In Silico Ensayos clínicos para enfermedades cardiovasculares

Resumen

Este protocolo demuestra el flujo de trabajo de la plataforma SILICOFCM para generar automáticamente un modelo paramétrico del ventrículo izquierdo a partir de imágenes de ultrasonido específicas del paciente mediante la aplicación de un modelo electromecánico multiescala del corazón. Esta plataforma permite ensayos clínicos in silico destinados a reducir los ensayos clínicos reales y maximizar los resultados terapéuticos positivos.

Resumen

El proyecto SILICOFCM tiene como objetivo principal desarrollar una plataforma computacional para ensayos clínicos in silico de miocardiopatías familiares (MCA). La característica única de la plataforma es la integración de datos biológicos, genéticos y de imágenes clínicas específicos del paciente. La plataforma permite probar y optimizar el tratamiento médico para maximizar los resultados terapéuticos positivos. Por lo tanto, se pueden evitar los efectos adversos y las interacciones farmacológicas, se puede prevenir la muerte súbita cardíaca y se puede acortar el tiempo entre el inicio del tratamiento farmacológico y el resultado deseado. Este artículo presenta un modelo paramétrico del ventrículo izquierdo generado automáticamente a partir de imágenes de ultrasonido específicas del paciente mediante la aplicación de un modelo electromecánico del corazón. Los efectos del fármaco se prescribieron a través de condiciones límite específicas para el flujo de entrada y salida, las mediciones de ECG y la función del calcio para las propiedades del músculo cardíaco. Los datos genéticos de los pacientes se incorporaron a través de la propiedad material de la pared del ventrículo. El análisis de vista apical implica segmentar el ventrículo izquierdo utilizando un marco U-net previamente entrenado y calcular el rectángulo limítrofe basado en la longitud del ventrículo izquierdo en el ciclo diastólico y sistólico. El análisis de la vista de modo M incluye el borde de las áreas características del ventrículo izquierdo en la vista de modo M. Después de extraer las dimensiones del ventrículo izquierdo, se generó una malla de elementos finitos basada en opciones de malla, y se ejecutó una simulación de análisis de elementos finitos con velocidades de entrada y salida proporcionadas por el usuario. Los usuarios pueden visualizar directamente en la plataforma varios resultados de simulación, como diagramas de presión-volumen, presión-deformación y miocardio de tiempo de trabajo, así como animaciones de diferentes campos como desplazamientos, presiones, velocidad y tensiones de cizallamiento.

Introducción

El rápido desarrollo de tecnologías de la información, paquetes de software de simulación y dispositivos médicos en los últimos años brinda la oportunidad de recopilar una gran cantidad de información clínica. Por lo tanto, la creación de herramientas computacionales completas y detalladas se ha vuelto esencial para procesar información específica a partir de la abundancia de datos disponibles.

Desde el punto de vista de los médicos, es de suma importancia distinguir fenotipos "normales" de "anormales" en un paciente específico para estimar la progresión de la enfermedad, las respuestas terapéuticas y los riesgos futuros. Modelos computacio....

Protocolo

El protocolo de este estudio fue aprobado por el Comité de Ética de Investigación de Investigación de Salud de la Autoridad de Investigación del Servicio Nacional de Salud del Reino Unido North East-Tyne & Wear South con el número de referencia 18 / NE / 0318 el 6 de febrero de 2019 y fue adoptado por la Junta de Revisión Institucional de cada centro participante. El estudio se realizó dentro de los principios de las Buenas Prácticas Clínicas y siguiendo la Declaración de Helsinki. Se obtuvo el consentimiento informado de todos los sujetos involucrados en el estudio. La información del paciente se mantiene anónima.

1. Flujo de trabajo....

Resultados

Como ejemplo, el flujo de trabajo para el análisis de imágenes DICOM en modo M de ultrasonido y la extracción de parámetros LV se presenta en la Figura 1. El modo M y la vista apical podrían probarse por separado o una tras otra, dependiendo de los parámetros de interés. Si se prueban uno tras otro, los resultados se anexan a un archivo común (por separado para las fases de sístole y diástole). Si solo se prueba una vista, los valores de los parámetros desconocidos se toman de la entrada de .......

Discusión

El proyecto SILICOFCM es una plataforma de ensayos clínicos in silico para diseñar poblaciones virtuales de pacientes para la predicción de riesgos, probar los efectos del tratamiento farmacológico y reducir los experimentos con animales y los ensayos clínicos en humanos. La prueba de los efectos del tratamiento farmacológico se modeló con las condiciones prescritas de flujo límite de entrada / salida, la función del calcio y las propiedades de la pared del material. Esta plataforma integra métodos multiescala a.......

Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo

Nombre	Empresa	Número de catálogo	Comentarios
	SILICOFCM	www.silicofcm.eu	acceso abierto para usuarios registrados

Proyecto