Brillouin Spektroskopisi için Ekstraselüler Matriks Proteini Elyaf Hazırlama

1School of Physics and Astronomy, University of Exeter, 2Department of Physics and Geology, University of Perugia, 3Istituto Officina dei Materiali del CNR, Unità di Perugia
Published 9/15/2016
0 Comments
  CITE THIS  SHARE 
Bioengineering
 

Summary

Cite this Article

Copy Citation

Edginton, R. S., Mattana, S., Caponi, S., Fioretto, D., Green, E., Winlove, C. P., et al. Preparation of Extracellular Matrix Protein Fibers for Brillouin Spectroscopy. J. Vis. Exp. (115), e54648, doi:10.3791/54648 (2016).

Please note that all translations are automatically generated.

Click here for the english version. For other languages click here.

Abstract

Introduction

Brillouin ışık saçılması (TYD) etkisi bir malzemede termal olarak aktive edilmiş akustik fononların görünür ışığın esnek olmayan saçılma oluşur 1922 yılında 1 Léon Brillouin tarafından keşfedilmiştir. Katı hal fiziği ise, akustik fononlar bir kafes içinde tüm atomların tutarlı titreşimler vardır. Bir kafes içinde atomların iki alternatif türlerinin tek boyutlu zincir IR absorpsiyon ve Raman saçılması (Şekil 1) probed BLS tarafından ortaya akustik fononların, ve optik fononların arasındaki farkı gösteren basit bir modeldir. Optik Fononlar atomların dışı faz hareketler iken akustik fononlar, (boyuna akustik fononlar) ya da yayılma yönüne (enine akustik fononlar) dik yayılma doğrultusu boyunca bir deplasman zinciri içindeki atom faz-hareketler salınımlı elektrik dipol momenti üreten (boyuna veya enine mod).

BLS spectroskopi 1920'lerden beri analitik bilim kullanılmıştır; Ancak, 1980'lerde tek beri yüksek kontrast ölçümleri tandem multipass Fabry-Perot spektrometresi kullanımı ile mümkün. O zamandan beri, 2-4 ve manyetik malzemeler (foton-magnon etkileşimi yoluyla) (foton-fonon etkileşmesi istismar edilir) Yoğun madde analitik uygulamalar için TYD gelişmelerin giderek artan sayıda yaklaşık 5 getirilmiştir. Biyomedikal uygulamalarda 6-8 seminal eserler burada uygulanan bir ve esnekliği tansörünün tam açıklamasını ulaşmak için trombosit benzeri konfigürasyonda bir yansıtıcı substrat kullanılarak önceden 9 açıklanan dahil olmak üzere, çeşitli yaklaşımların geliştirilmesi rotayı açmıştır Bir örnek.

Bu çalışmada, biz, lifli proteinler elastin bağ dokusunda hücre dışı matriks temel bileşenlerinin TYD spektroskopi uygulamak ve ben-kollajen yazın. TI kolajen ype örneğin tendon gibi dokularda, esas itibariyle katı lifler oluşturmak için kapsamlı çapraz bağlama ile yanal ve boylamsal olarak monte sert, üçlü sarmal bir moleküldür. kollajen ağları genellikle elastin ağları ile, alışılmadık, entropi ve çevresi ile hidrofobik etkileşimlerin bir kombinasyonu yoluyla uzun menzilli elastikiyetini üretir ve bu tür akciğer ve deri gibi dokuların fonksiyonları için gerekli olan bir protein bir arada yaşıyor. Her iki lifler güncel araştırma bir altıgen kristal modeli kullanılarak modellenmiştir. 9 bölüm 1, biz hayvan dokularından lifleri ayıklamak ve spektroskopik ölçümler için numune hazırlamak için protokol açıklar. part 2, Brillouin cihazı kurma ve elyaftan spektrumları elde etmek için prosedür sunulmuştur. Part 3 burada yer alan ilgili mekanik bilgileri ayıklamak için Brillouin spektrumları uygulanan veri analizi ayrıntılarını verir. Ardından, temsili sonuçlar sunulmuş ve Tartışılan vardırd.

Protocol

Dikkat: Biyolojik güvenlik protokolleri ve kullanılmadan önce ilgili tüm malzeme güvenlik bilgi formlarını (MSDS) danışın. Bu deneylerde kullanılan lazer sınıfı 3B lazer olduğu; Sistemin güvenli bir kullanım için yerel kurallara uyulması gereklidir. kişisel koruyucu ekipman (koruyucu gözlük) kullanımı da dahil olmak üzere lazer spektroskopisi ölçümü yaparken tüm uygun güvenlik uygulamalarını kullanın.

Kuyruk tendonlar AB düzenlemelerine 1099/2009 uyarınca ve Hayvanların Refahı (kesim veya öldürme) 1995 Sığır ense ligament yerel bir mezbahaya elde edilen Yönetmelikte başka amaçlar için ötenazi 7-8 haftalık Wistar sıçanların elde edilmiştir.

Örnek Elyaf hazırlanması 1.

Not: hücre dışı matrisin protein liflerin farklı prosedürler kullanılarak, çeşitli dokulardan elde edilebilir. Protokoller yaygın uygulanan prosedürlere dayanan rafine edildi.

  1. Vücut ağırlığı, sodyum pentobarbıton 100 mg / kg intraperitonal enjeksiyon ile bir sıçan Kurban. Sonra tek kenar jilet ile bastırarak, vücut ile temas noktasında doğrudan kuyruk sever. ince film kuyruk sarın ve gerekene kadar -20 ° C'de dondurulur saklayın.
  2. Dondurucu kuyruk toplamak yine oda sıcaklığında fosfat tamponlu serum fizyolojik (PBS) çözeltisi (pH 7.4) ile doldurulmuş bir petri tabağına çözülme bırakın, sonra dondurulmuş ve iken yakın ucundan 20 mm uzunluğunda bir bölümü kesilmiş.
  3. kuyruk çözülmüş sonra, cildi bölmek için bir neşter kullanılarak segmentin uzunluğu boyunca bir kesi yapmak. Sonra kuyruk omur dört kılıflı tendon demetleri ortaya çıkarmak için geri soyma.
  4. Ince forseps kullanarak ve herhangi bir ön gerginlik uygulamak için dikkatli olmak, pr yavaşça kılıf dışına her lif çekmek ve v sodyum asid w /% 0.01 ile distile su içeren bir şişede (NaN 3) için koyunolay bakteriyel büyüme ve mağaza buzdolabında. Tek bir kuyruk etrafında otuz tendon lifleri verir.
  5. I kolajen saf lifli türü elde etmek için, proteoglikanlar ve diğer tüm nonkollagenöz malzemeyi çıkarmak için tendon liflerine üç bölüm enzimatik sindirim sürecini 10 uygulanır.
    1. Önce, 200 rpm'de bir çalkalama inkübatöründe 37 ° C'de 24 saat süre ile, pH 8.0, 0.05 M Tris-tamponu, 0.06 M sodyum asetat (CH3 COONa) 0,125 U / ml kondroitinaz ABC lifleri bırakın.
    2. Daha sonra, pH 6.0'da 0.05 M Tris tamponu, 0.15 M sodyum klorür (NaCI) 'de 1 U / ml streptomis hyaluronidaz lifleri sokmak ve 37 ° C'de 24 saat boyunca çalkalama inkübatöründe dönün.
    3. Son olarak, 37 ° C'de çalkalama inkübatöründe 16 saat pH 7.2'de 0.05 M sodyum fosfat (NaHPO 4) ve 0.15 M NaCl tripsin, 1 mg / ml lifleri bırakın.
  6. damıtılmış su ihtiva eden viyaller içinde soğutulmuş saflaştırılmış elyafı depolayacaktır wiÖlçüm için gerekene kadar inci% 0.01 NaN3 bakteriyel büyümeyi önlemek için.
  • Sığır ense ligament gelen elastin liflerin Ekstraksiyon
    1. , Mezbahaya sığır ense ligament elde sarılmak film sarın ve kullanılana kadar -20 ° C'de dondurulmuş saklayın.
    2. Saf elastin üretmek için, dondurucu bağ toplamak aşağıdaki gibi, Lansing edilen prosedüre göre bir kaynar su banyosu içinde 11 bağ, oda sıcaklığında çözülme bir neşter kullanarak bozabilir ve sindirimi için izin verir.
      1. damıtılmış su içinde bir sodyum hidroksit (NaOH) içindeki bir 0.1 M çözelti hazırlayın ve dokuları kapsayan konik bir şişe içinde yağdan arındırılmış bağ ekleyin.
      2. 45 dakika boyunca 95 ° C'de bir su banyosu içinde balon kaynatın.
      3. sindirim şişesi ligament çıkarın ve pH 7.0 (pH metre kullanılarak izlenmiştir) elde edilinceye kadar damıtılmış su içinde sürekli olarak çözünmeyen doku bloğu yıkayın.
      4. Nihai doku kaldırmakçözelti yıkama ve kapalı bir kap içinde (bakteri büyümesini önlemek için,% 0.01 NaN3 ile karışık) ve buzdolabında saklayın damıtılmış su içinde daldırın.
    3. Buzdolabından doku toplamak ve daha büyük blok (uzun 20 50 mm, yaklaşık 2 mm kalınlığında) uzakta hafifçe daha küçük elastin kesimleri çekmek için çok fazla kuvvet ve ön gerginlik, kullanım cımbız uygulamak için dikkatli olmak ve koyun PBS çözeltisi (pH 7.4) içeren bir Petri kabı.
    4. Ince forseps kullanarak, yavaşça 1 mm kalınlığında çevresinde küçük lif demetleri alay ve bir neşter kullanılarak birkaç mm uzunlukta kesin.
    5. (Bakteri büyümesini önlemek,% 0.01 NaN3) ile ve ölçüm için gerekli kadar bunları buzdolabında saklayın damıtılmış su ihtiva eden şişelere lifleri aktarın.
  • Yansıtıcı tabaka üzerine lifleri Montaj
    1. Bir elmas kesici kullanılarak, yansıtıcı silikon slayt bir parça kesti.
    2. Bir hidratlanmış compartme oluşturmak içinnt, (bir elyafın sığacağı kadar geniş) merkezinde içi boş bir kesim ile silikon slayt üzerinde uygun ve silikon alt-tabaka üzerine yerleştirmek için Parafilm bir şerit kesilir.
      Not: Adım 1.3.4 mühürlü, dört tarafın bir havaya açık kalır, böylece kuru elyaf ölçümler için, U-biçimli bir parafilm kesilir.
    3. Depolama çözeltisinden tek bir lifin toplamak ve örnek yıkamak için 5 dakika boyunca oda sıcaklığında saf su dolu küçük bir Petri tabağına yerleştirin ince forseps bir çift kullanımı, buzdolabı lifleri çıkarın. Sonra, lif toplamak ve silikon tabaka üzerinde parafilm oyuk merkezine transfer.
      Dikkatli: Bu işlem sırasında gererek lif zarar kaçının ve bu mekanik özelliklerinde bir değişiklik neden olabileceğinden tabaka üzerinde örnek yeni bir yön kaçının.
    4. fiber üzerinden ince bir cam lamel yerleştirin ve altındaki parafilm eritmek için cam yüzey üzerinde hafifçe ısıtılmış havyaya geçirerek odasına mühürcam.
      Dikkatli: çok yakın lehim ucu getiren veya aşırı substrat ısıtma vermeyerek lif zarar kaçının.
    5. Küçük bir ağırlığı altında düz bir yüzeye mühürlü odasına yerleştirin ve numuneye zarar kaçınarak numune ve silikon substrat arasında iyi bir temas sağlamak için yaklaşık 12 saat boyunca bekletin.
    6. vidaları kullanarak, ağırlık kaldırmak ve alt tabaka üzerinde yerinde odasının sabitleyin.
  • 2. Brillouin Deney kurma ve Fiber Spectra Edinme

    1. Numune kompartımanı hazırlanması
      1. Ve hacim konumunu saçılması (Şekil SI-1'e bakınız 2 Φ = 90 °) sabit bir saçılma açısı korurken örnek düzlem döndürme etkinleştirmek için bir gonyometre ile donatılmış dikey bir tutucu üzerine bir parçası 1.3 olarak hazırlanan örnek monte edin.
      2. le ile örnek lazer ışığı doğru bir odak ayarlaması gerçekleştirmekns. 9
        Dikkatli: Lazer çıkış gücü çok yüksek olabilir ve örnek bir yanık üretebilir. örneğe zarar vermemek için çok yüksek iyi bir hassasiyet verecek şekilde yeterince yüksek ayarlanmış değil emin olun. İşte örnek üzerinde yaklaşık 76 mW gücünde kullanılır. Bu husus, bu ince ve lazer yanması ile üretilen ısıyı yardımcı olan bir alt-tabaka ile temas içinde olduğu dikkate alındığında, örnek yanma olmadan iyi bir duyarlılık elde etmek için yeterli olmuştur.
      3. Bir Vernier ölçeğini kullanarak olay lazer ışınına 45 ° açı (Φ) de örnek yerleştirin. bir ölçüm çalışan ve (aşağıya bakınız) spektrumunda piklerin yoğunluğu maksimize ederek en uygun konumlandırma elde edin.
    2. Spektrometre kurma
      1. Edinimi ve verilerin manipülasyonu için yazılımı açın ve örnek 12 bir Brillouin spektrumunun satın kurdu. Burada açıklanan prosedür mu geçerlidirltipass tandem interferometre (Şekil SI-1A).
      2. bağımsız kontrol ünitesi tarafından piezo uygulanan gerilimleri değişen iki Fabry-Perot (FP) interferometreleri hizalayın. Bu ön-hizalama işlemi için, her FP tarafından yansıyan ışık görüyoruz. İki hekimleri tarafından yansıtılan yoğunluğu sıfır eğilimi, doğru hizalama ulaşılır.
      3. Tayfı kalibre: erişilebilir frekans aralığı ya da serbest spektral aralığının (FSR), iki adet birinci AP boşluğun aynalar, L, FSR = C / 2 L'lik, c, ışığın hızı ile arasındaki uzaklığa bağlı olduğu, L dial-ölçü ile ölçülür.
      4. İki FP interferometreler taramalarını senkronize etmek ve tandem multipass konfigürasyonuna optik sistemini açmak. iletilen lazer ışık yoğunluğu bir geri besleme kontrolü otomatik olarak ölçüm sırasında iki FP hizalanmasını koruyacaktır.
    3. Ölçüm of Brillouin Spectra
      Dikkatli: Brillouin spektrum numune ve bu parametrelerin çok dikkatli kontrol sıcaklık ve hidrasyon son derece bağlıdır tekrarlanabilir spektrumları elde anahtarıdır.
      1. numunenin bir Brillouin spektrumu kazanılmasını başlatın ve iyi bir sinyal-gürültü oranı elde edilene kadar çalıştırın. Bu numunenin saçılma tesir kesiti, konsantrasyon ve kalınlığına bağlı olarak birkaç dakika sürebilir.
        NOT: Orada işaret-gürültü oranı için pratik kural değil ama spektral kalite analiz belirli örneğe dayalı deneye tarafından kontrol edilir. spektral kalite ve ölçüm süresi arasında bir trade-off, bu nedenle deneysel parametreler belirli uygulamaya göre seçilmesi gerekir vardır.
      2. kuru numune ölçümü için, birbirini izleyen spektrumları alır - her biri için, aşama 2.3.1 şu - tepe noktalarının konumu kadar olan herhangi bir değişiklik Is görülmektedir. Numune oda atmosferi ile dengede olduğu ve daha fazla kurutma spektrumu etkiler, bu başarılır.
      3. (V saçılma düzlemine ışık polarizasyon göreceli yatay yönde dikey ve H açılımı VV veya VH) ve lif eksenine her açıda spektrumları elde ışık polarizasyonu seçiniz (θ Şekil SI-1) örneği de çevirerek elle düzlem.
      4. sonraki işlemler için dosya Brillouin spektrumları kaydedin.

    Brillouin Spectra 3. Analizi

    NOT: Brillouin zirveleri Fit analizi çeşitli fonksiyonları kullanılarak yapılabilir. Bu viskoelastik medyada sönümlü akustik modları kaynaklanan zirveleri için geçerli bir model olarak bir sönümlü harmonik osilatör (DHO) işlevi 4,13 seçildi.

    1. Brillouin zirveleri Fit analizi
      1. inci ilgi zirve için spektral aralığı seçine Brillouin spektrum.
      2. spektral arka plan sıfırdan çok daha yüksek olması durumunda uyum içinde bir temel etkinleştirin.
        NOT: Bazal spektrumları arasında değişebilir. Düzeltme sistematik ve tekrarlanabilir bir şekilde tatbik olduğundan emin olun.
      3. Yakınsama elde edilir ve en iyi eğri uydurma elde iteratif kadar ilgi Brillouin zirvesine bir DHO işlevi 4,13 kullanarak uydurma detaylı en küçük kareler uygulayın. Ardından, dosyaya uygun sonuçları kaydedin.
      4. Her Brillouin ikilisinin iki doruklarına uyum parametrelerinden ortalama değerler elde.
      5. tepe frekansı akustik dalga hızını hesaplayın (aşağıda ifadesini kullanarak).
      6. Θ grafikler, örneğin, lif eksenine açısı vs akustik dalga hızı aracılığıyla uygun sonuçlar çizilir Ve bu elastikiyet tensör katsayıları gibi mekanik miktarlarda ayıklamak için (9 akustik anizotropik sistemler için, örneğin) ilgili modeller uygulamak.

    Representative Results

    Bu deneme için (Şekil SI-1A) 'da kullanılan Brillouin spektroskopisi cihazı daha önce tarif edilmiştir. Şekil 9'da, tek modlu örnek 76 mW'lık çıkış gücü 532 nm katı-hal lazer kullanmaktadır. A 20 cm akromatik objektif numune üzerine lazer ışığını odaklanır ve bir backscattering geometri örnekten saçılan ışık toplar. Tandem pasolu Fabry-Perot interferometre sonra düşük gürültü fotodiyot detektörü tarafından tespit edilir saçılan ışık, filtre edilmesi için kullanılır. Bu yaklaşım, son derece etalonu oynak piezo-tarama yoluyla yüksek kontrast (yaklaşık 120 dB) ve istikrar sağlar. Bir polarizör ve analizör olaydan ve dağınık ışık polarizasyonu seçmek tanıtılmaktadır. Spectra genellikle o polarize olay ışık kutuplaşma dikey (V) yön ve alternatif dikey (V) seçerek analizörü seçerek sabit tutulur ile elde edilirdağınık ışık kutuplaşma r yatay (H) yönünde. Bu yapılandırmada, boyuna ve enine akustik modlar sırası ile tespit edilir.

    Tipik Brillouin spektrumu nedeniyle esnek saçılma ve örneğin mekanik imzası olan eşit kaydırılmış tepe veya Brillouin çifti, bir veya daha fazla grup için yoğun bir merkezi tepe noktasına sahiptir. Bu ölçümlerde, dağınık ışık yüzeyi (PS modları) paralel seyahat toplu fononların gelen numune substrat arayüzünde gelen ışığın yansıması sonra, numune yarı dik ve seyahat toplu fononların hem kaynaklı olabilir. 9

    Şekil 2 30 GHz ücretsiz spektral aralığı, 0.2 GHz çözünürlükte VV kutuplaşma ile elde edilen kuru ve sulandırılmış tripsin-sindirilmiş kollajen liflerinin BLS spektrumlarını göstermektedir ve yaklaşık 10 dk toplama zamanıYelpazenin başına. Her spektrum θ dönme belirli bir açıya karşılık gelir (Şekil SI-1C). PS modu (9.85 ± 0.03) GHz (Şekil 2A) de iken İçeride ISTV melerin RWMAIWi'nin = 0 ° C'de kuru kollajen lif, uzunlamasına modları (18.92 ± 0.02) GHz'de toplu zirve doğurur. Aynı aralıkta İçeride ISTV melerin RWMAIWi'nin değiştirilmesi üzerine düşük frekanslarda PS pik değişimleri θ 90 ° (fonon radyal yön sondalama) 0 ° (lifin eksenel yönlendirme tarama fonon) arasında gider, dökme tepe ise sadece hafif kırmızı kaymalar (fonon rotasyon boyunca bir yarı-radyal yönde sondalama). Islak kollajen lif nedeniyle boyuna fononların iki tepe noktası yaklaşık 10.5 GHz hızında toplu tepe ve 4.9 GHz (Şekil 2B) PS tepe, deney boyunca temelde değişmemiştir. Bu 18.92 verilerine göre en yüksek frekansı 80 ila% 100 azalma gösterir (ve 9.85 GHz sırasıyla) ve bu yüzden hidrasyon nedeniyle malzemenin sertliği, bir. hidratlı kollajen toplu ve PS modları elastik sabitleri su oynadığı baskın rol ile, su ve lif katkılarının bir arada olduğunu öne sürerek, saf su modları frekansında yakın yalan olduğunu unutmayın.

    Şekil 3, θ = VH polarizasyonda 30 ° ölçülen kuru tripsin ile sindirilmiş kollajen lif spektrumunu gösterir; VV polarizasyon bir kaçak PS ve dökme pikleri de dikkat edilmesi sağlar. Enine modları (4.1 ± 0.2) GHz = 0 °) 0 ° 90 ° 'ye kadar θ değişiklikler olarak biraz mavi-vardiya bir tepe oluşturmaktadır. Enine ve PS zirveleri hem Fit sonuçları da gösterilmiştir. Tepe parametreler çıkarıldı ve akustik dalga hızları V L = v l / √2 olarak türetilmiştir qS k = 2 i (Φ) sin Şekil SI-1b, c), bu nedenle Bu yaklaşım özellikle avantajlı hale.

    Şekil 4, açılı θ'nın bir fonksiyonu olarak boyuna ve enine metodları ile elde edilen akustik dalga hızı (PS T tepe) bir grafiğidir . Aşağıdaki denklemler A1 ve A2 - - altıgen simetrik elastik katı 7 modeline uyum analizi kuru tripsin-sindirilmiş Çeşidi elastikiyet tensörün beş bileşenlerini ben lifleri (Tablo 1) kollajenin sağlar.

    9 tarafından verilen =

    denklem 1 (A1)

    denklem 2 (A2)

    ρ malzemenin yoğunluğu ve C 11, C 33, 44 ° C ve C 13 olduğu altıgen simetrili sistemler karakterize beş elastik sabitlerinin dörttür. Beşinci sabit 12 C, 12 ° C 11 C, yaklaşık ilişki elde edilebilir -. 2 C 44 7

    Katsayılar, daha önce saflaştırılmamış kollajen fibe elde edilenlere benzerdirrs. 9 A fark fark elastik modülü E ǁ ve e benzer değerlere yansıdığı 13 c katsayısı oluşur Dik saflaştırılmış kolajen için (yaklaşık 7.2 ve 7.7 GPa).

    Şekil 5 θ karşı Islak kollajen uzunlamasına akustik dalga hızının bir grafiğidir . Bu durumda, frekansta hiçbir periyodik değişimi hatası içinde sabit bir hız vererek görülmektedir. 6 θ = 0 ° C'de ölçülen kuru ve sulu elastin lifleri spektrumunu göstermektedir. Enine modları, bu örnekler için tespit edilememiştir. Kuru elastin, dökme pik 8.2 GHz 9 (13 ve kuru kollajen gelen bir zirve daha düşük% 20) PS modunda iken 16.8 GHz meydana gelir. Islak elastin lifleri toplu p sunmakeak de (12.30 ± 0.01) GHz (kuru elastin toplu zirve fazla sıklıkta% 37 daha düşük). Islak elastin PS modu çünkü bu frekanslarda elastik tepe yoğun kuyruk spektrumunda belirgin değildir. Öte yandan, yaklaşık 7.5 GHz hızında tepe toplu suya atfedilir.

    Şekil 7 İçeride ISTV melerin RWMAIWi'nin kuru elastin lif akustik dalga hızının bağımlılığını gösterir. Bu verilerden, esneklik tensör parçaları (ve mekanik modülü), ıslak kolajen gibi (Tablo 1). 9 elde edildi, suyla elastin lifleri mekanik modülünde izotropi kanıt vardır. Bu sonuçlar Brillouin spektroskopisi sertlik, kompozisyon ve malzemenin yapısal yönleri ile ilgili bilgi verebilir nasıl gösterir.

    Şekil 1
    Fi1. şekil akustik ve atomların tek boyutlu zincir optik Fononlar. tek boyutlu bir iki atomlu zincir akustik ve optik titreşimlerin şematik. Atomlar kitle m 1 ve m 2 ve dönüşümlü edilir. Oklar atomların yer değiştirmeleri göstermektedir. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

    şekil 2
    Tripsin ile saflaştırılmış Çeşidi Şekil 2. Brillouin spektrumlan I fare kuyruk tendon lifleri hücre oranında yerleştirilmiştir. (A) Kuru lif ve (B) spektrumu derece olarak, lif eksen İçeride ISTV melerin RWMAIWi'nin farklı açıda VV ölçümlerinden fiber hidratlanmış. Saf damıtılmış su bir spektrumu da gösterilmiştir. Spektrumlar toplu tepe yoğunluğuna (yükseklik) normalize edilmiştir. Etiketler B ve PS sırasıyla toplu ve paralel-yüzey modları ile ilgili zirveleri göstermek. Hata çubukları standart hata (sayılarında karekökü) gösterir. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

    Şekil 3,
    Kuru tripsin-saflaştırılmış tip Şekil 3. Brillouin spektrum ben sıçan kuyruğu tendon lifleri kollajen. Spectrum İçeride ISTV melerin RWMAIWi'nin bir VH ölçümden = 30 °. Etiketler T, PS ve B sırasıyla, paralel-yüzey ve toplu modları enine ilgili zirveleri göstermek. hem T ve PS modları için sönümlü harmonik osilatör (DHO) modeli kullanılarak fit analiz sonuçları da gösterilmiştir. Hata çubukları standart hatası (sayılarında karekökü) gösterir./54648fig3large.jpg "Target =" _ blank "> bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız.

    Şekil 4,
    Şekil lif eksenine açısı vs kuru tripsin-saflaştırılmış kollajen akustik dalga hızının 4. Konu. Brillouin zirveleri uygun analizlerden elde edilen kuru kollajen lif boyuna ve enine akustik dalga hızları. Veriler altıgen simetrik esnek katı bir model yerleştirilmiştir. Kırmızı çizgi: Denklem A1 (R2 = 0.99); mavi çizgi: Denklem A2 (R = 0.36 2). Hata çubukları Brillouin spektrumları uygun bir Levenberg-Marquardt doğrusal olmayan en küçük kareler sonra kovaryans matrisinin köşegen elemanları karekökü elde edilen standart hataları göstermektedir. Daha büyük bir versi görmek için buraya tıklayınız bu rakamın üzerinde.

    Şekil 5,
    Lif eksenine açısı vs ıslak tripsin-saflaştırılmış kollajen uzunlamasına akustik dalga hızı Şekil 5. Konu. Brillouin zirveleri uygun analizlerden elde edilen hidrate kollajen lif boyuna akustik dalga hızı. gösterilen çizgi göz için bir kılavuzdur ve bu aralıkta akustik dalga hızının ortalama değerini verir. Hata çubukları Brillouin spektrumları uygun bir Levenberg-Marquardt doğrusal olmayan en küçük kareler sonra kovaryans matrisinin köşegen elemanları karekökü elde edilen standart hataları göstermektedir. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

    jpg "/>
    Sığır ense ligament gelen elastin liflerin Şekil 6. Brillouin spektrumları. İçeride ISTV melerin RWMAIWi'nin kuru ve sulandırılmış fiber Spectra = 0 °. Spektrumlar toplu tepe yoğunluğuna (yükseklik) normalize edilmiştir. Etiketler B ve PS sırasıyla toplu ve paralel-yüzey modları ile ilgili zirveleri göstermek. B, F ve B W sırasıyla, lif ve su dökme zirveleri bakın. Hata çubukları standart hata (sayılarında karekökü) gösterir. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

    Şekil 7,
    Lif eksenine açısı vs kuru elastin boyuna akustik dalga hızı Şekil 7. Konu. Kuru elastin yalan Boyuna akustik dalga hızıer Brillouin zirveleri uygun analizlerden elde edilen. Veriler altıgen simetrik esnek katı bir model yerleştirilmiştir. Kırmızı çizgi: Denklem A1 9 (R = 0.74 2). Hata çubukları Brillouin spektrumları uygun bir Levenberg-Marquardt doğrusal olmayan en küçük kareler sonra kovaryans matrisinin köşegen elemanları karekökü elde edilen standart hataları göstermektedir. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

    Yan Şekil 1

    Şekil SI-1. Brillouin set-up ve TYD saçılma geometri şematik. (A) katı-hal lazer tarafından yayılan olay ışık bir akromatik lens aracılığıyla numune gönderilir. Toplu akustik fononların tarafından ve reflektör kaynaklanan kişiler tarafından saçılan ışıknumune ile temas halinde olan alt-tabaka yüzeyinin en ışık ection bir foto çoğaltıcı ile tandem pasolu Fabry-Perot interferometre ile filtre edildi ve tespit lens tarafından toplanır. FP1 ve FP2 tandem set-up oluşturan iki interferometreleri göstermektedir. Bir polarize gelen ışığın polarizasyonunun seçer ve çözümleyici saçılan ışığın polarizasyon seçmek için kullanılır. Yansıtıcı silikon alt-tabaka yüzeyi ile temas halinde olan bir örnek ile (B) TYD geometrisi. Bir cam slayt (gösterilmemiştir) bir bölme mühürlemek için numune üzerine yerleştirilmiştir ve hafif bir basınç taban köşelerinde ped vasıtasıyla uygulanır. Olay ışık (k i) merceğinden, hava numune arayüzü (k 'i) en kırılır ve numune substrat arayüzü odaklanmıştır geçer. Aynı lens tarafından toplanan dağınık ışık toplu fononların hem etkileşim sonuçları (q ( 's k)b) ve numune (q s olanlar seyahat PS). . Işığın yön ve yüzey normali arasındaki açılar Φ ve Φ 'olarak belirtilen (C) örnek benimsenen koordinat sisteminin şematik diyagramıdır; z liflerin yönüne olağanüstü eksen paralel tanımlar. Açılar θ ve α z sırasıyla -Axis b fononlar q s yönü ve q arasında olanlardır s 'k, k s i', k i k. Olayın dalgasayıları ve hafif dağınık, q b, q s, sırasıyla dökme ve PS modları, dalga vektörleri. (Ref 9. yayımlanmaktadır) bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız.

    Tablo akustik dalga hızlarının uygun analizlerden elde edilen 1. Elastik tensör katsayıları Ben lifleri kollajen kuru tripsin-saflaştırılmış Çeşidi Elastik tensör katsayıları (. Bu iş) ve elastin lifleri (ref 9).

    örnek Elastik katsayılar (GPa)
    tripsin ile sindirilmiş kollajen c 33 18.7 ± 0.1
    C 11 14.4 ± 0.2
    C 44 3.4 ± 0.1
    12 7.2 ± 0.2
    13 11.2 ± 0.3
    elastin c 33 11.5 ± 0.2
    C 11 10.4 ± 0.1
    C 44 1.9 ± 0.2
    12 6.6 ± 0.2
    13 6.8 ± 0.3

    Discussion

    Brillouin saçılım spektroskopisi bir protein lif esnekliği tansörünün bileşenleri tek tek görülmemiş detaylı olarak karakterize edilebilir bir benzersiz bir araçtır. Ayrıca, ölçümler mikroskopik ölçekte yapılabilir ve böylece karmaşıklığı, önemi, mekanik ve muhtemelen işlevsel anlamak için, ilk defa, bize izin biyolojik yapıların mikro ölçekli mekaniği içine yeni anlayışlar bize verecektir matris mimarisi ve biyokimya son yıllarda açığa edildiği.

    teknik GHz frekans aralığında mekanik özelliklerini ölçer. Bu etki, yapısal Biyopolimerlere için daha önce araştırılmış olmamıştı ve her iki yükseltir ve elastikiyet moleküler mekanizmaları hakkında temel soruları yanıtlamak için araçlar sağlar.

    Biz hayvan dokularından kolajen ve elastin lifleri ayıklamak ve Brillouin scatteri ölçmek için adımlar tarifFiber biyomekanik tam açıklamasını elde etmek için bir yansıtıcı substrat kullanılarak ng spektrumları. protokolü içinde kritik adımlar saflaştırılmış lifler edilen ve uygun deneysel koşullar lifli proteinlerin tekrarlanabilir ölçümler için yerinde olmasını sağlamak olanlardır. Ancak, ekstraksiyon işlemleri liflerin mekanik özellikleri değiştirebilir akılda tutulmalıdır.

    Tekniğin Değişiklikler microfocused Brillouin saçılımı ve haritalama için optik mikroskop ile bağlantı 13 yaklaşır içerir ve tamamlayıcı teknikler ile mümkün kombinasyonu (örneğin, Raman saçılması). Tekniğin Güncel uygulamalar ağırlıklı olarak eksize biyolojik materyaller üzerinde duruldu, ancak önemli gelişmeler, örneğin, çoklu VIPA etalonu 14 dayananlar, zaten uygulamaları bir dizi iblis ile başucunda benchtop bu tekniğin çevirisini mümkün yapıyoruzin vivo uygulamalarında potansiyeli dahil 15,16 strated. VIPA yaklaşımı açıklamak ne bir alternatiftir; daha hızlı bir alma zamanına sahip ancak burada analiz gibi zorunlu opak örnekleri için uygun değildir. onların kontrast yarı-elastik ışık reddetmek için yeterli olmaz çünkü Ayrıca, bir yansıtıcı yüzeye kullanımı VIPA etalonları kullanmak set-up pratik değildir. Bir spektral veri kümesi ve malzeme doğal olarak zayıf saçılma kesit alımı hızına ilişkin sınırlamalar dinamik biyolojik sistemlere ve derin dokularda veri edinimi uygulamaları sınırlayabilir, ancak teknik iyileştirmeler mevcut performansı artırabilir.

    BLS ekstraselüler matriks üzerinde temel biyofizik araştırma önemli bir araç olmayı vaat ve böylece yeni matris büyüme sırasında mekanik özelliklerinin evriminin anlayışlar ve patolojik onların kaybı üretmek içindejenerasyon. Ancak, ölçümler invaziv olmayan ve bu nedenle in vivo üstlenilen olabileceğini hatırlamak önemlidir. Nitekim, bu zaten kornea 16 elde edilmiştir ve bu çalışma bağ dokusu hastalıklarının geniş bir yelpazede için yeni tanı araçlarının geliştirilmesi için bir platform sağlayabilir.

    Ultrason elastografi ve atomik kuvvet mikroskopisi (AFM) mikromekanik ölçüm alternatif yöntemler vardır, ancak TYD tekniği, AFM aksine, eski ve daha (bir hücre içi ölçekte) daha iyi uzaysal çözünürlük sunuyor numune üzerinde hiçbir mekanik kuvvetleri dayatır ve sınırlı değildir sadece yüzey özelliklerinin analizi. makroskopik suşları Young modülü Mpa için (daha detaylı bilgi başka bir yerde rapor edilecektir) ait iken kolajen ve elastin Brillouin modülleri, GPa aralığında. Bu sonuca bağlı olarak, uyarım frekansı üzerinde güçlü bir bağımlılığı olan bir difransiyel esneklik katsayısı gösterirliflerin viskoelastik davranış. TYD biyomedikal sorunlar ve geniş bir malzeme yelpazesi uygulanabilir. Bu fizyoloji ve biyolojik dokuların patolojisi sorularını yanıtlayan yardımcı yanı sıra moleküler düzeyde malzeme ve etkileşimlerin temel olarak anlaşılması için fiziksel bir araç sağlayabilir.

    Materials

    Name Company Catalog Number Comments
    Chondroitinase ABC Sigma-Aldrich C2905
    Tris Buffer Fluka 93358
    Sodium Acetate Fisher Scientific S608-500
    PBS Sigma-Aldrich P4417
    Sodium Azide Fisher Scientific S2002
    Streptomyces Hyaluronidase  Sigma-Aldrich H1136-1AMP
    Sodium Chloride Fisher Scientific S7653
    Trypsin Sigma-Aldrich T4665
    Sodium Phosphate Sigma-Aldrich S9638
    Sodium Hydroxide Fisher Scientific S320-500
    Pure Water Millipore ZRQS0P3WW Produced in-house
    Distilled Water Bibby Scientific Limited D4000 Produced in-house from water still
    Euthatal Merial  J01601A 
    Tandem Interferometer TFP-1 JRS Scientific Instruments
    Freezer Lec TU55144
    Refrigerator Zanussi ZBA15021SA
    Hot Plate Fisher Scientific SP88857206
    Clamps VWR 241-7311 & 241-7201
    Clamp Stand VWR  241-0093
    Thermometer Fisher Scientific 13-201-401
    Cling Film Sainsbury's 7650540
    Parafilm Sigma-Aldrich P7793-1EA
    Silicone IDB Technologies N/A No catalogue number. Order upon request.
    Cover Glass VWR 631-1571
    Conical Flask VWR 214-1175
    Beaker VWR 213-0469
    Measuring Cylinder VWR 612-3838
    Vial VWR 548-0051 & 548-0863
    Petri Dish VWR 391-0441
    Scalpel Swann Morton Ltd  0914 & 0308
    Diamond Scribe RS Instruments 394-217
    Soldering Iron RS Instruments 231-5332
    Fine Forceps VWR 232-0188
    Double Micro-Spatula VWR Various Sizes
    pH Meter Hanna Instruments HI-2210-02
    Orbital Shaker IKA  0002819000

    DOWNLOAD MATERIALS LIST

    References

    1. Brillouin, L. Diffusion de la lumière et des rayonnes X par un corps transparent homogène; influence de l'agitation thermique. Ann. Phys. 17, 88-122 (1922).
    2. Caponi, S., Corezzi, S., Mattarelli, M., Fioretto, D. Stress effects on the elastic properties of amorphous polymeric materials. J. Chem. Phys. 141, (21), 214901 (2014).
    3. Mattarelli, M., Montagna, M., Still, T., Schneider, D., Fytas, G. Vibration spectroscopy of weakly interacting mesoscopic colloids. Soft Matter. 8, (15), 4235-4243 (2012).
    4. Comez, L., Masciovecchio, C., Monaco, G., Fioretto, D. Solid State Physics. Robert, E. C., Robert, L. S. 63, Academic Press. 1-77 (2012).
    5. Madami, M., et al. Direct observation of a propagating spin wave induced by spin-transfer torque. Nat. Nanotechnol. 6, (10), 635-638 (2011).
    6. Harley, R., James, D., Miller, A., White, J. W. Phonons and the elastic moduli of collagen and muscle. Nature. 267, (5608), 285-287 (1977).
    7. Cusack, S., Miller, A. Determination of the elastic constants of collagen by Brillouin light scattering. J. Mol. Biol. 135, (1), 39-51 (1979).
    8. Vaughan, J. M., Randall, J. T. Brillouin scattering, density and elastic properties of the lens and cornea of the eye. Nature. 284, (5755), 489-491 (1980).
    9. Palombo, F., et al. Biomechanics of fibrous proteins of the extracellular matrix studied by Brillouin scattering. J. R. Soc. Interface. 11, (101), (2014).
    10. Sivan, S. S., et al. Age-related accumulation of pentosidine in aggrecan and collagen from normal and degenerate human intervertebral discs. Biochem. J. 399, (1), 29-35 (2006).
    11. Leon, W. C. Methods in Enzymology. 144, Academic Press. 196-214 (1987).
    12. Fioretto, D., Scarponi, F. Dynamics of a glassy polymer studied by Brillouin light scattering. Mater. Sci. Eng. A. 521-522, 243-246 (2009).
    13. Palombo, F., Madami, M., Stone, N., Fioretto, D. Mechanical mapping with chemical specificity by confocal Brillouin and Raman microscopy. Analyst. 139, (4), 729-733 (2014).
    14. Scarcelli, G., Yun, S. H. Multistage VIPA etalons for high-extinction parallel Brillouin spectroscopy. Opt. Express. 19, (11), 10913-10922 (2011).
    15. Scarcelli, G., Kim, P., Yun, S. H. In Vivo Measurement of Age-Related Stiffening in the Crystalline Lens by Brillouin Optical Microscopy. Biophys. J. 101, (6), 1539-1545 (2011).
    16. Scarcelli, G., Yun, S. H. In vivo Brillouin optical microscopy of the human eye. Opt. Express. 20, (8), 9197-9202 (2012).

    Comments

    0 Comments


      Post a Question / Comment / Request

      You must be signed in to post a comment. Please or create an account.

      Video Stats