h 4 ° C에서 저장 될 수 있습니다.
- 사전 농축
- 컬렉션 튜브에서 각 샘플에 영양소 국물의 3 mL를 추가 합니다.
- 인큐베이터에 6 h 36 ° C에서 품 어.
- (선택 사항) 혼합 샘플
- 각 사전 농축 문화 100 µ L를 수집 하 고 10 개 이상의 샘플 있다면 1.5 mL 튜브에 1 견본의 8-10 샘플을 혼합.
- 제대로 표시 합니다.
- DNA 추출
- 사전 농축 문화 정착, 큰 입자를 허용 하도록 2 분 동안 800 x g에서 원심 그리고 새로운 튜브를 5 분에 12000 x g에서 원심 분리기는 상쾌한 전송 삭제는 상쾌한 포부에 의해.
- DNA 추출 솔루션의 100 µ L를 추가 (0.01 M pH 8.0 트리 스-EDTA, 0.01% Nonidet P 40 (NP40)) 펠 릿을. 1 분 동안 적극적으로 소용돌이입니다.
- 건조 욕조에 5 분 동안 100 ° C에서 끓인 다.
- 5 분을 위한 12000 x g에서 원심 분리기 상쾌한 성공 실시간 PCR 분석에 대 한 서식 파일을 있을 것입니다 새로운 튜브를 사용 하 여 수집 합니다.
- 실시간 PCR
- 반응 혼합물으로 설치 수행: 각 샘플에 대 한 반응 혼합물, 각 뇌관의 0.4 µ M, 각 프로브 ( 표 1에 시퀀스)27의 0.2 µ M, 5 µ L 단계 2.4.4에서 준비 하는 대로 서식 파일의 x 2의 12.5 µ L을 추가 하 고 사용 ddH2O 총 최대 25 µ L을 추가 하 볼륨입니다.
- 다음과 같이 순환 프로그램 설치: 3 분 동안 95 ° C 15 95 ° C의 40 주기 다음 s, 55 ° C 30에 대 한 s, 6-카-fluorescein (FAM)와 신장 단계 (72 ° C)에서 Hexachlorofluorescein (16 진수) 채널에서 34 미 수집 형광 신호를 위한 72 ° C 자동으로 형광 실시간 PCR 기계.
- 악기의 지시에 따라 형광 실시간 PCR 기계에 실시간 PCR을 수행 합니다.
- 4 단계로 바로 이동 하 고 부정적인 결과 샘플은 살 모 넬 라 종에 대 한 부정적인 팸/HEX 채널에서 발생 하는 경우 부정적인 보고서를 발행 /Shigella 종
- 긍정적인 결과 발생 16 진수 및 팸 채널에는 샘플 수 있습니다 살 모 넬 라 종 또는 Shigella 종에 대 한 긍정적인 각각 의미 하는 경우 3.1 및 3.2 단계로 이동 합니다.
참고: 샘플 혼합 수행 단계 2.3에서에서, 다음에 긍정적인 것을 만든 개별 샘플 실시간 PCR 수행 되어야 한다 진짜 긍정적인 샘플 화면을.
3. 인도 문화
-
살 모 넬 라 종 PCR 긍정적인 샘플
- 매체에 선택적 문화
- 테스트 튜브에서 Selenite Cystine 매체의 5 mL에 사전 농축 문화 100 µ L를 추가 합니다. 인큐베이터에서 18-24 h 36 ° C에서 품 어.
- 접시에 문화를 분리
- 마이크로-루프와 문화의 한 루프를 수집 하 고 XLD 접시 또는 살 모 넬 라 비 천 배지 확산. 인큐베이터에서 18-24 h 36 ° C에서 품 어.
- 생 화 확 적인 식별
- XLD 접시 (핑크 식민지/어두운 마음 없이 어두운 식민지, 노란색 식민지/어두운 마음 없이) 또는 살 모 넬 라 비 천 배지 선택 의심 스러운 식민지 (자주색 또는 prunosus 식민지, 부드럽고 둥근) (그림 2).
- 악기의 지시에 따라 자동화 된 미생물 식별 시스템에 생화학 식별을 위한 주제 의심 스러운 식민지.
- 혈 청 학적인 특성
- O 항 원 특성
- O 항 원 다 원자가 세라 깨끗 한 슬라이드에 한 방울을 추가 합니다.
- 마이크로-루프와 갈기는 세라에 식민지의 한 루프를 수집 합니다.
- 흐르는 모래, 처럼 보이는 경우 3.1.4.1.4 단계로 이동 식민지는 세라 (그림 3)에 반응. 그렇지 않으면, 단계 3.1.4.1.5로 이동 합니다.
- O 항 원 여러차례 세라를 사용 하 여 특정 O 항 원 특징 단계 3.1.4.1.1 3.1.4.1.3 단계를 반복.
- 바이 세라를 사용 하 여 3.1.4.1.1 3.1.4.1.3 단계를 반복 하십시오. 튜브에서 그 Vi 세라 반응 식민지를 수집 하 고 건조 욕조에 5 분 동안 100 ° C에서 비등. 특정 O 항 원 특징 때까지 5 분을 위한 12000 x g에서 원심 분리기는 펠 릿 및 반복 단계 3.1.4.1.1 3.1.4.1.4 수집 합니다.
- H 항 원 특성
- H 항 원 다 원자가 세라 깨끗 한 슬라이드에 한 방울을 추가 합니다.
- 마이크로-루프와 갈기는 세라에 식민지의 한 루프를 수집 합니다.
- 3.1.4.2.4 모래, 흐르는 처럼 보이는 단계에 서는 식민지는 세라에 반응.
- H 항 원 여러차례 세라를 사용 하 여 특정 H 항 원 특징 단계 3.1.4.2.1 3.1.4.2.3 단계를 반복.
참고: 때때로 혈 청 유도 필요할 수 있습니다 두 번째 단계 H 항 원 하. 그렇다면, 다음과 같은 선택적 단계 수행 되어야 한다. - (선택 사항) 영양 한 천 배지 위에 특정 H 항 혈 청 한 방울을 추가 합니다. 모든 세라 흡수 됩니다 때까지 기다립니다.
- (선택 사항) 특정 H 항 원 세라 흡수는 마이크로 루프와 접시에 확산 식민지의 한 루프를 수집 합니다. 인큐베이터에서 18-24 h 36 ° C에서 품 어.
- (선택 사항) H 항 원 여러차례 세라를 사용 하 여 단계 3.1.4.2.1 3.1.4.2.3 단계를 반복 2 단계 H 항 원 특징입니다.
- 단계 4로 이동 합니다.
- O 항 원 특성
- 매체에 선택적 문화
-
Shigella 종 PCR 긍정적인 샘플
- 접시에 문화를 분리
- 마이크로-루프와 사전 농축 문화의 한 루프를 수집 하 고 XLD 접시 또는 MAC 판에 확산. 인큐베이터에서 18-24 h 36 ° C에서 품 어.
- 생 화 확 적인 식별
- XLD 플레이트 (부드럽고, 라운드, 투명 하 고 빨간색 식민지) 또는 맥 플레이트 (부드럽고, 라운드, 직경; 2-3 m m 투명 하 고 무색 식민지에 의심 스러운 식민지를 수집 Shigella sonnei 더 큰 수 있으며 보육 시간 신장으로 핑크 빛 돌) (그림 4).
- 악기의 지시에 따라 자동화 된 미생물 식별 시스템에 생화학 식별을 위한 주제 의심 스러운 식민지.
- 혈 청 학적인 특성
- Shigella 종 다 원자가 세라 깨끗 한 슬라이드에 한 방울을 추가 합니다.
- 마이크로-루프와 갈기는 세라에 식민지의 한 루프를 수집 합니다.
- 3.2.3.4 흐르는 모래, 처럼 보이는 단계에 서는 식민지는 세라에 반응.
- Shigella 종 여러차례 세라를 사용 하 여 특정 Shigella 종 특징 단계 3.2.3.1 3.2.3.3 반복.
- 단계 4로 이동 합니다.
- 접시에 문화를 분리
4입니다. 보고서
- 위의 결과 따라 긍정적 이거나 부정적인 보고서를 발행.
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Representative Results
살 모 넬 라 종의 심사에 대 한 프로토콜 적용 된 음식과 물을 처리 하는 사람에서 항문 대변에서Shigella 종 샘플 /.
실시간 PCR 단계에서A, 그림 5같이 있었다 16 진수 채널 혼합된 샘플은 살 모 넬 라 종에 대 한 긍정적인 의미에서 성공적인 증폭 다음 추가 실시간 PCR은 긍정적인 것을 만든 개별 샘플에 실시 됐다. 그림 5B같이 샘플 2 긍정 했다. 따라서, 샘플 2 살 모 넬 라 종의 인도 문화에 대 한 선정 그림 5C, 팸 채널 혼합된 샘플은 Shigella 종에 대 한 긍정적인 의미에서 성공적인 증폭이 했다 추가 실시간 PCR 실시 그리고 샘플 10 긍정적인 발견 되었다 (그림 5D). 따라서, 샘플 10 Shigella 종의 인도 문화에 대 한 선정
살 모 넬 라 종, 인도 문화에 있었다 핑크 식민지와 XLD 플레이트 및 살 모 넬 라 비 천 배지, 보라색 식민지 별도로 그림 2와 같이. 다음 이러한 식민지 미생물 자동된 식별 시스템에 생 화 확 적인 id를 받게 했다. 결과 그것이 살 모 넬 라 종, 알 수 없는 종으로 나타났다. 따라서, 혈 청 학적인 특성은 수행된 (그림 3)과 그것 O4, O12, Hb, H1, 반응 했다 2. 화이트-Kauffmann-르 부 계획에 따라 샘플 2 마지막으로 살 모 넬 라 paratyphi B에대 한 긍정적으로 보고 되었다. Shigella 종의 인도 문화에 있었다 XLD 플레이트 및 맥 플레이트, 분홍색 빨간색과 무색 식민지 별도로, 그림 4와 같이. 다음 이러한 식민지 했다 또한 자동된 미생물 식별 시스템에 생 화 확 적인 id를 받게 됩니다. 결과 그것이 Shigella sonnei다는 것을 보여주었다. 확인 하려면 그 특정 serotype, 혈 청 학적인 특성은 수행된 (그림 3)과 그것에 sonnei 단계 II 반응 했다. 따라서, 샘플 10 Shigella sonnei 단계 II에대 한 긍정적으로 보고 마지막으로 되었다.
그림 1 : 프로토콜의 다이어그램. 두 가지 주요 단계는 표시 하 고 대시 선으로 구분 했다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 2 : 살 모 넬 라 종 XLD 플레이트 및 살 모 넬 라 발 한 접시의 대표 문화 결과. XLD 접시에 거기와 핑크 식민지/어두운 마음 없이 살 모 넬 라 비 천 배지를 하는 동안에 있었다 자주색 식민지. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 3 : 대표적인 혈 청 학적인 특성 결과. 식민지는 세라에 반응 있었다면, 그것은 흐르는 모래 처럼 (왼쪽) 보였다. 그렇지 않으면, 그건 탁 (오른쪽)입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 4 : Shigella 종 XLD 플레이트 및 맥 플레이트의 대표 문화 결과. XLD 접시에 빨간 식민지, 있었다 맥 접시에 투명 하 고 무색 식민지 이었다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 5 : 대표 실시간 PCR 결과. (A) 16 진수 채널 혼합 샘플에 대 한. (B) 16 진수 채널 개별 샘플에 대 한. (C) 팸 채널 혼합 샘플에 대 한. (D) 팸 채널 개별 샘플에 대 한. PC: 긍정적인 컨트롤입니다. NC: 부정적인 제어 합니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
| 병원 체 | 이름 | Sequence(5'-3') |
| 살 모 넬 라 | 소금-F 소금-R 샐 프로브 |
gctcatattaattccggcatttac caggtcaatagccagaaagg 16 진수-ataagtaatccaatccgaaatgcctgcgt-이클립스 |
| 이질균 | 시-F 시-R 시 조사 |
ccgggataaagtcagaactc cagtggagagctgaagtttc 팸-aggccaggtagacttctatctcatccac-이클립스 |
표 1: 뇌관 및 프로브 사용. 이름 및 뇌관 및 프로브의 시퀀스 제공 되었다.
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Discussion
살 모 넬 라 종부터 /Shigella 종 종종 음식 중독 및 급성 위장염28,29 의 지저분한 구두 전송 관련 된 고 일상적인 방법은 노동 집약적인 또는 소모 7, 우리는 살 모 넬 라 종에 대 한 높은 처리 플랫폼을설명/Shigella 종 심사, 실시간 PCR를 사용 하 여 결합 가이드 문화.
이 플랫폼의 기능을 최대화 하기 위해 고려해 야 할 몇 가지 단계가 있습니다. 첫 번째 영양소 국물 (단계 2.2)에서 샘플의 사전 농축 단계입니다. 비록 아무 사전 농축 단계 명백한 증상, 설사, 등, 그 환자에서 수집 된 대변 샘플에 필요한 일반적인 6 h 사전 농축 단계 여전히 필요 항문 면봉 샘플, 사전 고용 동안 수집 하는 때 그 사람들은 주로 건강 또는 적어도 무 증상 성인으로 음식과 물, 처리할 것 이다 사람들을 위한 신체 검사. 프로토콜은 살 모 넬 라 종 탐지에만 적용 됩니다, 경우 다음 사전 농축 수 실시 Selenite Cystine 매체에 감도 증가 하기 위하여. 두 번째 중요 한 단계는 의심 스러운 식민지 (단계 3.1.3.1 및 3.2.2.1)의 id입니다. 대변 샘플을 감지 및 격리 대상 병원 체30의 마스크 수 있는 많은 간섭 배경 식물이 있다. 따라서, 의심 스러운 식민지의 특성에서 정의 된 단계 3.1.3.1 및 3.2.2.1 지켜져야 한다 마음에 실험 기간 동안. 세 번째 중요 한 단계는 살 모 넬 라 종의 혈 청 학적인 특성 대부분의 살 모 넬 라 종 H 항 원31에 대 한 두 번째 단계를 포함, 혈 청 유도 수행 해야 합니다. 그러나, 혈 청 유도 항상 성공, 그리고 유도의 여러 라운드 올바른 두 번째 H 단계를 확인 하려면 필요할 수 있습니다.
프로토콜은 매우 구체적이 고 민감한 우리의 이전 연구27에 의해 확인. 프로토콜의 높은 특이성 spp는 살 모 넬 라 의 능력에 의해 설명 된다 /Shigella 종 다른 관련된 병원 균27구별 될 수 있습니다. 프로토콜의 탐지의 하한값은 104 CFU/mL와 10 살 모 넬 라 종 및 Shigella 종, 각각27, 이전 보고서7,32 에 대 등 한3 CFU/mL , 33 , 34. 우리는 위에 말한 바와 같이, 살 모 넬 라 종 검출의 감도 증가 될 수 있었다 더 Selenite Cystine 사전 농축 하 여 프로토콜만 살 모 넬 라 종의 검출에 대 한 적용 경우 또한, 프로토콜 수 두 겹에 의해 긍정적인 평가 증가 하 고 감소 작업/중간 처리 시간이 크게27.
마찬가지로 다른 NAAT 분석 실험, 프로토콜, 고전적인 박테리아 문화 방법에 비교 될 때의 한 가지 주요 한계는 프로토콜 살 모 넬 라 종 식별만 수 /Shigella 종, 다른 일반적인 설사를 일으키는 박테리아는 생략 된7. 대조적으로, 고전적인 박테리아 문화 중 그 박테리아 수 식별할 수 동시에 그들이 존재 하는 경우. 프로토콜의 또 다른 한계는 살 모 넬 라 종 중 일부 시퀀스 유사27인해 실시간 PCR에 의해Shigella 종을 식별할 수 없는 /. 그러나, 부정적인 실시간 PCR 결과 나타나는 경우 이러한 샘플에 대 한 명백한 임상 증상을 가진 환자에서 실험실 기술자 주의 기울여야 한다 고 결과 확인 하는 다른 실험을 수행할 수 있습니다. 큰 발발 동안 우리 PCR 검사의 첫 번째 라운드에 풀링된 샘플 대신 단일 샘플을 사용할 수 있습니다.
끝으로, 여기에 제공 된 프로토콜의 살 모 넬 라 종 심사에 대 한 가치 있는 플랫폼 될 수 /Shigella 종
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Disclosures
저자는 공개 없다.
Acknowledgments
이 작품은 과학 및 기술 프로그램의 주 하이, 중국 (보조금 번호 20171009E030064), 과학 및 기술 프로그램의 광 동, 중국 (보조금 번호 2015A020211004)는 과학 및 기술 프로그램의 일반 관리에 의해 지원 되었다 질 감독, 검사 및 검역 (보조금 번호 2016IK302, 2017IK224) 중화 인민 공화국의의.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Tris | Sigma | 10708976001 | |
| EDTA | Sigma | 798681 | |
| NP40 | Sigma | 11332473001 | |
| ddH2O | Takara | 9012 | |
| PrimeSTAR HS (Premix) | Takara | R040Q | |
| Nutrient Broth | LandBridge | CM106 | |
| Nutrient agar | LandBridge | CM107 | |
| Selenite Cystine medium | LandBridge | CM225 | |
| XLD | LandBridge | CM219 | |
| MAC | LandBridge | CM908 | |
| Salmonella chromogenic agar | CHROMagar | SA130 | |
| Salmonella diagnostic serum | Tianrun | SAL60 | |
| Shigella diagnostic serum | Tianrun | SHI54 | |
| anal swab (collecting tube plus) | Huachenyang | ||
| slide | Mingsheng | 7102 | |
| micro-loop | Weierkang | W511 | |
| incubator | Jinghong | DNP-9082 | |
| autoclave | AUL | SS-325 | |
| dry bath | Jinghong | KB-20 | |
| automated microbial identification system | bioMérieux | VITEK2 | other equivalent system could be used |
| fluorescent real-time PCR machine | ThermoFisher | ABI7500 | other equivalent machine could be used |
References
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