-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Encyclopedia of Experiments
Cancer Research
CUBIC Tabanlı Protein Ekspresyonunun Görselleştirilmesi: Tam Kalınlıkta Fare Derisi Biyopsilerind...
CUBIC Tabanlı Protein Ekspresyonunun Görselleştirilmesi: Tam Kalınlıkta Fare Derisi Biyopsilerind...
Encyclopedia of Experiments
Cancer Research
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
Encyclopedia of Experiments Cancer Research
CUBIC-based Protein Expression Visualization: A Procedure for Visualizing Protein Expression in Full Thickness Mouse Skin Biopsies

CUBIC Tabanlı Protein Ekspresyonunun Görselleştirilmesi: Tam Kalınlıkta Fare Derisi Biyopsilerinde Protein Ekspresyonunun Görselleştirilmesi İçin Bir Prosedür

Protocol
1,211 Views
05:50 min
April 30, 2023
AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Transcript

- Deri, birden fazla katman halinde düzenlenmiş çeşitli hücre popülasyonlarından oluşan karmaşık bir organdır. Doku temizleme tabanlı üç boyutlu bir görüntüleme tekniği olan CUBIC, tüm cilt biyopsilerini kullanarak bu cilt hücrelerinin içindeki protein ekspresyon modellerini görselleştirmeye yardımcı olur. Ötenazi yapılmış bir fare alarak ve sırt boyun bölgesindeki tüyleri alarak başlayın. Bir parça deri kesin ve küçük parçalar halinde kesin.

Parçaları bir CUBIC1 temizleme çözeltisine batırın ve inkübe edin. Deri hücreleri, ışık saçılımına neden olan kromoforların ve lipitlerin varlığı nedeniyle şeffaf değildir. CUBIC solüsyonundaki kimyasallar bu molekülleri uzaklaştırır, böylece ışık saçılımını azaltır ve dokuyu şeffaf hale getirir.

Daha sonra, dokuyu, cilt hücrelerinde eksprese edilen hedef hücre içi proteinlerine spesifik olarak bağlanan istenen birincil antikorlarla tedavi edin. Ayrıca, protein-primer antikor komplekslerine bağlanan floresan etiketli ikincil antikorlarla tedavi edin. Dokuya, çekirdeği boyayan DNA bağlayıcı bir boya ile karşı boyayın.

Son olarak, numuneyi bir CUBIC2 çözeltisine daldırın. Solüsyon, doku içindeki ışık saçılımını daha da azaltarak onu görüntüleme için daha şeffaf hale getirir. Üç boyutlu numunede floresan etiketli ilgi alanlarını görselleştirmek için konfokal mikroskop altında gözlemleyin. Aşağıdaki protokol, CUBIC protokolü kullanılarak tüm mount deri biyopsilerinde keratinosit proliferasyon belirteçlerinin ekspresyonunun görüntülenmesine izin verir.

- Ötenazi uygulanmış bir farenin boynundan kılları tıraş etmek için düzelticiler kullanarak başlayın ve cildi yaralamamaya dikkat edin. Ardından, cildi PBS'de% 70 etanol ile dekontamine edin. Daha sonra, sırt boynu derisini forseps ile kaldırın ve yaklaşık 1,5 x 4 santimetrelik bir dorsal fare derisi alanını çıkarmak için makas kullanın. Daha sonra, dermis tarafı aşağı bakacak şekilde cildi bir parça filtre kağıdı üzerine düzleştirin, numunenin ön-arka oryantasyonunu not edin ve kağıdı diseke edilen cildin etrafında kesin.

- Optimum görüntüleme için, cilt örneklerinin tutarlı saç folikülü oryantasyonu ile düz kalması gerekir. Numuneleri uygun bir antero-posterior pozisyonda tutmak için, cilt parçalarını dikdörtgen biyopsilerde filtre kağıdına sabitliyoruz.

- Numuneleri PBS'de taze hazırlanmış% 4 PFA ile doldurulmuş 15 mililitrelik bir tüpe aktarın. Daha sonra, filtre kağıdına sıkıca sabitlendiklerinde, numuneleri 5 dakikalık iki yıkama için 15 mililitrelik yeni bir PBS tüpüne aktarın.

İkinci yıkamadan sonra cilt biyopsilerini temizlemek için, dokuları yaklaşık 0,2 x 0,5 santimetrelik parçalar halinde kesmek için keskin bir tıraş bıçağı kullanın ve numunelerin uzun kenarlarının numunelerin ön-arka yönü boyunca kesilmesine dikkat edin.

- Biyopsinin uzun tarafının saç foliküllerinin yönüne paralel olarak kesilmesi de geniş saç folikülü hasarının önlenmesine yardımcı olur.

- Daha sonra, biyopsileri 5 mililitre taze hazırlanmış CUBIC1 temizleme solüsyonuna 15 mililitrelik yeni bir tüpe daldırın ve tüpü 37 santigrat derecede bir hibridizasyon fırınında dönen bir platform üzerine yerleştirin. Doku parçaları şeffaf hale geldikten sonra, biyopsileri 4 mililitre PBS'de 37 santigrat derecede 6 saatlik dört yıkama için yıkayın, ardından PBS'de hacim başına %20 ağırlıkta 4 saatlik 37 santigrat derece yıkama yapın.

İnkübasyonun sonunda, dokuların antikor penetrasyonuna geçirgenliğini artırmak için her bir numuneyi ayrı ayrı 15 mililitrelik tüplerde gece boyunca eksi 80 santigrat derecede optimum kesme sıcaklığı bileşiğinde dondurun.

Ertesi sabah, cilt örneklerini uygun antikorlar ve ilgilenilen hayati boyalarla boyayın. Daha sonra, numuneleri 1 mililitre taze hazırlanmış CUBIC2 temizleme solüsyonunda 2 mililitrelik tüplerde bir çalkalayıcı üzerinde 37 santigrat derece fırında 24 saat boyunca dokuların kırılma indisini eşitleyene kadar inkübe edin.

Dokular temiz olduğunda, biyopsileri, saç folikülü büyüme yönü kapak kayma yüzeyine paralel olacak şekilde, tek tek cam örtü kızaklarının uzun kenarı boyunca konumlandırın. Dokunun üzerine bir damla CUBIC2 solüsyonu damlatın. Bir kapak kızağı üzerine iki adet 1 milimetre x 2 santimetre mavi raptiye şeridi yerleştirin. Ardından, biyopsiyi ikinci bir kapak fişi ile örtün.

Ardından, görüntüleme odasını konfokal bir mikroskop aşamasına yerleştirin ve dokuyu ışık yoluna taşıyın. Uygun ışık kaynağını ve standart epifloresan filtrelerini kullanarak, floresan lekeli ilgili bölgeleri belirlemek için numuneyi tarayın. Ardından, ilgilenilen bölgelerin floresan konfokal görüntülerini elde edin.

Key Terms and Definitions

  • CUBIC - A tissue clearing and three-dimensional imaging technique for cell visualization.
  • CUBIC2 - The solution used to further reduce light scattering, enhances tissue transparency.
  • Protein Visualization - Process of marking proteins to visually track their expression levels.
  • 3D Sample - Biological sample that can be analyzed in three dimensions.
  • CUBIC cleared mouse - Mouse skin sample that's been made transparent by the CUBIC technique.

Scientific Background

  • Introduce CUBIC - Transparentizes tissue for 3D imaging of cellular proteins (e.g., cubic2).
  • Key Concepts - Uses specific chemical solutions to remove light scattering molecules (e.g., theory).
  • Underlying Mechanisms - Marker proteins and DNA-binding dyes are used for visualization.
  • Connect to Experiment - Describes a step by step procedure of utilizing CUBIC method on mouse skin samples.

Questions that this video will help you answer

  • What is the CUBIC and CUBIC2 method and how to make tissue transparent for imaging?
  • What are the key concepts behind skin tissue clearing and protein visualization?
  • How does the addition of marker proteins and DNA-binding dye aid in cellular visualization?

Applications and Relevance

  • Practical Applications - CUBIC method assists in studying skin cell's protein expression (e.g., protein visualization).
  • Industry Impact - Biomedical industry benefitting from 3D imaging of cells (e.g., healthcare).
  • Societal Importance - Enhanced understanding of cell structure and function (e.g., cubic_video).
  • Link to Scientific Advancements - Advances in 3D imaging and pathology analysis.

Related Videos

Kullanımı Netlik Fare Omurilik içinde Serotonerjik Elyaf Görüntüleme / KÜBİK Tekniği

09:54

Kullanımı Netlik Fare Omurilik içinde Serotonerjik Elyaf Görüntüleme / KÜBİK Tekniği

Related Videos

10.7K Views

İnsan pankreas nöro-ada ağının yüksek çözünürlükte 3D görüntüleme

09:54

İnsan pankreas nöro-ada ağının yüksek çözünürlükte 3D görüntüleme

Related Videos

11.2K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code