EVOLVER ढांचे के उच्च गति के साथ निरंतर माइक्रोबियल संस्कृति उच्च प्रवाह और प्रयोगात्मक मापदंडों पर गतिशील नियंत्रण सक्षम बनाता है । इस प्रोटोकॉल प्रदर्शित करता है कि कैसे एक जटिल फिटनेस प्रयोग आचरण प्रणाली लागू करने के लिए, कई व्यक्तिगत संस्कृतियों पर स्वचालित नियंत्रण प्रोग्रामिंग पर उपयोगकर्ताओं मार्गदर्शक, मापने, संग्रह, और वास्तविक समय में प्रयोगात्मक डेटा के साथ बातचीत ।
सतत संस् कृति पद्धतियां मात्रात्मक रूप से नियंत्रित पर्यावरणीय दशाओं के अंतर्गत कोशिकाओं को सक्षम बनाती हैं, और इस प्रकार फिटनेस फीनोटाइप के मापन के लिए और चयन द्वारा जीनोटाइप के आकार के बारे में हमारी समझ में सुधार करने के लिए मोटे तौर पर उपयोगी हैं । विकसित और आला सतत संस्कृति उपकरणों को लागू करने के लिए व्यापक हाल के प्रयासों कोशिका संस्कृति नियंत्रण के नए रूपों के संचालन के लाभों से पता चला है । यह कस्टम चयन दबाव और लंबी अवधि के प्रयोगात्मक विकास से जीनोम व्यापक पुस्तकालय चयन और सिंथेटिक जीन सर्किट लक्षण वर्णन को लेकर अध्ययन के लिए वृद्धि throughput परिभाषित शामिल हैं । EVOLVER मंच हाल ही में इस बढ़ती मांग को पूरा करने के लिए विकसित किया गया था: scalability, लचीलापन, और स्वचालन के एक उच्च डिग्री के साथ एक सतत संस्कृति मंच । eVOLVER एक मानकीकृत मंच है कि किया जा सकता है प्रदान करता है (आरई)-विंयस्त और ंयूनतम प्रयास के लिए उच्च throughput या बहुआयामी विकास चयन प्रयोगों के कई विभिंन प्रकार के प्रदर्शन के साथ पहुंचा । यहां, एक प्रोटोकॉल के लिए eVOLVER फ्रेमवर्क प्रणाली को विंयस्त करने के लिए एक कस्टम, बड़े पैमाने पर सतत विकास प्रयोग आचरण के उपयोगकर्ताओं को उपलब्ध कराने के लिए प्रस्तुत किया है । विशेष रूप से, प्रोटोकॉल कैसे मल्टीप्लेक्स दो चयन दबाव के लिए प्रणाली प्रोग्राम-तापमान और परासारिता-कई evolver शीशियों भर में आदेश saccharomyces cerevisiae म्यूटेंट के फिटनेस परिदृश्य को ठीक पर परिनिर्धारित करने के लिए पर उपयोगकर्ताओं गाइड संकल्प. हम कैसे युक्ति दोनों प्रोग्राम के माध्यम से विंयस्त किया जा सकता है दिखाने के लिए, अपने खुले स्रोत वेब आधारित सॉफ्टवेयर के माध्यम से, और शारीरिक रूप से, fluidic और हार्डवेयर लेआउट की व्यवस्था द्वारा । शारीरिक रूप से उपकरण की स्थापना, संस्कृति दिनचर्या प्रोग्रामिंग, निगरानी और इंटरनेट पर वास्तविक समय में प्रयोग के साथ बातचीत की प्रक्रिया, बाद में ऑफ़लाइन विश्लेषण के लिए नमूना शीशियों, और पोस्ट प्रयोग डेटा विश्लेषण विस्तृत हैं । यह विभिंन विषयों में शोधकर्ताओं के लिए एक प्रारंभिक बिंदु के रूप में काम करने के लिए अपने स्वयं के जटिल और उच्च throughput सेल विकास प्रयोगों के डिजाइन में eVOLVER लागू करने के लिए अध्ययन और जैविक प्रणालियों में हेरफेर करना चाहिए ।
सतत सेल संस्कृति तकनीक, पहले लगभग ७० साल पहले विकसित1,2, हाल ही में एक पुनरुद्धार3,4का आनंद ले रहे हैं । यह कारकों का एक संगम के कारण है । सबसे पहले, उच्च throughput-omics तकनीक है, जो इसे पढ़ने के लिए और जीनोटाइप5,6की बड़ी संख्या पैदा संभव बना दिया है के विकास, प्रयोगात्मक तकनीकों के लिए एक सहवर्ती मांग पैदा की है कि सुविधा अच्छी तरह से नियंत्रित सेल विकास और phenotyping । इस उद्देश्य के लिए, सतत संस्कृति एक शक्तिशाली प्रयोगात्मक दृष्टिकोण का प्रतिनिधित्व करने के लिए आकस्मिक जीनोमिक अग्रिमों पर कैपिटल । ठीक नियंत्रित (और गतिशील) पर्यावरणीय दशाओं में सेलुलर आबादी पर विकास चयन/प्रयोग को सुगम बनाकर, सतत संस्कृति, जीनोटाइप्स को फीनोटाइप7,8, को कड़ाई से मैप करने का साधन प्रदान करती है । प्रमाणात्मक रूप से अभियांत्रिक उपभेदोंऔर जीवों को चित्रित किया गया है, और10,11,12के प्रयोगशाला विकास अध्ययनों में अनुकूली आनुवंशिक परिवर्तन ट्रैक करें ।
दूसरा, सुलभ इस तरह के additive विनिर्माण और खुले स्रोत हार्डवेयर और सॉफ्टवेयर तत्वों के रूप में उपलब्ध प्रोटोटाइप तकनीकों के हाल के उद्भव, उपयोगकर्ताओं के एक व्यापक सेट डिजाइन और सतत संस्कृति प्रणाली के अपने स्वयं के लागत प्रभावी रूपों का निर्माण करने के लिए सक्षम किया गया है सीधे प्रयोगशाला में । यह सब करने का एक रोमांचक सरणी के लिए नेतृत्व किया है, यह अपने आप (DIY) उपकरणों है कि इस तरह के chemostat13के रूप में सतत संस्कृति functionalities, प्रदर्शन, turbidostat14, या morbidostat15. दुर्भाग्य से, हालांकि विशिष्ट (आला) समस्याओं के लिए जो वे डिजाइन किए थे संबोधित में सफल, इन तदर्थ समाधान आम तौर पर throughput और/
EVOLVER प्रणाली एक एकल मंच है कि सतत संस्कृति की बढ़ती प्रयोगात्मक जरूरतों को समायोजित कर सकते है और गति और आपात जीनोमिक तकनीक16 (चित्र 1क) के पैमाने पर मैच बनाने के लक्ष्य के साथ बनाया गया था । है evolver डिजाइन लागू आम सिद्धांतों अंय17विषयों, मानकीकृत पैरों के निशान, मॉड्यूलर घटकों, और खुले स्रोत डिजाइन सिद्धांतों सहित से उच्च स्केनीय प्रौद्योगिकियों अंतर्निहित । इस प्रकार, नए आला अनुप्रयोगों के लिए समाधान प्रणाली के लिए प्रमुख संशोधनों के बिना डिजाइन किया जा सकता है । अत्यधिक मॉड्यूलर और खुले स्रोत wetware, हार्डवेयर, इलेक्ट्रॉनिक्स, और वेब आधारित सॉफ्टवेयर के शामिल, eVOLVER पहली स्वचालित सतत संस्कृति प्रणाली है कि लागत प्रभावी ढंग से किया जा सकता है और आसानी से फिर से कॉंफ़िगर करने के लिए वस्तुतः किसी भी प्रकार के बाहर ले उच्च थ्रूपुट विकास प्रयोग । मॉड्यूलर और प्रोग्राम स्मार्ट आस्तीन जो घर सभी सेंसरों और व्यक्तिगत संस्कृतियों को नियंत्रित करने की जरूरत actuators के माध्यम से, eVOLVER विशिष्ट दोनों throughput और संस्कृति की स्थिति के व्यक्तिगत नियंत्रण की स्केलिंग सक्षम बनाता है । इसके अलावा, के रूप में एक वेब आधारित मंच, eVOLVER का आदान प्रदान डेटा और वास्तविक समय में दूरदराज के कंप्यूटरों के साथ जानकारी, व्यक्तिगत संस्कृतियों के सैकड़ों की एक साथ निगरानी की अनुमति और स्वचालित संस्कृति perturbations मनमाने ढंग से परिभाषित नियंत्रण के माध्यम से एल्गोरिदम.
पिछले काम में16, evolver के मजबूत प्रदर्शन के आपरेशन के सैकड़ों घंटे से अधिक लंबी अवधि के प्रयोगों में प्रदर्शन किया गया था, और इसकी क्षमता ई. कोलाई और एस cerevisiae से गैर-पालतू करने के लिए विभिन्न जीवों, खेती करने के लिए रोगाणुओं. विशिष्ट विकास चयन प्रयोगों की एक श्रृंखला है, जिसमें प्रोग्राम के माध्यम से परिभाषित बहुआयामी चयन gradients व्यक्तिगत संस्कृति शर्तों और जिसके परिणामस्वरूप सेलुलर स्वास्थ्य परिदृश्य की एक सरणी भर में लागू किया गया मात्रा निर्धारित. यहां, उद्देश्य कैसे प्रणाली का उपयोग करने के लिए डिजाइन और प्रयोगों के इन प्रकार के विवरण के साथ eVOLVER उपयोगकर्ताओं को प्रदान करना है । एक व्याख्यात्मक उदाहरण के रूप में, एक दो आयामी पर्यावरण तापमान और परासरणी तनाव से बना ढाल भर में एस cerevisiae म्यूटेंट के फिटनेस परिदृश्य बढ़ाता तरीकों प्रस्तुत कर रहे हैं । प्रोटोकॉल उपयोगकर्ताओं को इस प्रयोग के लिए evolver ढांचे को विंयस्त के माध्यम से गाइड दोनों प्रोग्राम के माध्यम से, 16 समानांतर सतत संस्कृतियों में से प्रत्येक के लिए अनुकूलित आविलता और तापमान नियंत्रण दिनचर्या सेट करने के लिए सॉफ्टवेयर का उपयोग करने में, और शारीरिक रूप से, fluidics लेआउट के माध्यम से विभिन्न नमक सांद्रता के उचित मार्ग medias. इस प्रोटोकॉल evolver को विन्यस्त करने के लिए विभिन्न अध्ययनों और विषयों के लिए स्वचालित सतत संस्कृति प्रयोगों की एक विस्तृत विविधता को निष्पादित करने के लिए एक सामान्य शीर्ष के रूप में सेवा करनी चाहिए.
विकास चयन जीव विज्ञान में एक अनिवार्य उपकरण है, मोटे तौर पर उत्पंन करने के लिए और सेलुलर आबादी के बीच लक्षणप्ररूपी मतभेद विशेषताएं इस्तेमाल किया । जबकि बैच संस्कृतियों एक सीमित तरीके से विकास के चयन की अनुमति है, सतत संस्कृति तकनीक नाटकीय रूप से और चयन की गतिशीलता पर सटीक विनियमन exerting द्वारा नियंत्रण और इन प्रयोगों के predictability की डिग्री का विस्तार करने के लिए उत्पंन दोहराए जाने योग्य, मात्रात्मक परिणाम22। सतत संस्कृति को कड़ाई से उच्च विविधता पुस्तकालयों के लिए चयन नियंत्रण के लिए नियोजित किया गया है20,23,24,25, और प्रयोगात्मक में परिष्कृत अनुकूली व्यवस्थाओं को लागू करने और निर्देशित विकास11,12,26,27। सतत संस्कृति भी मात्रात्मक नियंत्रित स्थितियों की एक सरणी भर में कोशिकाओं के सटीक लक्षण वर्णन के लिए बेहतर जटिल आनुवंशिक प्रणालियों को समझने के लिए सक्षम बनाता है और अनुकूलित इंजीनियर bioproduction उपभेदों9,14 , २८।
हालांकि, सतत संस्कृति के लिए कोई सार्वभौमिक प्रोटोकॉल है, के रूप में चयनात्मक स्थितियों में सूक्ष्म परिवर्तन जैविक परिणामों में नाटकीय परिवर्तन करने के लिए नेतृत्व कर सकते है4,29,30। Experimenters चयन व्यवस्थाओं के बीच चयन और तदनुसार प्रयोगात्मक प्रोटोकॉल और उपकरणों के अनुकूल करने में सक्षम होना चाहिए. नियंत्रण मापदंडों के बीच एक विकल्प की पेशकश करने के अलावा, इस तरह के सिस्टम को आदर्श रूप से काफी परिष्कृत करने के लिए स्वतंत्र रूप से उच्च समानांतर प्रयोगों है कि जटिल में आदानों बातचीत समझने की जरूरत है में एक साथ कई मापदंडों का प्रबंधन होगा जैविक प्रणालियों (उदा. epistasis) । eVOLVER उपयोगकर्ताओं को सक्षम करने के लिए मनमाने ढंग से संस्कृति की स्थिति और fluidic कार्यों के बीच प्रतिक्रिया नियंत्रण के क्रम में उच्च विशेष पर्यावरण niches निर्दिष्ट करने के लिए इस चुनौती के पते ।
वर्तमान सेटअप में सीमाओं पर काबू पाने के लिए और विस्तार या नियंत्रण मापदंडों को बदलने के लिए, स्मार्ट आस्तीन आसानी से नए सेंसर या actuators जोड़ने के लिए बदल दिया जा सकता है. इसके अतिरिक्त, शीशी की मात्रा को कम करने मीडिया व्यय है, जो सतत संस्कृति में महत्वपूर्ण हो सकता है कम होगा । जबकि वर्तमान डिजाइन माप और तापमान, संस्कृति आंदोलन, प्रकाश प्रेरण, turbidity, और fluidics के नियंत्रण की अनुमति देता है, अंय मानकों को बाहर की शीशियों से नमूना द्वारा मापा जाना चाहिए । वर्तमान काम में luciferase के माध्यम से एंजाइमी गतिविधि की निगरानी और evolver संस्कृतियों में भंग ऑक्सीजन और पीएच को विनियमित करने की क्षमता शामिल है । इसके अतिरिक्त, जबकि इस काम में प्रदर्शन नहीं, eVOLVER उपंयास millifluidic बहुसंकेतन उपकरणों के साथ इंटरफेस कर सकते है16 कि बड़े पैमाने पर एकीकरण के सिद्धांतों पर आकर्षित (इलेक्ट्रॉनिक्स से उद्भव और microfluidics द्वारा अपनाया) सस्ते में अधिक जटिल fluidic हैंडलिंग (जैसे बहुसंकेतन fluidic आदानों, शीशी के लिए शीशी स्थानांतरण) सक्षम करें । इन आर्द्रपात्र मॉड्यूल डिजाइन किया जा सकता है और पूरी तरह से प्रयोगशाला में निर्मित है, उपयोगकर्ताओं को रूट तरल पदार्थ के लिए प्रोग्राम द्वारा स्वचालित fluidic दिनचर्या में वाल्व के विभिंन संयोजनों ऐक्टिंग द्वारा अनुमति देता है । यह उपयोगकर्ताओं को कठोर fluidic पारंपरिक रूप से निरंतर संस्कृति में इस्तेमाल किया डिजाइनों पर काबू पाने के लिए अनुमति देता है, लेकिन यह भी महंगा नियंत्रण तत्वों (जैसे सिकुड़नेवाला पंपों) की एक छोटी संख्या के साथ उच्च throughput के लिए fluidic क्षमताओं पैमाने पर । अंत में, हम एक autosampling मंच है जो इन millifluidics और DIY घटकों का उपयोग करेंगे शामिल करने की उंमीद कर रहे हैं, अब और बड़ा प्रयोग के दौरान मैनुअल बातचीत की सीमा पर काबू पाने जहां संस्कृतियों नमूना बोझिल होगा ।
प्लेटफ़ॉर्म के लिए भौतिक संशोधनों के अलावा, वेब आधारित सॉफ़्टवेयर उपयोगकर्ताओं को लिखने, संपादित करने, और कस्टम eVOLVER स्क्रिप्ट साझा करने, पूरी तरह से स्वचालित, फ़ीडबैक-सक्षम संस्कृति प्रोग्राम (उदा., turbidostat) जेनरेट करने की अनुमति देकर, स्वतंत्रता के नए अंश खोलता है. उपयोगकर्ता प्रोग्राम के जरिए एक ही चयन योजना पर सूक्ष्म विविधताओं में पैरामीटर श्रेणियों में स्वीप कर सकते हैं या परिष्कृत चयन योजनाओं की किसी भी संख्या को निर्दिष्ट करने के लिए उपन्यास संयोजनों में नियंत्रण एल्गोरिदम कनेक्ट कर सकता है । इसके अलावा, आसानी से वास्तविक समय में संस्कृतियों की निगरानी करने की क्षमता में प्रयोग किया जाता है जिस तरह से बदल देती है । रीयल-टाइम मॉनिटरिंग के साथ, उपयोगकर्ताओं को 1) रन, bioproduction अनुप्रयोगों और उच्च-थ्रूपुट प्रयोगों के लिए एक महत्वपूर्ण विशेषता के बीच संगतता के लिए जाँच करें, और 2) यदि आवश्यक हो तो प्रदर्शन के दौरान हस्तक्षेप, चुनौतीपूर्ण उपभेदों का निवारण करने के लिए गरीब विकास या biofilm गठन, या उपयोगकर्ता त्रुटियों का निदान (जैसे, संदूषण). अंत में, एकाधिक डेटा धाराओं के साथ एकत्र किया जा रहा है और प्रत्येक व्यक्ति की संस्कृति के लिए वास्तविक समय में व्याख्या की, eVOLVER डेटा का एक उच्च घनत्व है, जो उपंयास डाउनस्ट्रीम विश्लेषण के लिए मशीन सीखने के दृष्टिकोण की सुविधा हो सकती है उत्पंन करता है ।
परे प्रदर्शन फिटनेस लक्षण वर्णन, पुस्तकालय चयन, और प्रयोगशाला विकास के लिए उपयोग करता है, हम एकीकृत fluidics के साथ eVOLVER में कार्यांवयन के लिए परिपक्व के रूप में संबंधित क्षेत्रों के एक नंबर देखते हैं । माइक्रोबायोम नमूनों के साथ evolver प्रयोगों नियंत्रित वातावरण में समुदाय स्थिरता परख सकता है31,३२, culturomics तकनीक का उपयोग कर माइक्रोबायोम संरचना का पता लगाने३३, या गतिशील मिश्रण प्रजातियों के लिए उपनिवेशन या आक्रमण३४,३५की पारिस्थितिकी गतिशीलता पूछताछ । जैव अणु के सतत निर्देश विकास के लिए कई तरीकों को आसानी से के रूप में अच्छी तरह से26,३६,३७डिवाइस पर लागू किया जा सकता है, इन प्रणालियों की पहुंच और throughput में काफी वृद्धि. एक गतिशील, उच्च throughput प्रकृति में मीडिया संरचना, तापमान, और उपभेदों के रूप में बढ़ती स्थितियों का अनुकूलन करने की क्षमता औद्योगिक biomanufacturing आवेदन9के लिए अनुकूलन प्रयासों में सहायता कर सकते हैं. हम एक बंद पाश फैशन में माइक्रोस्कोपी और प्रवाह कोशिका मिति के रूप में अन्य विश्लेषण तकनीकों के साथ ऊर्ध्व एकीकरण को आगे कल्पना, दोनों एकल कोशिका और जनसंख्या पर सेलुलर संस्कृतियों के विकास और विश्लेषण के लिए एक पूरी तरह से स्वचालित प्रणाली प्रदान स्तर. इसके अलावा, इस तरह के पोत सील और गैस की सामग्री को नियंत्रित करने के रूप में स्मार्ट आस्तीन करने के लिए कुछ हार्डवेयर संशोधनों के साथ, eVOLVER संभवतः इस तरह के निलंबन स्तनधारी कोशिकाओं के रूप में सेल प्रकार, की एक व्यापक श्रेणी के विकास का समर्थन करने के लिए अनुकूलित किया जा सकता है । अवायवीय कोशिका संस्कृति के लिए पूरे ढाँचे को अवायवीय कक्ष में रखना भी व्यवहार्य है । आगे खोज, हम एक केंद्रीकृत बादल बुनियादी ढांचे में हमारे सॉफ्टवेयर रूपरेखा बनाने के उद्देश्य और विश्वास है कि यह उपयोगकर्ताओं को आसानी से विंयस्त करने की अनुमति होगी, विश्लेषण, और अपने डेटा को दूर से साझा करने के लिए शारीरिक रूप से प्रयोगशाला में मौजूद होने की जरूरत के बिना । एक डेटा क्यूरेटर के रूप में कार्य, बादल बुनियादी सुविधाओं को भी बड़े पैमाने पर प्रयोगों में मेटा विश्लेषण के लिए खुद को उधार दे देंगे । हमें आशा है कि eVOLVER और इन भावी अग्रिमों बहुत सतत संस्कृति में स्वचालन और नवाचार को सुविधाजनक बनाने के द्वारा संभव विकास चयन प्रयोगों के दायरे का विस्तार होगा ।
The authors have nothing to disclose.
हम प्रणाली के डिजाइन में उसकी सहायता के लिए बी Stafford धंयवाद, और एच खलील, ए Soltanianzadeh, ए सूर्य, एस पाइप, और एक प्रणाली के निर्माण के साथ मदद के लिए Cavale । हम इलेक्ट्रॉनिक्स डिजाइन सुविधा (EDF), इंजीनियरिंग उत्पाद नवाचार केंद्र (महाकाव्य), और उनकी सेवाओं के लिए बोस्टन विश्वविद्यालय में कंप्यूटिंग के लिए हरीरी संस्थान में सॉफ्टवेयर & एप्लीकेशन इनोवेशन लैब (SAIL) स्वीकार करते हैं । यह काम एक NSF कैरियर पुरस्कार (MCB-१३५०९४९ से A.S.K.), और DARPA अनुदान HR0011-15-सी-००९१ और HR0011-18-2-0014 (A.S.K. के लिए) द्वारा समर्थित किया गया । A.S.K. भी NIH है निदेशक नई प्रर्यातक पुरस्कार (1DP2AI131083-01), DARPA युवा संकाय पुरस्कार (D16AP00142), और कंप्यूटिंग में एनएसएफ अभियान (CCF-१५२२०७४) से धन स्वीकार करते हैं ।
5 Gallon Plastic Hedpack with cap | Midwest Brewing and Winemaking Supplies | 45-56Y8-E2FR | For waste collection |
a-D(+)-Glucose | Chem-Impex | 00805 | For YPD Medium |
Attune NxT Autosampler | Thermo Fisher | Allows Flow Cytometer to run samples from 96 well plate | |
Attune NxT Flow Cytometer | Thermo Fisher | Used to determine population fractions via single cell fluoresence | |
Bacto Peptone | Fisher Scientific | DF0118-07-0 | For YPD Medium |
Carbenicillin | Fisher Scientific | BP2648250 | For YPD Medium |
Chemical-Resistant Barbed Tube Fitting Tee Connector, for 1/8" Tube ID, 250°F Maximum Temperature | McMaster- Carr | 5121K731 | For media input branching |
Chloramphenicol | Fisher Scientific | BP904-100 | For YPD Medium |
CLOROX GERMICIDAL Bleach 8.25 | Fisher Scientific | 50371500 | For Sterilization of fluidic lines |
Custom eVOLVER vial lid | FynchBio | Lid has ports for sampling and fluidic input/output | |
Cycloheximide | Fisher Scientific | ICN10018301 | For flow cytometry sampling plates |
Ethanol, Anhydrous (Histological) | Fisher Scientific | A405P-4 | For sterilization of fluidic lines |
eVOLVER Unit | FynchBio | ||
Fisherbrand Extended-Length Tips (Lift Off Rack; 1 to 200 ul) | Fisher Scientific | 02-681-420 | For vial sampling |
Fisherbrand Octagon Spinbar Magnetic Stirring Bars | Fisher Scientific | 14-513-57 | Diameter: 4.5 mm, Length, 12 mm |
Fisherbrand Reusable Glass Media Bottles with Cap | Fisher Scientific | FB8002000 | Must be fitted with tubing |
High-Temperature Silicone Rubber Tubing Semi-Clear White, Durometer 70A, 1/8" ID, 1/4" OD | McMaster- Carr | 51135K73 | For media bottles |
Mac Mini | Apple | For running the experiment/collecting data | |
Phosphate Buffered Saline (PBS) | Fisher Scientific | BP243820 | For flow cytometry sampling plates |
Pipettes | Eppendorf | ||
Plastic Quick-Turn Tube Coupling, Plugs, for 1/16" Barbed Tube ID, Polypropylene | McMaster- Carr | 51525K141 | For media bottles |
Plastic Quick-Turn Tube Coupling, Plugs, for 5/32" Barbed Tube ID, Polypropylene | McMaster- Carr | 51525K144 | For media bottles |
Plastic Quick-Turn Tube Coupling, Sockets, for 1/16" Barbed Tube ID, Polypropylene | McMaster- Carr | 51525K291 | For media bottles |
Plastic Quick-Turn Tube Coupling, Sockets, for 5/32" Barbed Tube ID, Polypropylene | McMaster- Carr | 51525K294 | For media bottles |
SCREW CAPS, OPEN TOP, WITH PTFE FACED SILICONE SEPTA, LAB-PAC, SEPTUM. Screw thread size: 24-400, GREEN | Chemglass | CG-4910-04 | Culture vials |
Sodium Chloride (NaCl) | Fsher Scientific | S271-3 | For YPD Medium |
SpectraMax M5 Multi-Mode Microplate Reader | Molecular Devices | For measuring OD600 of overnight cell cultures | |
Vial Only, Sample, 40mL, Clear, 28x95mm, GPI 24-400 | Chemglass | CG-4902-08 | Culture vials |
Yeast Extract | Fisher Scientific | BP1422-500 | For YPD Medium |