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Biology

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JoVE Journal Biology
A Novel Bayesiana Algoritmo de Mudança-ponto para Genome-wide Análise de tipos de dados ChIPseq Diversos
An Anoxia-starvation Model for Ischemia/Reperfusion in C. elegans
Journal (Biology)
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Using the optokinetic response to study visual function of zebrafish
Journal (Biology)
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A Novel Bayesiana Algoritmo de Mudança-ponto para Genome-wide Análise de tipos de dados ChIPseq Diversos

Article DOI: 10.3791/4273-v • 12:39 min • December 10th, 2012
December 10th, 2012 •
1, 1,2, 1,2, 2,3
1Department of Applied Mathematics & Statistics, Stony Brook University, 2Computational Biology and Bioinformatics, Cold Spring Harbor Laboratory, 3Department of Molecular and Cell Biology, University of Texas at Dallas

Chapters

Summary
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Nosso ponto de mudança Bayesiana (BCP) algoritmo baseia-se no estado-da-arte avanços em modelagem de mudanças de pontos através de modelos ocultos de Markov e os aplica a cromatina imunoprecipitação seqüenciamento (ChIPseq) análise de dados. BCP executa bem em tipos de dados ampla e pontuada, mas supera em identificar com precisão robustos, ilhas reproduzíveis de enriquecimento histona difusa.

Tags

Genética Edição 70 Bioinformática Biologia Genômica Molecular Biologia Celular Imunologia Cromatina imunoprecipitação Chip-Seq modificações de histonas segmentação Bayesianas modelos ocultos de Markov a epigenética
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