Summary

Síntesis, funcionalización y caracterización de nanopartículas de silicio poroso fusogénicas para entrega de oligonucleótidos

Published: April 16, 2019
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Summary

Demostramos la síntesis de nanopartículas de silicio poroso fusogénicas para la entrega eficaz de oligonucleótidos in vitro e in vivo. Nanopartículas de silicio poroso están cargadas de siRNA para formar el núcleo, que es cubierto por fusogénicas lípidos a través de la protuberancia para formar la cáscara. Funcionalización de parte de la segmentación y caracterización de partículas están incluidos.

Abstract

Con el advenimiento de la terapia génica, ha sido el desarrollo de un sistema de entrega de efectivo en vivo nucleótido-carga de importación paralela. Nanopartículas de silicio poroso fusogénica (F-pSiNPs) recientemente han demostrado alta eficacia debido a su alta capacidad de cargamento y vía única absorción celular que evita la endocitosis de oligonucleótidos de silenciamiento del gen en vivo. La síntesis de F-pSiNPs es un proceso de múltiples paso que incluye: (1) de carga y sellado de cargas útiles de los oligonucleótidos en los poros de silicio; (2) simultánea capa y apresto de lípidos fusogénicas alrededor de los núcleos de silicio poroso; y (3) Conjugación de dirigidos a péptidos y lavado para eliminar exceso de oligonucleótidos, restos de silicio y péptidos. Uniformidad de tamaño de partícula se caracteriza por la dispersión ligera dinámica y su estructura de core-shell puede ser verificada por microscopía electrónica de transmisión. La absorción fusogénicas es validada por cargar un lipofílico del tinte, 1, 1′-dioctadecyl-3, 3, 3′, 3′-tetramethylindocarbocyanine perclorato (DiI), en el bilayer del lípido fusogénicas y tratar a las células in vitro para observar membrana de plasma versus la coloración endocíticas localizaciones. Previamente se cuantificaron los efficacies gene silenciamiento de segmentación e in vivo en un modelo murino de neumonía por Staphylococcus aureus en el targeting peptide se espera que a la F-pSiNPs a casa en el sitio de la infección. Más allá de su aplicación en S. aureus la infección, el sistema de F-pSiNP puede utilizarse para entregar cualquier oligonucleótidos para terapia del gene de una amplia gama de enfermedades, incluyendo infecciones virales, cáncer y enfermedades autoinmunes.

Introduction

Terapia génica modula la expresión del gen específico para obtener un resultado terapéutico. Numerosas herramientas para modulación de genes han sido descubiertos y estudiados, incluyendo el ácido ribonucleico de interferencia (ARNi) usando oligonucleótidos (por ejemplo, corta interferencia RNA (siRNA)1,2, microRNA (miRNA)3,4 ), ADN plásmidos5,6, nucleasas (p. ej., dedo de zinc, TALENS)7,8y CRISPR/Cas9 sistemas9,10. Mientras que el mecanismo de la herramienta de acción es diferente, todas las herramientas deben alcanzar el citoplasma de la célula o el núcleo activo. Como tal, mientras que estas herramientas han demostrado para inducir un efecto significativo en la modulación de la expresión génica in vitro, la eficacia in vivo sufre obstáculos extracelulares e intracelulares. Debido a que las herramientas son de origen biológico, muchas enzimas y sistemas de separación existen en nuestro cuerpo que tienen la capacidad para degradar o eliminar los extranjeros moléculas11. Incluso en el caso que los instrumentos lleguen a la célula diana, sufren de endocitosis; un modo de absorción celular que encapsula y atrapa las herramientas en vesículas de estómago como ácidas que degradan o expulsan las herramientas fuera de la célula. De hecho, estudios han demostrado que las nanopartículas lipídicas son endocytosed través de macropinocitosis, de los cuales aproximadamente el 70% de lo siRNA se exocytosed de las células dentro de las 24h de absorción12,13. La mayoría de lo restantes siRNA es degradada a través de la vía lisosomal, y alcanzar en última instancia solamente 1-2% de lo siRNA que inicialmente entra en la célula con las nanopartículas escape endosomal a potencialmente ARNi13,14 .

Recientemente hemos desarrollado nanopartículas de silicio poroso fusogénica (F-pSiNPs) que tienen un núcleo cargado de siRNA compuesta por nanopartículas de silicio poroso y fusogénicas lípidos concha15. F-pSiNPs presenta tres grandes ventajas sobre otros sistemas convencionales de oligonucleótidos: (1) un lípido fusogénicas capa que permite que las partículas de omitir la endocitosis y entregar la carga entera directamente en el citoplasma de la célula (en comparación con el 1-2% mediante la endocitosis partículas13,14) (figura 1); (2) alta carga de masa siRNA en la pSiNPs (> 20% de peso en comparación con el 1-15% de peso por los sistemas convencionales)15, que rápidamente se degradan en el citoplasma (una vez que las partículas del núcleo arrojan la capa lipídica mediante absorción fusogénicas) para liberar el siRNA; y (3) orientación verbal de péptido homing selectivo a deseado tipos celulares in vivo.

El sistema F-pSiNP ha demostrado eficacia de silenciamiento del gen significativo (> 95% en vitro; > 80% in vivo) y posterior efecto terapéutico en un modelo de ratón fatal de la pulmonía de S. aureus ; los resultados de que se publicaron previamente15. Sin embargo, la compleja estructura del sistema F-pSiNP requiere manejo delicado y optimización optimizado para generar nanopartículas de uniforme y estables. Así, el propósito de este trabajo es presentar un protocolo exhaustivo, así como estrategias de optimización de la síntesis, funcionalización y caracterización de F-pSiNPs para ser utilizado en la entrega específica de siRNAs para efecto de silenciamiento del gene potente.

Protocol

1. síntesis de nanopartículas de silicio poroso (pSINPs) PRECAUCIÓN: Siempre tenga cuidado al trabajar con ácido fluorhídrico (HF). Siga a todas las guías de seguridad según su hoja de datos de seguridad (SDS), manejar productos químicos que contiene HF en una campana de humos y usar equipo de protección personal (PPE, guantes doble con guantes de butilo en el exterior, delantal de butilo con bata de laboratorio por debajo, cara proteger con gafas de seguridad debajo). Todas las univers…

Representative Results

Una síntesis exitosa de fusogénicas pSiNPs debe producir una solución homogénea, ligeramente opaca (figura 3a). Fracaso para optimizar la relación y la concentración de pSiNPs: siRNA: CaCl2 puede conducir a la agregación a la carga (figura 3b). Como se sacan las partículas a través de 200 membranas nm, el diámetro medio de la hidrodinámico de la pSiNPs fusogénicas medido por DLS debe ser aproximadamente 200…

Discussion

Síntesis de nanopartículas de silicio poroso se muestran en la figura 5. El paso crítico en la síntesis de pSiNPs fusogénicas es en el paso de carga (paso 3). Si las nanopartículas fusogénicas están agregando la síntesis (figura 3), la razón puede deberse a lo siguiente: (1) stock de cloruro de calcio forma homogénea no estaba preparada, así paso 3.1.2 debe ser cuidadosamente seguido o refinado; o (2) la relación de pSiNP: siRNA: CaCl2 o …

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Este trabajo es apoyado por los institutos nacionales de salud a través de contrato # R01 AI132413-01.

Materials

1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DMPC) Avanti Polar Lipids 850345P Powder
1,2-dioleoyl-3-trimethylammonium-propane (chloride salt) (DOTAP) Avanti Polar Lipids 890890P Powder
1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[maleimide(polyethylene glycol)-2000] (ammonium salt) (DSPE-PEG(2000) Maleimide) Avanti Polar Lipids 880126P Powder
Aluminum foil VWR International, LLC 12175-001
Calcium chloride (CaCl2) Spectrum C1977 Anhydrous, Pellets
Chloroform Fisher Scientific C6061
Computer Dell Dimension 9200 Any computer with PCI card slot is acceptable
Dil Stain (1,1'-Dioctadecyl-3,3,3',3'-Tetramethylindocarbocyanine Perchlorate ('DiI'; DiIC18(3))) Life Technologies D3911
Ethanol (EtOH) UCSD Store 111 200 Proof
Hydrofluric acid (HF) VWR International, LLC MK264008  Purity: 48%
Keithley 2651a Sourcemeter Keithley 2651A
LabVIEW National Instruments Sample program available at: http://sailorgroup.ucsd.edu/sofware/
LysoTracker Green DND-26 Thermo Fisher Scientific L7526
Liposome extrusion set with heating block Avanti Polar Lipids 610000
Microcon-30kDa Centrifugal Filter Unit EMD Millipore MRCF0R030
O-ring ChemGlass CG-305-220
Phosphate-buffered saline (PBS) Thermo Fisher Scientific 10010-049
Platinum coil VWR International, LLC AA10285-BU
Potassium hydroxide (KOH) Fisher Scientific P250-3
Silicon wafer Siltronix Custom order
siRNA Dharmacon Custom order IRF5, sense 5’-dTdT-CUG CAG AGA AUA ACC CUG A-dTdT-3’ and antisense 5’-dTdT UCA GGG UUA UUC UCU GCA G dTdT-3’
Sonicator VWR International, LLC 97043-960
Targeting peptide (CRV) CPC Scientific Custom order sequence CRVLRSGSC; made cyclic by a disulfide bond between the side chains of the two cysteine residues
Teflon etch cell Interface Performance Materials, Inc. Custom order
UltraPure DNase/RNase-Free Distilled Water  Thermo Fisher Scientific 10977015

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Cite This Article
Kim, B., Sailor, M. J. Synthesis, Functionalization, and Characterization of Fusogenic Porous Silicon Nanoparticles for Oligonucleotide Delivery. J. Vis. Exp. (146), e59440, doi:10.3791/59440 (2019).

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