Name: 定制黑曲霉（Aspergillus niger）通过添加滑石粉微粒形态 (视频) | JoVE Journal
Uploaded: 2012-03-15T13:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 51 s
Description: 了解如何通过添加滑石粉微粒定制黑曲霉（Aspergillus niger）的形态，以建立形态与生产力的数学相关性。该方法结合显微镜观察与数字图像分析，为丝状微生物的形态发生研究提供新见解。

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

作者衷心感谢德国布伦瑞克工业大学德国研究基金会（DFG）通过合作研究中心SFB 578“从基因到产品”提供的资金支持。

1. 反应器设置与培养启动
总共进行4次生物反应器培养。
<ol>
 <li>使用工作体积为 2.2 L 的 3 L 机械搅拌罐式生物反应器培养 A. niger SKAn1015。</li>
 <li>将 72.6 g 一水葡萄糖倒入反应器中，并加入 1.9 L 去离子水至所需体积。</li>
 <li>安装反应器设备，包括 3 块挡板、一个双六叶圆盘涡轮搅拌器、pH 电极、带空气过滤器的气体入口、冷却指、带空气过滤器的排气冷却器，以及用于无菌取样的浸入管和用于培养基、接种物、酸和碱的带空气过滤器的进液软管。</li>
 <li>在 121 °C 下对反应器进行 20 分钟的高压灭菌。</li>
 <li>将反应器连接至酸碱储液瓶（2 M HCl，2 M NaOH）及相应泵，并通过 pH 控制单元将 pH 值设定为 5.0 ± 0.05。</li>
 <li>将反应器连接至冷却水系统，并将加热夹套包裹在反应器容器外部。</li>
 <li>安装温度传感器及其相应的控制单元，并通过温度控制单元将温度设定为 37 ± 0.1 °C。</li>
 <li>将搅拌电机安装在反应器顶部，并以 200 min-1 的搅拌速度启动运行。</li>
 <li>通过其中一个无菌进液软管加入无菌基础培养基11（250 mL）。培养基配制时，所有组分均在 121 °C 下高压灭菌 20 分钟后混合。对于三次培养，分别在培养基中加入滑石粉（3MgO•4SiO2•H2O），浓度分别为 1 g/L（反应器 2）、3 g/L（反应器 3）和 10 g/L（反应器 4）。使用前，将微粒悬浮于 50 mM 醋酸钠缓冲液（pH 6.5）中，然后加入无菌培养基。对照培养（不含微粒）中，以 50 mM 醋酸钠缓冲液（pH 6.5）替代微粒悬浮液。</li>
 <li>通过其中一个无菌进液软管加入按 Wucherpfennig 等（2011）11 方法制备的孢子悬浮液（接种物）（50 mL），使孢子终浓度达到 1×106 mL-1。接种时刻标记为培养开始时间（h = 0 h）。</li>
 <li>以 1.0 L min-1 的流速开始通气。</li>
</ol>
2. 培养 24、48 和 72 小时后的无菌取样
<ol>
 <li>取50 mL无菌培养液至一个螺口管中。</li>
 <li>使用样品测定生物量干重、β-呋喃果糖苷酶活性及进行显微分析。</li>
</ol>
3. 培养24、48和72小时后生物量干重的测定
<ol>
 <li>生物量样品应至少取两份平行样。</li>
 <li>将纤维素滤膜在干燥器中干燥后，用微量天平称重，并将其放入布氏漏斗中，连接水流抽气泵。</li>
 <li>过滤一定体积的样品（例如 10 mL），并用 10 mL 去离子水冲洗滤膜，以去除生物量中的培养基成分。</li>
 <li>将滤膜在中间折叠一次，放入玻璃培养皿中，置于隔间干燥器中直至恒重（至少 24 小时）。</li>
 <li>在干燥器中冷却滤膜后称重。</li>
 <li>生物量干重的计算公式为：滤膜与干燥后生物量的总重量减去空白滤膜重量，再除以所用样品体积。</li>
</ol>
4. 培养24、48和72小时后通过GOD/POD法测定β-呋喃果糖苷酶的胞外酶活性
处理样本时，应始终将其置于冰上保存。
<ol>
 <li>用注射器将1.5 mL培养液悬浮液通过醋酸纤维素滤膜过滤至反应管中。将反应管储存于-20 °C，待用。</li>
 <li>取20 μL样品作为反应体系，并加入200 μL溶于0.05 M磷酸缓冲液（pH 5.4）中的1.65 M蔗糖溶液，以启动蔗糖转化为葡萄糖的反应。该反应至少需设两个重复。</li>
 <li>将反应体系置于40 °C加热块中孵育20分钟。随后在95 °C加热块中孵育10分钟以终止反应。将反应体系置于冰上冷却，并在4 °C下以13,000 g离心10分钟，去除冷凝水。</li>
 <li>为校正因pH和温度导致的蔗糖非酶促水解为葡萄糖的影响，设置空白对照，即用20 μL去离子水替代20 μL样品进行相同操作。</li>
 <li>为校正培养液中残留的葡萄糖含量，需为每个样品设置阴性对照。具体操作为：取20 μL样品，先在95 °C加热10分钟以灭活β-呋喃果糖苷酶，再加入蔗糖，并按步骤4.3所述条件孵育。</li>
 <li>稀释样品，使后续测定的吸光度值处于标准曲线的线性范围内。</li>
 <li>所有酶学测定均需设三个重复。在微孔板的每个孔中加入2 μL稀释后的样品。同时在微孔板上设置标准曲线：分别用2 μL十种已知浓度（1 mM至15 mM）的葡萄糖溶液替代2 μL样品，每种浓度各设一孔，用于校准；零点校准则使用2 μL去离子水替代2 μL样品。</li>
 <li>使用多通道移液器向各孔中加入200 μL试剂溶液。</li>
 <li>室温下孵育反应体系10分钟。</li>
 <li>将微孔板储存于6 °C，直至检测（最多数小时内完成）。</li>
 <li>使用96孔Sunrise酶标仪及Magellan数据采集软件，在450 nm波长下测定吸光度。设置混匀时间为5秒，静置时间为1秒。</li>
 <li>在电子表格中打开结果图表，并利用标准曲线数据绘制校准线： 
 葡萄糖浓度 = a × 吸光度 + b </li>
 <li>计算酶活性： 
 活性 = (吸光度 × 稀释倍数 - 空白值) × a + b </li>
 <li>通过计算样品活性与相应阴性对照活性之间的差值，确定β-呋喃果糖苷酶的活性。</li>
 <li>结合生物量干重与β-呋喃果糖苷酶活性，计算比生产速率，供后续使用11。</li>
</ol>
5. 培养 72 小时后的显微观察与自动图像分析
<ol>
 <li>将约3 mL培养物悬液置于塑料培养皿中，加入生理氯化钠溶液稀释，直至形态结构分离。</li>
 <li>将培养皿置于配备集成或连接相机的显微镜下。采集并保存约100张图像（图2每个样本的形态结构数量。注意每张图像中至少有一个物体被完整呈现。</li>
 <li>使用图像处理程序 ImageJ 打开同一样本的所有图像12. 使用“转换为黑白”处理工具（Make Binary）将图像转为黑白图像（图2）。若要将该命令应用于整批图像，请使用如下宏代码。 运行（,,制作二值图像） 
 </li>
 <li>使用 ImageJ 再次打开已处理的二值图像。利用“设置测量”分析工具，计算每幅图像的形态学参数，包括 Feret 直径、投影面积、周长、圆形度、长宽比、圆整度和实心度。若需将该命令应用于一系列图像，可使用如下宏代码。 
 run("8-bit"); 
 执行“转为二值图像”； 
 运行("设定比例...", "距离=X 已知=1000 像素=1 单位=μm 全球 
 run("设置测量...", "面积 周长 形状 Feret直径 限制 显示 重定向=None 小数位数=3"); 
 运行("分析颗粒...", "大小=10000-无穷大 圆形度=0.00-1.00 显示=轮廓 显示结果"); 
 确定X为与之相关的像素数量 1000 μm 通过在比例尺上绘制一条直线来确定。将该直线的像素数量与比例尺的实际长度相关联 μm.</li>
 <li>在电子表格中打开包含每幅图像形状因子值的结果图表。按如下方法为每幅图像计算形态学数值。 
 <img alt="Morphology number formula using area, solidity, Feret's diameter, and aspect ratio in physics diagram." src="/files/ftp_upload/4023/4023eq1.jpg" data-altupdatedat="1787630408000" data-alt="Equation 1"></li>
 <li>计算一个样本所有图像的形态学数值的平均值和标准偏差。</li>
 <li>使用绘图与数据分析软件对形态学数值与比生产率进行图形相关性分析，并通过数学回归确定其数学关系。</li>
</ol>
6. 典型结果
通过添加滑石微粒，A. niger SKAn 1015 的形态从典型的菌球形态转变为分散或甚至菌丝形态。在标准条件下表现为菌球形态，而在培养基中添加 10 g/L 滑石微粒后则形成菌丝形态（图4）。同时，β-呋喃果糖苷酶的活性提高约 3 倍3-5。添加 1 或 3 g/L 滑石粉则导致分散形态的形成，并使呋喃果糖苷酶活性增加一倍（图4）。
微粒依赖性形态可通过形态数进行综合描述，该形态数可利用自动图像分析确定的参数计算得出。在显微图像中，完全圆形且表面光滑的菌粒表现为完美的圆形，此类颗粒的形态数为1。菌丝体形态的最小碎片可简化为一维线条，其形态数为0。因此，所有介于两者之间的中间形态，如伸长的不规则菌粒或团块，其形态数介于0和1之间。较大的颗粒将产生较高的形态数，而具有较大表面积的真菌颗粒或伸长形颗粒则对应较低的形态数11。
在标准条件下，反应器1中的形态表现出约0.8的形态学数值。添加10 g/L滑石粉的反应器4，其形态学数值（Mn）约为0.1。反应器2和3的滑石粉浓度分别为1 g/L和3 g/L，其形态学数值介于上述两个极端之间，表现出分散的形态特征。由于依赖微粒的形态特征与β-呋喃果糖苷酶的生产率密切相关，因此可获得形态学数值与生产率之间的数学关联关系，如图5所示。
<img alt="生物反应器工艺示意图；干重、酶活性、显微镜观察；时间点 24-72 小时。" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig1.jpg" data-altupdatedat="1787630408000" data-alt="图 1"> 
图 1. 实验设计与分析流程的总体方案。A. niger 在 3 L 搅拌式生物反应器中培养 72 小时（可添加或不添加微粒）。在培养 24、48 和 72 小时后取样，测定菌体干重和 β-呋喃果糖苷酶活性，并据此计算比生产速率。培养 48 小时后，通过显微镜观察真菌形态，并采用数字图像分析进行表征。图像分析的相关参数被整合为一个形态学数值，该数值与比生产速率在数学上具有相关性。
<img alt="图像处理工作流程图：采集、增强、二值化、使用ImageJ进行分析。" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig2.jpg" data-altupdatedat="1787630408000" data-alt="图2"> 
图2. 对来自A. niger的形态结构显微图像进行图像处理的步骤。步骤1：通过显微镜进行图像采集。步骤2：如有必要，对图像进行增强处理。步骤3：图像二值化，使用ImageJ生成黑白（二值）图像。步骤4：对二值图像进行处理，并清除不需要的对象。步骤5：利用开源程序ImageJ中的“分析颗粒”功能进行形态学分析。
<img alt="滑石微粒对样品的影响；光学显微镜；6 μm 颗粒；形态学分析。" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig3.jpg" data-altupdatedat="1787630408000" data-alt="Figure 3"> 
图3. A. niger 在不同浓度微粒添加下的多种形态结构。随着微粒浓度的增加，菌体聚集体的尺寸可被精确调控，直至形成微小的核壳结构聚集体、微小菌团，甚至完全分散的菌丝体。通过在 submerged culture（浸没式培养）中添加微粒对 Aspergillus niger SKAn1015 进行形态工程改造。未添加微粒（A）、10 mg/L（B）、0.1 g/L（C）、0.2 g/L（D）、0.3 g/L（E）、0.6 g/L（F）、1.0 g/L（G）、1.5 g/L（H）、2.0 g/L（I）、2.5 g/L（J）、3.0 g/L（K）、3.5 g/L（L）、4.0 g/L（M）、4.5 g/L（N）、5.0 g/L（O）、10 g/L（P）、15 g/L（Q）、20 g/L（R）、30 g/L（S）和 40–50 g/L（T）。图像为培养72小时后通过光学显微镜拍摄。
<img alt="果糖呋喃苷酶活性随滑石粉浓度变化的柱状图，显示酶活性增加。" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig4.jpg" data-altupdatedat="1787630408000" data-alt="Figure 4"> 
图4. 果糖呋喃苷酶活性随滑石微粒浓度的变化关系，浓度分别为1 g/L（反应器2）、3 g/L（反应器3）和10 g/L（反应器4）。反应器1未添加微粒，其培养在标准条件下进行。
<img alt="比生产率与形态学数值关系图；黑曲霉 SKAn 1015；指数衰减拟合。" src="/files/ftp_upload/4023/4023fig5.jpg" data-altupdatedat="1787630408000" data-alt="图 5"> 
图 5. 形态学数值与比生产率之间具有代表性的好相关性（R2 = 0.91）。横坐标为形态学数值，纵坐标为比生产率。非线性回归得到指数相关关系。

<ol><li>Wucherpfennig, T., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aWucherpfennig%2C+T+%22Advances+in+Applied+Microbiology%22">Advances in Applied Microbiology</a>. 72, Academic Press. 89-136 (2010).</li>
<li>Driouch, H., Hänsch, R., Wucherpfennig, T., Krull, R., Wittmann, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+enzyme+production+by+bio-pellets+of+Aspergillus+niger%3A+Targeted+morphology+engineering+using+titanate+microparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+and+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Improved enzyme production by bio-pellets of Aspergillus niger: Targeted morphology engineering using titanate microparticles.</a> Biotechnology and Bioengineering. 109, 462-471 (2012).</li>
<li>Driouch, H., Roth, A., Dersch, P., Wittmann, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimized+bioprocess+for+production+of+fructofuranosidase+by+recombinant+Aspergillus+niger%5BTitle%5D)+AND+%22Applied+Microbiology+and+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Optimized bioprocess for production of fructofuranosidase by recombinant Aspergillus niger.</a> Applied Microbiology and Biotechnology. 87, 2011-2024 (2010).</li>
<li>Driouch, H., Roth, A., Dersch, P., Wittmann, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Filamentous+fungi+in+good+shape%3A+Microparticles+for+tailor-made+fungal+morphology+and+enhanced+enzyme+production%5BTitle%5D)+AND+%22Bioengineered+Bugs%22%5BJournal%5D)">Filamentous fungi in good shape: Microparticles for tailor-made fungal morphology and enhanced enzyme production.</a> Bioengineered Bugs. 2, 100-104 (2011).</li>
<li>Driouch, H., Sommer, B., Wittmann, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphology+engineering+of+Aspergillus+niger+for+improved+enzyme+production%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+and+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Morphology engineering of Aspergillus niger for improved enzyme production.</a> Biotechnology and Bioengineering. 105, 1058-1068 (2010).</li>
<li>Kaup, B. -A., Ehrich, K., Pescheck, M., Schrader, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microparticle-enhanced+cultivation+of+filamentous+microorganisms%3A+Increased+chloroperoxidase+formation+by+Caldariomyces+fumago+as+an+example%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+and+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Microparticle-enhanced cultivation of filamentous microorganisms: Increased chloroperoxidase formation by Caldariomyces fumago as an example.</a> Biotechnology and Bioengineering. 99, 491-498 (2008).</li>
<li>Hirayama, M., Sumi, N., Hidaka, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Purification+and+characterization+of+a+fructooligosaccharide-producing+beta-fructofuranosidase+from+Aspergillus+niger+ATCC+20611%5BTitle%5D)+AND+%22Agricultural+and+Biological+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Purification and characterization of a fructooligosaccharide-producing beta-fructofuranosidase from Aspergillus niger ATCC 20611.</a> Agricultural and Biological Chemistry. 53, 667-673 (2006).</li>
<li>Rajoka, M. I., Yasmeen, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+productivity+of+beta-fructofuranosidase+by+a+derepressed+mutant+of+Aspergillus+niger+form+conventional+and+non-conventional+substrates%5BTitle%5D)+AND+%22World+Journal+of+Microbiology+and+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Improved productivity of beta-fructofuranosidase by a derepressed mutant of Aspergillus niger form conventional and non-conventional substrates.</a> World Journal of Microbiology and Biotechnology. 21, 471-478 (2005).</li>
<li>Zuccaro, A., GÃ¶tze, S., Kneip, S., Dersch, P., Seibel, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tailor-made+fructooligosaccharides+by+a+combination+of+substrate+and+genetic+engineering%5BTitle%5D)+AND+%22ChemBioChem%22%5BJournal%5D)">Tailor-made fructooligosaccharides by a combination of substrate and genetic engineering.</a> ChemBioChem. 9, 143-149 (2008).</li>
<li>Huggett, A. S. G., Nixon, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+glucose+oxidase%2C+peroxidase%2C+and+o-dianisidin+in+determination+of+blood+and+urinary+glucose%5BTitle%5D)+AND+%22The+Lancet%22%5BJournal%5D)">Use of glucose oxidase, peroxidase, and o-dianisidin in determination of blood and urinary glucose.</a> The Lancet. , 270-368 (1957).</li>
<li>Wucherpfenning, T., Hestler, T., Krull, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphology+engineering+-+Osmolality+and+its+effect+on+Aspergillus+niger+morphology+and+productivity%5BTitle%5D)+AND+%22Microb.+Cell+Fact%22%5BJournal%5D)">Morphology engineering - Osmolality and its effect on Aspergillus niger morphology and productivity.</a> Microb. Cell Fact. 10, (2011).</li>
<li>Rasband, W. S. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRasband%2C+WS+%22ImageJ%22">ImageJ</a>. , National Institutes of Health. Bethesda, Maryland, USA. (1997).</li>
<li>Papagianni, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+the+fractal+nature+of+mycelial+aggregation+in+Aspergillus+niger+submerged+cultures%5BTitle%5D)+AND+%22Microbial+Cell+Factories%22%5BJournal%5D)">Quantification of the fractal nature of mycelial aggregation in Aspergillus niger submerged cultures.</a> Microbial Cell Factories. 5, 5(2006).</li>
</ol>

我无任何披露事项。

真菌形态的改造在生物技术领域已受到数十年的关注。不同的研究尝试通过改变特定的工艺参数（如pH值、功率输入、温度、培养基营养成分或接种浓度1）来调控形态，但这些方法往往存在对形态控制不够精确和不完全、能耗高、抑制效应或产物不稳定等问题。相比之下，添加微粒可通过对微粒尺寸和浓度的精细调节，实现对真菌形态的精确工程化调控。这为利用微粒优化并定制设计高产形态，应用于黑曲霉（A. niger）及其他丝状微生物的生物技术生产，开辟了新的可能性。
数字图像分析是一种易于重复的方法，用于表征真菌的宏观形态。然而，文献中描述的形态结构在大小、形状和表面特征方面的参数种类繁多，使得对真菌形态的快速评估变得复杂。本文提出的形态数，通过整合相关参数，克服了这一缺陷，不仅可用于形态结构的全面表征，还可与生产率进行直接的数学关联。这使得根据给定形态估算生产率成为可能，从而可根据工艺需求定制形态。
利用形态学数值，可以区分不同的菌体颗粒和菌团形态4,5。为进一步发展该形态学数值，引入分形维数的概念似乎具有前景。分形维数可用于衡量物体的复杂程度及其质量填充特性13，因此特别适用于对菌丝体形态进行整体表征。
然而，形成高产的菌丝体形态可能会对工艺性能造成问题，尤其是在大规模培养中，因为先前的研究表明，菌丝体生长形态会导致培养液黏度显著升高2。这会引起传热和传质困难，并形成不流动的非混合区域，从而需要更高的功率输入，使培养过程的运行成本增加1。因此，在改变菌体形态时，应考虑真菌形态与培养液黏度之间的关系，并将其纳入后续的模型中。

通过添加滑石微粒定制aspergillus niger的形态

Customization of Aspergillus niger Morphology Through Addition of Talc Micro Particles

丝状真菌A. niger 是一种广泛应用于从食品到制药工业等多个工业生产过程中的菌株。这种丝状生物最引人注目且常常难以控制的特征之一是其复杂的形态，其形态可从致密的球形菌团到黏稠的菌丝体不等（图1）。已知多种工艺参数和培养基成分会影响真菌的形态1。由于最佳生产效率与特定的形态形式密切相关，真菌的形态通常成为工业生产中提高产量的瓶颈。
一种直接且简洁的方法是通过向培养基中添加无机不溶性微粒（如水合硅酸镁、氧化铝或硅酸钛氧化物），以精确控制形态形状，从而提高酶的产量2-6。由于微粒依赖的形态与酶产量之间存在明显相关性，因此有必要在数学上将生产效率与形态特征关联起来。为此，需要实现一种定量、精确且全面的形态学描述。
因此，我们提出一种方法，用于生成和表征依赖微粒的形态结构，并将真菌形态与生产性能相关联（图1），这可能有助于更深入地理解丝状微生物的形态发生过程。
重组菌株 A. niger SKAn1015 在3 L搅拌式生物反应器中培养72 h。在接种前添加浓度分别为1 g/L、3 g/L和10 g/L的滑石微颗粒，可重复地诱导产生多种形态结构。分别在24、48和72小时无菌取样，用于测定生长进程及所产酶的活性。所形成的产物为高价值酶β-呋喃果糖苷酶，这是一种在食品或制药工业中用于新糖合成的重要生物催化剂，可催化蔗糖转化为葡萄糖等反应7-9。因此，加入蔗糖后葡萄糖的定量可反映所产β-呋喃果糖苷酶的量。葡萄糖的定量采用GOD/POD法测定10，并针对96孔微孔板的高通量分析进行了改良。
培养72小时后，通过显微镜观察真菌形态，并利用数字图像分析进行表征。采用开源图像处理程序ImageJ，计算表征真菌宏观形态的颗粒形态因子，如Feret直径、投影面积、周长、圆形度、长宽比、圆整度和实心度。将相关参数组合为一个无量纲的形态学数值（Mn）11，以实现对真菌形态的全面表征。通过数学回归分析，凸显了形态学数值与生产效率之间的密切相关性。

本文描述了一种精确生成并全面表征丝状真菌Aspergillus niger形态的方法，该方法可实现形态特征与生产性能之间的数学关联。

通过添加滑石微粒定制Aspergillus niger的形态

丝状真菌 A. niger 是一种广泛应用于从食品到制药工业等多个工业领域的菌株。其中最重要的……

该方法通过生成和表征依赖微粒的丝状真菌——曲霉（Aspergillus niger）的形态结构，以关联真菌形态与产率。在三升搅拌罐生物反应器中培养黑曲霉，分别在有或无微粒的条件下培养72小时，以计算比生产率。在规定的时间点取样，测定生物量、干重及β-呋喃果糖苷酶活性。72 小时后，通过显微镜检查真菌形态，并利用数字图像分析进行表征。然后将图像分析的相关参数组合成一个形态学数值，该数值在数学上与比生产率相关联。最终，该方法可精确生成并全面表征黑曲霉的形态，从而更深入地理解丝状微生物的形态发生过程。Aspergillus Nigel 数十年来一直是生物技术领域重要的工业用模式菌株。曲霉属、Nigel 及相关物种最引人注目且常难以控制的特征之一，是其复杂的形态结构，会因培养条件不同而呈现从致密球状菌丝球到黏稠菌丝体的多种形式。本方法的主要优势在于，通过添加微颗粒，我们现在能够根据工艺需求定制化调控真菌的形态结构。迄今为止，尚未有其他方法被报道可用于真菌形态的此类定制化调控。该方法有助于解答关于丝状微生物培养的关键问题。因为在工业应用中，控制真菌的形态至关重要，同时还需要能够区分高产与低产的真菌形态。本方案提供了对真菌形态进行理想定制与表征的方法。尽管该方法可用于研究曲霉属尼日尔形态，也可应用于其他丝状微生物，如青霉菌或链霉菌菌株。按照配套方案中的详细说明，设置四个用于无菌培养的生物反应器。基于微粒添加，培养具有不同形态的黑曲霉。72小时后，将50毫升培养液样品转移至Falcon管中。在干燥器中干燥后，至少取两份生物质样品，用微量天平称量带有纤维素滤膜的滤器。将滤膜置于布氏漏斗中，连接水流抽气泵，先过滤10毫升样品，再过滤10毫升去离子水，以去除生物质中的培养基成分。将滤膜在中间折叠一次。将其放入玻璃培养皿中，并置于干燥箱内干燥至恒重。将滤膜转移至干燥器中冷却，然后称重。通过计算滤膜重量差，并除以样品体积，来确定每升培养液的生物量干重，用于葡萄糖氧化酶和过氧化物酶活性测定。使用注射器将1.5毫升样品经醋酸纤维素滤膜过滤至反应管中，过滤过程中保持样品置于冰上，用于进行β-呋喃果糖苷酶（beta fructo SASE）测定。为确保实验结果的统计学稳健性，我们精心设置了两组三个重复样本。开始检测时，向试管中加入 20 µL 样品；为控制因 pH 和温度依赖性导致的蔗糖水解为葡萄糖，需用 20 µL 去离子水代替 20 µL 样品。此外，针对每个样品，还需通过检测制备阴性对照，以排除培养基中残留葡萄糖的干扰。取20微升热灭活样品，为启动蔗糖转化为葡萄糖的反应，加入200微升1.65摩尔的蔗糖溶液。在pH 5.4条件下，取20微升样品，将所有反应管置于40摄氏度的加热模块中孵育20分钟。反应结束后，将反应管先在冰上冷却，然后在95摄氏度加热10分钟以终止反应。必要时离心样品，为使测定的吸光度处于校准值范围内，需对样品进行稀释。现在，向微孔板中每个反应孔加入两微升样品。每个样品需设三个复孔进行测定。同时为10种葡萄糖溶液准备标准曲线，浓度范围为1毫摩尔至15毫摩尔。零点校准使用2微升去离子水。然后，向每个样品中加入200微升试剂溶液。室温孵育10分钟。使用96孔Sunrise酶标仪和Magellan数据处理软件在450纳米处测定吸光度。用电子表格打开结果图表，并绘制标准曲线校准线。计算每个样品的活性，然后通过从样品活性中减去相应阴性对照的数值来计算β-呋喃果糖苷酶活性。最后，结合生物量干重和β-呋喃果糖苷酶活性计算比生产速率。将三毫升培养液悬液置于塑料培养皿中，并用生理氯化钠溶液稀释，以分离形态结构。显微图像的质量至关重要。为确保后续图像分析的准确性，稀释步骤中需格外注意操作质量。将培养皿置于配备集成摄像头的显微镜下。每个样品采集并保存约100张形态结构图像，确保每张图像中至少有一个完整的物体。以相同方式继续对含有不同反应器样品的培养皿进行操作，每次均采集新的图像。注意来自不同反应器的样品在添加不同量滑石粉后表现出的形态生长差异。然后在图像处理程序 Image J 中打开同一份样品的所有图像。使用处理工具将其转换为二值图像。将图像转换为黑白图像，以便对整组图像应用命令。接下来使用宏代码，打开一张包含比例尺的图片。在比例尺上绘制一条直线，以确定对应于2000微米的像素数量。选择分析工具，设置测量参数，并选取形状因子、费雷特直径、面积和周长。使用宏代码处理一系列图像。现在打开电子表格，其中绘制了形状因子数值的结果图表。针对每张图像，使用同一样品的所有图像计算每张图像的形态学数值。计算形态学数值的平均值。使用绘图和数据分析软件将形态学数值与比生产率进行作图。通过逐步增加滑石微粒的浓度，利用数学回归确定其数学关系。八种尼日尔SKAN 10 15。形态学上，从真正的颗粒形态转变为分散状甚至丝状形态，而在标准条件下则表现出预期的颗粒形态。有趣的是，通过在培养基中添加每升10克的滑石微粒，可形成菌丝体形态。与此同时，β-果糖苷酶的活性大约增加三倍；而添加每升1克或3克滑石粉则导致分散形态，并使果糖活性加倍，相关参数由自动图像分析确定。这种依赖微粒的形态特征可通过形态学进行系统描述。形态学数值注释：在显微图像中，呈光滑颗粒状且完全圆形的颗粒会显示为完美的圆形。此类颗粒在标准条件下的形态学数值接近于1。反应器一中的颗粒表现出约0.8的形态学数值。4号反应器中滑石粉浓度为10克/升时，其形态学数值约为0.1。2号和3号反应器中滑石粉浓度分别为1克/升和3克/升，其形态学数值介于上述两个极端之间，表现出分散的形态特征。由于微颗粒依赖的形态与β-果糖胞的生产率密切相关，因此在发育完成后，形态、数量与生产率之间存在良好的数学相关性。该技术为生物技术领域的研究人员进一步探索真菌形态及其与生产率的关系奠定了基础。通过采用这种详细构建特定形态真菌交配类型的方法，还可进一步探究丝状微生物培养的其他重要方面。例如，已知菌丝形态比菌落形态具有更高的黏度。因此，该过程的整体生产效率会因操作问题以及目标产物的纯化困难而受到影响。我们的形态学参数将有助于建立与培养、形态发生学相关的模型，并进一步加深对真菌形态学的总体理解。

customization-aspergillus-niger-morphology-through-addition-talc

Research

科研

JoVE Journal

Immunology and Infection

免疫学与感染

定制黑曲霉（Aspergillus niger）通过添加滑石粉微粒形态

有性杂交及重组子代的分离是研究丝状真菌Fusarium...

禾谷镰刀菌的有性发育与子囊孢子释放

冷冻电子显微镜，包括扫描电镜（SEM）和透射电镜（TEM），广泛用于含水量较高的生物样品或其他材料的表征1。利用扫描电镜/聚焦离子束（FIB）可识别样品中感兴趣的结构特征，并切割出一片薄而电子束可穿透的薄片，用于转移至冷冻透射电镜中进行进一步分析。...

利用聚焦离子束制备冷冻电子显微镜样品

在扫描电子显微镜观察的生物样品制备过程中，存在的问题包括细胞塌陷、来自湿润微环境的样品处理以及细胞破坏。本文汇编并详细描述了适用于制备具有挑战性样品（如花分生组织、卵菌囊、真菌（伞菌目））的低成本且相对快速的实验方案。...

扫描电镜（SEM）用于难处理的植物、卵菌和真菌样品的实验方案

本文介绍了一种用于分析表达抗真菌蛋白的玉米籽粒中Aspergillus flavus生长及黄曲霉毒素产生的实验方案。  利用表达GFP的A.

抑制 Aspergillus flavus 表达α-淀粉酶抑制剂的转基因玉米中的生长及黄曲霉毒素产生 Lablab purpureus L.

本文介绍了利用扫描电子显微镜（SEM）成像精细组织样本的详细处理方案。针对坚硬的蛋壳、早期发育阶段的胚胎以及真菌培养物，分别描述了三种不同的处理方法：六甲基二硅氮烷（HMDS）化学干燥法、简单的空气干燥法和临界点干燥法。...

胚胎、卵壳及真菌培养物的扫描电子显微镜制样

本方案描述了一种在斑马鱼幼鱼中建立Aspergillus感染的模型。Aspergillus孢子被显微注射至幼鱼的后脑，通过化学处理诱导免疫抑制。利用每日成像系统监测感染进展，以观察真菌生长和免疫反应，并通过菌落形成单位平板法对存活孢子进行计数。...

斑马鱼幼虫感染 曲霉属 用于宿主-病原体相互作用分析的孢子

子囊菌门丝状真菌 Huntiella omanensis 中的 CRISPR-Cas9 介导基因组编辑

我们介绍一种无需标记的活体成像方案，利用透射光显微技术对丝状真菌A.

使用活体显微镜和开源软件对Aspergillus nidulans生长速率进行定量分析

本实验方案旨在提供收集、固定和保存菌异养植物样品的详细步骤，并应用多种显微技术（如扫描电镜、透射电镜、光学显微镜、共聚焦显微镜和荧光显微镜），以研究菌根真菌在植物组织及经菌根真菌接种萌发的种子中的定殖情况。...

用于解读菌根异养植物组织中真菌定植及种子共生萌发的显微技术

本文介绍了一种在基于超吸收性聚合物的自养体系中接种并观察丛枝菌根真菌的简单且低成本的技术。...

在基于超吸水聚合物的自养系统上接种并观察丛枝菌根培养物

优化冷冻电子显微镜样品制备

了解如何通过添加滑石粉微粒定制黑曲霉（Aspergillus niger）的形态，以建立形态与生产力的数学相关性。该方法结合显微镜观察与数字图像分析，为丝状微生物的形态发生研究提供新见解。

通过添加滑石微粒定制Aspergillus niger的形态

探索更多视频