प्रोटीन अलग actin बाध्यकारी मॉड्यूल के माध्यम से filamentous actin (एफ actin) करने के लिए बाध्य. इस वीडियो में हम actin की प्रक्रिया सह अवसादन है, जो इन विट्रो परख में एक नियमित रूप से प्रोटीन या विशिष्ट डोमेन है कि एफ actin बाँध का विश्लेषण किया जाता है प्रदर्शित करता है.
Abstract
सेल के भीतर actin cytoskeleton actin filaments के एक नेटवर्क है कि कोशिकाओं और सेलुलर प्रक्रियाओं के आंदोलन की अनुमति देता है है, और है कि तनाव उत्पन्न करता है और मदद करता है सेलुलर आकार रखता है. हालांकि actin cytoskeleton एक कठोर संरचना है, यह एक गतिशील संरचना है कि लगातार remodeling है. प्रोटीन का एक संख्या actin cytoskeleton करने के लिए बाध्य कर सकते हैं. एफ actin के लिए एक विशेष प्रोटीन के बंधन अक्सर सेल जैविक टिप्पणियों का समर्थन या आगे actin cytoskeleton की remodeling के कारण गतिशील प्रक्रियाओं को समझने के लिए वांछित है. actin परख सह – अवसादन इन विट्रो परख में एक नियमित रूप से एफ actin के साथ विशिष्ट प्रोटीन या प्रोटीन डोमेन के बंधन का विश्लेषण करने के लिए प्रयोग किया जाता है. परख के बुनियादी सिद्धांतों के हित के प्रोटीन का एक ऊष्मायन (पूर्ण लंबाई या डोमेन) एफ actin के साथ, गोली और प्रोटीन एफ actin के साथ सह – sedimenting के एफ actin के विश्लेषण के लिए ultracentrifugation कदम शामिल है. Actin सह अवसादन assays के अनुसार बनाया जा सकता है actin बाध्यकारी समानताएं और प्रतियोगिता assays के उपाय.
Protocol
1. Actin की तैयारी इस परख में इस्तेमाल किया actin के स्रोत गैर मांसपेशी मानव (β-actin) प्लेटलेट्स cytoskeleton इंक स्टॉक aliquots 10 मिलीग्राम / एमएल -70 º सी फ्रीजर में रखा जाता है से प्राप्त किया गया था. परख के लिए, actin 0.4 मिलीग…
Discussion
सह – अवसादन actin इन विट्रो परख में एक सरल specfic एफ actin बंधनकारी प्रोटीन का विश्लेषण है. इस वीडियो में, हम कैसे एक साधारण सह अवसादन actin के बाहर किया जा सकता है एक उदाहरण प्रदर्शित करता है. हम बताते हैं कि कैसे एफ actin तैयार करन…
Acknowledgements
आप HaCAT कोशिकाओं में actin की फिल्म के लिए UCSF में Wittman प्रयोगशाला में डा. प्रवीण कुमार के लिए धन्यवाद.
Lee, H., Bellin, R. M., Walker, D. L., Patel, B., Powers, P., Liu, H., Garcia-Alvarez, B., de Pereda, J., Liddington, R. C., Volkmann, N., Hanein, D., Critchley, D. R., Robson, R. M. Characterization of an Actin-binding Site within the Talin FERM Domain.J Mol Biol. 22, 771-784 (2004).
Srivastava, J., Barber, D. Actin Co-Sedimentation Assay; for the Analysis of Protein Binding to F-Actin. J. Vis. Exp. (13), e690, doi:10.3791/690 (2008).