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Chemistry

Eine neue einfache Methode zur Messung der Lipophilie (LogP) mit 19F-NMR-Spektroskopie

Published: January 30, 2019 doi: 10.3791/58567

Summary

Eine neue und unkomplizierte Variante der Shake-Kolben-Methode wurde von 19F-NMR-Spektroskopie für die genaue Lipophilie Messung von fluorierten Verbindungen entwickelt.

Abstract

Fluorierung ist ein wirksames Instrument zur Optimierung der physikalisch-chemischen Eigenschaften von bioaktiven Substanzen geworden. Eines der Anwendungsgebiete von Fluor-Einführung ist die Lipophilie der Verbindung zu modulieren. In unserer Gruppe sind wir in der Studie über die Auswirkungen der Fluorierung auf Lipophilie der aliphatischen Fluorohydrins und fluorierten Kohlenhydrate interessiert. Diese sind nicht UV-aktiv, was zu einer anspruchsvollen Lipophilie Entschlossenheit. Hier präsentieren wir Ihnen eine einfache Methode zur Messung der Lipophilie fluorierten Verbindungen von 19F-NMR-Spektroskopie. Diese Methode erfordert keine UV-Aktivität. Richtig gelöste Masse, Lösungsmittel und aliquoten Volumen sind auch nicht verpflichtet, gemessen werden. Mit dieser Methode haben wir die Lipophilicities einer großen Anzahl von fluorierten Alkanols und Kohlenhydraten gemessen.

Introduction

Lipophilie ist ein wichtige physikalisch-chemische Parameter von Wirkstoffmolekülen, der die Eigenschaften von Wirkstoffkandidaten in vielen Aspekten beeinflusst, einschließlich Wirkstofflöslichkeit, Bioverfügbarkeit und Toxizität1. Lipophilie wird als Logarithmus (LogP) des Verhältnisses der zusammengesetzten Konzentrationen nach Aufteilung zwischen n-Oktanol und Wasser gemessen. Optimale Lipophilie Bereiche sind vorgeschlagen worden, basierend auf statistischen Daten der oral verabreichte Medikamente, von denen die Lipinski "Regel 5 '' das berühmteste Beispiel2,3 ist. In der Tat hat Steuerung Lipophilie wesentlich zur Verbesserung der Aussicht auf eine Medikamenten-Kandidaten gezeigt. Erhöhung der Droge Bindungsaffinität von erhöhten Lipophilie wurde als eines der Hauptprobleme in Drug Discovery Projekte in den letzten Jahrzehnten festgestellt führt zu erhöhten Abrieb Preise3. Daher wurde vermutet, dass erfolgreiche Medikamentenentwicklung mit der molekularen Lipophilie von Wirkstoffkandidaten in optimalen Grenzen zu halten, während die Affinität Optimierung Prozess3,4verbunden ist. In diesem Zusammenhang wurden neue Konzepte (z. B. lipophilen Effizienz Indizes) eingeführte5,6.

Es ist daher von großer Bedeutung, Lipophilie während der Arzneimittelentwicklung genau zu messen. Außerdem ist die Verfügbarkeit von einfache Methoden für die Messung der Lipophilie gefragt als Grundlagenforschung zielt darauf ab, Lösungen für logP Modulation. Derzeit stehen zahlreiche etablierte Methoden Lipophilie Bestimmung1. Der standard "Shake-Kolben (SF)" Methode7und seine Variationen werden häufig eingesetzt, um LogP -Werte direkt zu messen, die in den meisten Fällen abhängig von UV-Vis Spektroskopie zur Quantifizierung. Der Hauptnachteil dieser klassischen SF-Methode ist die arbeitsintensive Natur. Darüber hinaus kann die Bildung von Emulsionen, speziell für hoch lipophilen Verbindungen8,9auftreten. Verschiedene Methoden wurden entwickelt, um solche Probleme, wie z. B. zu umgehen, indem Sie mittels Injektion-Flow-Analyse, Dialyse Schläuche etc.. 9,10. Allerdings ist keine dieser Methoden einfach oder leicht anwendbar in nicht spezialisierten Labors.

Es gibt auch viele indirekte Methoden zur Verfügung, wie z. B. potentiometrische Titration11, elektrophoretische Methoden12,13, RP-HPLC-basierte chromatographische Methoden, Masse-Massenspektrometrie-basierte Methoden14, usw.. Diese sind indirekte Methoden wie der LogP -Werte von Kalibrierkurven gewonnen werden. Unter diesen Verfahren hat die RP-HPLC-Methode verbreitet weil es benutzerfreundlich und zeitsparend ist. Dennoch seine Genauigkeit hängt die Ausbildung gesetzt, die zum Herstellen der Eichkurve verwendet, und die geschätzte Lipophilie richtet sich nach der Partition System verwendet13,15.

Es gibt eine Reihe von 1H NMR-basierte Methoden in der Literatur zur Bestimmung der Lipophilie beschrieben. Mo Et Al. entwickelte eine Methode zur Messung der LogP mit 1H NMR ohne deuterierte Lösungsmittel. Wasser und Oktanol als Partition Lösungsmittel, dienten als Referenzen für die Quantifizierung der gelöste Konzentration in jeder Phase16. Herth und Kollegen berichteten auch einen Ansatz, mit dem die Partition Experiment direkt in ein NMR-Röhrchen wo die NMR-Daten der unteren D2O wässrige Schicht gesammelt wurden vor und nach der Extraktion mit 1-Octanol aufgetreten, um die Verteilung zu erhalten Koeffizient17. Darüber hinaus ausgebeutet Soulsby Et Al. 1H NMR als Analysetool bestimmen die Amplitude der Signale mittels vollständige Reduktion Amplituden-Frequenz-Tabelle-Software. Das Verhältnis der Amplituden in beiden Schichten führte zu der gemessenen Partition Coefficient18. Diese Methoden sind relativ einfach zu verwenden, sondern erfordern häufig die Kalibrierung des selektiven Pulse und Leistungsstufen oder die Verwendung von gradient Pulse signal Selektivität zu gewährleisten geeignete Lösungsmittel Unterdrückung geprägt.

Berechneten LogP (ClogP) Werte für Verbindungen erhalten Sie ebenfalls. Verschiedene Berechnungsmethoden und kommerziell verfügbare Software stehen zur Verfügung. Diese verstopfenP -Werte sind in der pharmazeutischen Industrie gebräuchlich, bei der großen Anzahl von Wirkstoffmolekülen Bewertung. Große Fehler von ClogP -Werte sind jedoch nicht ungewöhnlich,19,20.

Die Anforderungen der UV-Aktivität für die Analyse der Konzentration und die Einrichtung von Kalibrierkurven für LogP Berechnung behindern Forschung Fortschritte auf diesem Gebiet. Dies gilt insbesondere für UV-aktive aliphatischen Verbindungen. Fluorierten aliphatischen Moieties geworden in den letzten Jahren zunehmend attraktiver für Wirkstoff-Design und ihr Einfluss auf die allgemeine Lipophilie der Verbindung ist ein Forschungsthema in unserer Gruppe21. Darüber hinaus ist 19F einen hochsensiblen NMR-aktiven Kern, 19F NMR ein nützliches Werkzeug für die Analyse von fluorierten Verbindungen machen. Es hat auch eine größere chemische Verschiebung Reichweite im Vergleich zu 1H. Daher lohnt es sich, eine einfache Methode für LogP -Ermittlung des UV-aktive fluorierten Verbindungen von 19F-NMR-Spektroskopie zu entwickeln. Daher ist das übergeordnete Ziel dieser Methode praktisch Lipophilie Bestimmung von fluorierten Verbindungen zu erreichen.

Das Grundprinzip unserer 19F NMR-basierte Methode ist einen Verbindung in die Partition Experiment (Abbildung 1)21fluorierten Verweis hinzufügen. Zwischen Wasser und n- Oktanol sind zusammengesetzte X- und Referenz zusammengesetzten (Ref) aufgeteilt. Nach Äquilibrierung, eine Aliquote aus jeder Phase ist ein NMR-Röhrchen berücksichtigt, und 19F NMR-Experimente sind auf beide NMR-Proben laufen. Die Intensität der Fluor-Peaks ist proportional zur Konzentration (C) und die Anzahl der Fluoratome (n) der Verbindungen zu verstärken. Integrale Verhältnisse zwischen zusammengesetzten X und Ref erhalten Sie für beide Phasen. Das Verhältnis in n- Oktanol Schicht ist definiert als ρoctund ρAq für Wasserschicht (GL. 1). Das Verhältnis von ρ Werten entspricht das Verhältnis der Partition Koeffizienten (P) der Verbindung X und Ref (GL. 2). Dies führt zu der letzten Gleichung (GL. 4) für LogP Messung der Verbindung X. Daher, um festzustellen, LogP -Wert von einem unbekannten Verbindung X, nur Integration Verhältnisse (ρoct und ρAq) in beide Schichten benötigt man an 19F NMR gemessen werden.

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Protocol

(1) Partitionierung

  1. Hinzufügen 4,4,4-Trifluorobutan-1-Ol (Verbindung X, ca. 6,0 mg) und 2,2,2-Trifluoroethanol (Referenz zusammengesetzte, ca. 3,0 mg) in ein 10 mL birnenförmige Kolben lösen sich in n- Oktanol (HPLC Grade, ca. 2 mL), und fügen Sie Wasser (HPLC-Klasse, ca. 2 mL).
    Hinweis: Dieses Experiment läuft in dreifacher Ausfertigung. Zusammengesetzte Löslichkeit in Wasser und n- Oktanol muss überprüft werden. Die Menge der Verbindung verwendet für Partition muss sorgfältig geprüft werden, um Übersättigung der Verbindung in jeder Schicht zu vermeiden. Das Massenverhältnis zwischen zusammengesetzten X- und Referenz, die zusammengesetzten Ref auch berücksichtigt werden muss, um das zu vermeiden sind die integrale Verhältnisse ein NMR Probe außerhalb eines 10/1 bis 1/10. Zum Beispiel, wenn es gibt einen Unterschied von < 2 LogP -Einheiten zwischen zusammengesetzten X und Ref, optimale Massenverhältnis kann versichern, dass Integration-Verhältnisse im Wasser und 1-Octanol NMR-Proben innerhalb eines Bereichs von 10/1 bis 1/10. Im Gegensatz dazu, wenn eine Integration-Verhältnis von 50/1 in einer Schicht vorliegt, werden eher relativ größere Fehler bei der Integration für die Peak mit niedriger Konzentration. Die Gleichung unten lässt sich optimal zusammengesetzten Massenverhältnis Vorhersagen:
    mX / mRef = {(cP X/PRef)-0,5 * (MX/ M-Ref) * [(1 + cPX) / (1 + PRef)]} / (NX / NRef)
    m, Masse; M, molekulare Masse; N Anzahl der F-Atome; P, Partition Koeffizienten; cP, berechnete Partition Koeffizienten.
  2. Legen Sie die Flaschen in einen temperierten Behälter über eine Stirplate, und verbinden Sie mit einem umlaufenden Kühlaggregat. Rühren Sie die Mischung biphasische bei 25 ° C für 2 h, unter Rühren Geschwindigkeit bei 600 u/min eingestellt.
  3. Equilibrate die Mischung bei 25 ° C über Nacht (ca. 16 h), erlauben für komplette Phasentrennung.
    Hinweis: In einigen Fällen kann eine Schaumbildung zwischen dem n- Oktanol und Wasser Grenze beobachtet werden. In diesem Fall war die Mischung in eine 4 mL Glasflasche übertragen und bis das Verschwinden des Schaums zentrifugiert. Die biphasische Mischung wurde dann wieder links nach equilibrate bei 25 ° C über Nacht.

(2) NMR Probenvorbereitung

  1. Befestigen Sie den Kolben auf einem Stativ mit einer Klemme.
  2. Entnehmen Sie eine Aliquote von ca. 0,70-0,85 mL Wasser und n- Oktanol Schichten, mit 1 mL Einwegspritzen aus Kunststoff mit langen Nadeln.
    1. Ziehen Sie für die Aufnahme des Wassers aliquoten ca. 0,02 mL Luft in die Spritze vor dem setzen der Nadelöhrs in die Mischung. Während der Bewegung die Nadel durch die oberen n- Oktanol Schicht in Wasserschicht, vorsichtig herausdrücken der Luft zu verhindern, dass n- Oktanol Lösung in die Nadel.
    2. Die lange Nadel aus dem Gemisch zu entfernen. Eine kleine Menge der Wasserprobe, verlassen ca. 0,6 mL Probe links in die Spritze zu verwerfen. Vorsichtig die Nadel mit einem trockenen Tuch abwischen, und ca. 0,5 mL Wasserprobe in ein sauberes Röhrchen NMR injizieren. Schließen Sie schnell die NMR-Röhrchen mit einer Kappe.
    3. Entfernen Sie für die n- Oktanol-Probe die lange Nadel aus der n- Oktanol Schicht. Eine kleine Menge von n- Oktanol Probe, so dass ca. 0,6 mL Probe links in die Spritze zu verwerfen. Vorsichtig wischen Sie die Nadel mit einem trockenen Tuch ab und injizieren Sie ca. 0,5 mL n- Oktanol Probe in ein sauberes Röhrchen NMR. Schließen Sie schnell die NMR-Röhrchen mit einer Kappe.
  3. Überprüfen Sie beide n- Oktanol und Wasser-Proben für jede Verunreinigung (z. B.., kleine Tröpfchen von n- Oktanol Wasserprobe oder kleine Tröpfchen von Wasser in n- Oktanol Probe).
    Hinweis: Ist eine Kontamination, muss die Aliquote Probe wieder bereit aus dem zweiphasigen Gemisch. Da die Messung in dreifacher Ausfertigung erfolgt, ergeben sich sechs NMR Röhrchen.
  4. Hinzufügen jedes NMR-Röhrchen, 0,1 mL deuterierte Lösungsmittel NMR, die mit n- Oktanol und Wasser mischbar ist (zB., Aceton-d6) Signal Sperren während NMR Erwerb zu ermöglichen.
  5. Für Verbindungen mit niedrigen Siedepunkten (zB., < 120 ° C), versiegeln die NMR-Röhrchen mit einer Lötlampe und nach dem Abkühlen, invertieren die Röhre auf Lecks prüfen. Sorgfältig Experimente Invert versiegelt oder nicht versiegelte NMR Röhrchen 20 Mal für 19F NMR eine homogene Lösung zu erhalten.

(3) NMR-Experimente

  1. Mit NMR Parameter Standardeinstellungen ausgeführt (NS 64, D1-1 s, SW 300 ppm, O1P-100 ppm), 19F {1H} NMR-Experimente, chemische Verschiebungen von 4,4,4-Trifluorobutan-1-Ol (Verbindung X) und 2,2,2-Trifluoroethanol (Referenz-Verbindung) in beiden n zu identifizieren - Octanol und NMR Wasserproben.
  2. Messen Sie die Spin-Gitter-Relaxationszeit (T1) für diagnostische Fluor Kerne mithilfe einer Inversion-Recovery Sequenz22. Messen Sie die Höhe der entsprechenden Puls-Delay-Zeit (D1, als ≥ 5 * T1) aus den erhaltenen T1-Werte für eine genaue quantitative NMR-Integration.
    Hinweis: Dies ist sehr zeitaufwendig, aber ein D1 60 s für die Wasserprobe Phase und 30 s für die Octanol Phase Probe sind konservative Einstellungen, die sicher zu erfüllen, werden die D1 ≥ 5 * T1 Criterium.
  3. Führen Sie 19F {1H} NMR-Experimente wieder mit angepasst Parametereinstellungen wie folgt: ein) Verwendung D1 ≥ 5 * T1; (b) Zentrum der Frequenz versetzt Punkt (O1P) zwischen den beiden diagnostischen Fluor-Signalen, also beide Kerne ebenso begeistert werden können; (c) die spektrale Breite (SW) als 300 ppm eingestellt, aber verringern, wenn ein besseres SNR-Verhältnis bei Bedarf; (d) legen Sie die Anzahl der Transienten (NS) als 64 aber erhöhen Sie, wenn höhere SNR erforderlich ist.
    Hinweis: Nicht entkoppelt 19F NMR-Experimente können auch für die NMR-Datenerfassung verwendet werden. Proton-entkoppelt 19F NMR-Experimente werden jedoch bevorzugt hier, wie es die Fluor-Signale vereinfacht durch das Entfernen der Proton-Fluor-Kupplungen, die auch Signal-Rausch-Verhältnis erhöht. Wir verwenden Inverse-gated Entkopplung um ein entkoppeltes Spektrum ohne nOe (nuclear Overhauser Effekt) Erweiterungen23zu erhalten. Für die quantitative Integration ist ein Signal-Rausch-Verhältnis (≥300) erwünscht. 24

4. Datenverarbeitung

  1. Verarbeiten Sie die gewonnenen Daten mit ACD/NMR Prozessor Academic Edition oder andere benutzerdefinierte NMR-Processing-Software.
    1. Öffnen Sie die NMR-Daten-Datei, und öffnen Sie den Ordner " Pdata ", gefolgt von Ordner 1. Löschen Sie 1r -Datei.
    2. Zurück zu die NMR-Daten-Datei und ziehen Sie die Fid -Datei in das Fenster der ACD/NMR-Prozessor.
    3. Klicken Sie auf die Schaltfläche " WFunctions ", wählen Sie Exponential, LB-Wert als 2festgelegt und klicken Sie auf "OK" .
    4. Klicken Sie auf Null zu füllen , erhöhen Sie die Punkte zählen , 4 Mal von seiner Ursprünglichen Punkte zählen durch Klicken auf einen kleinen Knopf neben der Anzahl, und klicken Sie auf "OK" -Taste.
    5. Klicken Sie auf Fourier TR .
    6. Klicken Sie auf die Schaltfläche " Phase ", dann klicken Sie auf Maus pH , klicken Sie und halten Sie die linke Maustaste gedrückt, bewegen Sie die Maus nach vorne oder nach hinten bis die wichtigsten Gipfel des Spektrums richtig eingestellt ist.
      1. Klicken Sie und halten Sie die Rechte Maustaste gedrückt, bewegen Sie die Maus nach vorne oder nach hinten bis die anderen Peak(s) des Spektrums richtig eingestellt ist. Deaktivieren Sie dann die Schaltfläche " Maus Ph. ", in den spektralen Bereich mit Fluor Gipfeln vergrößern Sie, klicken Sie Fine-Tuning, führen Sie die Phasenkorrektur bei Bedarf wie oben beschrieben, bis alle Gipfel richtig eingestellt sind und klicken Sie auf das Häkchen Schaltfläche ".
    7. Klicken Sie auf die Grundlinie , dann die Schaltfläche " Optionen ". Spektrum von durchschnittlich für automatische Modelle auswählen, stellen Sie die Anzahl der Punkte für die halbe Breite der Box (insbesondere für Spektrum mit niedrigen S/R-Verhältnis), klicken Sie auf "OK" | Auto, und klicken Sie dann auf die Schaltfläche " ticken ".
    8. Klicken Sie auf Integration, integrieren Sie die diagnostische Fluor-Gipfel, und klicken Sie auf die Schaltfläche " ticken ".
      Hinweis: Wenn die integrale Kurve nicht parallel zur Grundlinie ist, klicken Sie auf Bias Korr , und stellen Sie die Neigung und die Neigung die Kurve parallel zur Grundlinie.
  2. N- Octanol und NMR Wasserproben die Integration Verhältnisse einzuholen und in der LogP Berechnung Gleichung (Abbildung 1, GL. 4), zu der LogP -Wert von 4,4,4-Trifluorobutan-1-Ol (Verbindung X) nutzen.

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Representative Results

Zwei Sätze von Daten, wie in Abbildung 2-21Experimente gezeigt werden. Mit 2,2,2-Trifluoroethanol als Referenz Verbindung, LogP -Werte wurden für 2-Fluoroethanol und 3,3,3,2,2-Pentafluoropropanol als-0.75 und +1.20, bzw. (Abbildung 2A). Anschließend wurde die Lipophilie des 2-Fluoroethanol wieder, aber mit 3,3,3,2,2-Pentafluoropropanol als Referenz (mit seiner vorherigen experimentell gemessenen LogP -Wert +1.20) bestimmt. Die gemessenen LogP -Wert war-0.76, die nur eine Differenz von 0,01 Log-P -Einheiten im Vergleich zu den Messwert mit 2,2,2-Trifluoroethanol als Referenz.

Ebenso für GUS-2,3-Difluoro-1,4-Butandiol, der Unterschied in der LogP -Werte gemessen mit 2-Fluoroethanol und seine Trans -Isomer ist auch sehr klein (0,01 logP Einheiten, Abb. 2 b). Dies zeigte, dass die Auswahl an Referenz-Verbindung keine Auswirkungen auf die LogP -Messung haben. Darüber hinaus ist eine eher kleine Standardabweichung (< 0,01) gute Reproduzierbarkeit unserer Methode angegeben.

Mit unserer Methode wurde eine Reihe von Verbindungen mit bekannten LogP -Werte gemessen, wie in Tabelle 1dargestellt. Der Unterschied zwischen Literaturdaten und die Messwerte mit unserer Methode wird in der letzten Spalte der Tabelle angezeigt. Insgesamt haben die experimentell ermittelten LogP -Werte (bei 25 ° C) gute bis sehr gute Übereinstimmung mit der Literatur-Werte, die unsere Methode weiter validiert.

Weitere ausgewählte Beispiele21 wurden in Abbildung 3gezeigt. Alle diese UV-aktive aliphatischen Verbindungen (aus fluorierten Kohlenhydrate, Fluorohydrins) können leicht mit unserer Methode gemessen werden.

Figure 1
Bild 1: Prinzip der LogP -Ermittlung-Methode. Diese Abbildung mit freundlicher Genehmigung von Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA reproduziert wurde. 21. dieser Shake-Kolben-Methode basiert auf 19F-NMR-Spektroskopie. Eine Referenz-Verbindung dient zur Partition Experiment. Aliquote für n- Oktanol und Wasser-Phase wurden für NMR-Experiment. Integration-Verhältnisse zwischen Verbindung und die Verbindung zu messenden ergeben sich für die Ermittlung der LogP -Wert. Ausführliche mathematische Abzug von Gleichungen, führt zu der letzten Gleichung für die Messung sind ebenfalls angegeben. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Figure 2
Abbildung 2: Beispiele für interne Validierung 21. zwei Sätze von Experimente, LogP -Wert einer Verbindung, Messung mit zwei verschiedenen Referenzverbindungen wurden durchgeführt. Das LogP Unterschied zwischen diesen Experimenten ist vernachlässigbar. Standardabweichung (< 0,01) aus Experimenten Lauf in dreifacher Ausfertigung zeigt gute Reproduzierbarkeit der Methode. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Figure 3
Abbildung 3: Weitere ausgewählter Beispiele der LogP -Messung mit unserer Methode. Anwendung dieser Methode, LogP -Werte für 8 fluorierten Verbindungen (z. B. fluorierten Kohlenhydrate, azyklische Alkanols und conformationally eingeschränkte Fluorohydrins) stammen. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Tabelle 1: Vergleich zwischen Literaturdaten und die experimentelle LogP -Werte mit unserer Methode21. Log-P -Werte für 14 fluorierten Verbindungen (mit bekannten LogP Daten) wurden mit dieser neuen Methode gemessen. Die Referenzverbindungen verwendet für jede Messung wurden auch tabellarisch dargestellt. (LogP) Vergleich zwischen Literatur und LogP ergibt sich aus unserer Methode zeigte guten Genauigkeit dieser Methode. ein2,2,2-Trifluoroethanol (TFE), 2-Fluoroethanol (FE); b Gemittelten LogP -Wert von mindestens drei Experimente; c Experimentell gemessenen LogP -Wert mit unserer Methode (-0.75) wurde als Referenz verwendet. Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterladen.

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Discussion

Das Protokoll in der Zeitung beschrieben ist eine einfache Methode für LogP Messung von fluorierten Verbindungen. Diese Methode gilt für fluorierte Verbindungen mit einem LogP -Wert von-3 bis 3. Für mehr hydrophil (logP <-3) oder lipophile Verbindungen (LogP > 3), diese Methode kann weiterhin verwendet werden, sondern erfordert viel NMR-Experiment länger als erweiterte Anzahl von transienten erforderlich sind, um ein gutes Signal-Rausch-Verhältnis zu erhalten. Daher ist dies eine Einschränkung der Methode. Es gibt keine Voraussetzung für die Häufigkeit der NMR-Spektrometer, solange die Bedingungen (NMR Parametereinstellungen und genügend SNR) zur quantitativen Integration erfüllt sind. Wie bei jeder Shake Flask Methode ist es wichtig, Übersättigung und Kontamination während der Probenahme Schicht zu vermeiden.

Verglichen mit früheren Shake-Kolben-Methode und seine Variationen, gibt es mehrere Vorteile in unserer Methode in Bezug auf bestehende Methoden. (1) Messung des gelösten Masse, Volumen der Partition Lösungsmittel und Aliquote für NMR-Probe sind nicht erforderlich. (2) die Verbindung zur Messung kann unrein sein, vorausgesetzt, dass die Fluor chemische Verschiebungen der Verunreinigungen unterscheidet sich von der gemessenen Verbindung sind. (3) wegen der inneren Ausgleich Effekt bei der Arbeit mit dem Verhältnis ein Verhältnis sind systematische Fehler beseitigt. (4) diese Methode gilt für UV-aktive fluorierten Verbindungen. (5) diese Methode ist einfach zu bedienen mit frei zugänglichen NMR Einrichtungen, da keine speziellen NMR-Einstellungen (z. B. Lösungsmittel Unterdrückung benötigt werden, Anwendung, eine kleine Anregung Winkel usw.).

Derzeit sind wir diese Methode zur Messung der Lipophilicities von fluorierten Kohlenhydraten, Fluorohydrins und fluorierten Amide, um die Beeinflussung der Fluorierung Lipophilie untersuchen und fluorierten Moieties mit ermitteln Lipophilie-senkende Wirkung. Methodenentwicklung für LogP Messung mehr lipophile Verbindungen (logP > 3) und für fluorierte Amine läuft in unserer Gruppe.

Es kann darauf hinzuweisen, dass 19F NMR auch für kritische Micelle Konzentration (CMC) Bestimmung30verwendet werden kann.

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Disclosures

Die Autoren haben nichts preisgeben.

Acknowledgments

Diese Forschung ist als Teil des EPSRC EP/K016938/1 und EP/P019943/1 (ZW, HRF) Zuschüsse und des Schiedsspruchs EPSRC/AstraZeneca Fall Konvertierung (BFJ) finanziert. Der University of Southampton ist für zusätzliche Unterstützung gedankt. Die EPSRC wird weiter für einen Kern Fähigkeit Zuschuss EP/K039466/1 gedankt.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
NMR (400 MHz) with Bruker 5 mm SEF probe Bruker n/a AVIIIHD400
NMR (400 MHz) with Bruker 5 mm SMART probe Bruker n/a
DrySyn Snowstorm reactor Asynt ADS13-S
recirculating chiller Asynt n/a model:Grant-LTC2
magnetic stirplate Asynt ADS-HP-NT
ACD/NMR processor software ACD/Labs n/a ACD/NMR processor academic edition or ACD/Spectrus processor 2015

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References

  1. Arnott, J. A., Planey, S. L. The influence of lipophilicity in drug discovery and design. Expert Opinion on Drug Discovery. 7 (10), 863-875 (2012).
  2. Lipinski, C. A., Lombardo, F., Dominy, B. W., Feeney, P. J. Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings. Advanced Drug Delivery Reviews. 23 (1), 3-25 (1997).
  3. Leeson, P. D., Springthorpe, B. The influence of drug-like concepts on decision-making in medicinal chemistry. Nature Reviews Drug Discovery. 6, 881 (2007).
  4. Perola, E. An Analysis of the Binding Efficiencies of Drugs and Their Leads in Successful Drug Discovery Programs. Journal of Medicinal Chemistry. 53 (7), 2986-2997 (2010).
  5. Tarcsay, A., Nyiri, K., Keseru, G. M. Impact of Lipophilic Efficiency on Compound Quality. Journal of Medicinal Chemistry. 55 (3), 1252-1260 (2012).
  6. Tarcsay, Á, Keserű, G. M. Contributions of Molecular Properties to Drug Promiscuity. Journal of Medicinal Chemistry. 56 (5), 1789-1795 (2013).
  7. OECD Guidelines for Testing of Chemicals. , Paris. (1992).
  8. Tsang, S. C., Yu, C. H., Gao, X., Tam, K. Y. Preparation of nanomagnetic absorbent for partition coefficient measurement. International Journal of Pharmaceutics. 327 (1), 139-144 (2006).
  9. Andersson, J. T., Schräder, W. A Method for Measuring 1-Octanol−Water Partition Coefficients. Analytical Chemistry. 71 (16), 3610-3614 (1999).
  10. Danielsson, L. -G., Yu-Hui, Z. Mechanized determination of n-octanol/water partition constants using liquid-liquid segmented flow extraction. Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 12 (12), 1475-1481 (1994).
  11. Scherrer, R. A., Donovan, S. F. Automated Potentiometric Titrations in KCl/Water-Saturated Octanol: Method for Quantifying Factors Influencing Ion-Pair Partitioning. Analytical Chemistry. 81 (7), 2768-2778 (2009).
  12. Poole, S. K., Poole, C. F. Separation methods for estimating octanol-water partition coefficients. Journal of Chromatography B. 797 (1), 3-19 (2003).
  13. Ishihama, Y., Oda, Y., Uchikawa, K., Asakawa, N. Evaluation of Solute Hydrophobicity by Microemulsion Electrokinetic Chromatography. Analytical Chemistry. 67 (9), 1588-1595 (1995).
  14. Jorabchi, K., Smith, L. M. Single Droplet Separations and Surface Partition Coefficient Measurements Using Laser Ablation Mass Spectrometry. Analytical Chemistry. 81 (23), 9682-9688 (2009).
  15. Kaliszan, R. Quantitative structure-retention relationships. Analytical Chemistry. 64 (11), 619A-631A (1992).
  16. Mo, H., Balko, K. M., Colby, D. A. A practical deuterium-free NMR method for the rapid determination of 1-octanol/water partition coefficients of pharmaceutical agents. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 20 (22), 6712-6715 (2010).
  17. Stéen, E. J. L., et al. Development of a simple proton nuclear magnetic resonance-based procedure to estimate the approximate distribution coefficient at physiological pH (logD7.4): Evaluation and comparison to existing practices. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 27 (2), 319-322 (2017).
  18. Soulsby, D., Chica, J. A. M. Determination of partition coefficients using 1H NMR spectroscopy and time domain complete reduction to amplitude-frequency table (CRAFT) analysis. Magnetic Resonance in Chemistry. 55 (8), 724-729 (2017).
  19. Tetko, I. V., Poda, G. I., Ostermann, C., Mannhold, R. Accurate In Silico log Predictions: One Can't Embrace the Unembraceable. QSAR & Combinatorial Science. 28 (8), 845-849 (2009).
  20. Waring, M. J. Lipophilicity in drug discovery. Expert Opinion on Drug Discovery. 5 (3), 235-248 (2010).
  21. Linclau, B., et al. Investigating the Influence of (Deoxy)fluorination on the Lipophilicity of Non-UV-Active Fluorinated Alkanols and Carbohydrates by a New log P Determination Method. Angewandte Chemie International Edition. 55 (2), 674-678 (2016).
  22. Derome, A. E. Modern NMR Techniques for Chemistry Research. , 6th ed, Pergamon: Oxford. (1997).
  23. Claridge, T. High-Resolution NMR Techniques in Organic Chemistry. , Pergamon. (1999).
  24. Zhang, F. -F., et al. Quantitative analysis of sitagliptin using the 19F-NMR method: a universal technique for fluorinated compound detection. Analyst. 140 (1), 280-286 (2015).
  25. Muller, N. When is a trifluoromethyl group more lipophilic than a methyl group? partition coefficients and selected chemical shifts of aliphatic alcohols and trifluoroalcohols. Journal of Pharmaceutical Sciences. 75 (10), 987-991 (1986).
  26. Hansch, C., Leo, A. Substituent constants for correlation analysis in chemistry and biology. , Wiley. (1979).
  27. Dillingham, E. O., Mast, R. W., Bass, G. E., Autian, J. Toxicity of Methyl- and Halogen-Substituted Alcohols in Tissue Culture Relative to Structure-Activity Models and Acute Toxicity in Mice. Journal of Pharmaceutical Sciences. 62 (1), 22-30 (1973).
  28. Leo, A., Hansch, C., Elkins, D. Partition coefficients and their uses. Chemical Reviews. 71 (6), 525-616 (1971).
  29. Fujita, T., Iwasa, J., Hansch, C. A New Substituent Constant, π, Derived from Partition Coefficients. Journal of the American Chemical Society. 86 (23), 5175-5180 (1964).
  30. Zhong-Xing, J., Xin, L., Eun-Kee, J., Bruce, Y. Y. Symmetry-Guided Design and Fluorous Synthesis of a Stable and Rapidly Excreted Imaging Tracer for 19F MRI. Angewandte Chemie International Edition. 48 (26), 4755-4758 (2009).

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Chemie Ausgabe 143 Lipophilie Organofluorine 19F NMR Fluorierung fluorierte Alkanols Kohlenhydrate
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Wang, Z., Jeffries, B. F., Felstead, More

Wang, Z., Jeffries, B. F., Felstead, H. R., Wells, N. J., Chiarparin, E., Linclau, B. A New Straightforward Method for Lipophilicity (logP) Measurement using 19F NMR Spectroscopy. J. Vis. Exp. (143), e58567, doi:10.3791/58567 (2019).

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