Yijun Ruan Genome Institute of Singapore Agency for Science, Technology and Research, Singapore Biography Publications Institution JoVE Articles Yijun Ruan has not added a biography. If you are Yijun Ruan and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications CHIP-SEQ忠実に影響を与える要因の体系的評価 Nature Methods. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22522655 胃腺癌のExomeシーケンシングは、細胞接着とクロマチンリモデリング遺伝子の再発体細胞突然変異を識別します Nature Genetics. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22484628 一般的なBIMの欠失多型を仲介固有抵抗と癌におけるチロシンキナーゼ阻害剤よりも劣って応答 Nature Medicine. 2012 | Pubmed ID: 22426421 豊富なプロモーターを中心としたクロマチンの相互作用は、転写調節のためのトポロジーの基礎を提供する Cell. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22265404 5 'および3'対の終了タグの次世代シーケンシング(RNA-PET)を使用したゲノムワイドフルレングスの転写解析 Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2012 | Pubmed ID: 22113299 多能性細胞でCTCF媒介機能クロマチンのインタラクトーム Nature Genetics. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21685913 蚊のウイルスメタゲノミクスを通じて得られたDNAウイルスの多様性の広範な調査 PloS One. 2011 | Pubmed ID: 21674005 クロマチンの相互作用ネットワークと真核生物ゲノムの高次アーキテクチャ Journal of Cellular Biochemistry. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21520242 Comprehensive Long-span Paired-end-tag Mapping Reveals Characteristic Patterns of Structural Variations in Epithelial Cancer Genomes Genome Research. May, 2011 | Pubmed ID: 21467267 乳癌におけるゲノム構造異常の転写帰結 Genome Research. May, 2011 | Pubmed ID: 21467264 ゲノムシークエンシング周年。ヒトゲノムを提示:今すぐ3Dに! Science (New York, N.Y.). Feb, 2011 | Pubmed ID: 21350163 転写因子の結合の決定 Nature Genetics. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21217639 エストロゲン受容体αによる結合部位の選択を決定するためのゲノム要因の統合モデル Molecular Systems Biology. Dec, 2010 | Pubmed ID: 21179027 ゲノムワイドな解析は、レット症候群のマウスモデルにおけるマイクロRNAのメチル化CpG結合タンパク質2依存的な調節を明らかに Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20921386 システム生物学における多重化された平行ペア線でエンド-ditagシーケンシングアプローチ Wiley Interdisciplinary Reviews. Systems Biology and Medicine. Mar-Apr, 2010 | Pubmed ID: 20836024 がんゲノムプロジェクトの国際的ネットワーク Nature. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20393554 類鼻疽菌のポジティブセレクションのゲノム調査では、偶発的な病原性の進化への洞察を提供します。 PLoS Pathogens. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20368977 シーケンスペアエンドタグとの包括的なクロマチンの相互作用分析のためのCHIA-PETツール Genome Biology. 2010 | Pubmed ID: 20181287 シーケンスペアエンドタグを使用したクロマチンの相互作用解析 Current Protocols in Molecular Biology / Edited by Frederick M. Ausubel ... [et Al.]. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20069536 共同規制の遺伝子間の優遇協会は赤血球系細胞における転写ラクを明らかに Nature Genetics. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20010836 エストロゲン受容体-α-結合したヒトクロマチンラク Nature. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19890323 再生水におけるウイルスのメタゲノム解析 Environmental Microbiology. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19555373 男性型脱毛症のヒトのアンドロゲン受容体/ Ectodysplasin A2受容体のハプロタイプとの関係の最近のポジティブセレクション Human Genetics. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19373488 トランスクリプトームとゲノム解析のためのペアエンドタグの次世代のDNAシーケンシング(PET) Genome Research. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19339662 デノボPPARgamma / RXR結合部位と脂肪細胞の間に直接の標的の同定 PloS One. 2009 | Pubmed ID: 19300518 ロングレンジクロマチンの相互作用の同定のためのチップベースの方法 Journal of Cellular Biochemistry. May, 2009 | Pubmed ID: 19247990 トランスポゾン経由哺乳類の転写因子結合レパートリーの進化 Genome Research. Nov, 2008 | Pubmed ID: 18682548 多能性幹細胞のエピゲノムへの取り組み Journal of Genetics and Genomics = Yi Chuan Xue Bao. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18640620 胚性幹細胞における転写ネットワークのコアを持つ外部のシグナル伝達経路の統合 Cell. Jun, 2008 | Pubmed ID: 18555785 屋内都市環境における空中メタゲノム PloS One. 2008 | Pubmed ID: 18382653 ナインバイオームの機能メタゲノムプロファイリング Nature. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18337718 現代のストロマトライトとThrombolitesでファージの生物多様性と生物地理 Nature. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18311127 複雑なDNAライブラリーを増幅する複数の変位増幅の使用 Nucleic Acids Research. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18285362 チップペットの実験における転写因子結合部位のゲノムスケールの結合力分布の数値解析とモデリング Genome Informatics. International Conference on Genome Informatics. 2007 | Pubmed ID: 18546507 ヒストンH3 Lys4と27 Trimethylationsの全ゲノムマッピングは、人間の胚性幹細胞の個別ゲノムコンパートメントを明らかに Cell Stem Cell. Sep, 2007 | Pubmed ID: 18371363 トランスクリプトームとゲノム解析のためのペアエンドDiTagging Current Protocols in Molecular Biology / Edited by Frederick M. Ausubel ... [et Al.]. Jul, 2007 | Pubmed ID: 18265396 RELA(P65)のゲノムワイドなマッピングは、バインディングは、TLR4活性化されるNF-κB活性によって補充される転写活性化因子としてE2F1を識別します Molecular Cell. Aug, 2007 | Pubmed ID: 17707233 ペアエンドDiTagトランスクリプトームで観測されたマウスメラノーマ細胞の経路収差 BMC Cancer. 2007 | Pubmed ID: 17594473 、ENCODEパイロットプロジェクトによるヒトゲノムの1%の機能要素の同定と解析 Nature. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17571346 チップによって哺乳動物細胞における転写因子結合領域のマッピング:配列とシーケンスベースのテクノロジの比較 Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568005 、ENCODE領域における偽:コンセンサス注釈、転写の解析と進化 Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568002 ペアエンドDiTagsを使用した融合転写物との包括的トランスクリプトーム解析で検出された転写さRetrotransposed座(PETS) Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568001 エストロゲン受容体アルファ結合部位の全ゲノム地図作成 PLoS Genetics. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17542648 デング熱感染時に宿主応答を理解するにゲノミクスのアプローチ Novartis Foundation Symposium. 2006 | Pubmed ID: 17319164 ヒトB細胞におけるc-Mycの結合部位と標的遺伝子ネットワークのグローバルマッピング Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2006 | Pubmed ID: 17093053 PET-ツール:ペアエンドDiTag(PET)配列データの包括的な処理および管理するためのソフトウェアスイート BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 16934139 ペアエンドDitagsの多重シーケンス(MS-PET):トランスクリプトームとゲノムの超高スループット分析のための戦略 Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16840528 Oct4とNanogの転写ネットワークは、マウス胚性幹細胞の多能性調節する Nature Genetics. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16518401 ヒトゲノムにおけるp53転写因子結合部位の地球地図 Cell. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16413492 ヒト糞便中のウイルスコミュニティRNA:植物病原性ウイルスの有病率 PLoS Biology. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16336043 マイクロアレイを用いたゼブラフィッシュ胚のトランスクリプトーム解析 PLoS Genetics. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16132083 トランスクリプトームの特性とゲノムアノテーションの遺伝子同定の署名(GIS)の分析 Nature Methods. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15782207 シンガポールでのSARSの送信パターンは、ウイルス配列変異解析による再評価 PLoS Medicine. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15736999 ステータス、品質、およびNIH完全長cDNAプロジェクトの拡張:哺乳類遺伝子コレクション(MGC) Genome Research. Oct, 2004 | Pubmed ID: 15489334 細胞培養およびヒト集団におけるSARSコロナウイルスの変異のダイナミクスは、2003年に分離された BMC Infectious Diseases. Sep, 2004 | Pubmed ID: 15347429 5 '遺伝子発現のロングシリアル解析(LongSAGE)及び3'トランスクリプトームの特性とゲノムアノテーションのLongSAGE Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2004 | Pubmed ID: 15272081 研究室で取得した重症急性呼吸器症候群 The New England Journal of Medicine. Apr, 2004 | Pubmed ID: 15103000 トランスクリプトームを問い合わせる Trends in Biotechnology. Jan, 2004 | Pubmed ID: 14690619 クロマチンの相互作用のマッピングと転写調節を理解するためのペアエンドタグシーケンシング(CHIA-PET)によるクロマチンの相互作用の解析 Yufen Goh*1, Melissa J. Fullwood*1,2,3, Huay Mei Poh1, Su Qin Peh1, Chin Thing Ong1, Jingyao Zhang1, Xiaoan Ruan1, Yijun Ruan1,3 1Genome Institute of Singapore, Agency for Science, Technology and Research, Singapore, 2A*STAR-Duke-NUS Neuroscience Research Partnership, Singapore, 3Department of Biochemistry, National University of Singapore, Singapore JoVE 3770 Biology
クロマチンの相互作用のマッピングと転写調節を理解するためのペアエンドタグシーケンシング(CHIA-PET)によるクロマチンの相互作用の解析 Yufen Goh*1, Melissa J. Fullwood*1,2,3, Huay Mei Poh1, Su Qin Peh1, Chin Thing Ong1, Jingyao Zhang1, Xiaoan Ruan1, Yijun Ruan1,3 1Genome Institute of Singapore, Agency for Science, Technology and Research, Singapore, 2A*STAR-Duke-NUS Neuroscience Research Partnership, Singapore, 3Department of Biochemistry, National University of Singapore, Singapore JoVE 3770 Biology