Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Cancer Research

Imagens de imunofluorescência de dna dano e reparo de focos em células cancerígenas de cólon humano

Published: June 9, 2020 doi: 10.3791/61399

Summary

A resposta de dano de DNA induzida por radiação ativada pelo feixe misto de nêutrons usado na terapia de captura de nêutrons de boro (BNCT) não foi totalmente estabelecida. Este protocolo fornece um procedimento passo-a-passo para detectar focos induzidos por radiação (RIF) de proteínas de reparação por manchas de imunofluorescência em linhas de células cancerígenas de cólon humano após a irradiação com o feixe misturado de nêutrons.

Abstract

O objetivo do manuscrito é fornecer um protocolo passo-a-passo para a realização de microscopia de imunofluorescência para estudar a resposta de dano de DNA induzida por radiação induzida pelo feixe misto de nêutrons usado na terapia de captura de nêutrons de boro (BNCT). Especificamente, a metodologia proposta é aplicada para a detecção de ativação de proteínas de reparo que podem ser visualizadas como focos usando anticorpos específicos para quebras de dupla cadeia de DNA (DNA-DSBs). Os focos de reparação de DNA foram avaliados por imunofluorescência em células cancerígenas de cólon (HCT-116) após irradiação com o feixe misto de nêutrons. Os DNA-DSBs são as lesões mais genotoxiicas e são reparados em células mamíferas por duas vias principais: via final não homólogo (NHEJ) e reparação de recombinação homologos (HRR). As frequências de focos, imunoquimicamente manchadas, para marcadores comumente usados em radiobiologia como γ-H2AX, 53BP1 estão associadas ao número DNA-DSB e são consideradas como marcadores eficientes e sensíveis para monitorar a indução e reparação de DNA-DSBs. Foi estabelecido que os focos γ-H2AX atraem proteínas de reparo, levando a uma maior concentração de fatores de reparo perto de um DSB. Para monitorar os danos do DNA no nível celular, foi planejada a análise de imunofluorescência para a presença de focos proteicos de reparação representativos de DNA-PKcs da via NHEJ e Rad52 da via HRR. Desenvolvemos e introduzimos um protocolo confiável de coloração de imunofluorescência confiável para a detecção de resposta a danos de DNA induzido por radiação com anticorpos específicos para fatores de reparo das vias NHEJ e HRR e focos induzidos por radiação (RIF). A metodologia proposta pode ser usada para investigar proteínas de reparo altamente ativadas no caso de radiação de feixe misturado de nêutrons, indicando assim o domínio da via de reparo.

Introduction

A resposta de dano de DNA induzida por radiação ativada pelo feixe misto de nêutrons usado na terapia de captura de nêutrons de boro (BNCT) não foi totalmente determinada. Este protocolo fornece um procedimento passo-a-passo para realizar a detecção de focos induzidos por radiação (RIF) de proteínas de reparação por manchas de imunofluorescência, por exemplo, na linha de células cancerígenas de cólon humano após a irradiação com o feixe misturado de nêutrons.

A radiação ionizante (IR) induz uma infinidade de diferentes tipos de dano de DNA (DNA-DSBs, DNA-SSBs, dano à base de DNA) dos quais as quebras de DNA duplo são as lesões de DNA mais genoóxicos1. Quebras não reparadas podem causar morte celular, enquanto quebras mal reparadas aumentam a probabilidade de rearranjo de cromossomo, mutagênese e perda de informações genéticas decisivas. As vias de resposta a danos que respondem aos DSBs incluem caminhos de reparação de DNA como a junção final não homólogo (NHEJ), um mecanismo que requer Ku 70/80, DNA-PKcs, Xrcc4 e DNA ligase IV como fatores-chave2,3,,4,,5,6. Nos mamíferos, a segunda principal via de reparação de DNA é a via de reparação de recombinação homologou (HRR), que requer componentes-chave - a família genética Rad52 epistasis – Rad51, Rad52, Rad54, Rad55, Rad57, Rad57 e Rad587. Rad51 e Rad54 são os principais fatores de recombinação humana envolvidos em mecanismos de reparação relacionados ao estresse de replicação e quebras de DNA em eucariotes. Curiosamente, observou-se que a redução da via HRR melhora a via NHEJ, que é propensa a erros apontando a relevância da via de RH para a estabilidade do genoma8.

O primeiro passo da formação de DSBs é a fosforilação da histona γ-H2AX na Ser-139 por Ataxia telangiectasia mutada quinase (ATM) da família pi3 quinase7,8. Curiosamente, a fosforilação H2AX pode ser visualizada facilmente pela técnica de imunofluorescência como focos (focos γ-H2AX) utilizando anticorpos específicos para H2AX6fosforilado . Há uma relação 1:1 entre o número de DSBs e os focos γ-H2AX, portanto, o marcador DSB, γ-H2AX, é estudado extensivamente através da caracterização da formação de focos, tamanho e quantidade6,,7,,8,,9,,10,,11. A formação de focos γ-H2AX leva ao recrutamento e acúmulo de proteínas de resposta a danos de DNA (DDR) e fatores modificadores de cromatina, como 53BP1 (proteína de ligação p53 1), MDC1 (mediador do ponto de verificação de danos do DNA), BRCA1, Mre11/Rad50/Nbs1, PARP-1, e muitos outros fatores de reparação formando assim focos induzidos por radiação (RIF). Todas essas proteínas co-localizam com γ-H2AX através de ligação direta ou indireta1,,11,12.

É importante detectar danos de DNA e reparar com um teste sensível adequado, portanto, mais atenção é dada ao desenvolvimento de técnicas altamente precisas13. No contexto de estudos de danos e reparos de DNA, a metodologia é crucial para a detecção sensível de danos no DNA do genoma, descrição da categoria de dano e quantificação de danos de DNA e mecanismos de reparação13. Para detectar células únicas com DNA danificado, o ensaio do cometa é comumente usado em estudos radiobiológicos14. Outros métodos citogenéticos disponíveis reconhecem aberrações cromossômicas, incluindo dicentrics, translocações, fragmentos centrados, anéis e aberrações do tipo cromátide, e danos cromossômicos micronucleos (Mn). O método mais utilizado na radiobiologia, especialmente na dosimetria biológica, é o ensaio do cromossomo dicêntrico devido à sua alta especificidade para radiação15. Por exemplo, o PCR, um método molecular clássico, não pode reconhecer o tipo de dano de DNA detectado. Neste caso, os métodos imunométricos passam o nível de sensibilidade porque as reações são específicas entre o antígeno e o anticorpo. A imagem de imunofluorescência fornece evidências visuais para o aparecimento de diferentes proteínas em focos distintos em resposta a agentes nocivos do DNA como a radiação ionizante16. No entanto, os níveis de ativação dos níveis de mRNA de danos e reparação de proteínas são facilmente detectáveis por PCR em tempo real, que é um método quantitativo adequado para estudos moleculares adicionais no contexto da resposta a danos no DNA17.

Levando em conta que os focos γ-H2AX atraem fatores de reparo18, para monitorar danos e reparos de DNA no nível celular, desenvolvemos um procedimento confiável de coloração de imunofluorescência, baseado na análise dos focos de proteína de reparação representativos da via NHEJ (DNA-PKcs) e Rad52 da via HRR.

Aqui, propomos o uso da imunodetocção para essas proteínas como procedimento eficiente e sensível para o monitoramento da indução e reparação do DNA-DSB. Até agora, não há dados disponíveis sobre DNA-DSBs baseados em focos de proteínas de reparo no nível celular após a irradiação de feixe misto de nêutrons para BNCT, exceto γ-H2AX e 53BP1 marcadores19. Sugerimos a adaptação da linha de células cancerígenas de cólon HCT-116, pois é rica em focos DSBs, como uma linha celular padrão para análise de danos ao DNA, porque os RIFs são facilmente detectáveis. Esta linha celular aderente é fácil de manter e adequada para procedimentos de irradiação. O procedimento proposto baseia-se em uma enorme quantidade de estudos anteriores relacionados ao procedimento geral de imunofluorescência da coloração γ-H2AX. No entanto, inclui todos os detalhes sobre a seleção de anticorpos apropriados com diluições testadas para cada proteína representativa pertencente a cada via de reparo. Além disso, descreve a utilização de um feixe único de nêutrons misturados usado na terapia BNCT. No entanto, recomendamos estender os estudos com ambos os métodos, mancha de imunofluorescência em primeiro lugar e, em seguida, com análise molecular de alto custo, conforme realizado anteriormente4,17.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1. Preparação da cultura celular e configuração experimental

  1. Manter células cancerígenas de cólon humano, HCT-116 conforme recomendado pelo fornecedor, em monocamadas em frascos de cultura de 75 cm2 contendo 10 mL de McCoy's 5a Medium Modified, complementado com soro bovino fetal de 10% e 1% de solução antimíctica antibiótico.
  2. Cultivar células em um ambiente umidificado de 5% de CO2 a 37 °C até 70% de confluência com renovação média a cada 2 a 3 dias.
  3. Para ganhar feixe BNCT (por exemplo, feixe de nêutrons mais 10BPA) e efeito BNCT de matar células cancerígenas como partículas pesadas e depositar a maior parte de sua energia dentro das células cancerígenas contendo boro, um dia antes da irradiação, adicionar agente de entrega de boro ao meio da cultura celular – por exemplo, 10BPA, 4-Borono-L-fenillanina (10 μg 10B/mL, 0,925 mM final) 12-16 h (absorção máxima de boro) antes da irradiação, como estudado anteriormente para células cancerígenas de cólon e células cancerígenas da tireoide20,21.
    NOTA: Se usar outra linha celular, para a qual não existem dados no caso do estudo BNCT, teste a captação de boro para cada linha celular para obter a concentração ideal de boro. Meça a captação celular de 10BPA por espectroscopia de emissão óptica de plasma indutivamente acoplada (ICP-OES) realizada pelo grupo Dagrosa21.
  4. Após 12-16 h de entrega de boro, aspire o meio e lave as células com 10 mL de 1x PBS. Em seguida, tentepsinizar as células adicionando 2 mL de solução Trypsin-EDTA às células e incubar por 5 min a 37 °C para melhorar o descolamento celular. Quando as células começarem a se soltar, pare a ação de trippsina adicionando 10 mL de meio completo.
  5. Aspire a suspensão celular no tubo de 15 mL e conte as células usando um contador automático de células adicionando 10 μL de 0,4% de trippan azul a 10 μL de células, misture e aliquoting 10 μL em um slide de contagem. Diluir a suspensão celular a uma concentração de 1 x 106 células/mL do meio. Alíquota de 1 mL da suspensão celular por crioboto.
  6. Prepare os dosímetros termoluminescentes (TLDs) para a medição de doses de raios gama e folhas de ouro para fluências de nêutrons e conecte TLDs aos criobotos ou frascos de cultura celular antes da irradiação.
  7. Irradiar as células 1 x10 6/mL com o feixe misto de nêutrons no fluxo de nêutrons térmicos recomendado de 5,9 x 1011 (n/cm-2 min−1)4 em frascos de cultura ou criobofos, dependendo das capacidades de instalação.
    NOTA: Configure o tempo de irradiação antes para obter fluxo de nêutrons recomendado.
  8. Após a irradiação, semente 1 mL de células irradiadas (1 x 106 células/mL) em 22 x 22 mm de tampas em placas de Petri de 35 mm ou 6 placas de poço, complemente com 2 mL de meio necessário. Incubar células por um máximo de 3h a 37 °C em um ambiente umidificado de 5% de CO2 para deixá-las anexadas às tampas. Observe a fixação das células de tempos em tempos sob um microscópio invertido com objetivo de 20x.
    NOTA: Para as células HCT-116 a densidade mínima é de 600.000 células para a semente. Para um procedimento de coloração mais rápido use lâminas de câmara, reduza a densidade celular em conformidade.

2. Fixação de células

  1. Após a irradiação e incubação de células, remova o meio das células anexadas e lave as células uma vez com 2,5 mL de PBS.
  2. Fixar células com 1 mL de 70% de etanol por 10 min na RT.
    NOTA: Use alternativamente 1%-3,7% paraformaldeído (PFA) para fixação conforme recomendado anteriormente19. O protocolo está pausado aqui. Armazene células fixas em etanol em um congelador a -20 °C por não mais do que algumas semanas para análise suplementar e coloração de imunofluorescência.

3. Permeabilização das células

  1. Após a fixação retire o etanol da placa de Petri e lave com 2,5 mL de 1x PBS.
    NOTA: Não deixe as células secarem entre as etapas de lavagem.
  2. Adicione suavemente 1 mL de 0,2% de Triton X-100/PBS para cobrir as tampas com células em placas de Petri.
  3. Incubar por 5 min na RT.
  4. Lave as células 3x com 2,5 mL de 1x PBS.
    NOTA: Aumente o percentual de Triton X-100 em PBS até 0,5% se necessário (mais focos detectáveis, dependentes da linha celular testada). Realize lavagens adicionais com PBST (PBS com 0,5% Tween) para evitar a vinculação inespecífica.
  5. Bloco de permeabilização passo com 1 mL de 2% BSA (Bovine Serum Fraction V albumin) diluído em PBS e incubar por um mínimo de 30 min ou 1h com 1% de BSA.
    NOTA: Esta etapa pode ser omitida e depende do tipo de anticorpo utilizado. Alternativamente, use 5% de FBS conforme recomendado no ref4.

4. Mancha de imunofluorescência

  1. Adicione a quantidade adequada de anticorpo primário (Anti-ɣ-H2AX, Anti-DNA-PKcs e Anti-Rad52) diluído em PBS com BSA (2% Bovine Serum Fraction V albumin) conforme recomendado (ver Tabela 1 com diluições recomendadas) (100 μL é necessário por amostra).
Anticorpo primário Função Diluição recomendada armazenamento [°C]
Anti-ɣ-H2AX detecção de DNA-DSBs 1:1000 (PBS-BSA) 4
Anti-DNA-PKcs detecção de RIFs de proteína DNA-PKcs pertencentes ao NHEJ 1:200 (PBS-BSA) -20
Anti-Rad52 detecção de RIFs de proteína Rad52 pertencentes ao HRR 1:200 (PBS-BSA) -20
Anticorpo secundário No escuro
anti-mouse IgG FITC ɣ-H2AX 1:400 (PBS-BSA) 4
Cabra Anti-Coelho IgG H&L (Alexa Fluor 488) para NHEJ e HRR reparar proteínas focos 1:500 (PBS-BSA) -20

Tabela 1: Diluições e notas recomendadas para o uso de anticorpos utilizados na seção 4.

  1. Cubra a placa de Petri para manter a umidade em uma caixa de plástico com lignina hidratada usando água destilada e incubar por 30 min a 37 °C na incubadora.
    NOTA: O protocolo pode ser pausado aqui. A incubação pode ser realizada a 4 °C durante a noite.
  2. Após a incubação realizar 3 lavagens com 2,5 mL de PBS.
    NOTA: Não permita que o slide seque durante as etapas de lavagem.
  3. Adicione a quantidade adequada de anticorpo secundário (anti-mouse IgG FITC, Goat Anti-Rabbit IgG (Alexa Fluor 488) diluído em PBS com BSA (ver Tabela 1) (100 μL é necessário por amostra). Para isso e os seguintes passos funcionam no escuro.
  4. Cubra a placa de Petri novamente para manter a umidade em uma caixa de plástico com lignina hidratada e incubar por 30 min de mínima a 37 °C na incubadora.
  5. Após a incubação realizar 3 lavagens com 2,5 mL de PBS.
  6. Adicione 100 μL de DAPI diluído em PBS a uma concentração final de 1 μg/mL para neutralizar os núcleos.
  7. Incubar em breve, por um máximo de 2 min na RT.
  8. Após a incubação realizar 3 lavagens com 2,5 mL de PBS.
  9. Retire o PBS e coloque delicadamente uma mancha de cobertura na parte superior do meio de montagem, evitando a formação de bolhas de ar e bordas de vedação da tampa com esmalte. Aguarde até que o verniz seque e pinte a tampa ao redor.
  10. Aguarde o endurecimento do meio de montagem (até 3 h) antes da análise da imagem sob microscopia de fluorescência.
    NOTA: O protocolo pode ser pausado aqui. Armazene lâminas de vidro em uma caixa de plástico a 4 °C no escuro.

5. Aquisição e análise de imagens

  1. Adquira imagens com um microscópio de fluorescência abaixo do objetivo de 100x com óleo de imersão.
    1. Analisar os focos nos núcleos com um microscópio de fluorescência equipado com os seguintes filtros para: Alexa Fluor 488: excitação⁄emissão (nm): 496/519, emissão verde; DAPI: excitação⁄emissão (nm): 358⁄461, cor de emissão azul.
      NOTA: A análise de DSBs ao longo de faixas de partículas únicas pode exigir microscopia avançada, como microscopia de varredura a laser confocal com maior resolução.
  2. Salve imagens e processos adquiridos com software de imagem apropriado, por exemplo, ImageJ ou Image Pro3,20.
    NOTA: Recomenda-se o uso de macros e plugins individuais desenvolvidos para análise automática ou desenvolvimento/compra de software bioinforático individual.
  3. Se usar o software Image-Pro para análise de focos, processe imagens em arquivos TIFF: selecione Botão de Contagem/Tamanho e clique em Tipos [escolha o tipo de medição (por exemplo, diâmetro ou área)], clique em Intervalos [alcance definido da medição], clique em Objetos divididos se necessário. Para ajustar o brilho, clique em Bright [ajuste treshold]. Em seguida, clique em Contagem [botão vermelho].
  4. Para exportar dados, clique em Data Table | Estatísticas | Exportar para o Excel. No software de planilha, desenhe gráficos com a análise estatística necessária.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Em primeiro lugar, realizamos uma análise de um marcador padrão de detecção de DNA-DSBs, γH2AX focos em células cancerígenas de cólon, não irradiados e irradiados com o feixe misturado de nêutrons. Os focos γ-H2AX aparecem como pontos fluorescentes distintos e mostram a formação de DNA-DSBs (como cada ponto fluorescente γ-H2AX representa um único DSB) (ver Figura 1).

Figure 1
Figura 1: Imagens representativas de padrões de focos γ-H2AX em células cancerígenas de cólon da linha celular HCT-116 (sem radiação) e após irradiação de feixe misto de nêutrons. A irradiação de feixe misto de nêutrons foi realizada em uma dose de 2,6 Giros em células tratadas no dia anterior com BPA (N+BPA). (A) O painel esquerdo representa a coloração da DAPI dos núcleos. O painel direito, os focos verdes (Alexa 488), corresponde à imunodefecção do γ-H2AX. A seta amarela indica trilha de α-partícula cruzando o núcleo (barra de escala = 10 μm). (B) Diagramas representativos que ilustram o aumento observado no tamanho dos focos induzidos por rádio. A média do diâmetro dos focos γ-H2AX foi realizada automaticamente pelo software Image-Pro. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Curiosamente, em células irradiadas com o feixe misto de nêutrons (N+BPA) em uma dose de aproximadamente 2,6 Gy (1,33 Gy (γ) + 1,26 Gy (N)), observamos níveis de diâmetro mais elevados de γ-H2AX(Figura 1B). Além disso, foi detectada uma única faixa de alta α-partícula LET (por causa da reação nuclear BNCT) cruzando os núcleos da célula (seta amarela)(Figura 1A). Diferentes tipos de radiação poderiam causar diferentes efeitos: quanto maior a radiação LET, mais complexos DNA-DSBs, maiores os focos γ-H2AX e os níveis de área mais altos de proteínas de reparação visíveis como focos induzidos por radiação18.

Por isso, testamos níveis de proteínas representativas de reparação de DNA-PKcs (da via de reparo NHEJ) e Rad52 (da via de RH) por microscopia de imunofluorescência nas mesmas condições, o que não foi realizado antes no caso do feixe BNCT. Conseguimos detectar o alto valor médio do diâmetro dos focos de DNA-PKcs em quebras de DNA após uma mistura de nêutrons em comparação com células de controle (sem radiação) (ver Figura 2).

Figure 2
Figura 2: Imagens representativas de padrões de DNA-PKcs e rad52 reparação de focos em células cancerígenas de cólon da linha celular HCT-116 (sem radiação) e após irradiação de feixe misto de nêutrons. A irradiação de feixe misto de nêutrons foi realizada em uma dose de 2,6 Giros em células tratadas no dia anterior com BPA (N+BPA). (A) O painel esquerdo representa a coloração da DAPI dos núcleos. O painel do meio representa a detecção de focos induzidos por radiação. O painel direito é a imagem mesclada. (B) Diagramas representativos que ilustram o aumento observado no tamanho dos focos induzidos por rádio. A média do diâmetro dos focos Rad52 e DNA-PKcs foi realizada automaticamente usando o software de análise de imagem. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Neste caso, observamos DNA-DSBs agrupados em células HCT-116 irradiadas pelo feixe misturado de nêutrons, pois o DNA-PKcs é específico para focos mais complexos. Em células irradiadas, por feixe misto de nêutrons, esses focos foram observados apenas dentro do núcleo celular como mais complexos, maiores e agrupados com maior intensidade(Figura 2A,B). No caso de Rad52, o efeito não foi tão forte quanto para pkcs de DNA, o que indica o domínio da via NHEJ neste tipo de radiação. Além disso, com base nos dados da literatura, DSBs complexos são lentamente reparados e os PKCs de DNA só são recrutados para DSBs complexos de vida mais longa, o que indica que o feixe misto de nêutrons leva à formação de DSBs complexos e reparos através de DNA-PKcs, no entanto, mais pesquisas são necessárias a um nível molecular para confirmar esses resultados obtidos anteriormente22.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

As frequências de focos, imunoquimicamente manchadas para γ-H2AX e 53BP1 são comumente utilizadas em radiobiologia e estão associadas ao número DNA-DSB e são consideradas como marcadores eficientes e sensíveis para monitorar a indução e reparação de DNA-DSBs19. O procedimento de co-coloração de γ-H2AX e 53BP1 é um procedimento padrão para a detecção de DNA-DSBs. A formação de focos γ-H2AX está associada ao recrutamento de 53BP1, um regulador da resposta a danos de DNA23. No entanto, diferentes linhas celulares podem variar nos níveis de fundo dos focos γ-H2AX /53BP1 11. Foi demonstrado que os focos γ-H2AX atraem fatores de reparo18, acumulando uma maior concentração de proteínas de reparo perto de um local DSB. Quanto mais complexos d-DSBs de DNA, maiores os focos γ-H2AX e maiores os níveis de proteínas de reparação. Ele ativa uma cascata de vias de reparo, se os fatores de reparo estão se acumulando em uma maior concentração em um local DSB, eles são facilmente detectáveis usando anticorpos específicos e o protocolo proposto permite que eles sejam visualizados facilmente. Aqui demonstramos uma metodologia para estudar os efeitos biológicos no nível celular para a terapia BNCT o impacto do feixe misturado de nêutrons no reparo do DNA usando a técnica de imunofluorescência em células cancerígenas de cólon humano. Os autores desenvolveram e introduziram protocolo confiável passo a passo com anticorpos específicos para detectar vias de reparação de DNA baseadas em manchas imunofluorescentes com um anticorpo específico para fatores de reparo da via NHEJ e HRR e focos induzidos por radiação (RIF). Além disso, os autores propõem o uso da linha de células cancerígenas de cólon HCT-116 como uma linha celular padrão para análise de danos de DNA e como linha celular de controle para o teste de anticorpos de reparação de DNA porque esta linha celular é rica em focos de DSBs. Dna-DSBs são facilmente detectáveis, e diferentes linhas celulares, especialmente células cancerosas como a linha celular cervical representam diferentes níveis de fundo de focos H2AX, e intensidade24.

Existem duas etapas críticas importantes no protocolo, fixação de células e procedimento de imunossuagem. Os autores recomendam a fixação de células em 70% de etanol, pois preserva as células por um longo tempo, e é incubado no congelador não mais do que algumas semanas. Além disso, essa etapa é fundamental porque este pode ser ponto de pausa após a realização do procedimento de irradiação, por exemplo, em outra instituição/construção/outro dia. Outro passo crítico é a concentração adequada do anticorpo. Os autores anexaram na tabela as concentrações testadas de anticorpos primários e secundários.

O procedimento apresentado fornece um protocolo passo-a-passo para obter resultados confiáveis, porém, alguns parâmetros podem alterar os resultados dos experimentos, como a escolha adequada dos anticorpos utilizados, diferentes reagentes utilizados para as etapas de fixação e permeabilização, tempo de incubações, percentual crítico de reagentes, etapas de lavagem, trabalho no escuro e microscópio fluorescente adequado. Os autores explicam como obter resultados confiáveis e repetíveis nas notas.

Uma pequena limitação desta técnica é ter acesso à fonte de radiação como fonte de nêutrons, no entanto, o protocolo pode ser usado como um protocolo geral para a detecção de vias de reparação de DNA obtidas após diferentes tipos de radiação e pode ser tratado como protocolo universal para vários tipos de radiação, por exemplo, comparando a ativação de vias de reparo de radiação de baixa LET e alta LET.

Fornecemos uma metodologia universal e pronta para uso que pode ser usada no nível celular para analisar efeitos biológicos no contexto da terapia BNCT. No BNCT, o boro não radioativo-10 (por exemplo, após o tratamento com 4-Borono-L-fenillanina, BPA – agente de entrega de boro) é irradiado com nêutrons térmicos de baixa energia e como resultado da reação nuclear partículas alfa e núcleos de lítio-7 com ALTO LET são produzidos25,26. Portanto, nosso protocolo pode ser útil para a análise de efeitos biológicos a nível celular também para a radiação representada por outros feixes de LET elevados, como prótons usados na terapia de feixe de prótons27, e íons de carbono usados na terapia de hádron28. Observamos que pesquisas mais detalhadas são necessárias no campo da radiação de alta LET e feixes mistos, e o conhecimento do processo de reparação de DNA é necessário para desenvolver terapias anticâncológicas eficazes, portanto, desenvolvemos um protocolo que permite pesquisar a resposta de dano de DNA induzida por radiação ativada pelo feixe misto de nêutrons. Além disso, o método de imunofluorescência de detecção de resposta a danos de DNA e reparação de DNA pode ser um método potencial para avaliação e detecção de tumores.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Os autores não têm nada a revelar.

Acknowledgments

Feixe misto de nêutrons composto de radiação nêutron/gama foi acessado do reator de pesquisa Maria no Centro Nacional de Pesquisa Nuclear na Polônia. K.M.O. foi apoiado pelo National Science Centre, Poland (Miniatura 2) grant no. #2018/02/X/NZ5/02849.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
12 mm Coverslips VWR 89015-725
35 mm Petri dishes Sarstedt 7.183.390.000
4-Borono-L-phenylalanine SIGMA-ALDRICH 17755
Antibiotic-Antimycotic (100X) Gibco 15240062
Anti-DNA PKcs (phospho S2056) antibody - ChIP Grad Abcam AB18192
Anti-Mouse IgG (whole molecule)–FITC antibody produced in goat SIGMA-ALDRICH F0257
Anti-phospho-Histone H2A.X (Ser139) Antibody, clone JBW301 MerckMillipore 05-636
Anti-RAD52 antibody Abcam AB117097
Bovine Serum Albumin Fraction V (BSA) Roche BSAV-RO
DAPI (4',6-Diamidino-2-Phenylindole, Dihydrochloride) ThermoFisher SCIENTIFIC D1306
Fetal Bovine Serum (Heat Inactivated) SIGMA-ALDRICH F9665
Goat Anti-Rabbit IgG H&L (Alexa Fluor 488) Abcam AB150077
HCT-116 cell line ATCC CCL-247™
ImageJ National Institute of Health (NIH) https://imagej.nih.gov/ij/
Image Pro Media cybernetics http://www.mediacy.com/imagepro
LUNA II Automated Cell Counter Logos Biosystems L40002
McCoy’s 5A Medium (Modified, with L-glutamine and sodium bicarbonate) SIGMA-ALDRICH M9309
microscope slides ThermoFisher SCIENTIFIC B-1198
Phosphate Buffered Saline (PBS) Hirszfeld Institute of Immunology and Experimental Therapy, PAS 20.59.52.0
Triton X-100 SIGMA-ALDRICH X100
Trypan Blue Stain, 0.4% Logos Biosystems T13001
Trypsin-EDTA solution 0.25% SIGMA-ALDRICH T4049

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Carter, R. J., et al. Complex DNA Damage Induced by High Linear Energy Transfer Alpha-Particles and Protons Triggers a Specific Cellular DNA Damage Response. International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics. 100 (3), 776-784 (2018).
  2. Kondo, N., et al. DNA damage induced by boron neutron capture therapy is partially repaired by DNA ligase IV. Radiation Environmental Biophysics. 55 (1), 89-94 (2016).
  3. Sakai, W., Sugasawa, K. DNA Damage Recognition and Repair in Mammalian Global Genome Nucleotide Excision Repair. DNA Replication, Recombination, and Repair: Molecular Mechanisms and Pathology. , Springer. Tokyo. 155-174 (2016).
  4. Rodriguez, C., et al. In vitro studies of DNA damage and repair mechanisms induced by BNCT in a poorly differentiated thyroid carcinoma cell line. Radiation Environmental Biophysics. 57 (2), 143-152 (2018).
  5. Sollazzo, A., et al. Live Dynamics of 53BP1 Foci Following Simultaneous Induction of Clustered and Dispersed DNA Damage in U2OS Cells. International Journal of Molecular Sciences. 19 (2), (2018).
  6. Jeggo, P., Löbrich, M. Radiation-induced DNA damage responses. Radiation Protection Dosimetry. 122 (1-4), 124-127 (2006).
  7. Sigurdsson, S., Van Komen, S., Petukhova, G., Sung, P. Homologous DNA pairing by human recombination factors Rad51 and Rad54. The Journal of Biological Chemistry. 277 (45), 42790-42794 (2002).
  8. Choi, E. H., Yoon, S., Hahn, Y., Kim, K. P. Cellular Dynamics of Rad51 and Rad54 in Response to Postreplicative Stress and DNA Damage in HeLa Cells. Molecules and Cells. 40 (2), 143-150 (2017).
  9. Burma, S., Chen, B. P., Murphy, M., Kurimasa, A., Chen, D. J. ATM phosphorylates histone H2AX in response to DNA double-strand breaks. The Journal of Biological Chemistry. 276 (45), 42462-42467 (2001).
  10. Nakamura, T. M., Du, L. L., Redon, C., Russell, P. Histone H2A phosphorylation controls Crb2 recruitment at DNA breaks, maintains checkpoint arrest, and influences DNA repair in fission yeast. Molecular and Cellular Biology. 24 (14), 6215-6230 (2004).
  11. Kuo, L. J., Yang, L. X. Gamma-H2AX - a novel biomarker for DNA double-strand breaks. In Vivo. 22 (3), 305-309 (2008).
  12. Sage, E., Shikazono, N. Radiation-induced clustered DNA lesions: Repair and mutagenesis. Free Radical Biology and Medicine. 107, 125-135 (2017).
  13. Boguszewska, K., Szewczuk, M., Urbaniak, S., Karwowski, B. T. Review: immunoassays in DNA damage and instability detection. Cellular and Molecular Life Sciences. 76 (23), 4689-4704 (2019).
  14. Møller, P., et al. Potassium bromate as positive assay control for the Fpg-modified comet assay. Mutagenesis. , geaa011 (2020).
  15. Sommer, S., Buraczewska, I., Kruszewski, M. Micronucleus Assay: The State of Art, and Future Directions. International Journal of Molecular Sciences. 21 (4), 1534 (2020).
  16. Bennett, B. T., Bewersdorf, J., Knight, K. L. Immunofluorescence imaging of DNA damage response proteins: optimizing protocols for super-resolution microscopy. Methods. 48 (1), 63-71 (2009).
  17. Cheng, L., et al. Simultaneous induction of dispersed and clustered DNA lesions compromises DNA damage response in human peripheral blood lymphocytes. PLoS One. 13 (10), 0204068 (2018).
  18. Paull, T. T., et al. A critical role for histone H2AX in recruitment of repair factors to nuclear foci after DNA damage. Current Biology. 10 (15), 886-895 (2000).
  19. Okumura, K., et al. Relative biological effects of neutron mixed-beam irradiation for boron neutron capture therapy on cell survival and DNA double-strand breaks in cultured mammalian cells. Journal of Radiation Research. 54 (1), 70-75 (2013).
  20. Dagrosa, M. A., et al. First evaluation of the biologic effectiveness factors of boron neutron capture therapy (BNCT) in a human colon carcinoma cell line. International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics. 79 (1), 262-268 (2011).
  21. Dagrosa, A., et al. Studies for the application of boron neutron capture therapy to the treatment of differentiated thyroid cancer. Applied Radiation and Isotopes. 69 (12), 1752-1755 (2011).
  22. Reynolds, P., et al. The dynamics of Ku70/80 and DNA-PKcs at DSBs induced by ionizing radiation is dependent on the complexity of damage. Nucleic Acids Research. 40 (21), 10821-10831 (2012).
  23. Rasche, L., et al. Analysis of Lymphocytic DNA Damage in Early Multiple Sclerosis by Automated Gamma-H2AX and 53BP1 Foci Detection: A Case Control Study. PLoS One. 11 (1), 0147968 (2016).
  24. Banáth, J. P., Macphail, S. H., Olive, P. L. Radiation sensitivity, H2AX phosphorylation, and kinetics of repair of DNA strand breaks in irradiated cervical cancer cell lines. Cancer Research. 64 (19), 7144-7149 (2004).
  25. Barth, R. F., et al. Current status of boron neutron capture therapy of high grade gliomas and recurrent head and neck cancer. Radiatiation Oncology. 7, 146 (2012).
  26. Mirzaei, H. R., et al. Boron neutron capture therapy: Moving toward targeted cancer therapy. Journal of Cancer Research and Therapeutics. 12 (2), 520-525 (2016).
  27. Vitti, E. T., Parsons, J. L. The Radiobiological Effects of Proton Beam Therapy: Impact on DNA Damage and Repair. Cancers. 11 (7), Basel. 946 (2019).
  28. Mohamad, O., et al. Carbon Ion Radiotherapy: A Review of Clinical Experiences and Preclinical Research, with an Emphasis on DNA Damage/Repair. Cancers. 9 (6), Basel. 66 (2017).

Tags

Pesquisa do Câncer Questão 160 BNCT DNA-DSBs focos induzidos por radiação danos ao DNA vias de reparo feixe misto
Imagens de imunofluorescência de dna dano e reparo de focos em células cancerígenas de cólon humano
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Maliszewska-Olejniczak, K.,More

Maliszewska-Olejniczak, K., Dróżdż, A., Waluś, M., Dorosz, M., Gryziński, M. A. Immunofluorescence Imaging of DNA Damage and Repair Foci in Human Colon Cancer Cells. J. Vis. Exp. (160), e61399, doi:10.3791/61399 (2020).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter