Summary
ここでは、ラクトバチルス細胞遊離上清(LCFS)の抗癌効果を理解する方法が提示されている。大腸癌細胞株は、3D培養でLCFSで治療した場合の細胞死を示す。スキャフォールドの生成過程はスキャフォールドに応じて最適化でき、提示される解析方法は、関係するシグナル伝達経路を評価するのに有用である。
Abstract
本稿は、 乳酸菌 発酵細胞培養物 の上清を用いた多細胞型癌細胞の三次元(3D)スフェロイドにおける癌細胞死亡を評価するプロトコルを、プロバイオティクス培養物と考える。 ラクトバチルス 細胞遊離上清(LCFS)をテストするための3D培養物の使用は、特に L.発酵 が腸内で抗癌効果を生み出すことができるため、2D単層での試験よりも優れた選択肢です。 L.発酵 物上清は、3D培養条件で複数の大腸癌(CRC)細胞に対する抗増殖効果の増加を有することを同定した。興味深いことに、これらの効果は培養モデルと強く関連し 、L.発酵 が癌細胞死を誘導する顕著な能力を示した。安定したスフェロイドは、以下に示すプロトコルを用いて多様なCRC(大腸癌細胞)から生成された。3Dスフェロイドを生成するこのプロトコルは、時間の節約とコスト効率が高いです。このシステムは、複数のタイプのCRCスフェロイドにおけるLCFSの抗癌効果を容易に調べる開発された。予想通り、LCFSで処理されたCRCスフェロイドは、実験中に細胞死を強く誘導し、qRT-PCR、ウェスタンブロッティング、およびFACS分析によって分析された特定のアポトーシス分子マーカーを発現した。したがって、この方法は、細胞の生存率を探索し、抗癌薬の有効性を評価するために有用である。
Introduction
プロバイオティクスは、免疫恒常性および宿主エネルギー代謝を改善する腸内で最も有利な微生物である1.乳酸菌およびビフィズス菌からのプロバイオティクスは腸内で見つかったその種の最も先進的な 2,3.これまでの調査では、ラクトバチルスは大腸癌を含むいくつかの癌に対して阻害および抗増殖効果を有することが示されている。また、プロバイオティクスは炎症性腸疾患、クローン病、潰瘍性大腸炎5,6を予防する。しかし, プロバイオティクスを用いたほとんどの研究は、2 次元で行われました (2D) 固体表面上で成長している単層.
人工培養システムは、がん細胞にとって自然ではない環境特性を欠いています。この制限を克服するために、3次元(3D)培養システムが7,8に開発されている。3Dにおける癌細胞は、細胞生存率、増殖、形態、細胞細胞通信、薬物感受性、および生体内関連性9,10などの基本的な生物学的機構の点で改善を示す。さらに、スフェロイドは、多細胞型の大腸癌から作製され、細胞間相互作用および細胞外マトリックス(ECM)11に依存する。我々の以前の研究は、ラクトバチルス発酵を用いて産生されたプロバイオティクス無細胞上清(CFS)が大腸癌(CRC)細胞12の3D培養に抗癌効果を示したことを報告した。我々は、CFSが3Dスフェロイド12に対するプロバイオティクス効果をテストするための適切な代替戦略であることを提案した。
ここでは、プロバイオティクス無細胞上清(CFS)の治療効果を複数の3D大腸癌模倣システムに対する分析のために、多細胞型の3D大腸癌に対応できるアプローチを提示する。この方法は、インビトロで関連プロバイオティクスと抗癌効果の分析のための手段を提供します。.
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Protocol
1. 細菌細胞培養と ラクトバチルス 細胞フリー上清(LCFS)の調製
注:ステップ1.2 - 1.9は嫌気性の部屋で行われます。
- L-システインを含むMRS寒天プレートとブロスを準備し、オートクレーブで殺菌します。
- 20 ppm酸素で37 °Cで維持されたH2 嫌気性チャンバーにMRS寒天プレートをプレインキュベートします。
- 乳酸菌の細菌ストックを解凍し、細菌培養物で寒天板を接種する(図1A(i))。
- 細菌を37°CでH2 嫌気室で2~3日間培養し、単一の細菌コロニーが得られるまで20ppmの酸素をインキュベートする。
- ハンガト型の無神経培養チューブを洗浄し、乾燥させます。121°Cで15分間培養管をオートクレーブします。
- その後、37°CでH2 嫌気性チャンバーにチューブをインキュベートし、酸素を除去するために20ppmの酸素を除去します。
- MRSスープの2〜3mLをチューブに入れる。ブチルゴム栓でチューブを密封し、キャップをねじ込みます。
- ループを持つ単一コロニーを取得し、1x PBSの500 μLで1.5 mL培養チューブに入れ.(図1A(ii) )
- 1 mL シリンジを使用してコロニーを中断します (図 1A (iii))。これを行うには、チューブ蓋の中央に1mLシリンジの針を挿入し、浮遊コロニーを吸引し、それをMRSブロス培地に再懸濁させる。(図1A(iv))
- MRSブロス培地を2日間(37°C、5%CO2、200rpm)のシェーカーインキュベーターでインキュベートします。
- 分光光度計を使用して光学密度(OD)を測定し、OD620 の吸光度が2.0に達するまで細菌の成長曲線を監視します。
- 15分間1,000 x g で遠心分離して、細菌ペレットと調整された培地を分離します。1x PBSで採取した細菌ペレットを洗浄し、10%の胎児ウシ血清を補充したRPMI 1640の4mLで再懸濁します。培地に抗生物質を含まないでください。
- 細菌ペレットをRPMIに保持し、37°Cで4時間、100rpmの速度で5%CO2でシェーカーインキュベーターでインキュベートします。
- プロバイオティクス上清の調製のために、4°Cで15分間、1000 x gで遠心分離を介して細菌ペレットを除去する。 0.22 μmフィルターを使用して回収した上清を滅菌フィルターし、使用するまで−80°Cで保存します。
2. スフェロイドの生成
-
大腸癌細胞株の準備
- DLD-1、HT-29、及びWiDr細胞株を70〜80%の合流まで単層として増殖させ、5%CO2インキュベーターで37°Cでプレートをインキュベートする(成長培地:10%ウシ胎児血清(FBS)および1%ペニシリンストレプマイシンを含むRPMI。
- 100mmペトリ皿で増殖した細胞の場合は、4 mLの1x PBSでプレートを2回洗浄します。0.25%トリプシン-EDTAの1 mLを加え、5%CO2インキュベーターで37°Cで2分間ペトリ皿をインキュベートし、細胞を解体します。
- インキュベーション後、顕微鏡下で細胞解離を確認し、5 mLの成長培地でトリプシン-EDTAを中和します。
- 解約した細胞を15 mLの円錐形チューブに移し、遠心分離機を300xgで3分間移動します。
- 上清を捨て、3 mLの成長培地で穏やかに再び再び停止します。
- トリパンブルーで細胞を数え、ヘモサイトメーターを使用して生存可能な細胞を決定します。(図1B(i)
-
スフェロイド形成
- 15 mL円錐形チューブで、2.1.5から細胞を希釈して1〜2 x 105細胞/mLを得る(図1B(ii)
- 細胞懸濁液に0.6%メチルセルロースの最終濃度を加え、希釈した細胞を滅菌貯蔵所に移します。
注:細胞株ごとに、必要なメチルセルロースの量を滴定し、それに応じて決定する必要があります。 - マルチチャンネルピペットを使用して、超低い取り付け96ウェルの丸底マイクロプレートの各ウェルに200 μLの細胞を分配します。(図1B(iii)
- プレートを37°Cで24〜36時間5%CO2 インキュベーターでインキュベートします。
- 24~36時間後、プレートを光学顕微鏡で観察し、回転楕円体形成を確実に行います。
3. LCFSによる3次元大腸癌細胞の治療
- 手順 2 および 3 で説明されているように、回転楕円体を生成します。
- LCFS処理を行う前に、凍結したLCFSを室温(RT)で10〜20分間解凍します。
- LCFSストックソリューションを成長培地に接種します。成長培地で25%、12.5%、6%に連続希釈(すなわち、LCFSは25%=150μLの成長培地+LCFSの50 μL)。
- インキュベーターからスフェロイドを含む細胞培養プレートを取り出し、200 μLピペットを使用して各ウェルからできるだけ多くの成長培地を取り出します。
- 細胞にLCFSを含む成長培地を加え、24〜48時間5%CO2インキュベーターで37°Cでインキュベートします。
注:使用されるボリュームは、プレートサイズによって次のように異なります: 6ウェル細胞培養プレートの場合は2 mL;96ウェル細胞培養プレート用200μL。
4. スフェロイドの細胞生存率
- 8 - 10 LCFS治療大腸癌スフェロイドを不透明壁のマルチウェルプレートに準備する(細胞生存アッセイはLCFS治療後48時間実施される)。
- 細胞生存率試薬( 材料表を参照)を一晩4°Cで解凍します。
- 細胞生存率試薬を使用前に室温に平衡化する。
- アッセイを行う前に、スフェロイドから成長培地の50%を取り除く。
- 各ウェルに100μLの細胞生存率試薬を加えます。
注:使用する容積は、プレートサイズによって次のように異なります: 96ウェル細胞培養プレートの場合は100 μLです。 - 試薬を5分間激しく混ぜて細胞のリシスを促進する。
- 30分間のインキュベート – 37 °Cで2時間。
- 発光を記録します。
5. スフェロイドの定量リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応解析
- 各条件に対して、2 mLチューブに10~15個のスフェロイドを用意し、遠心分離機を400 x gで3分間用意します。
- 上清を捨て、氷冷1x PBSの1mLでスフェロイドを2回洗います。
注:遠心分離を避け、回転楕円体を落ち着かせてください。 - 1x PBSをできるだけ吸引し、市販のキットを用いてRNAを分離した。
- メーカーのプロトコルに従って市販のキットを使用して、1 μgのRNAからcDNAを合成します。
- マスター ミックスを準備して、すべてのサンプルを三重で実行します ( 表 1 および 表 2を参照)。
- テンプレートマスターミックスの20 μLで各qPCRプレートウェルに増幅を行います。
- 反応をよく混ぜて、必要に応じてスピンします。
- 機器メーカーの推奨事項に従ってサンプルを実行します (表 3)。
6. スフェロイドからのウェスタンブロッティング
注:スフェロイドを収集する場合は、200 μLピペットを使用し、その構造を乱さないように先端の端をカットします。
- 各条件に対して、2 mL チューブに 30 ~ 40 個のスフェロイドを用意します。
- チューブを氷の上に置き、回転楕円体を2 mLチューブの底まで下ろします。
- 上清を捨て、1 mL氷冷1x PBSでスフェロイドを2回洗う
注:遠心分離を避け、回転楕円体を落ち着かせてください。 - 1x PBSをできるだけ吸い込み、プロテアーゼ阻害剤カクテル(10スフェロイド=30μLのRIPAバッファー)でRIPAバッファーを追加します。
- 上下にピペットを使用して細胞をライセし、30 sの30 sで10サイクル氷の上で超音波処理を行います。
- タンパク質を遠心分離して、15000xgで4°Cで15分間にリセートする。
- 各細胞のリセートに対するタンパク質濃度を決定します。
- 積み込む前に、各細胞のライセートを100°Cのサンプルバッファーで10分間沸騰させます。
- SDS-PAGEゲルのウェルに等量のタンパク質をロードし、100 Vで1〜2時間ゲルを実行します。
- ゲルからPVDF膜にタンパク質を移します。
- 転写後、ブロックバッファー(5%スキムミルク+Tween-20でTBS)を使用して、室温で1時間膜をブロックします。
- 一次抗体の1:1,000希釈液で膜をインキュベートする (表4)1x TBSTで、一晩で5%BSAバッファーを一晩で5%BSAバッファーで。
- 膜をTBSTで3回洗浄し、洗浄ごとに15分ずつ洗浄します。
- 2時間の室温でブロッキングバッファーに二次抗体の1:2,500希釈を用いて膜をインキュベートする( 材料表を参照)。
- 膜をTBSTで3回洗浄し、洗浄ごとに15分ずつ洗浄します。
- 化学発光基質を用いてHRP検出用膜を準備します。
- 化学発光画像を取得します。
7. ヨウ化プロピジウム(PI)は、スフェロイドの染色
- ステップ4.1で説明したように5-10スフェロイドを準備し、37°Cおよび5%CO2でインキュベーターにスフェロイドを置く。
- 1mg/mLのPI 1:100を1x PBSで希釈します。
- 96ウェルプレートの各ウェルから培地の50%を取り除きます。
- 各ウェルに100 μLのPI溶液を加え、37°Cのインキュベーターに井戸を、10~15分間5%CO2 に入れる。
- 1x PBS で PI 溶液を洗い流します。
- 200 μL の成長培地を加え、蛍光顕微鏡を用いて画像を撮ります。イメージJを用いて蛍光強度を解析し、回転楕円体の生存率カウントを取得します。
8. スフェロイドのFACS分析
- 前述のとおり、回転楕円体を生成します。
- 各条件について、FACSチューブに30~40個のスフェロイドを用意し、遠心分離機を400xgおよびRTで3分間用意します。
- 上清を吸引し、スフェロイドを1x PBSの3mLで洗浄し、400xgで遠心分離機を4°Cで3分間洗浄する。
- 上清を吸引し、0.25%トリプシン-EDTAの200 μLを加え、RTで2-3分間インキュベートします。
メモ:インキュベーション時間は、スフェロイドサイズとセルタイプに依存します。 - FACSバッファーを1 mL追加し、200 μLピペットを使用してスフェロイドを優しく解約します。
- 解約細胞を400xgで遠心分離し、4°Cで3分間遠心する。
注: FACS バッファ = 1x PBS + 2.5% FBS、0.22 μm のトップ フィルタを使用してフィルタリング。 - 上清を捨て、7-AAD/アネキシンV試薬(7AAD(5 μL)、アネキシンV(5 μL)/サンプルを加えます。
- 細胞を穏やかに渦を起させ、暗闇の中でRTで13〜30分間インキュベートする。
- 500 μL の FACS バッファーを追加し、円錐ポリスチレン試験管を使用して細胞をフィルター処理して、凝集細胞を除去します。
- 遠心分離機は400xgで、4°Cで3分間。
- 各チューブに500 μLのアネキシンV結合バッファーを追加し、再中断します。
- フローサイトメーターを使用して分析します。
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Representative Results
多様な大腸癌細胞株からスフェロイドを得るプロトコルについて述べています。メチルセルロースによる補充は、スフェロイドを生成するために必要とされた。また、LCFS調製の方法を提示し、プロバイオティクスと大腸癌の相関関係を研究するモデルを提示する。スフェロイド形成およびLCFS調製プロトコルは、図1A,Bに概略的に示される。図2Aに示すように、メチルセルロース濃度0.6%は癌細胞をコンパクトなスフェロイドに変換する。この結果は、メチルセルロースプロトコルを使用して、いくつかのタイプの大腸癌からスフェロイドを生成できることを示しています。次に、スフェロイドを25%LCFSで処理し、48時間後に光顕微鏡を用いてモルフォロジーを研究した。図3Aに示すように、LCFSで処理された群の回転楕円体は、破壊された表面を示した。適切な濃度でのLCFSの抗癌効果を調査するために、スフェロイドはLCFSの様々な用量で48時間治療した:0(対照)、6%、12.5%、および25%。図3Bに示すように、25%LCFSで処理されたスフェロイドでスフェロイド形態の破壊が観察された。さらに、スフェロイドを24時間および48時間の25%LCFSで処理し、48時間の治療後にスフェロイド形態の破壊が観察された。図3Cに、スフェロイドの顕微鏡画像を示します。
48時間後、サンプルを細胞生存アッセイで評価し、大腸癌細胞死を用量依存的にLCFSで治療した際に観察され、LCFS量が高いほど観察された細胞死を高くした(図3D)。次に、試料をヨウ化プロピジウム(PI)で染色し、アポトーシスを観察した。予想通り、アポトーシスの誘導はLCFS用量に依存していた(図4A、B、C)。RT-PCRは、アポトーシスすなわち、BAX、BAKおよびNOXAの分子マーカーの変化を検出するために行われた(図5A,B)。最後に、アポトーシスマーカーは、FACSを介してウェスタンブロッティングおよびアネキシンV/7AADを用いて検討した(図6A,B,C,D)。これらの観測は、LCFSが3Dモデルでアポトーシスを効果的に誘導したことを示している。
図1:スフェロイド形成とLCFS調製物の概略表現
(A)LCFS生成プロトコルの模式図画像は、(i-iv)(B)メチルセルロース媒介型スフェロイド形成の回路図(i-iii)でマークされる。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図2:メチルセルロース媒介性スフェロイド形成。
(A)HT-29、DLD1、およびWiDrのメチルセルロース媒介スフェロイド形成の代表的な画像。細胞は、メチルセルロース濃度が0.1〜1.2%の超低く付着した96ウェルの丸底板に48時間播種した。スケールバー 10 μm(実験ごとに n=3) この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図3:LCFS濃度とスフェロイド形態の評価
(A) LCFS で 48 時間処理された HT-29 の代表的な画像。スケールバー100 μm。(B) HT-29, DLD1, および WiDr スフェロイドは、LCFS の増加用量で処理 48 時間.すべてのスフェロイドは12.5-25%LCFSでエッジを破壊しました。スケールバー 20 μm (実験ごとに n=3)(C)HT-29、DLD1、および WiDr スフェロイドのスフェロイド形態を 24 および 48 時間の 25% LCFS で処理した。スケールバー20μm(n=3)(D)測定された細胞生存率は、SEM±平均値として示され、p<0.05(n=3)を各実験に対して示した。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図4:回転楕円体のヨウ化プロピジウム染色。
PI染色の代表的な画像(A)HT-29, (B) DLD1, および (C) LCFS処理の48時間後の回転楕円体のWiDr.画像を蛍光顕微鏡を用いて取得し、PI強度の増加を画像J.スケールバー10μmを用いて測定した。SEM±平均が表示されます。、P < 0.05 (n = 3 実験ごとに) この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図5:qRT-PCRを用いてアポトーシスマーカーを同定した。
BAX、BAKおよびNOXAなどのアポトーシスマーカーを定量化した。mRNA定量は、(A)βアクチンおよび(B)18s rRNAに正規化された相対発現として提示される。SEM±平均が表示されます。P < 0.05 (実験ごとに n =3)この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図6:アポトーシスマーカーは、スフェロイドのウェスタンブロッティングおよびFACS分析を介して決定した。
図に示されているのは、LCFS処理後の(A)HT-29、(B)DLD1、および(C)WiDr細胞のウェスタンブロットである。PARP1、BCL-XL、およびp-IκBαが検出された。βアクチンを内部統制として使用した。(D) HT-29、 DLD1、および WiDr スフェロイドにおけるアポトーシスの FACS 解析を LCFS と共にインキュベートした。アキセプティック細胞は、アネキシンV−FITCの蛍光強度の増加によって検出された。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
| 反応 | 1つのシングル20 μLあたりの容積 |
| 2X qPCR ミックス | 10 μL |
| フォワードプライマー(10 pmols/μL) | 1 μL |
| リバースプライマー(10 pmols/μL) | 1 μL |
| cDNA (50 ng/μL) | 1 μL |
| PCRグレード水 | 7 μL |
表1:PCR反応混合物。
| 入門 | 順序 |
| バックスフォワード | CCCGAGAGGTCTTTCCGAG |
| バックスリバース | CCAGCCCATATATTTCTGAT |
| バクフォワード | アトクトカックタククテクチャア |
| バクリバース | TCATAGCGTCGGTGtGTCG |
| ノクサフォワード | アコーグコッガット |
| ノクサリバース | アクトGCACTTGTTCGTGG |
| 18s rRNAフォワード | ガッグッググググガーアタグ |
| 18s rRNAリバース | GCGTGGGGCTGCATATT |
| βアクチンフォワード | TCCTGTGGカッカックガアクト |
| βアクチン逆 | ゴーカトッヒッグガグガクダット |
表2:qRT-PCR分析で用いられるプライマー配列。
| 舞台 | 一時 (ºC) | 時間 |
| 初期変性 | 95 | 10分 |
| 40サイクル: | ||
| ステップ 1 | 95 | 15秒 |
| ステップ2 | 60 | 60秒 |
| 融解曲線ステージ | 95 | 15秒 |
| 60 | 60秒 | |
| 95 | 15秒 | |
表 3: qRT-PCR 条件
| 抗体 | 希釈 |
| PARP 1 (C2-10) | 1:1000 |
| BCL-XL (H-5) | 1:1000 |
| p-IκBα (B-9) | 1:1000 |
| βアクチン (C4) | 1:1000 |
| ヤギアンチマウスIgG(H+L) | 1:2500 |
| ヤギアンチラビットIgG(H+L) | 1:2500 |
表4:ウェスタンブロット分析に用いる抗体。
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Discussion
隣接する細胞および細胞外マトリックス(ECM)を含む組織微小環境は、組織発生の基本であり、細胞増殖および組織発達13の制御において極めて重要である。しかし、2D培養物には、細胞間相互作用の中断、細胞形態の変化、細胞外環境、および分割14のアプローチなど、いくつかの欠点がある。3D細胞培養システムは、生体内の効果をより良く再現するために厳密に研究されており、15,16のインビトロがん検査のためのより精密なシステムとして証明されている。化学療法に対するパーソナライズされた応答をより正確に予測するモデルシステムが必要です17.
3D足場はティッシュ工学のために開発された。これは、ECMの代理損失として機能し、腫瘍細胞の利用可能な空間を表す。さらに、足場は、細胞接着および増殖に対する物理的相互作用を提供し、細胞が適切な空間分布および細胞-ECMまたは細胞細胞相互作用18を形成する原因となる。メチルセルロース(MC)ポリマーは、3D細胞培養工学19,20における適用用MCベースのヒドロゲル系の生成における適合性を決定するために継続的に研究されている。しかし、これらのヒドロゲルを3D細胞ネットワークのような生体材料にそのまま組み込むことは、技術的には困難な21のままである。したがって、ここで提示されるスフェロイド形成プロトコルは、各CRC細胞株に対して様々な時点でMC濃度および最適化の滴定を推奨する。細胞の凝集、生存率、死などの細胞株特異的な特性は、テストした各条件に大きな影響を与える可能性があります。この方法は、がん細胞上でLCFSを検査するための均一なスフェロイドを生成する手段を提供することができる。
プロバイオティクス, 有益な細菌, 潜在的に抗癌効果を模倣することができる活性代謝産物を生成します。.そこで、乳酸菌(LAB)を単離し、細胞を含まない上清(CFS)から代謝抽出物の抗がん効果をテストすることを目的とした研究を行いました。我々の研究は、3D系における大腸癌細胞におけるアポトーシス細胞死を誘導するL.発酵細胞遊離上清の効果を観察する方法を提供した。アポトーシス経路に関与するアポトーシスマーカーのmRNAレベルは、3D条件でLCFS曝露後に劇的に誘導される。さらに、PARP1およびBCL-XLの減少したレベルは、図4C,D,Eの対照と比較してLCFS処理された3Dスフェロイド制御で発現した。NF-κB活性化の阻害は、また、LCFSによる処理後の3D培養において観察された。全体として、3Dで細胞を培養する利点は、細胞と細胞の相互作用を増加させ、生体内システムでより良い模倣するためにシグナル伝達分子に対する応答を含む。スフェロイドを用いたウェスタンブロッティングは、様々なシグナル伝達分子の状態に関する定量的な洞察を導くことができる。
細胞株は、がん研究の前臨床モデルとして一定の制限があります。近年、癌オルガノイドは、個別化抗癌治療22,23のモデル化に利用されている。オルガノイドのプロバイオティクスで LCFS の治療は抗がん効果をテストする強力なプラットフォームとして使用することが期待されています。.さらに、我々は癌モデルの様々なプロバイオティクスの中でラクトバチルス種の1つだけをテストしました。種々のプロバイオティクスは、また、メタボリックシンドローム、免疫学的、および神経疾患24、25、26の予防について試験されている。ビフィドバクテリウム、サッカロミセス、ストレプトコッカス、エンテロコッカス、アッカーマンシア属のLCFSは、様々な種類の疾患モデル27、28、29を通じて健康上の利点の検査の候補となる可能性がある。
本研究の結果、スフェロイドにおけるシグナル伝達の理解と3DモデルにおけるLCFS治療に対する様々な反応が、我々が提案した方法を用いた抗癌効果の検査に有益であると結論付けることができる。さらに、3Dがんモデルは、従来の2D単層では不可能ないくつかの利点を提供できます。
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Disclosures
著者らは関連する財務上の開示を持っていません。
Acknowledgments
本研究は、韓国規格研究所が出資する「化学・放射線測定基準の確立」、助成番号KRISS-2020-GP2020-0003、「生物材料と医療収束のための測定基準と技術の開発」によって支援されました。また、科学・ICT省、韓国国立研究財団(NRF-2019M3A9F3065868)、厚生省(MOHW)、韓国保健産業開発研究所(KHIDI、HI20C0558)、貿易産業エネルギー省(MOTIE)、韓国工業技術研究所(KEIT)、韓国評価研究所20009350も支援しました。ORCID ID(ヒーミンユー:0000-0002-5951-2137;ドゥッジンカン:0000-0002-5924-9674;Seilキム: 0000-0003-3465-7118;ジュウン・リー: 0000-0002-2495-1439;ジナ・リー:0000-0002-3661-3701)。チャン・ウー・パークの実験支援に感謝します。
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
10% Mini-PROTEAN TGX Precast Protein Gels, 15-well, 15 µl |
Biorad | 4561036 | Pkg of 10 |
| Applied Biosystems MicroAmp Optical Adhesive Film | Thermo Fisher Scientific | 4311971 | 100 covers |
| 10x transfer buffer | Intron | IBS-BT031A | 1 L |
| 10X Tris-Glycine (W/SDS) | Intron | IBS-BT014 | 1 L |
| Axygen 2.0 mL MaxyClear Snaplock Microcentrifuge Tube, Polypropylene, Clear, Nonsterile, 500 Tubes/Pack, 10 Packs/Case | Corning | SCT-200-C | 500 Tubes/Pack, 10 Packs/Case |
| BD Difco Bacto Agar | BD | 214010 | 500 g |
| BD Difco Lactobacilli MRS Broth | BD | DF0881-17-5 | 500 g |
| CellTiter-Glo 3D Cell viability assay | Promega | G9681 | 100μl/assay in 96-well plates |
| Complete Protease Inhibitor Cocktail | Sigma-Aldrich | 11697498001 | vial of 20 tablets |
| Corning Phosphate-Buffered Saline, 1X without calcium and magnesium, PH 7.4 ± 0.1 | Corning | 21-040-CV | 500 mL |
| EMD Millipore Immobilon-P PVDF Transfer Membranes | fisher Scientific | IPVH00010 | 26.5cm x 3.75m roll; Pore Size: 0.45um |
| Falcon 5 mL Round Bottom Polystyrene Test Tube, with Cell Strainer Snap Cap | Corning | 352235 | 25/Pack, 500/Case |
| Fetal Bovine Serum, certified, US origin | Thermo Fisher Scientific | 16000044 | 500 mL |
| iScript cDNA Synthesis Kit, 25 x 20 µl rxns #1708890 | Biorad | 1708890 | 25 x 20 µL rxns |
| iTaq Universal SYBR Green Supermix | Biorad | 1725121 | 5 x 1 mL |
| Lactobacillus fermentum | Korean Collection for Type Cultures | KCTC 3112 | |
| L-Cysteine hydrochloride monohydrate | Sigma-Aldrich | C6852-25G | 25 g |
| Methyl Cellulose (3500-5600mPa·s, 2% in Water at 20°C) | TCI | M0185 | 500 g |
| MicroAmp Fast Optical 96-Well Reaction Plate with Barcode, 0.1 mL | Applied Biosystems | 4346906 | 20 plates |
| Millex-GS Syringe Filter Unit, 0.22 µm, mixed cellulose esters, 33 mm, ethylene oxide sterilized | Millipore | SLGS033SB | 250 |
| PE Annexin V Apoptosis Detection Kit with 7-AAD | Biolegend | 640934 | 100 tests |
| Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | 100 mL |
| Propidium Iodide | Introgen | P1304MP | 100 mg |
| RIPA Lysis and Extraction Buffer | Thermo Fisher Scientific | 89901 | 250 mL |
| RNeasy Mini Kit (250) | Qiagen | 74106 | 250 |
| RPMI-1640 | Gibco | 11875-119 | 500 mL |
| Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | Thermo Fisher Scientific | 25200056 | 100 mL |
| Name of Materials/Equipment/Software | Company | Catalog Number | Comments/Description |
| anti - p-IκBα (B-9) | Santa cruze | sc-8404 | 200 µg/mL |
| anti-BclxL (H-5) | Santa cruze | sc-8392 | 200 µg/mL |
| anti-PARP 1 (C2-10) | Santa cruze | sc-53643 | 50 µl ascites |
| anti-β-actin (C4) | Santa cruze | sc-47778 | 200 µg/mL |
| BD FACSVerse | BD Biosciences | San Diego, CA, USA | |
| Synergy HTX Multi-Mode Microplate Reader | BioT | S1LFA | |
| CO2 incubator | Thermo fisher | HERAcell 150i | |
| Conical tube 15 ml | SPL | 50015 | |
| Conical tube 50 ml | SPL | 50050 | |
| Corning Costar Ultra-Low Attachment Multiple Well Plate | Sigma-Aldrich | CLS7007 | |
| Corning Costar Ultra-Low Attachment Multiple Well Plate | Sigma-Aldrich | CLS3471 | |
| Costar 50 mL Reagent Reservoirs, 5/Bag, Sterile | Costar | 4870 | |
| Countess Cell Counting Chamber Slides | Thermofisher | C10228 | |
| Countess II FL Automated Cell Counter | invitrogen | AMQAF1000 | |
| EnSpire Multimode Reader | Perkin Elmer | Enspire 2300 | |
| Eppendorf Research Plus Multi Channel Pipette, 8-channel | Eppendorf | 3122000051 | |
| FlowJo software | TreeStar | Ashland, OR, USA | |
| Goat Anti-Mouse IgG (H+L) | Jackson immunoresearch | 115-035-062 | 1.5 mL |
| Goat Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson immunoresearch | 111-035-144 | 2.0 mL |
| GraphPad Prism 5 | GraphPad Software | Inc., San Diego, CA, USA | |
| ImageJ | NIH | ||
| ImageQuant LAS 4000 mini | Fujifilm | Tokyo, Japan | |
| Incubated shaker | Lab companion | SIF-6000R | |
| Multi Gauge Ver. 3.0, | Fujifilm | Tokyo, Japan | |
| Optical density (OD)LAMBDA UV/Vis Spectrophotometers | Perkin Elmer | Waltham, MA, USA | |
| Phase-contrast microscope | Olympus | Tokyo, Japan | |
| SPL microcentrifuge tube 1.5mL | SPL | 60015 | |
| SPL Multi Channel Reservoirs, 12-Chs, PS, Sterile | SPL | 21012 | |
| StepOnePlus Real-Time PCR system | Thermo Fisher Scientific | Waltham, MA, USA | |
| Vibra-Cell Ultrasonic Liquid Processors | SONICS-vibra cell | VC 505 | 500 Watt ultrasonic processor |
| Vinyl Anaerobic Chamber | COY LAB PRODUCTS |
References
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